单细胞数据挖掘算法方面取得新进展
图 SEVtras高效识别单细胞转录组数据中的胞外小囊泡 在国家自然科学基金项目（批准号：32025009、32130020等）资助下，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在单细胞数据挖掘算法方面取得新进展，研究成果以“SEVtras识别单细胞转录组中液滴分辨率的胞外小囊泡（SEVtras delineates small extracellular vesicles at droplet resolution from single-cell transcriptomes）”为题，于2023年12月4日在《自然•方法》（Nature Methods）杂志发表。论文链接：https://www.nature.com/articles/s41592-023-02117-1。 胞外小囊泡是由细胞分泌的微小囊泡，携带蛋白质、脂质和RNA等多种内容物，广泛存在于组织微环境中，充当细胞间信息交流的“信使”角色。胞外小囊泡在癌细胞转移......阅读全文
胞外转录反应
实验概要RNA聚合酶由一条多胜肽 (polypeptides)所构成，其在进行转录反应时所须辨认的启动子长度仅20bp左右，而且转录起始位置非常明确，转录效能良好，成了目前进行胞外转录反应时的最佳选择。要进行胞外转录反应时，仅需将目标基因次选殖 (subclone)至带有SP6，T3或T7启动
单细胞转录组测序研究热点和发文锦囊
从Top50期刊2000余篇文献统计： 在刚刚发布的“十四五”规划中，“基因与生物技术”作为前沿科技攻关领域之一。而在这个领域，近年来最具里程碑的技术突破必然不能忽略“单细胞转录组测序”。本文通过对PubMed数据库中Top50期刊的共计2357篇单细胞转录组测序的引文进行数据分析，帮助读者了
杨树次生木质部单细胞转录组图谱建立
近日，北京林业大学教授张德强团队在《植物生物技术杂志》发表研究论文。该研究以杨树为研究模式，利用单细胞测序技术、基因组分析、RNA原位杂交、愈伤组织遗传转化等技术建立了杨树次生木质部的单细胞转录组图谱，重构了完整的杨树次生木质部细胞类群，鉴定了调控木质部发育过程的关键转录因子，系统解答了次生木质
台式扫描仪实现高通量单细胞外囊泡分泌分析
近日，中科院大连化物所单细胞分析研究组（1820组）陆瑶研究员团队在高通量单细胞外囊泡分泌分析技术研究中取得新进展，利用台式扫描仪实现了高通量单细胞外囊泡分泌分析。 细胞是生命存在的基础，细胞研究是探索生命健康与疾病的基本条件和起点。长期以来，人们假定细胞群是同类的，但是越来越多的研究表明，即
台式扫描仪实现高通量单细胞外囊泡分泌分析
近日，中国科学院大连化学物理研究所单细胞分析研究组研究员陆瑶团队在高通量单细胞外囊泡分泌分析技术研究中取得新进展，研究利用台式扫描仪实现了高通量单细胞外囊泡分泌分析。 近年来，单细胞分析技术迅速发展并推动了生物医学的研究，然而目前大部分单细胞分析技术依赖体积庞大、价格昂贵的仪器进行单细胞计数以
Cell：纤毛G蛋白偶联受体与细胞外囊泡之间信号转导调控
纤毛（cilium）是一种细胞表面比细胞小5000倍的小仓室，集中了Hedgehog信号传导、视觉、嗅觉和体重稳态的受体。通过维持其自身的第二信使环状AMP（cAMP）和Ca2+的浓度，纤毛为信号分子提供了独特的反应条件，这些信号分子在通路激活时动态进入和离开纤毛。例如，Hedgehog通路的激
基于细胞外囊泡的表面蛋白检测方法实现肝癌早筛早诊
全球范围内，肝细胞癌（Hepatocellular Carcinoma, HCC）在肿瘤中的发病率排在第六位，但死亡率却高居前三。肝癌的发病大多遵循肝炎－肝硬化－肝癌的“三步曲”模式，肝硬化患者是肝癌最主要的高危人群，在肝硬化人群中及早发现肝癌是当前肝癌早筛的重中之重。目前对肝癌高危人群早筛的方
外泌体和微囊泡：使用NTA技术测定浓度、粒径大小和表型
人们的关注点更多地集中在微囊泡和外泌体，因为它们正越来越多的被引用为一个潜在的生物标记。 虽然在这一新兴领域内的定义还不够正式，但这两类生物纳米颗粒都可以通过其粒度范围和生物起源加以区分。 通常，微泡的直径为100 nm至1 μm，而外泌体的直径为30 nm -100 nm。 微泡一般是通过细
