Isoseq全长转录组测序助力拟南芥蛋白质异构体的发现
背景 植物科学中常以高通量的方式（组学）研究生物体不同层次的复杂性，通常整合多组学数据以获得生物体发育或在不同环境条件下的生物学的准确图像。目前，全长异构体测序(Iso-Seq)与短读长转录组学和蛋白质组学的整合已经成功地用于增加蛋白质异构体的表征，不仅有助于提高基因组和转录组的质量，而且有助于通过蛋白质基因组学方法鉴定由单个基因序列产生的不同功能的蛋白质异构体的多样性。 西班牙Jesús Pascual团队在plants上发表了题为“The Integration of Data from Different Long-Read Sequencing Platforms Enhances Proteoform Characterization in Arabidopsis”的研究。 在本文中，研究人员分析了Iso-Seq和ONT-DRS数据对拟南芥质谱蛋白质组学数据中蛋白质异构体表征的影响。结果表明，将来自Iso-Seq......阅读全文
中国农业科学院Nature－Genetics发表测序新成果
来自中国农业科学院、荷兰瓦赫宁根大学和研究中心、南京农业大学等机构的研究人员证实，在芜菁（Brassica rapa）和甘蓝（Brassica oleracea）中亚基因组平行选择与形态多样化和作物驯化有关联。这一研究发现发布在8月15日的《自然遗传学》（Nature Genetics）杂志上。
中德科学家揭示甘薯起源历史
今天，上海辰山植物园（中科院上海辰山植物科学研究中心）和中科院上海植物生理生态研究所联合德国马克斯普朗克分子遗传研究所和分子植物生理研究所的科研团队在国际著名学术期刊《Nature Plants》上共同发表了揭示甘薯起源的重要论文。这是科学界在多倍体基因组学领域取得的一项重大突破，也是上海辰山植
测序技术发展过快？基因组学千万大奖告吹
X奖基金会近日决定取消了奖金高达1000万美元的基因组学Archon X奖(Archon Genomics X Prize)，因为基因组测序成本的直线下降已使得竞争毫无意义。 X奖基金会的主席兼CEO Peter Diamandis在上周四宣布了关闭竞赛的决定。他表示，这是因为如今
江西省疾控高通量测序技术获突破
近日，省疾控中心疾检所首次在我省采用高通量测序技术直接从患儿标本中获得病毒全基因组序列，这也意味着我省在不明原因传染病暴发疫情的病原诊断和溯源方面取得重大突破，对于我省传染病防控工作具有重要意义。 据了解，今年5月初，我省宜春市某幼儿园出现以发热、咳嗽为主要症状，并继发肺部感染的聚集性疫情。经
IntegraGen为巴斯德研究所提供高通量测序服务
IntegraGen公司今天宣布与巴斯德研究所达成合作协议，在微生物学领域开展高通量测序。 根据协议细则，IntegraGen公司将为法国国家参考中心与巴斯德研究所微生物基因组文库提供测序服务。另外，IntegraGen公司也将开发一款新型管理软件以供巴斯德研究所内部使用。 合作双方表示，该
罗氏454高通量测序平台的特点及应用
Genome Sequencer FLX (GS FLX)系统是罗氏454 公司的第二代测序台，GS FLX的命名正是来源于其在多领域的灵活(flexible)应用。随着该系统性能和应用领域的不断提升和扩展，必将带动整个测序领域的技术发展，对大规模基因序列研究的相关应用领域产生巨大的推动作用。美吉生
高通量测序揭秘中药苦参注射液如何抗癌
最近，澳大利亚阿得雷德大学和山西中医学院的研究人员，解开了“来自一种传统中药的植物化合物的复杂混合，如何起作用来杀死癌细胞”。相关研究结果发表在《Oncotarget》杂志上，首次描述了传统中药的分子作用，而不是将它分解成其组成部分。 在中国，复方苦参注射液（CKI）被批准用于治疗各种癌症肿瘤
华大基因获批开展高通量基因测序临床应用
日前，国家卫生计生委医政医管局委托中华医学会、国家卫生计生委临床检验中心和产前诊断技术专家组评估确定了第一批高通量基因测序技术临床应用试点单位，开展遗传病诊断、产前筛查与诊断、植入前胚胎遗传学诊断3个专业的试点工作。华大基因成为获批单位之一。 据悉，华大基因下属的深圳华大临床检验中心获批开展
谢晓亮：从单细胞研究到高通量测序
