新平台可绘制亚细胞精度的组织3D图
Open-ST平台可以利用一系列2D图像,将其重建为3D图像。图片来源:拉杰斯基实验室网站科技日报北京6月26日电 (记者张佳欣)德国马克斯·德尔布吕克中心尼古拉斯·拉杰斯基实验室团队开发出一种名为Open-ST的空间转录平台,能以三维(3D)方式重建患者组织细胞内的基因表达,并以亚细胞精度绘制出组织样本的分子图谱。相关论文发表在新一期《细胞》杂志上。转录组学是研究细胞或细胞群中基因表达的学科,通常不包括空间信息,而空间转录组学则能测量组织样本中RNA在空间中的表达。Open-ST平台提供了一种经济高效、高分辨率、易于使用的方法,既可以拍摄样本的组织形态,也能拍摄组织切片的空间转录组学信息。该平台可以利用一系列2D图像,将其重建为3D“虚拟立体组织”。在实验中,研究人员利用来自头颈癌患者健康和转移淋巴结的样本,成功识别出免疫、间质和肿瘤细胞群的多样性特征。这些细胞群是围绕原发肿瘤内的通讯热点组织起来的,但这种组织在转移......阅读全文
Nature封面:艾滋病毒的衣壳结构原子图绘制出
由匹兹堡大学医学院的研究人员领导的一个研究小组,第一次描述了HIV病毒衣壳的6400万原子结构。这一研究成果被选为封面文章,发表在5月30日的《自然》(Nature)杂志上,有可能为对抗这一经常发生改变,且极难攻克的病毒开辟出新的途径。 匹兹堡大学医学院结构生物学副教授张培军说,科学家们长
科学家绘制高精度类人猿基因组图谱
一个国际科研团队宣布,他们新近绘制出红毛猩猩和黑猩猩这两种类人猿的高精度基因组图谱。与过去类似研究不同的是,这次没有参照人类基因组图谱,因此更准确地揭示了人类与类人猿的基因差异。 利用第三代基因测序技术和先进的拼接方法,美国华盛顿大学等机构研究人员绘制出的这个高精度基因组图谱,对人与类人猿基因组
高精度亚洲猪参考基因组图谱绘制成功
近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物基因工程与种质创新科技创新团队联合北京相关生物企业等单位成功绘制了梅山猪高质量基因组图谱。该图谱是迄今为止精度最高的亚洲猪基因组图谱,为我国地方猪种质资源保护和开发利用奠定了基础。相关成果发表于《分子生态资源(Molecular Ecology Reso
科研人员绘制肝癌组织乳酰化修饰图谱
乳酸 (lactate) 是哺乳动物糖酵解代谢中的主要产物,在肿瘤、败血症、自身免疫性疾病等病理状态下显著增多。其生物学功能因肿瘤细胞中存在的“瓦伯格效应(Warburg effect)”而得到广泛关注。2019年,芝加哥大学Yingming Zhao教授团队发现哺乳动物细胞内的乳酸可驱动形成一
细胞亚株的概念
中文名称细胞亚株英文名称cell substrain定 义由原细胞株再次克隆形成的与原株性状有部分不同的细胞群。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞培养与细胞工程(二级学科)
亚细胞的成分介绍
细胞是生物体的构造和生理的基本单位,却不能因此认为所有的生物细胞都相同,即使在同一个个体内,也有因为分化而产生各式各样外观与功能不同的细胞,即使相同种类的细胞,也可能正在执行的生理工作也有差异,但是基本上彼此都有共同的基本构造。细胞膜细胞膜为细胞与环境之间以及细胞器与细胞质之间的分界,能够调节物质的
Science绘制细胞药物反应图谱
为什么对于同一种药物人们会有不同的反应?研究人员第一次解开了与药物反应相关的遗传和环境因素,使得我们朝着预测出药物将会对我们造成的影响又近了一步。 来自英属哥伦比亚大学的研究人员将6,000种酵母菌株暴露于3,000种药物之中。他们对酵母菌株进行了改造使得能够测量这些酵母的反应。研究人员发
