科学家绘制小细胞肺癌蛋白基因组学图谱

肺癌是全球癌症致死的首位原因,而小细胞肺癌约占肺癌总数的15%,是所有肺癌亚型中恶性程度最高、预后最差的亚型,5年生存率仅为5%。与非小细胞肺癌形成鲜明对比,小细胞肺癌的治疗手段单一,患者总生存率低。分子表征与组学研究不足,限制了小细胞肺癌的基础研究和临床进展,迄今为止,仅有少量针对小细胞肺癌临床样本的基因组研究被报道。小细胞肺癌普遍存在TP53和RB1的失活突变。缺乏驱动突变使得研究难以通过基因突变信息获得有效靶点和分子分型。蛋白质作为生命功能的执行者,是95%以上药物的作用靶点。目前,缺乏从蛋白质组层面对小细胞肺癌的系统研究,因此全面系统地表征小细胞肺癌的蛋白质组学图谱,利于剖析小细胞肺癌的病理机制,对于实现更精准的小细胞肺癌分子分型和个性化治疗具有重要意义。 1月5日,《细胞》(Cell)在线发表了中国科学院上海药物研究所研究员周虎团队,与同济大学附属上海市肺科医院教授张鹏团队、中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究......阅读全文

与肺癌相关的AREG基因编码功能描述

这个基因编码的蛋白质是表皮生长因子家族的一员。它是一种自分泌生长因子,也是星形细胞、雪旺细胞和成纤维细胞的有丝分裂原。与表皮生长因子(egf)和转化生长因子α(tgfα)有关。该蛋白与EGF/TGFα受体相互作用,促进正常上皮细胞的生长,抑制某些侵袭性癌细胞系的生长。在乳腺、卵母细胞和骨组织发育中也

与肺癌相关的PRKACA基因编码功能描述

该基因编码蛋白激酶A的一个催化亚单位,作为一种具有两个调节亚单位和两个催化亚单位的四聚体全酶以非活性形式存在。cAMP使非活性全酶解离成一个调节亚单位二聚体,与四个cAMP和两个自由单体催化亚单位结合。人类已鉴定出四种不同的调节亚单位和三种催化亚单位。蛋白激酶A的cAMP依赖性磷酸化对许多细胞过程,

与肺癌相关的CBL基因编码功能描述

这个基因是一个原癌基因,编码一个无名指E3泛素连接酶。编码蛋白是蛋白酶体降解底物所需的酶之一。该蛋白介导泛素从泛素结合酶(E2)转移到特定底物。该蛋白还包含一个N端磷酸酪氨酸结合域,使其与许多酪氨酸磷酸化底物相互作用,并以蛋白酶体降解为靶点。因此,它作为许多信号转导途径的负调节器发挥作用。该基因在包

与肺癌相关的GNAS基因编码功能描述

GNAS作为一个重要的信号转导蛋白,主要功能是在G蛋白偶联受体信号转导途径中,激活腺苷酸环化酶,导致cAMP水平的升高,参与调控细胞生长和细胞分裂。

与肺癌相关的KRAS-基因编码功能描述

KRAS (Kirsten Rat Sarcoma Viral Oncogene Homolog)基因是GDP/GTP结合蛋白,比较重要的同家族基因还包括HRAS和NRAS。KRAS与GTP结合呈激活状态,与GDP结合呈关闭状态,KRAS可被生长因子或酪氨酸激酶(如EGFR)短暂活化,活化后的KRA

与肺癌相关的ATM基因编码功能描述

ATM基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,这种蛋白是一种重要的细胞周期检查点激酶,通过磷酸化调控下游一系列重要蛋白,包括抑癌蛋白p53和BRCA1、检查点激酶CHK2、检查点蛋白RAD17和RAD9以及DNA修复蛋白NBS1。ATM和与其密切相关的蛋白ATR被认为是在细胞周期调控以及DNA损伤

与肺癌相关的RICTOR基因编码功能描述

Rictor和Mtor(frap1;mim 601231)是一种蛋白质复合物的组成部分,该复合物整合了营养和生长因子衍生的信号来调节细胞生长(Sarbassov等人,2004[PubMed 15268862])。RICTOR and MTOR (FRAP1; MIM 601231) are comp

与肺癌相关的SMO基因编码功能描述

Hedgehog(Hh)信号通过两个跨膜蛋白Patched(Ptc)和Smoothened(Smo)介导,在无Hedgehog的情况下,Ptc抑制Smo。当Hedgehog与Ptc结合时,则解除了Ptc对Smo的抑制作用,激活的Smo可导致下游靶基因的活化。Smo或者Hh基因突变或表达异常均可导致细

