大连化物所等发展出利用原位化学交联解码细胞中蛋白质动态结构的策略
近日，中国科学院大连化学物理研究所生物技术研究部生物分子高效分离与表征研究组研究员赵群、张丽华等，与中国科学院精密测量科学技术创新研究院副研究员龚洲合作，提出了利用原位化学交联-质谱技术（in vivo XL-MS），解码细胞中蛋白质动态结构的策略。该策略将AlphaFold2的结构作为先验信息，结合in vivo XL-MS数据与多种结构计算方法评估结构与交联信息的匹配度，重构了细胞内多种蛋白质，尤其是多结构域蛋白质和固有无序蛋白质（intrinsically disordered protein，IDP）的原位动态结构。为剖析蛋白质在细胞微环境中发挥功能的分子机制提供技术支撑。 活细胞内蛋白质的原位动态结构对于揭示其生物学功能至关重要。随着深度学习算法助力蛋白质结构预测的发展迭代，AlphaFold2实现了对蛋白质结构的全面预测，而该方法对柔性区域的结构预测仍面临挑战。近年来，in vivoXL-MS以高通量、高灵敏、......阅读全文
中国科大实现活细胞的高分辨低功耗快速拉曼成像
中国科学技术大学工程科学学院Zachary J. Smith教授团队和华中师范大学化学学院高婷娟教授团队在拉曼生物成像研究领域取得新进展，提出了一种基于线扫描拉曼成像系统和偶氮增强拉曼探针相结合的快速生物成像方法，实现了对细胞器动态过程的高分辨率、低功耗的影像。相关研究成果于2022年8月15日以“
5分钟了解活细胞成像：记录真实过程－揭示生命真相
对人类活动的记录促使了抖音等视频的流行，对科学的观察和记录也有同样的追求，正在从静态的“快照”观察转向对活体动态过程的描述。目前研究活性物质生物活性的最有效手段正是活细胞成像，它彻底革新了生物学家研究细胞、蛋白质以及众多分子之间相互作用和生理过程的方式，活细胞成像市场正在吸引着大量公司的进入，预
自动化拉曼光谱仪用于活细胞功能分类（一）
自动化拉曼光谱仪可以在单细胞层面进行功能分析，筛选对某种物质具有代谢活性的细胞用于后续分析，使得微生物生态的研究更加具有针对性和精确性。2019年3月《Nature microbiology》期刊上，“自动化拉曼光谱仪用于活细胞功能分类”介绍了一个微流控光学平台结合了微流体、光镊和拉曼光谱技术，用于
Lattice－Lightsheet－7活细胞晶格激光片层扫描显微镜共享
仪器名称：Lattice Lightsheet 7活细胞晶格激光片层扫描显微镜仪器编号：A23000133产地：德国生产厂家：Zeiss型号：Lattice Lightsheet 7出厂日期：20231116购置日期：20231116所属单位：医研院>生物医学测试中心>细胞生物学平台>细胞平台光镜机
自动化拉曼光谱仪用于活细胞功能分类（二）
3分选、回收效率和准确率RACS平台提供一个用户友好的程序界面，用户可自定义筛选标准，操作方法如视频3所示。首先进行空白校对（calibration），然后根据用户设计的标准光镊在捕获区样品流中随机捕获细胞，根据PC判断是否成功捕获，捕获成功后移动到评估区进行拉曼光谱测量，如果满足标记细胞的标准则释
上海九院完成基础研究：巧“种”干细胞产出“活皮肤”
上海交通大学医学院附属第九人民医院整复外科主任李青峰教授领衔的课题组新近完成一项基础研究：通过巧“种”干细胞，获取机体自产的“活皮肤”。国际外科领域最具影响的杂志《外科学年鉴(美国)》日前在最新一期发表了该研究的学术论文。 据介绍，临床治疗大面积皮肤严重烧伤、创伤的经典方法，往往是“拆东墙
为什么溶液中酸碱度可对活细胞产生严重的影响
各种生命活动都是需要一个适宜的pH的，如过酸，过碱都会影响蛋白质的活性，而生命活动的承担者是蛋白质，细胞中进行的反应需要酶的催化，酶主要是蛋白质，少数是RNA，这些酶都是有自己的最是pH的，当pH不在最适值范围内的时候，酶的活性便会受到影响，当超过一定的范围时候，酶便会失去活性，因此正常的生命活动便
上海应物所在活细胞成像和胞内运输方面取得进展
近日，中国科学院上海应用物理研究所物理生物学研究室与加州大学圣地亚哥分校合作，发展了一种基于金纳米粒子的荧光-纳米等离子体双模态成像fPlas探针，并对其在胞内运输中的聚集过程及聚集态对其传输动力学的影响开展研究。相关结果发表于《自然-通讯》（Nature Communications, 201