2011年7月第八期《自然—方法学》刊登了Monya Baker撰写的一篇人物特写，详细介绍了在当期发表的论文 “Fluorogenic DNA sequencing in PDMS microreactors”的主要作者哈佛大学谢晓亮教授的高通量测序技术。全文翻译如下： 在科学界，
高通量DNA自动测序仪技术指标
高通量DNA自动测序仪是一种用于信息科学与系统科学领域的分析仪器，于2012年3月15日启用。 技术指标 1.双光速双侧激光和后置超薄CCD检测成像系统 2.内置一体化自动进样器及样品板储器。 3.内置样品板条形码自动识别。 4.100次（9600个样品）运行试剂一次性上机。 5.自
昆明植物所建立叶绿体基因组遗传信息获取技术体系
在分子生物学和基因组时代，叶绿体基因组为植物分类、系统发育和物种鉴定等提供了不可或缺的遗传信息。随着新一代测序技术的快速发展，叶绿体基因组学已经成为植物系统基因组学和超级条形码研究的热点，也是中国科学院昆明植物研究所三个重大突破目标——iFlora 研究的重要内容。 昆明植物所种质资源库多年来
德国助力测序受忽视生物体
近日，德国的一个州为那些希望解密那些不太受关注的生物体基因的生物学家提供了一个大帮助。黑森州日前宣布为当地研究机构提供1760万欧元经费。这个为期7年的项目前一半将主要测序植物、动物和真菌。该项目还包括高通量测序约700种生物体，以及部分或重新测序数千种生物。 “德国科学家正在向了解生命的基因
新的DNA测序技术将促进对基因结构和功能的探索
今天在此间开幕的“二00七年国际基因组学大会”透露，新近问世的DNA测序法已经在基因组研究中得到了广泛的应用，使基因表达的精确度达到数字化,揭示了染色质组蛋白的新功能。 全世界二百多位专家学者，在为期四天的会上将交流新近问世的DNA测序技术的最新进展，探讨基因组学和基因测序技术在生命科学研究
950万！中国科学院水生生物研究所高通量测序系统采购项目
项目概况 中国科学院水生生物研究所高通量测序系统采购项目 招标项目的潜在投标人应在www.oitccas.com；北京市海淀区丹棱街1号互联网金融中心20层获取招标文件，并于2023年12月18日 09点30分（北京时间）前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号：OITC-G23086
中科院自主研发基因测序技术将实现产业化
2013年国际基因组学大会10月29日在青岛举行。在开幕现场，中国科学院北京基因组研究所与吉林紫鑫药业股份有限公司就合作开发第二代高通量测序系统项目签订投资意向协议，这标志着由中科院自主研发的第二代测序仪项目即将进入市场转化和产业转化阶段。 基因测序技术，自人类基因组计划实施以来长期占据着
单细胞基因组学：通往个体化医疗之门
随着第二代测序技术的普及，单细胞测序迎来了迅猛发展。 近日，南方科技大学生物学系副教授贺建奎在美国冷泉港参加了单细胞分析会议后，在科学网博客里写道：“这是一个非常令人激动的前沿学术会议，我深深地体会到了单细胞基因组学时代的来临。” 他对《中国科学报》表示：“单细胞基因测序技术的突破，只是开了
《自然．通讯》发表华中农业大学水稻表型组学团对成果
2014年10月8日，《自然•通讯》（Nature Communications）发表了我校作物遗传改良国家重点实验室水稻表型组研究团队和华中科技大学生物医学光子学研究中心最新研究成果，题为“结合高通量表型测量技术和全基因组关联分析技术促进水稻遗传结构解析”（Combining high-thr
遗传发育所开发水稻分子育种整合组学知识库
10月18日，中国科学院遗传与发育生物学研究所植物基因组学国家重点实验室梁承志研究组开发的分子育种整合组学知识库水稻子库在线发表于学术期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）。文章题目为MBKbase for rice: an integrated omics knowl
国外田间高通量植物表型平台FieldScan应用案例
随着高通量植物表型测量技术的快速发展，越来越多的研究人员和育种家开始采用这一新兴的技术进行研究。植物表型组学时代已经来临！植物表型组学是一个跨学科的研究领域，它必须与基因组学、生物信息学、大数据计算相结合才能更好的为育种服务。由国际植物表型组织（IPPN）、欧盟植物表型组织（EPPN）和德国植物表型
