人工智能赋能原位结构生物学取得新进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518893.shtm记者从中国科学院自动化研究所获悉，该所多模态人工智能系统实验室与生物物理研究所蛋白质科学研究平台生物成像中心合作，以人工智能技术赋能原位结构生物学，提出了一种基于弱监督深度学习的快速准确颗粒挑选方法DeepETPicker，相关研究近日在国际学术期刊《自然·通讯》发表。 ?DeepETPicker 软件用户图形界面据了解，DeepETPicker仅需要少量人工标注颗粒进行训练即可实现快速准确三维颗粒自动挑选。为降低对人工标注量的需求，该方法优选简化标签来替代真实标签，并采用了更高效的模型架构、更丰富的数据增强技术和重叠分区策略来提升小训练集时模型的性能；为提高颗粒定位的速度，采用GPU加速的平均池化-非极大值抑制后处理操作，与现有的聚类后处理方法相比提升挑选速度数十倍。......阅读全文
人工智能赋能原位结构生物学取得新进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518893.shtm记者从中国科学院自动化研究所获悉，该所多模态人工智能系统实验室与生物物理研究所蛋白质科学研究平台生物成像中心合作，以人工智能技术赋能原位结构生物学，提出了一种基于弱监督深度学习的快速准
人工智能排出最具影响力生物学家
《科学》官网近日报道称，艾伦人工智能研究所开发的一项科学文献搜索引擎工具“语义学者”的分析显示，博德研究所创始人、美国麻省理工学院生物学家、数学家艾瑞克·兰德（Eric Lander）是现代最具影响力的生物医学科学家，他在最新生物医学研究者名单上排名第一。 英国伦敦大学学院神经科学家卡尔·福瑞
人工智能排出最具影响力生物学家
《科学》官网近日报道称，艾伦人工智能研究所开发的一项科学文献搜索引擎工具“语义学者”的分析显示，博德研究所创始人、美国麻省理工学院生物学家、数学家艾瑞克·兰德（Eric Lander）是现代最具影响力的生物医学科学家，他在最新生物医学研究者名单上排名第一。 英国伦敦大学学院神经科学家卡尔·
原位压力机结构组成及工作原理
原位压力机结构及工作原理：★系统由手动泵和千斤顶用高压油管连接而成，当回油阀关闭，手动泵开始 向千斤送油，推动活塞向上运动，数显表随着压力不断增大而变化，直到将被测物体破坏。工作结束后，可打开回油阀，油液流回手动泵中，记录压力表的最大峰值，按公式中算出砌体强度。★结构组成1、手动油泵 2、数字压力
80后结构生物学家赵强：因为很酷，我选择了结构生物学
赵强在实验室工作。(中科院上海药物所供图) “为什么会选择生物？因为高考的时候觉得，数理化的体系已经很完整了，但生命科学还有那么多说不清楚的东西。” “为什么会选择结构生物学？那是因为觉得它很酷啊！完全不能想象，蛋白质结构可以看到……长出的晶体那么漂亮。” 科学是理性的，可选择自己的科研道路却
Nature：结构生物学重要成果发表
在11月15日的Nature杂志上，美国能源部SLAC国家加速器实验室的研究人员实现了首次对调控蛋白质生产的RNA开关进行了实时成像。这项重要的研究成果向人们展示了X射线无电子激光器（XFEL）在研究RNA方面的强大能力。 领导这项研究的结构生物学家Yun-Xing Wang说：“这是首次在原
Nature发表结构生物学重要成果
美国能源部SLAC国家加速器实验室的研究人员首次对调控蛋白质生产的RNA开关进行了实时成像。这项重要的研究成果发表在十一月十五日的Nature杂志上，向人们展示了X射线无电子激光器（XFEL）研究RNA的强大实力。 “这是首次在原子水平上实时观察由两个生物分子化学互作触发的生物反应，”领导这项
人工智能气候室结构与特点分析
人工智能气候室是由6面保温墙体制成,室内分为冷室与热室。被测试的设备为家用电加热器,放置在热室内,测试期间要求热室恒温在(23±0.5)℃。冷室模拟室外环境温度,温度设定根据测试电加热器的功率确定。冷室内的制冷量要与热室内被测电加热器的散热量保持平衡,从而保证热室温度的恒定。冷热室之间的能量交换主要
