新方法可全局性解析“修饰调控酶—底物”互作
近日，中国科学院上海药物研究所陈小华课题组与谭敏佳课题组合作，利用前期开发的PANAC光点击化学，发展了一种在活细胞内直接捕捉“修饰调控酶—底物”相互作用的时空可分辨解析新方法，为蛋白质相互作用和蛋白质翻译后修饰研究提供了新工具。相关研究发表于《自然—通讯》。 精确解析“修饰调控酶—底物”的动态互作对于深入理解蛋白质功能和靶标发现具有重要意义，但利用现有技术直接进行“修饰调控酶—底物”的时空动态全局性解析，尤其对动态和微弱相互作用产生的修饰底物、修饰位点的准确鉴定，非常具有挑战性。 作为直接捕捉“修饰调控酶—底物”动态互作策略的概念性验证，研究团队基于前期发展的化学生物学工具，发展了一种在活细胞中直接捕捉赖氨酸酰基化修饰酶的全局性底物新方法。通过整合酰基化修饰调控酶的催化机制及在酶活性口袋中定点引入的赖氨酸残基选择性交联的非天然氨基酸，研究人员实现了对多种原核系统的赖氨酸修饰调控酶和真核系统的赖氨酸修饰调控酶......阅读全文
Cell子刊：DNA酶促氧化修饰新调控作用
哺乳动物基因组DNA中5-甲基胞嘧啶(5mC)的动态平衡调节胚胎和成年哺乳动物的神经发生。这种表观遗传修饰不仅控制神经前体细胞的增殖和存活，还会影响新生神经元的轴突生长。近期研究发现5mC在体内可以被TET家族蛋白氧化成5-羟甲基化胞嘧啶(5hmC)等形式，而这些氧化修饰在早期胚胎和哺
核酸的修饰酶
The restriction/modification system in bacteria is a small-scale immune systemfor protection from infection by foreign DNA. W. Arber and S. Linn (1969
新方法可全局性解析“修饰调控酶—底物”互作
近日，中国科学院上海药物研究所陈小华课题组与谭敏佳课题组合作，利用前期开发的PANAC光点击化学，发展了一种在活细胞内直接捕捉“修饰调控酶—底物”相互作用的时空可分辨解析新方法，为蛋白质相互作用和蛋白质翻译后修饰研究提供了新工具。相关研究发表于《自然—通讯》。 精确解析“修饰调控酶—底物”的动态互作
新方法可全局性解析“修饰调控酶—底物”互作
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519752.shtm近日，中国科学院上海药物研究所陈小华课题组与谭敏佳课题组合作，利用前期开发的PANAC光点击化学，发展了一种在活细胞内直接捕捉“修饰调控酶—底物”相互作用的时空可分辨解析新方法，为蛋白
新方法可全局性解析“修饰调控酶—底物”互作
近日，中国科学院上海药物研究所陈小华课题组与谭敏佳课题组合作，利用前期开发的PANAC光点击化学，发展了一种在活细胞内直接捕捉“修饰调控酶—底物”相互作用的时空可分辨解析新方法，为蛋白质相互作用和蛋白质翻译后修饰研究提供了新工具。相关研究发表于《自然—通讯》。 精确解析“修饰调控酶—底物”的动态互作
关于修饰酶的相关介绍
体内有些酶可在其他酶的作用下，将酶的结构进行共价修饰，使该酶活性发生改变，这种调节称为共价修饰调节(covalent modification regulation)，这类酶称为修饰酶(prosessing enzyme)。 碱性磷酸酶去除5′－P，可防止二分子DNA片段5′端P基团自身空间障
修饰酶的基本信息
体内有些酶可在其他酶的作用下，将酶的结构进行共价修饰，而使其在高活性形式和相对较低的活性形式之间互相转变，这种调节称为共价修饰调节(covalent modification regulation)，这类酶称为修饰酶(prosessing enzyme)。例如某些酶的巯基发生可逆的氧化还原，一些酶以
RNA修饰相关酶PCR芯片
应用场景：通过关键酶/蛋白的RNA表达变化，确定样品表型与特定RNA 修饰的联系 优势：预制的PCR板,覆盖68个针对不同RNA修饰的Writers/Erasers/Readers基因。精心优化的引物Tm值均一，并经过了严格的预实验验证，无须摸索引物设计和测试。工业化生产的高度均一的PCR
修饰酶的基本信息