生物体内的活细胞怎样使ADP转化成ATP
ADP转化成ATP时所需要的能量，主要来自线粒体内有氧呼吸过程中分解有机物释放出的能量。对于绿色植物来说，ADP转化成ATP时所需要的能量，除了来自有氧呼吸过程中分解有机物释放出的能量外，还来自光合作用(如图)。有关这方面的内容，将在后面进一步讲述。 总之，构成生物体的活细胞，根据生命活动的需要，内
国际首次|我国学者实现活细胞RNA标记与无背景成像
华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室的杨弋、朱麟勇等教授历经7年合作研究，在荧光RNA及活细胞RNA成像领域获突破性进展。他们原创的系列高性能荧光RNA，在国际上首次实现了不同种类RNA在动物细胞内的荧光标记与无背景成像。11月5日，该成果以封面论文形式发表于《自然—生物技术》。 荧光蛋白
蛋白质的研究方法
蛋白质是被研究得最多的一类生物分子，对它们的研究包括“体内”(in vivo)、“体外”(in vitro)、和“在计算机中”(in silico)。体外研究多应用于纯化后的蛋白质，将它们置于可控制的环境中，以期获得它们的功能信息；例如，酶动力学相关的研究可以揭示酶催化反应的化学机制和与不同底
为什么有些血清是热灭活的？如何热灭活？
热灭活是一种通过在56°C水浴中处理30分钟来破坏血清中补体的活性的常用处理方法。在免疫学应用、培养胚胎干细胞、昆虫细胞和平滑肌细胞时，通常推荐使用热灭活的血清。这是因为热灭活可以去除补体蛋白的活性，从而减少补体介导的细胞溶解和其他潜在的不良反应。在热灭活过程中，每隔大约10分钟旋转一次瓶子，以确保
细胞也用“洗涤剂”！蛋白质帮细胞自主消灭细菌
像很多人一样，细胞也会用“清洁产品”抵御细菌。 这种细胞“洗涤剂”实际上是一种蛋白质，人体大多数组织都能产生这种分子，它可以清除入侵的细菌，就像清洗油渍的洗洁精。在杀死沙门氏菌之前，像洗涤剂一样的蛋白质APOL3必须通过细菌外膜。图片来源：霍华德·休斯医学研究所 美国霍华德·休斯医学研究所研
单细胞蛋白质组学：让细胞个体研究更加精细
细胞是生命活动的基本单元。对细胞的精确认知是理解细胞在生理和病理过程中功能的先决条件。 在组织、器官或个体中，细胞具有非常大的异质性，而传统的研究手段针对大量细胞进行分析，得到的是大量细胞的平均结果，无法区分不同细胞个体对于大量样品结果的具体贡献值，从而忽视或掩盖了单细胞的个体差异，不
分析细胞内特定的细胞类型中表达的蛋白质
多色流式细胞术是一种强大的技术，用于分析细胞内特定的细胞类型中表达的蛋白质。对于许多类型的细胞，如Th17细胞，细胞表面和细胞内标记物的结合使用是必要的明确的表型鉴定。表征信号响应于特定的靶细胞的性质，可用于表面标志物的同时分析和信号转导蛋白。 细胞表面染色的技术是比较标准的，往往依赖于目标蛋白的
透化细胞和退化细胞器蛋白质磷酸化—悬浮培养细胞透化
实验材料悬浮培养物试剂、试剂盒胞外缓冲液ATP 储存液实验步骤1. 约在实验开始前 1 小时，用 50 ml 灭菌试管以 1000 g 离心悬浮培养物 5 分钟，用 40 ml 左右胞外缓冲液清洗细胞两次。用预热至 37℃ 的胞外缓冲液重悬细胞至 107 细胞/ml。于 37℃ 轻轻摇动 15~30
透化细胞和退化细胞器蛋白质磷酸化—单层培养细胞透化
实验材料细胞培养物试剂、试剂盒HEPES仪器、耗材培养基实验步骤1. 约在实验开始前 1 小时，将细胞培养物换上含有预热（37℃）的 20 mmol/L HEPES（pH 7.2）的培养基，继续培养。让细胞在实验前与新培养基达成平衡。2. 将所需数量的有细胞的培养基放在一个丝网托盘上，放入 37℃
Sci－Rep：酵母组蛋白甲基转移酶COMPASS复合体的完整结构
国际学术期刊Scientific Reports在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所丛尧研究组的最新成果“Architecture and subunit arrangement of the complete Saccharomyces cerevisiae COMPASS com
