单细胞数据挖掘算法方面取得新进展
图 SEVtras高效识别单细胞转录组数据中的胞外小囊泡 在国家自然科学基金项目（批准号：32025009、32130020等）资助下，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在单细胞数据挖掘算法方面取得新进展，研究成果以“SEVtras识别单细胞转录组中液滴分辨率的胞外小囊泡（SEVtras delineates small extracellular vesicles at droplet resolution from single-cell transcriptomes）”为题，于2023年12月4日在《自然•方法》（Nature Methods）杂志发表。论文链接：https://www.nature.com/articles/s41592-023-02117-1。 胞外小囊泡是由细胞分泌的微小囊泡，携带蛋白质、脂质和RNA等多种内容物，广泛存在于组织微环境中，充当细胞间信息交流的“信使”角色。胞外小囊泡在癌细胞转移......阅读全文
冻干细胞外囊泡治疗干眼病研究获进展
干眼病是常见的眼部疾病，全球数以百万计的人群受到这一疾病的影响。细胞外囊泡具有干眼病治疗潜力，但因储存稳定性等问题，其临床应用受到限制。因此，亟需开发新的治疗策略，以实现长期管理。针对上述问题，中国科学院上海药物研究所研究员张继稳团队提出新的策略——将天然渗透调节剂依克多因作为保护剂应用于牛乳源细胞
肿瘤细胞外囊泡DNA分子逻辑运算研究获进展
近日，中国科学院国家纳米科学中心孙佳姝课题组与上海交通大学教授韩达课题组、中国人民解放军总医院第五医学中心教授张少华合作，在肿瘤细胞外囊泡DNA分子逻辑运算与乳腺癌分子分型研究方面取得进展。相关研究成果以Molecular Identification of Tumor-Derived Extr
使用CytoFLEX流式细胞仪检测囊泡/外泌体
囊泡/外泌体天然存在于体液中，并稳定携带了一些重要的信号分子。囊泡/外泌体相关功能的研究已经成为研究热点，并有望在多种疾病的早期诊断中发挥作用。通常，因流式细胞仪无法检测低于 250nm 的颗粒，因而并不是检测囊泡/外泌体微颗粒的最佳选择。而贝克曼库尔特公司的 CytoFLEX 流式细胞仪的问世，为
牛乳细胞外囊泡健康功能研究方面取得新进展
日前，中国海洋大学食品科学与工程学院易华西教授团队与新加坡国立大学王炯伟教授团队合作，在生物医学1区杂志《Theranostics》（2020 IF： 11.556）上发表题为“Milk-derived extracellular vesicles alleviate ulcerative co
家蚕丝腺单细胞转录组图谱绘成
中新网重庆6月15日电 (记者 钟旖)记者15日从家蚕基因组生物学国家重点实验室(西南大学)获悉，我国家蚕研究又有新进展。该实验室徐汉福教授课题组近日在国际知名期刊Nature Communications《自然通讯》上发表相关主题研究论文，以单细胞分辨率揭示了家蚕丝腺的全细胞异质性及其基因转
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序，它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序，它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达，能准确区分细胞群体，并进行细胞分类间比较，以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序，它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序，它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达，能准确区分细胞群体，并进行细胞分类间比较，以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序，它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序，它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达，能准确区分细胞群体，并进行细胞分类间比较，以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞转录组重要研究文献汇总（一）
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
单细胞转录组重要研究文献汇总（二）
4.单细胞转录组测序在植物领域崭露头角相比动物的单细胞研究，由于植物具有细胞壁的特点，使得植物的单细胞研究相比较难，但是继2月份的拟南芥根组织单细胞转录组学研究[8]，本月在《Developmental Cell》上又发表了一篇基于拟南芥根组织的单细胞转录组学研究报道[9]。来自德国图宾根大学植
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序，它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序，它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达，能准确区分细胞群体，并进行细胞分类间比较，以及能找到稀有的细胞的表达情况。
液滴微流控：单细胞高通量液滴测序（Dropseq）
细胞是生物结构与功能的基本单位，形态类型千差万别。通过细胞基因组学，可以描述细胞特性及功能，本文所介绍的单细胞（single-cell）高通量液滴测序（Drop-seq）技术，是一种快速分析成千上万个单细胞的方法，通过将每个细胞包裹在纳升级微滴中，进行RNA杂交并生成mRNA转录物，制作细胞基因表达
基于血清细胞外囊泡微生物组标记物的胰腺癌诊断机器学习模型
胰腺癌，这个 “癌症之王”，一直让医学界头疼不已。它极其善于 “伪装”，在早期几乎没有明显症状，等到患者察觉到身体不适时，往往已经发展到了晚期。目前，胰腺癌的 5 年生存率还不到 8%，主要原因就是缺乏有效的早期筛查手段。传统的检测方法，要么准确性不高，要么对患者身体有创伤，很难满足临床需求。在这样
