复旦大学樊嘉、孙云帆等团队揭秘转移性肝癌:多组学研究揭示关键分子特征

一支来自中国的团队采用多组学方法,分析了随时间变化的转移性肝细胞癌(HCC)肿瘤内部和跨越肿瘤的分子特征,发现了早期转移性扩散的多样性肿瘤克隆。复旦大学肝癌研究所的肝脏外科研究员孙云帆在一封电子邮件中解释说:“传统上将HCC转移视为疾病的终点。然而,我们的数据显示原发性HCC和转移瘤之间存在高度的遗传分歧,反映出转移前体在进化历史中早期出现。”正如他们在周四在《癌细胞》杂志上报告的那样,共同第一作者孙云帆及其同事依靠外显子测序和RNA测序来分析来自182名转移性HCC(mHCC)患者的461个甲醛固定石蜡埋藏的肿瘤区域,这些肿瘤侵犯了肺、骨、脑、肾、肾上腺、淋巴结、脾脏、膈肌、或腹膜。基于基因组和转录组的特征,研究团队结合数字空间分析(DSP)、组织病理学、T细胞受体库、以及转移性肿瘤的单细胞RNA测序数据,对mHCC肿瘤中的遗传异质性进行了表征。孙云帆说:“尽管监测和治疗策略取得了进展,提高了总体生存率,但转移仍然是导致患者死......阅读全文

癌遗传学

Serial Analysis of Gene Expression (SAGE) SAGE is a powerful tool that allows the analysis of overall gene expression patterns with digital analysis. 

靶向治疗肺癌,从表观遗传学水平抑制肿瘤基因表达

   非小细胞肺癌是世界范围内导致癌症致死的主要杀手,应用拓扑异构酶II抑制剂依托泊苷只对一小部分患有非小细胞肺癌的病人具有良好疗效,因此,改变药物作用靶点愈来愈成为药物治疗该疾病的重中之重。之前有研究表明,EZH2能与PRC2共同作用对H3K27进行三甲基化,从而起到基因沉默的作用,因此甲基转移酶

Nat-Rev-Cancer综述:肿瘤蛋白质基因组学

导 读       肿瘤蛋白质基因组学(Cancer proteogenomics)是将基于质谱(MS)的蛋白质丰度和翻译后修饰(PTM)信息与临床前肿瘤模型和肿瘤样本的基因组、表观基因组和转录组数据相结合的组学技术。基因组学和表观基因组学为解释可能发生的生物过程提供了基础知识,蛋白质组学是对已经发

新观点|死亡肿瘤细胞或助肿瘤“卷土重来

  上海仁济医院肝脏外科主任夏强教授团队的研究提出了肿瘤免疫新观点,死亡肿瘤细胞可能会协助肿瘤“卷土重来”。  中国专家提出肿瘤免疫新观点:死亡肿瘤细胞或助肿瘤“卷土重来  肿瘤细胞的死亡是否意味着肿瘤生物学事件的终结?上海交通大学医学院附属仁济医院15日披露,该院肝脏外科主任夏强教授团队的研究提出

肝癌肿瘤5公分算几期?

核心提示: 相信大家对于肝癌都有一定的了解,这种疾病的危害性非常大,但是由于它初期的症状并不明显,所以很容易造成病情的耽误,这样就会导致患者错过最佳的治疗时间,从而治疗造成非常大的困难。所以对于这种疾病,我们要采取早发现早治疗的原则,千万不要耽误病情,以免疾病发展到晚期,那样会造成严重的后果。

免疫学实验肿瘤特异性生长因子介绍

肿瘤特异性生长因子介绍:  肿瘤特异性生长因子(lumor specific growth factor, TSGF)是恶性肿瘤形成和生长过程中,促使肿瘤及周边毛细血管大量增殖并释放到外周血液中的因子,是恶性肿瘤及周边毛细血管大量扩增的结果。肿瘤特异性生长因子正常值:  正常值是0-64U/ml肿瘤