与肺癌相关的RHOA基因编码功能描述

这个基因编码一个小GTP酶的rho家族成员,在非活性GDP结合态和活性GTP结合态之间循环,在信号转导级联中起分子开关的作用。rho蛋白促进肌动蛋白细胞骨架的重组并调节细胞的形状、附着和运动。该基因的过度表达与肿瘤细胞增殖和转移有关。已识别出多个可选拼接变体。This gene encodes a

与肺癌相关的PBK基因编码功能描述

该基因编码一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,与双特异性丝裂原活化蛋白激酶(MAPKK)家族有关。有证据表明,有丝分裂磷酸化是必需的催化活性。编码蛋白可能参与淋巴细胞的激活和支持睾丸功能,并在精子发生过程中发挥作用。这种基因的过度表达与肿瘤发生有关。选择性剪接导致多个转录变体。This gene encod

与肺癌相关的PDGFRA基因编码功能描述

PDGFRA基因编码的蛋白全名为血小板源性生长因子受体α,是一种细胞表面受体酪氨酸激酶,PDGFRA可以与其相应的配体PDGF结合后活化,再激活磷脂酰肌醇、cAMP及多种蛋白质的磷酸化途径,调控细胞的分裂和增殖,当基因激活异常时,则会导致肿瘤的发生并促进肿瘤血管生成,PDGFRA的突变与胃肠道间质瘤

eLife:基因突变协同让肺癌更恶性!

  根据开放获取的期刊eLife的一篇新报告,科学家已经确切地展示了两种不同基因的突变如何协调驱动恶性肺部肿瘤的发展。  这项在新型基因工程小鼠身上进行的研究观察了肺肿瘤的特征--从小到肉眼看不到到大到可能致命的肿瘤。这一结果为肿瘤进展机制的研究提供了新的线索,并将有助于目前正在开发治疗肺肿瘤药物的

与肺癌相关的RET基因编码功能描述

RET蛋白是一种受体酪氨酸激酶,可以激活下游多种信号途径,如RAS、PI3K及STAT等,诱导细胞增生。RET常以本身断裂再与另一基因融合,重组成一新基因,具备自我磷酸化且持续激活,KIF5B-RET、CCDC6-RET、TRIM33-RET和NCOA4-RET是非小细胞肺癌中已发现的RET融合基因

与肺癌相关的NRAS基因编码功能描述

NRAS基因是GDP/GTP结合蛋白,比较重要的同家族基因还包括KRAS和HRAS。NRAS与GTP结合呈激活状态,与GDP结合呈关闭状态,该基因的突变与黑色素瘤密切相关,机制为该基因的突变导致其下游基因的如Raf激酶的异常持续激活。

肺癌常见突变基因EGFR与ALK的认知

肺癌是我国发病率最高,也是我国死亡率最高的癌症,而幸运的是在我国大约有40-50%的肺癌具有敏感基因突变,最常见的是EGFR突变及ALK融合突变(欧美10%),可以应用靶向药物治疗,EGFR/ALK靶点的突变应用靶向药物有效率高达70%,明显提高患者生存质量,提高生存期。有效率虽然很高但总有一个跨不

乳腺癌相关基因变异增肺癌风险

  一项大规模国际研究发现,一种与乳腺癌有关的基因变异会显著增加肺癌风险,尤其是吸烟者如果出现这一基因变异,其患肺癌的风险要比不吸烟者高出近80倍。  研究小组在新一期英国《自然—遗传学》杂志上介绍说,他们对约1.1万名患有肺癌的欧洲人与约1.5万名未患肺癌的人进行了基因状况对比。结果发现,一种名为

与肺癌相关的RET基因编码功能描述

RET蛋白是一种受体酪氨酸激酶,可以激活下游多种信号途径,如RAS、PI3K及STAT等,诱导细胞增生。RET常以本身断裂再与另一基因融合,重组成一新基因,具备自我磷酸化且持续激活,KIF5B-RET、CCDC6-RET、TRIM33-RET和NCOA4-RET是非小细胞肺癌中已发现的RET融合基因

与肺癌相关的PGR基因编码功能描述

这个基因编码类固醇受体超家族的一个成员。编码蛋白介导孕酮的生理效应,孕酮在与妊娠的建立和维持有关的生殖事件中起着核心作用。这个基因使用第一外显子中两个不同的启动子和翻译起始位点来产生几个转录变体,包括蛋白质编码和非蛋白质编码。两种亚型(A和B)是相同的,除了在B亚型的N端发现的另外165个氨基酸外,

与肺癌相关的MTAP基因编码功能描述

该基因编码一种在多胺代谢中起主要作用的酶,对腺嘌呤和蛋氨酸的修复都很重要。编码酶在许多癌症中缺乏,因为这个基因和抑癌基因p16被共同删除。已经描述了该基因的多个选择性剪接转录变体,但它们的全长性质仍然未知。This gene encodes an enzyme that plays a major