体内有些酶可在其他酶的作用下，将酶的结构进行共价修饰，而使其在高活性形式和相对较低的活性形式之间互相转变，这种调节称为共价修饰调节(covalent modification regulation)，这类酶称为修饰酶(prosessing enzyme)。例如某些酶的巯基发生可逆的氧化还原，一些酶以
修饰性工具酶功能应用
（一）末端转移酶（terminal transferase）l 末端转移酶是一类不依赖于DNA模板的DNA聚合酶。l 特性：该类酶可以在没有模板链存在的情况下，将核苷酸连接到dsDNA或ssDNA的在3’－OH。特别是对于平末端的双链DNA末端加尾十分有用。l 最常见的用途：给外源DNA片段及载体分
上海药物所发现赖氨酸丙二酰化的新蛋白修饰及其调控酶
蛋白翻译后修饰是调控诸多生物学过程和疾病的主要生物学通路之一，因而，蛋白翻译后修饰通路研究正成为目前新药研发的重要热点之一。近日，中科院上海药物研究所联合美国芝加哥大学Ben May癌症研究所赵英明教授实验室建立的中科院上海药物所化学蛋白质组学研究中心发现了细胞中赖氨酸丙二酰化的新蛋白修饰及
筛选或验证RNA修饰直接靶点，研究RNA修饰靶基因的调控...
筛选或验证RNA修饰直接靶点，研究RNA修饰靶基因的调控机制技术简介用体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合，从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后，通过Western Blot检测特定的RNA结合蛋白是否与R
关于组蛋白修饰—基因调控的基本介绍
基因表达是一个受多因素调控的复杂过程.组蛋白是染色体基本结构-核小体中的重要组成部分，其N-末端氨基酸残基可发生乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、多聚ADP糖基化等多种共价修饰作用.组蛋白的修饰可通过影响组蛋白与DNA双链的亲和性，从而改变染色质的疏松或凝集状态，或通过影响其它转录因子与结构基因启
徐国良研究组Cell子刊发现DNA酶促氧化修饰的新调控作用
哺乳动物基因组DNA中5-甲基胞嘧啶(5mC)的动态平衡调节胚胎和成年哺乳动物的神经发生。这种表观遗传修饰不仅控制神经前体细胞的增殖和存活，还会影响新生神经元的轴突生长。近期研究发现5mC在体内可以被TET家族蛋白氧化成5-羟甲基化胞嘧啶(5hmC)等形式，而这些氧化修饰在早期胚胎和哺乳动物脑内
研究揭示RNA去甲基化酶的氧化还原修饰调控番茄果实成熟机制
活性氧作为重要的信号分子，在植物抵御病原菌侵染、响应逆境胁迫以及维持正常生长发育的多个生物学过程中发挥重要的调控作用。在多种活性氧分子中，过氧化氢具有较长的半衰期，可调控干细胞分化、花粉管伸长、气孔发育、果实成熟等植物发育过程，但过氧化氢如何与其他信号途径协同作用，共同调控植物发育过程却不甚清楚。中
什么是酶的共价修饰调节？
是指酶活性因其分子内的某些氨基酸残基发生共价修饰而发生变化的过程。这种调节方式比别构调节要慢。共价修饰的方式有：磷酸化、腺苷酸化、尿苷酸化、ADP-核糖基化和甲基化，其中磷酸化是最为常见的形式。
研究揭示蛋白β羟基丁酰化修饰关键调控因子
近日，中国科学院上海药物研究所研究员黄河课题组与美国芝加哥大学教授赵英明团队合作，通过全面分析哺乳动物细胞中的Kbhb底物，系统揭示了新型蛋白动态修饰β-羟基丁酰化（Kbhb）的关键调控因子。相关研究成果于2月25日在线发表在Science Advance上。 细胞代谢为生命过程提供能量，同时
蛋白质乙酰化修饰的精细调控
近期，国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》在线发表了中国科学技术大学生命科学学院施蕴渝教授与姚雪彪教授研究组的合作成果，文章标题为EB1 acetylation by P300/CBP-associated factor (PCAF) ensures accurate kinetochore -m
SUMO化修饰调控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：RNA甲基化研究深度剖析）。 近三个月高分文章部分列表： 2月28日
修饰酶的组成性质及特点