遗传学大牛Nature子刊发布基因组编辑新工具

生物医学研究和基因治疗需要非常精确的基因组编辑技术。哈佛医学院的研究人员为此开发了一种新的基因组编辑工具。这个重要成果十一月二日发表在Nature Communications杂志上,文章通讯作者是著名遗传学George Church和Luhan Yang。近年来基于核酸酶的基因组编辑工具特别火,比

遗传学大牛Nature子刊发布基因组编辑新工具

  生物医学研究和基因治疗需要非常精确的基因组编辑技术。哈佛医学院的研究人员为此开发了一种新的基因组编辑工具。这个重要成果十一月二日发表在Nature Communications杂志上,文章通讯作者是著名遗传学George Church和Luhan Yang。  近年来基于核酸酶的基因组编辑工具特

基因组“暗物质”挑战遗传学中心法则?

1953年,DNA双螺旋模型的提出标志着近代分子生物学的诞生。1957年,弗朗西斯·克里克进一步提出了经典的遗传学中心法则,开启了分子生物学时代。经过几十年的研究,科学家对于非编码RNA的认知极大丰富了人类对中心法则的理解。从广义上讲,非编码RNA在真核生物转录组中占据了非常大的部分,包括小RNA、

遗传学大牛将合成完整人类基因组?

  上周,哈佛医学院的著名遗传学家George Church和小伙伴们悄悄邀请了130名科学家、律师、企业家和政府官员,在波士顿召开了一次不对外公开的基因组会议。据说,他们在会议上探讨了体外合成完整大基因组的可行性,以及相关项目的实施。Church后来提供给STAT News的一份声明指出,这样的尝

与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有何优点

那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点:①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易;②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于基因和蛋白的数目.③ 由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的,所以研究

上海仁济医院团队发现死亡肿瘤细胞或助肿瘤卷土重来

  2017年5月8日,国际免疫学最权威杂志《Nature Reviews Immunology》(IF=39.416)在线发表了上海交通大学医学院附属仁济医院肝脏外科主任夏强教授团队撰写的题为“Immunosuppressive cell death in cancer”的论文(correspon

免疫组化、Western、ELISA免疫学三大工具的差异分析

对于IHC来说,定位是免疫组化最大的优势该方法可在组织和细胞中进行抗原的准确定位,因而可同时对不同抗原在同一组织或细胞中进行定位观察,这样就可以进行形态与功能相结合的研究,相比于其他蛋白检测方法,免疫组化具有定位较直接准确、定性灵敏度高,是定位检测分析首选方法对病理学领域开展深入研究是十分有意义,尤

免疫学词汇免疫学检测

免疫学检测是机体识别“自身”与“非己”抗原,对自身抗体形成天然免疫耐受,对“非己”抗原产生排斥作用的一种生理功能的检测。正常情况下,这种生理功能对机体有益,可产生抗感染、抗肿瘤等维持机体生理平衡和稳定的免疫保护作用。在一定条件下,当免疫功能失调时,也会对机体产生有害的反应和结果,如引发超敏反应、自身

导致肝癌的易感基因区域被发现

  军事医学科学院院长、中国科学院院士贺福初领衔的蛋白质组学国家重点实验室,在肝癌研究领域又有重大科学发现。日前,在军事医学科学院蛋白质组学国家重点实验室功能基因组学课题组的带领下,国内多家单位合作,在人类染色体的一个特殊位置发现了一个容易导致肝癌的易感基因区域。   该课题组组长周

上海交大教授最新发表Nature综述文章

  上海交通大学医学院附属仁济医院,美国癌症研究所的研究人员发表了题为“Immunosuppressive cell death in cancer”的文章,提出了肿瘤免疫新观点,即死亡肿瘤细胞可能会协助肿瘤“卷土重来”。论文强调,深入研究肿瘤细胞死亡的方式及其对免疫系统的影响,并充分考虑肿瘤局部、

我国科学家发现人体内导致肝癌的易感基因

  由解放军军事医学科学院院长、中国科学院院士领衔的蛋白质组学国家重点实验室在肝癌研究领域又有重大科学发现:在人类染色体的一个特殊位置发现了一个容易导致肝癌的易感基因区域。相关研究成果在线发表于2日的《自然—遗传学》(Nature Genetics)。  肝癌仍是目前临床上治疗效果最不理想