循环高敏C反应蛋白浓度与肺癌风险

  近日,顶级杂志BMJ上发表了一篇研究文章,研究人员为了根据吸烟状况(从不、既往和现在吸烟)和组织学分型,对前瞻性测量的循环高敏C反应蛋白(hsCRP)浓度与肺癌整体风险进行综合分析。  该研究为嵌套病例对照研究。以亚洲、欧洲、澳大利亚和美国20个基于人群的队列研究为基础。参与者为5299例肺癌患

基因调节蛋白

中文名称基因调节蛋白英文名称gene regulatory protein定  义与基因的DNA序列相互作用调控转录的蛋白质。即反式作用因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

研究发现小细胞肺癌扩散与基因缺失相关

  在一个癌细胞数以百计的基因突变中找出导致癌症扩散的最主要基因是癌症生物研究者面临的一个主要难题。据美国物理学家组织网7月19日报道,日前麻省理工学院的科学家利用全基因组分析技术,发现了导致小细胞肺癌扩散的新基因。  小细胞肺癌是较为严重的一种肺癌,占肺癌患者的约15%,约95%的

基因泰克肺癌新药获-FDA-优先审评资格

  罗氏集团旗下基因泰克 (Genetech) 公司近日宣布, FDA 已经接受了该公司的补充新药申请 (sNDA),并为 Alecensa(alectinib) 颁发了优先审评资格, 用于治疗间变性淋巴瘤激酶 (ALK) 阳性,局部晚期或转移性非小细胞肺癌 (NSCLC) 患者的一线疗法。FDA

利好!非小细胞肺癌基因检测纳入医保

  美国医疗保险机构National Government Services最近签署了一项最终区域覆盖决议(local coverage determination,LCD)更大范围地满足晚期非小细胞肺癌患者的基因组测序需求。   该机构认为基因组测序能够有效检测5至50个基因,对于早期确诊为非小细

与肺癌相关的CCND-2基因编码功能描述

该基因编码的蛋白质属于高度保守的细胞周期蛋白家族,其成员在细胞周期内具有显著的蛋白质丰度周期性。细胞周期蛋白起着调节CDK激酶的作用。不同的细胞周期蛋白表现出不同的表达和降解模式,这有助于每个有丝分裂事件的时间协调。该细胞周期蛋白与CDK4或CDK6形成复合物,并作为该复合物的调节亚单位发挥作用,其

Nature,Science子刊:肺癌的基因组分类

  两项最新的研究显示,如何根据肿瘤的遗传结构来特别定制肺癌的治疗,这可能会最终改善现有的治疗方法,甚至有助于发现新的治疗方法。   第一项研究发表在Science Translational Medicine杂志上,研究者们发现了一种根据其遗传组成将肺癌肿瘤进行分类的方法,能够为一些患者治疗

Nature-Comm:基因融合筛选有助预测肺癌恶性程度

  目前开发肺癌有效的治疗已经具有相当大的挑战性,部分是因为许多基因突变在肺癌中发挥作用。通过分析肺癌的RNA和DNA,美国密歇根州综合癌症中心研究人员发现含大量基因融合的肺癌患者比只有较少基因融合的肺癌患者有更糟糕的结果。  此外,研究人员确定肺癌(包括有吸烟史的)患者的几个新遗传异常。肺癌是一个

53个国家批准肺癌基因新技术用于临床

  肺癌是全球排名第一位的恶性肿瘤,通常分为非小细胞肺癌(NSCLC)和小细胞肺癌(SCLC)。研究发现,胰岛素受体的家族成员——间变性淋巴瘤激酶(ALK)是NSCLC的关键启动癌基因。通过对ALK阳性NSCLC患者的准确诊断,有助于实现肺癌的个体化靶向治疗和提高临床疗效。   今年6月出台的《中

与肺癌相关的ABCB1基因编码功能描述

由该基因编码的膜相关蛋白是ATP结合盒(ABC)转运蛋白超家族的成员。ABC蛋白通过细胞外膜和细胞内膜转运各种分子。ABC基因分为7个不同的亚家族(abc1,mdr/tap,mrp,ald,oabp,gcn20,white)。这种蛋白是MDR/TAP亚家族的成员。MDR/TAP亚家族成员参与多药耐药

与肺癌相关的ABL1基因编码功能描述

ABL1基因所编码的蛋白存在于细胞核与细胞质中,属于酪氨酸激酶,主要参与细胞的分化、分裂与应激反应等,ABL1蛋白的SH3结构域对该蛋白起着负调控作用,SH3结构域的缺失会使ABL1成为原癌基因,ABL1蛋白将持续激活导致细胞发生癌变。在肿瘤细胞中发现ABL1基因与其它多种基因发生融合,最常见的为t