外泌体和微囊泡：使用NTA技术测定浓度、粒径大小和表型
简介人们的关注点更多地集中在微囊泡和外泌体，因为它们正越来越多的被引用为一个潜在的生物标记。 虽然在这一新兴领域内的定义还不够正式，但这两类生物纳米颗粒都可以通过其粒度范围和生物起源加以区分。 通常，微泡的直径为100 nm至1 μm，而外泌体的直径为30 nm - 100 nm。 微泡一般
外泌体和微囊泡：使用NTA技术测定浓度、粒径大小和表型
人们的关注点更多地集中在微囊泡和外泌体，因为它们正越来越多的被引用为一个潜在的生物标记。 虽然在这一新兴领域内的定义还不够正式，但这两类生物纳米颗粒都可以通过其粒度范围和生物起源加以区分。 通常，微泡的直径为100 nm至1 μm，而外泌体的直径为30 nm - 100 nm。 微泡一般是通过细胞质
Nature子刊：揭示肝星状细胞外泌己糖激酶HK1加速肝癌机制
厦门大学生命科学学院吴乔课题组课题组在 Nature Metabolism 期刊发表了题为：HK1 from hepatic stellate cell-derived extracellular vesicles promotes progression of hepatocellular car
单细胞测序新技术：同时分析转录组和甲基化组
单细胞转录组和甲基化组分析已经成为了单细胞研究的强大工具。然而，在单细胞中揭示DNA甲基化与基因表达的直接关联还比较困难。这是因为细胞之间存在较大的差异，又不能同时检测一个细胞的转录组和甲基化组。加州大学范国平教授和同济大学薛志刚教授领导团队解决了这个问题。他们在Genome Biology杂志上发
－杨祝良研究组为囊泡杯伞属验明正身
囊泡杯伞属真菌。 囊泡杯伞属是蘑菇目口蘑科真菌，部分物种是重要的食用菌，因其菌盖和菌柄表面具有囊泡状的膨大细胞，有人将其独立成属，但其属级地位一直饱受争议。 很久以来，在我国东北市场上白漏斗囊泡杯伞这个种一直作为野生食用菌出售，但却没有一个可靠的科学名称。 近日，中国科学院东亚植物多样性与生物
囊泡运输和膜泡运输是什么关系
囊泡运输和膜泡运输的英文都是vesicular transport，由于翻译的缘故产生的中文差异。指的都是蛋白质通过不同类型的转运小泡从糙面内质网合成部位转运至高尔基体，进而分选到细胞的不同部位，其中涉及到不同的运输小泡的定向转运，以及膜泡出芽与融合的过程。在细胞分泌和胞吞途径中都有膜泡运输。囊泡运
利用台式扫描仪实现高通量单细胞外囊泡分泌分析
近日，中国科学院大连化学物理研究所单细胞分析研究组研究员陆瑶团队在高通量单细胞外囊泡分泌分析技术研究中取得新进展，研究利用台式扫描仪实现了高通量单细胞外囊泡分泌分析。 近年来，单细胞分析技术迅速发展并推动了生物医学的研究，然而目前大部分单细胞分析技术依赖体积庞大、价格昂贵的仪器进行单细胞计数以
同济大学发表单细胞转录组研究新成果
人类大脑是极为复杂的，数十亿神经元形成的庞大网络控制着我们的行为和情感。正因如此，解析神经回路的分子基础并不是一件容易的事。过去人们大多是在一块脑组织上进行遗传学和表观遗传学图谱分析，但这样的方法往往无法提供足够的精确性。 同济大学医学院的研究团队将电生理学技术与单细胞转录组分析结合起来，揭示
人类脑细胞的单细胞转录组测序研究成果
人脑是由多种不同类别细胞组成的极其复杂的器官。传统的细胞分类方法只能根据少数已知的细胞的标记分子（marker）对细胞进行分类，对每一类细胞的认识也非常有限。斯坦福大学的著名学者Stephen Quake及其团队利用单细胞测序技术，对466个人大脑皮层的单细胞进行了转录组测序，通过数据分析发
研究人员绘制七鳃鳗单细胞转录组图谱
雷氏七鳃鳗作为现存的无颌脊椎动物代表，是一种由无脊椎动物向脊椎动物进化的过渡类型，被视为研究脊椎动物演化的重要模式生物。近日，华大生命科学研究院联合辽宁师范大学七鳃鳗研究中心等单位在《自然—通讯》发表最新研究成果，团队基于华大自主研发的DNBelab C4和 DNBSEQ测序平台，采用单细胞RNA测
单细胞转录组测序构建胸腺器官发生的分子图谱
2019年10月8日，四川大学胡洪波研究组、解放军总医院第五医学中心刘兵研究组与暨南大学基础医学院兰雨研究组合作在Immunity杂志在线发表了题为“Single-cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thy