体内有些酶需在其它酶作用下,对酶分子结构进行修饰后才具催化活性,这类酶称为修饰酶(modification enzyme)。其中以共价修饰为多见,如酶蛋白的丝氨酸,苏氨酸残基的功能基团-OH可被磷酸化,这时伴有共价键的修饰变化生成,故称共价修饰(covalent modification)。由于这种
最新研究揭示蛋白β羟基丁酰化修饰关键调控因子
近日，中国科学院上海药物研究所研究员黄河课题组与美国芝加哥大学教授赵英明团队合作，通过全面分析哺乳动物细胞中的Kbhb底物，系统揭示了新型蛋白动态修饰β-羟基丁酰化（Kbhb）的关键调控因子。相关研究成果在线发表在Science Advance上。 细胞代谢为生命过程提供能量，同时代谢物可通过
蛋白酰化修饰调控天然产物生物合成研究取得进展
近期，中国科学院上海药物研究所谭敏佳课题组与华东理工大学叶邦策课题组合作研究，揭示了蛋白赖氨酸酰化修饰在天然产物的生物合成代谢通路中的调控新机制，研究工作发表在8月Cell Chemical Biology（25(8): 984-995. doi: 10.1016/j.chembiol.2018
关于真核生物的基因调控—修饰作用的介绍
真核细胞修饰 DNA的主要途径是胞嘧啶(c）在5位上的甲基化反应。5-甲基胞嘧啶通常位于鸟嘌呤（G）的旁边。可见 GC顺序最容易被甲基化。在刚刚完成复制的 DNA分子中只有母链（模板链）是甲基化的。新生 DNA链的甲基化在母链的指导下进行。用限制酶进行分析的结果表明在不转录的DNA中的GC有 7
揭示RNA－m6A修饰调控抗肿瘤免疫机制
免疫治疗是对抗肿瘤的前沿阵地，其治疗成功的关键是引发针对肿瘤抗原的自发性T细胞反应。许多病人的免疫系统无法有效识别肿瘤抗原，难以引发持续性的T细胞应答并清除肿瘤。研究免疫系统识别肿瘤抗原的分子机制有望发现新型药物靶点，提高免疫治疗效果。 中国科学院北京基因组研究所韩大力团队与清华大学徐萌团队、
蛋白酰化修饰调控天然产物生物合成研究取得进展
近期,中国科学院上海药物研究所谭敏佳课题组与华东理工大学叶邦策课题组合作研究,揭示了蛋白赖氨酸酰化修饰在天然产物的生物合成代谢通路中的调控新机制,研究工作发表在8月Cell Chemical Biology（25(8)： 984-995. doi： 10.1016/j.chembiol.2018
SUMO化修饰调控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能分子机制
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：RNA甲基化研究深度剖析）。 近三个月高分文章部分列表： 2月28日
蒲慕明小组发现泛素连接酶修饰途径
来自加州大学伯克利分校Helen Wills神经科学研究所等处的研究人员发现了蛋白泛素化途径中的一种关键酶调控的新机制，有助于解释细胞功能蛋白选择性降解。这一研究成果公布在《神经元》(Neuron)杂志上。 领导这一研究的是著名的神经生物学家蒲慕明教授，其现任中科院神经科学研究所所长，
组蛋白修饰对衰老的调控机制研究取得重要进展
衰老是一个基本的生物学现象，在人口老龄化日趋严重的情况下，对其调控机制的研究显得极为重要。在发育和衰老过程中，表观遗传学调控被认为可能起到重要作用，但是长久以来这方面的证据一直很少，具体作用机理还不清楚。 中科院遗传与发育生物学研究所韩敬东实验室的这项研究，通过生物化学、分子
何川教授新发Nature综述：mRNA修饰介导的基因调控
在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以调控基因的表达，并由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现，mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine（m6A）是真
组蛋白修饰分工调控基因表达水平和基因表达噪音
基因表达过程依赖于转录因子、染色质调控因子和染色质等生物大分子在布朗运动过程中的随机碰撞，因此，即使是基因型和分化类型完全相同的细胞在相同环境下也存在基因表达的差异，被称为基因表达噪音。研究基因表达噪音，对研究干细胞增殖分化、个体发育、病原菌的抗药性以及农作物的稳产有着重要的意义，而其在人类早期