科学家开发冷冻电镜颗粒挑选新方法
人工智能赋能生物学再获新进展。中国科学院生物物理研究所蛋白质科学研究平台生物成像中心与中国科学院自动化研究所多模态人工智能系统实验室杨戈团队合作，以人工智能技术赋能原位结构生物学，提出了一种基于弱监督深度学习的快速准确颗粒挑选方法DeepETPicker。相关研究3月7日发表于《自然-通讯》。原位冷
原位PCR和原位RT
（一）、仪器设备 英国Thermo Hybaid原位PCR仪 。（二）、操作流程1、原位PCR 步骤1）预处理：（1）切片常规脱蜡；（2）0.2mol/L HCl处理10min；（3）5μg/ml蛋白酶K消化组织37℃10min；（4）Nase消化组织37℃ 30min；（5）梯度酒精脱水，室温干燥
线粒体原位膜蛋白的高分辨结构解析首次实现
3日，记者从南京中医药大学获悉，该校医学院朱家鹏教授和耶鲁大学张凯教授联合研究团队突破了蛋白质纯化的传统概念，直接以线粒体成像，首次实现了线粒体原位膜蛋白的高分辨结构解析，得到呼吸链超级复合体的最真实最清晰的三维结构，为氧化磷酸化这一最基本的生命过程的研究提供了坚实的理论基础。相关科研成果发表在国际
线粒体原位膜蛋白的高分辨结构解析首次实现
3日，记者从南京中医药大学获悉，该校医学院朱家鹏教授和耶鲁大学张凯教授联合研究团队突破了蛋白质纯化的传统概念，直接以线粒体成像，首次实现了线粒体原位膜蛋白的高分辨结构解析，得到呼吸链超级复合体的最真实最清晰的三维结构，为氧化磷酸化这一最基本的生命过程的研究提供了坚实的理论基础。相关科研成果发表在
我国科研人员提出冷冻电镜颗粒挑选新方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518925.shtm“人工智能+”赋能科学研究有新进展。记者12日从中国科学院自动化所获悉，该所和中国科学院生物物理所等单位的科研人员以人工智能技术赋能原位结构生物学，提出了一种基于弱监督深度学习的快速准
我国科研人员提出冷冻电镜颗粒挑选新方法
“人工智能+”赋能科学研究有新进展。记者12日从中国科学院自动化所获悉，该所和中国科学院生物物理所等单位的科研人员以人工智能技术赋能原位结构生物学，提出了一种基于弱监督深度学习的快速准确颗粒挑选方法DeepETPicker。这种方法仅需要少量人工标注颗粒训练，即可实现对生物大分子快速准确的定位识
结构生物学领域迎来“不结晶”革命
在英国剑桥市一座钢结构建筑深处的地下室里，一场大规模的“叛乱”正在上演。 一个约3米高的庞大金属箱正通过消失在屋顶上的橙色粗电缆，静悄悄地发射兆兆字节的数据。这是全球最先进的冷冻电子显微镜之一：一台利用电子束为冷冻的生物分子成像并揭秘其分子形状的设备。英国医学研究委员会分子生物学实验室（LM
Nature，Cell文章揭示关键结构生物学
清华大学生科院近年来在结构生物学研究方面取得了许多进展，2017年开年也连续在Cell，Nature杂志上发表重要成果，首先高宁研究组与北京大学分子医学所陈雷研究组合作，报道了ATP敏感的钾离子通道（KATP）的中等分辨率（5.6Å）冷冻电镜结构，揭示了KATP组装模式，为进一步研究其工作机制提
ATP的基本结构和生物学功能
ATP由3个磷酸基团,一个腺嘌呤核苷组成,在生物体内作为能量货币,主要功能是为细胞的生命活动（DNA复制、转录、翻译等等）提供能量
研究提出基于弱监督学习的冷冻电镜颗粒挑选新方法
生物大分子的结构与功能随着细胞生理状态的变化而不断进行动态调整。原位结构生物学是在接近自然生理状态下研究生物大分子结构和功能的科学。原位冷冻电镜技术（Cryo-ET）以高分辨率和在接近生理条件下观察样品的特点，成为原位结构生物学研究的关键手段。原位冷冻电镜的技术流程涉及样品制备、数据采集、电子断
研究提出基于弱监督学习的冷冻电镜颗粒挑选新方法