皮脂腺的简介和分类
皮脂腺是由腺泡与短的导管构成的全浆分泌腺，皮脂腺导管开口于毛囊。除手外的其余部位皮肤中均有皮脂腺，前额、鼻、背上部的皮脂腺最多，称为皮脂溢出部位。其余的部位比较少，掌、足趾及足背没有皮脂腺。 皮脂腺大多位于毛囊及立毛肌之间，由一个或几个囊状的腺泡与一个共同的短导管构成。分泌部呈囊泡状，由多层腺
Science揭示囊泡的复杂外衣
要维持正常的生命活动，真核生物必须通过囊泡运输来转移物资。因此，囊泡运输的具体机制一直受到研究者们的广泛关注。日前，欧洲分子生物学实验室EMBL的研究人员采用尖端技术揭示了囊泡表面复杂的蛋白质包被，这一成果发表在七月十日的Science杂志上。 蛋白质是细胞功能的执行者，它们在核糖体合成之后，
最新！通过神经细胞相关的特异性细胞外囊泡评估AD进展
阿尔茨海默病(AD)是一种广泛性神经退行性脑疾病，与其他类型的痴呆症一起，它影响着全球约4400万人。近年来，细胞外囊泡(EV)在生理和病理条件下的细胞间通讯中发挥着重要作用，引起了研究者的广泛关注。 越来越多的证据表明，从脑组织和生物液体中分离出来的EV会被包括AD在内的神经退行性疾病动态地
小泡运输的概念
蛋白质从内质网转运到高尔基体以及从高尔基体转运到溶酶体、分泌泡、细胞质膜、细胞外等则是由小泡介导的，这种小泡称为运输小泡(transport vesicles)。
EXOC2基因的结构特点及主要作用
该基因编码的蛋白质是胞外囊复合物的一个组成部分，胞外囊复合物是一种多蛋白复合物，是胞外囊泡极化靶向细胞膜上特定对接位点所必需的虽然在酵母中表现最好，但在高等真核生物中，外囊复合体的组成蛋白和功能已被证明是高度保守的包括这种蛋白在内，至少有八种胞外复合物成分被发现与肌动蛋白细胞骨架重塑和囊泡转运机制相
花生光暗幼苗的单细胞转录组图谱构建成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518535.shtm近日，广东省农业科学院作物研究所花生研究团队与合作者，在花生光暗形态转变的单细胞基因表达谱研究方面取得进展，成功构建的花生光暗幼苗的单细胞转录组图谱。相关成果发表于《植物生物技术杂志》
研究成果：灵长类海马衰老的单细胞转录组图谱绘制
海马体作为脑的重要组成部分，在学习和记忆中发挥重要作用。随着年龄增长，海马功能逐渐退化，导致认知功能的减退以及多种人类神经退行性疾病发生。由于海马结构复杂，细胞组成具有高度异质性，传统研究技术难以精确揭示海马衰老过程中不同细胞类型的衰老规律及分子调控网络。此外，由于伦理及样本来源的限制，不同年龄
单细胞转录组揭秘玉米根系对热胁迫的响应机制
近日，中国农业科学院生物技术研究所玉米功能基因组创新团队首次在单细胞水平解析了玉米根系细胞对热胁迫的特异性响应机制，揭示了热胁迫下植物根系的细胞异质性、根系类型的差异和分化轨迹，鉴定了单双子叶植物响应热胁迫的关键核心基因，相关研究成果发表于《自然—通讯》（Nature Communications）
科学家开发单细胞全转录组测序新技术
北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组在《美国科学院院刊》（PNAS）上发表题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的论文。该研究利用微流控芯片技术实现了高质量单细胞的全转录组测序样品准备，全面提高了单细胞全
新型微流控芯片可提高单细胞转录组测序效率
近日，中国科学院深圳先进技术研究院医工所微纳系统与仿生医学研究中心研究员陈艳和南加州大学教授钟江帆合作，在针对稀有细胞样本的单细胞测序技术方面取得新进展。相关研究成果以Improving single-cell tranome sequencing efficiency with a microfl
近期外泌体重要研究成果一览！
本文中，小编整理了近期科学家们在外泌体相关研究领域取得的重要研究成果，与大家一起学习！ 图片来源：Nature 【1】Nature：一种特殊的“诱饵”外泌体机制或能保护宿主抵御细菌感染 doi：10.1038/s41586-020-2066-6 近日，一篇发表在国际杂志Nature上的研