Nature子刊：检测癌症特异性突变的新探针
来自美国宾州大学，东南大学的研究人员发表了题为“Rapid magnetic isolation of extracellular vesicles via lipid-based nanoprobes”的文章，研发出了一种新颖的脂质纳米探针方法，可以快速、经济且高效地分离纳米级的胞外囊泡（nE
Nature子刊：检测癌症特异性突变的新探针
来自美国宾州大学，东南大学的研究人员发表了题为“Rapid magnetic isolation of extracellular vesicles via lipid-based nanoprobes”的文章，研发出了一种新颖的脂质纳米探针方法，可以快速、经济且高效地分离纳米级的胞外囊泡（nE
Nature－Communications：微流控捕获脑肿瘤脱落的细胞外囊泡
精确的癌症治疗依靠获得有关肿瘤的分子信息来指导有效的治疗决策。由于脑肿瘤的针头活检是侵入性的且困难的，因此生物工程师已经开发了捕获脑肿瘤释放的细胞外囊泡(EV)的微技术。囊泡携带突变的遗传物质和蛋白质样品，引起恶性肿瘤，研究人员希望对其进行分析以优化治疗方法。 尽管它们携带大量信息，但来自肿瘤
血管生成细胞外囊泡的分泌依赖于这一蛋白！
肿瘤缺氧是实体肿瘤的一个标志，与肿瘤进展、转移发展和治疗抵抗有关。作为对缺氧的反应，肿瘤细胞分泌促血管生成因子，诱导血管形成，恢复缺氧区域的氧气供应。细胞外小泡(EVS)是肿瘤微环境中细胞间通讯的媒介。在这里，作者证明了LC3/GABARAP蛋白家族成员GABARAPL1的表达增加是内体成熟、分
细胞外囊泡介导的eNAMPT系统性递送有望抗衰老
近日，华盛顿大学医学院的研究人员发现了一种存在于人和小鼠等动物体内的酶-细胞外烟酰胺磷酸核糖转移酶(extracellular nicotinamide phosphoribosyltransferase，eNAMPT)，当把年轻小鼠的eNAMPT注入老年小鼠时，可有效防止衰老相关的功能下降和疾
玉米单细胞转录组测序，11种细胞类型
近日，广东省科学院南繁种业研究所生物育种研究室在玉米单细胞转录组测序研究方面取得新进展。相关研究在线发表于《作物学报》（The Crop Journal）。广东省科学院南繁种业研究所李旭辉博士为该论文第一作者，齐永文研究员为通讯作者。玉米是全球重要的粮食和能源作物，而其产量形成的基础依赖其特殊的根系
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
高通量单细胞转录组测序发展与展望
单细胞转录组测序技术这几年的发展之快，运用之广已众所周知。为更好的在国内推广该技术，也为更好的将该技术运用到广大科研工作者的实际工作中，上海生物芯片有限公司生物信息团队通过对该技术的整理和归纳，在《生命科学》杂志上发表了名为“高通量单细胞转录组测序发展与展望”综述文章，希望能进一步提升科研工作者对该
单细胞转录组制备仪的技术指标
将 C1 应用于单细胞 mRNA 测序，可以从多个细胞个 体平行处理多达 96 个 cDNA 文库，在任何 Illumina 测序仪上对 mRNA表达进行相对定量。此系统的主要特征包括： 高通量 -可对 96 个单细胞进行大规模平行、连贯的制备， 引入条形码序列标记（Barcode），可将测序
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析，在上一篇中，我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容（具体内容查看链接）。在这里，我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。细胞谱系分析，最简明的理解就是细胞领域的进化树，通常指的是某类祖源细胞，在特定条件下，有多个发育轨迹和
倾听细胞的低语，胞外体研究指南
人们往往以为，血液、尿液、乳汁和脑脊液这些体液系统是均匀的，不过事情并非这么简单。蛋白（和核酸）的确能够在这些体液系统中自由流动。但也有一些生物分子被包裹在脂质囊泡中，这些囊泡被称为胞外体。近年来研究者们渐渐发现，这些胞外体中含有大量可以成为生物学指标的分子。 本文针对胞外体的研究价值、研究现
Apogee超灵敏流式在微小颗粒检测领域的应用
Apogee超灵敏流式分析仪，整合了最先进的光学、电子和流体学技术，具有超高的散射光灵敏度（70nm）和分辨率（10nm），不仅可以应用于细胞分析，还擅长微小颗粒的分析与检测，其在微生物、病毒学、肿瘤学和干细胞微囊泡及外泌体等多个领域均有着广泛的应用。 1.纳米材料1.1.乳胶和二氧化硅混合物的检测
水稻种子细胞外囊泡对种子活力影响机制获揭示
广东省农业科学院农业生物基因研究中心植物种质资源团队在广东省重点研发专项、广东省科技创新战略专项等项目的资助下，研究揭示了水稻种子细胞外囊泡对种子活力影响的可能机制。相关成果近日在线发表于《国际分子科学杂志》（International Journal of Molecular Sciences）。
新方法有望实现细胞外囊泡的精确测量和荧光成像
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500250.shtm5月4日，中国科学院深圳先进技术研究院杨慧研究员团队在化学综合性学术期刊《中国化学快报》上发表了最新研究成果。科研团队提出了一种基于微纳流控平台的细胞外囊泡荧光标记新策略，以实现细胞外
王建斌/黄岩谊合作组比较液滴超高通量单细胞RNA测序
自2009年汤富酬研究员首次报道其开创性工作【1】以来，单细胞RNA测序技术已经逐渐成为生物医学研究的重要方法，其在发育生物学和干细胞领域展现出强大的应用前景。随着单细胞转录组扩增方法的不断优化，以及测序通量的持续提升，研究人员已经不再满足于几十甚至几百个单细胞所提供的信息量。2015年以来，一
胞外转录反应
实验概要RNA聚合酶由一条多胜肽 (polypeptides)所构成，其在进行转录反应时所须辨认的启动子长度仅20bp左右，而且转录起始位置非常明确，转录效能良好，成了目前进行胞外转录反应时的最佳选择。要进行胞外转录反应时，仅需将目标基因次选殖 (subclone)至带有SP6，T3或T7启动