实验室型高通量植物表型平台简介
实验室型高通量植物表型平台可以全自动、高通量对大量小植株进行成像的系统，可以选择配置可见光（VIS）成像、近红外（NIR）成像、红外（IR）成像、荧光成像或激光扫描3D成像（只适合高度15 cm以下的小植株）中的一种或多种。成像系统带程控移动装置，可以在X轴和Y轴上进行移动，并配有射频或条形码读
昆明植物所山茶属代表植物比较叶绿体基因组学研究获进展
山茶属是山茶科中包含许多举世闻名经济植物的一个重要类群，包括为人类提供天然保健饮料的茶（Camellia sinensis var. assamica 和C. sinensis var. sinensis），健康型高级食用植物油的油茶（C. oleifera）以及观赏花卉云南山茶（C. reti
武汉植物园在裸子植物叶绿体基因组学研究方面获进展
篦子三尖杉(Cephalotaxus oliveri)是我国特有珍稀濒危植物，属裸子植物三尖杉科(Cephalotaxaceae)三尖杉属(Cephalotaxus)。它在三尖杉属中的地位特殊，形态、解剖、胚胎发育、孢粉、核型及分子系统学的研究均支持将其独立成篦子三尖杉组。 松杉类植物
别人家的实验室：植物园里的逆境生物学研究中心
——走进上海中科院植物逆境生物学研究中心 分析测试百科网讯 中国科学院上海植物逆境生物学研究中心坐落于风景优美的上海辰山植物园内，由中央“千人计划”顶尖人才、美国科学院院士朱健康教授领衔，是在中国科学院、上海市和国家有关部委联合支持下，依托中国科学院上海生命科学研究院研究平台，与上
关于基因组高通量测序的技术发展介绍
高通量测序平台(high-throughput_genome_sequence_database) 自从2005年454 Life Sciences公司（2007年该公司被Roche正式收购）推出了454 FLX焦磷酸测序平台（454 FLX pyrosequencing platform）以
高通量DNA测序法可绘制全脑神经连线图
美国神经科学家团队提出了一种全新的革命性方法，以获得小鼠的全脑神经元连接图。相关研究成果刊载于10月23日《公共科学图书馆·生物学》杂志上。
Nature－子刊：用高通量免疫测序诊断病毒感染
药明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 宣布在《自然》子刊《Nature Genetics》上发表创新型研究论文，结果证明可提供一种潜在的新颖方法诊断慢性病毒感染。 Adaptive Biotechnologies 是高通量测序领域的先驱性公司和领军企业之一，其专长
国内首家高通量测序技术创新应用示范中心揭牌
9月1日，解码（上海）生物医药科技有限公司（以下简称“解码DNA”）和深圳华大智造科技股份有限公司（以下简称“华大智造”）举行合作签约仪式，并正式为国内首家“高通量测序技术创新应用示范中心”揭牌。该中心将基于全球最高日通量的基因测序仪DNBSEQ-T7等国产化测序平台，面向长三角地区的高通量测序
华大基因发布最新高通量测序系统BGISEQ50
2016年11月5日，中国深圳——在第十一届国际基因组学大会（ICG-11），全球最大的基因组学研发机构——华大基因发布了其自主研发的高通量台式测序系统BGISEQ-50。这是华大基因继2015年10月24日发布首款桌面型高通量测序系统BGISEQ-500后的又一力作。 华大基因董事长汪建说，
高通量测序技术在无创产前检测中的应用
染色体非整倍体是胎儿出生缺陷最常见病因之一，其中以21-三体综合征、18-三体综合征最为常见，占所有足月妊娠的0.2%~0.3%。对先天性遗传病进行产前筛查和产前诊断是优生优育的重要保证。自1970年以来，针对上述胎儿染色体疾病的产前筛查和产前诊断已逐渐应用到临床上，并在降低出生缺陷方面得到了良好的
Roche－454（GS－FLX－Titanium－System）超高通量测序技术原理
Roche 454（GS FLX Titanium System）超高通量测序技术原理2005年底，454公司推出了革命性的基于焦磷酸测序法的超高通量基因组测序系统——Genome Sequencer 20 System，被《Nature》杂志以里程碑事件报道，开创了边合成边测序的先河。2007