生物大分子的结构与功能随着细胞生理状态的变化而不断进行动态调整。原位结构生物学是在接近自然生理状态下研究生物大分子结构和功能的科学。原位冷冻电镜技术（Cryo-ET）以高分辨率和在接近生理条件下观察样品的特点，成为原位结构生物学研究的关键手段。原位冷冻电镜的技术流程涉及样品制备、数据采集、电子断层重
研究揭示骨骼肌兴奋收缩偶联过程原位结构基础
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519487.shtm
研究揭示骨骼肌兴奋收缩偶联过程原位结构基础
中国科学院生物物理研究所孙飞研究组和大连化学物理研究所李国辉研究组共同揭示了高等哺乳动物骨骼肌三联体介导兴奋-收缩偶联过程的原位结构基础。相关论文3月20日发表于《先进科学》。在生物体内，骨骼肌的收缩与舒张是受神经系统控制的。神经系统传递来的化学信号经过一系列的转变与传递过程最后形成肌肉的机械收缩行
层状结构二硫化锡锂化反应的原位电镜观察
锂离子电池广泛应用于从个人电子产品到电动汽车等诸多储能领域。锂离子电池电极材料中最重要的一类是层状氧化物材料。在这种材料中，锂离子和金属离子嵌于氧化物结构中，锂离子在一定驱动力下可以嵌入和脱出结构。但实际情况下，锂离子的可循环脱出/嵌入量不超过特定阈值（对于LiCoO2，大约50%的Li能抽出）。与
间接原位PCR（原位杂交PCR）
与直接原位PCR所不同的是，靶基因在扩增时不进行标记基团的掺入，而是标记一段与扩增片段互补的探针，在扩增结束后，应用此探针进行原位杂交。因此，此处主要介绍原位杂交，其余方法同原位PCR。实验材料组织或细胞样品试剂、试剂盒SSC硫酸葡聚糖甲酰胺脱脂奶粉Denhardt’s 液SDS变性的鲑鱼精DNAR
间接原位PCR（原位杂交PCR）
间接原位PCR（原位杂交PCR） 实验材料 组织或细胞样品 试剂、试剂盒
间接原位PCR（原位杂交PCR）
与直接原位PCR所不同的是，靶基因在扩增时不进行标记基团的掺入，而是标记一段与扩增片段互补的探针，在扩增结束后，应用此探针进行原位杂交。因此，此处主要介绍原位杂交，其余方法同原位PCR。一、预杂交1. 试剂与配制2×SSC50%去离子甲酰胺：用4×SSC配制（v/v）预杂交液：2×SSC，5%硫酸葡
祝贺！人工智能首次成功解析蛋白质结构
生物学界最大的挑战之一——蛋白质三维结构解析如今有望被破解。谷歌旗下人工智能公司DeepMind开发的深度学习程序AlphaFold能够精确预测其三维形状。长久以来，人们需要借助实验确定完整的蛋白质结构，这些方法往往需要数月甚至数年时间。而现在，人工智能也有能力给出精确预测的计算方法，可能只要几
PNAS：单分子成像：结构生物学的未来
结构到功能的研究对生物学领域有着重要的意义。自从解析出DNA的三维结构后，结构生物学帮助科学家们解析出了更多的生物大分子的结构，解决了很多生物学的根基上的问题。然而，结构生物学的发展受到了技术层面上的重大瓶颈。新技术的出现，将对结构生物学的发展带了跨越式的进展。 传统的结构解析方法是X光衍射和
清华大学成立结构生物学中心
4月16日，清华大学结构生物学中心正式成立。结构生物学是现代生命科学研究的重要主流前沿方向，对于解决一系列生命领域重大基础科学问题，帮助人类更好地理解生命现象本质，指导新药研究与开发具有重要意义。 中科院院士、清华大学校长顾秉林在仪式上表示，结构生物学中心的成立，将有利于改变目前清华
原位PCR
About in situ PCR (Applied Biosystems)Basic information about in situ PCR and its applications.The In Situ PCR: Amplification and Detection in a Cellu
原位PCR
实验概要原位PCR技术自上世纪90年代初建立至今，科学家就一直对原位PCR的技术和应用进行研究，目前该项技术已日臻完善。原位PCR既能分辨带有靶序列的细胞又能标出靶序列在细胞内的位置，在分子和细胞水平上研究疾病的发病机理、临床过程以及病理的转归，其特异性和敏感性均高于一般PCR技术。在病毒学、病理学