细胞蛋白质总量样品的制备及分析
实验步骤取 20 mg 异硫氰酸荧光素，加 20 ml 无水乙醇，使 FITC 充分溶解，即为染色液的原液，保存于 4℃ 冰箱待用。具体荧光染色步骤如下：1. FITC 贮存液的稀释：用 pH 7.4 的 PBS 液稀释成 50 ug/ml 浓度的工作液，备用。2. 被染色细胞首先用 70% 酒精破
非蛋白质新标签可追踪细胞过程
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504716.shtm 图片来源：俄罗斯卫星通讯社科技日报莫斯科7月13日电 （记者董映璧）俄罗斯研究人员使用一种新开发的非蛋白质光学标签，可在不改变基因组的情况下标记单个细胞。使用该项技术能在任何
根分生细胞核蛋白质提取实验
实验材料细胞核 试剂、试剂盒Ficoll 硫酸葡萄聚糖
首张肿瘤细胞蛋白质图谱绘就
日前绘制的首张癌症蛋白质相互作用图谱涵盖了以前被忽视的突变，而这些突变可能成为治疗的目标。 美国加州大学圣地亚哥分校的Trey Ideker和同事完成的这幅图谱，研究了几十种常见癌症蛋白质在乳腺癌和头颈癌中的相互作用。“癌症基因并不是单独起作用的。”Ideker说，“就像任何机器的部件一样，它们
蛋白质如何阻止细胞攻击自己的DNA
病毒通过将其DNA注入宿主细胞来繁殖。一旦进入细胞内液，这种异物就会触发一种称为cGAS-STING途径的防御机制。蛋白质环状GMP-AMP合酶(cGAS)也存在于液体中，它与入侵的DNA结合形成一个新分子。反过来，它与另一种称为干扰素基因刺激物(STING)的蛋白质结合，从而诱导炎症性免疫反应。
细胞破碎和蛋白质溶解实验_匀浆法
为了纯化细胞蛋白质，采用有效的方法进行细胞破碎和固液分离是必要的。它是全过程的第一步，通常是将处于细胞不同位置的待纯化蛋白释放出来，溶入已知成分的溶液内。该步骤是目的蛋白初级分离纯化阶段的重要环节，它直接影响产物的回收率，也可能影响产物的纯度。实验方法原理通过固体剪切力破碎组织和细胞，释放蛋白进入溶
细胞蛋白质总量样品的制备及分析
实验步骤 取 20 mg 异硫氰酸荧光素，加 20 ml 无水乙醇，使 FITC 充分溶解，即为染色液的原液，保存于 4℃ 冰箱待用。具体荧光染色步骤如下：1. FITC 贮存液的稀释：用 pH 7.4 的 PBS 液稀释成 50 ug/ml 浓
蛋白质在细胞中是怎样合成的
首先是转录，在细胞核中由DNA转录出mRNA。然后再翻译，翻译时转运RNA携带着氨基酸根据碱基配对原则与mRNA配对，氨基酸相互链接成肽链，这个过程是在核糖体中进行的。然后肽链进入内质网，在内质网中盘曲、折叠，形成具有简单空间结构的蛋白质，然后再进入高尔基体中，进一步盘曲，折叠，这时就形成了具有复杂
细胞蛋白质总量样品的制备及分析
实验步骤 取 20 mg 异硫氰酸荧光素，加 20 ml 无水乙醇，使 FITC 充分溶解，即为染色液的原液，保存于 4℃ 冰箱待用。具体荧光染色步骤如下：1. FITC 贮存液的稀释：用 pH 7.4 的 PBS 液稀释成 50 ug/ml 浓
关于无细胞蛋白质合成系统的简介
无细胞蛋白质合成系统（Cell-Free Protein Synthesis System）是一种以外源mRNA或DNA为模板，在体外条件下的使用酶、氨基酸底物和能量来合成蛋白质的生化反应系统。与传统的体内重组表达系统相比,体外无细胞合成系统具有多种优点。 无细胞蛋白质合成系统（The cel
根分生细胞核蛋白质提取实验
实验材料细胞核试剂、试剂盒Ficoll硫酸葡萄聚糖Tris-HClEDTA正辛醇仪器、耗材阿拉伯树胶高速分散搅拌器实验步骤3.1 植物材料( 1 ) 洋葱鳞茎，除去棕色干枯的外皮，用自来水清洗，将每一个正立放在加有大约 90 ml 过滤水的圆桶状玻璃容器中，这样只有底部浸没在水中（见注释 3)。水必
蛋白质相互作用如何驱动细胞凋亡
细胞敢死队 “健康的身体取决于严格按规定执行的细胞分裂和死亡，波鸿“Resolv” 卓越电子顺磁共振光谱研究组Stephanie Bleicken博士说。“当它们失控时，癌症和神经退行性疾病就会发生。”细胞凋亡是身体摆脱损害、老化或不需要的细胞的重要安全机制。 Bcl-2蛋白家族决定细胞何时