上海交大教授最新发表Nature免疫学综述文章

  上海交通大学医学院附属仁济医院,美国癌症研究所的研究人员发表了题为“Immunosuppressive cell death in cancer”的文章,提出了肿瘤免疫新观点,即死亡肿瘤细胞可能会协助肿瘤“卷土重来”。论文强调,深入研究肿瘤细胞死亡的方式及其对免疫系统的影响,并充分考虑肿瘤局部、

《自然》子刊-阻断PDL1蛋白合成显著抑制致命肝癌生长

图片来源于网络  日前,加州大学旧金山分校(UCSF)的研究人员在《Nature Medicine》上发表的一项重磅研究表明,使用遗传学方法或者一种在研药物抑制PD-L1蛋白的合成,在肝癌的小鼠模型中不但延缓了肿瘤的生长,而且成功阻断了肿瘤逃避免疫反应的能力。这项研究可能为治疗肝癌带来新的药物开发策

单细胞组学解码泛癌肿瘤微环境中的T细胞

T细胞是最关键的抗肿瘤免疫细胞。肿瘤微环境中存在“肿瘤浸润T细胞”亚群,能够对肿瘤抗原产生反应,肩负着清除肿瘤细胞的重任,也是摧毁癌细胞的“主力军”。然而,随着肿瘤发展,这些英勇的“战士”常常陷入功能失调状态,“战斗力”大幅下降,被科学家称为“T细胞耗竭”。越来越多的证据表明,不同癌症的肿瘤微环境对

应用转录组学-为更多的患者量身定制精确的肿瘤药物。

  WINTHER试验(WINTHER trial),编号NCT01856296,是由Vall d'Hebron肿瘤学研究所(西班牙)、Chaim Sheba医学中心(以色列)、Gustave Roussy(法国)、Léon Bérard中心(法国)、麦吉尔大学Segal癌症中心(加拿大)、

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?       代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

牦牛基因组研究成果揭示高原适应的遗传学机制

  由兰州大学主导、深圳华大基因研究院以及中科院昆明动物所等多家单位联合完成的牦牛基因组研究成果于7月1日在国际著名杂志《自然-遗传学》(Nature Genetics)上在线发表(http://www.nature.com/ng/journal/vaop/ncurrent/full/ng.23

胡伟:用基因组学技术,绘制热作遗传改良蓝图

近年来,海南省坚定不移地加快建设中国特色自由贸易港,大力发展“四大主导产业”,精心培育“三大未来产业”,不断夯实实体经济基础,形成结构更合理、支撑更稳固、竞争力更强、效益更好的现代产业体系。  未来,海南将立足国家战略,发挥资源优势,聚焦“专精特新”,以超常规的努力打一场科技创新攻坚战,全面推进创新

孙方霖:表观遗传学-后基因组时代的领舞者

DNA双螺旋的解码者、诺贝尔奖获得者Watson说:“你可以继承DNA序列之外的一些东西。这正是现在遗传学中让我们激动的地方。” 不久前,美国国立卫生研究院利用由“路标计划”管理的新基金,启动了表观基因组学研究计划,一批表观遗传学项目和研究人员将获得数百万到上千万美元的经费支持。几乎在同时,国家自然

基于质谱分析技术的蛋白质组学检测法能更有效识别肝癌

随着丙型肝炎病毒感染的不断发生,肝癌病例不断增加,这就急需一种针对肝癌的早期诊断方法。 一项发表在1月15日《临床癌症研究》(Clinical Cancer Research)杂志上的研究性文章称,一种基于质谱分析技术的蛋白质组检测比传统的生物标志物检测更为准确,可以更好地区分肝癌患者和丙型肝炎肝硬

安捷伦授予深耕免疫肿瘤学的Antoni-Ribas教授“思想领袖奖”

这位著名的黑色素瘤医生-研究员因在癌症基因组学和免疫疗法领域的研究而荣获该表彰  2019年4月25日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)日前宣布将“安捷伦思想领袖奖”授予Antoni Ribas教授,为他在基因组学和免疫疗法领域的研究提供支持。Ribas博士是一位著名的肿瘤学家,他目前正使用