解析Python中利用Matplotlib绘制多图并合并展示(一)
大家好,最近在研究在搞Python的大作业,有个需求就是利用Matplotlib画几个像模像样的统计图然后合并在一张图中,因为此前很少用这方面的东西,所以折腾了不少时间,今天介绍一下。1、subplot多合一其实,利用python 的matplotlib包下的subplot函数可以将多个子图
全球海洋生物多样性分布图绘制完成
据英国《自然》杂志网站7月28日报道,《国际海洋生物普查计划》的研究结果日前正式向全球公布。该项目共历时10年,覆盖了从浮游生物到鲸鱼等13组共11000多种海洋生物。 研究人员发现,不同种类海洋生物的分布模式非常相似,温度同所有种类生物的生物多样性密切相关;人类活动密集的
哈佛大学科学家绘制奇异“脑彩虹图”
科学家称三维图能让人们首次观察大脑的内部。“脑彩虹”地图显示纤维连接的模式,并形成三维立体的大脑图。 长期以来,大脑被认为是一团缠绕的线路组成,但近来研究者发现大脑纤维实际上像国际象棋的棋盘形状,以直角交叉形式出现。 据英国每日邮报报道,哈佛大学科学家已经研发出一种高科技的核磁共
世界首张地下深处水流分布图绘制成功
加拿大不列颠哥伦比亚大学的研究人员近日首次绘制出地表下流经岩石和沉积物的地下水流分布图。在最新一期出版的《地球物理研究快报》(Geophysical Research Letters)杂志上,加科学家发表了绘制的地图和相关数据。该项成果对于更深入地了解地质过程有重要意义,对于评估
《科学》发表系列文章绘制世界核电站分布图
3月11日的大地震重创日本部分研究设施,图为日本质子加速器研究园区(J-PARC)。 今年3月11日,日本东北部发生9级大地震,并引发海啸和福岛核电站辐射泄漏事故,世界为之震惊。人们再次质疑:核能安全吗?这次核事件对世界核能前景有何影响?处于震中的仙台地区驻有日本重要的大学
美科学家绘制人体100万亿细菌分布图
人体细菌分布图有助于治疗疾病。这是分布在人体肠内的粪肠球菌 美国科罗拉多大学博尔德分校一个研究小组成功绘制出人体细菌群落分布图,为临床医学研究提供重要帮助 新浪科技讯北京时间12月4日消息,据国外媒体报道,美国科研人员最新研究发现,人体100万亿个细菌分布在不同的群落。科研人
绘制出西南喀斯特地区复杂森林空间分布图
记者9月13日从中国科学院亚热带农业生态研究所获悉,该所环江喀斯特生态系统观测研究站王克林研究员团队基于深度学习和国产高分辨率卫星遥感影像,绘制了我国西南喀斯特地区复杂森林空间分布图。近日,这一研究成果的论文发表在Remote Sensing in Ecology and Conservati
解析Python中利用Matplotlib绘制多图并合并展示(二)
plt.figure(1):表示取第一块画板,通俗地讲,一个画板就是一张图,如果你有多个画板,那么最后就会弹出多张图。plt.subplot(221):221表示将画板划分为2行2列,然后取第1个区域。那么第几个区域是怎么界定的呢?这个规则遵循行优先数数规则!比如说4个区域:优先从行开始数,
解析Python中利用Matplotlib绘制多图并合并展示(三)
2、subplot2grid分格显示这种方式和上一种实现的效果一样,只不过更加容易理解罢了,先来看一个案例代码:import matplotlib.pyplot as pltimport numpy as npplt.rcParams['font.sans-serif']=['SimHei'] #
科学家研制3D生物打印笔-可“画”出骨细胞
据香港《文汇报》26日报道,严重创伤或截肢将对骨组织细胞造成严重伤害。澳大利亚科学家从3D打印技术获取灵感,研发3D生物打印设备“骨画笔”,直接在伤骨“画”出新骨细胞,一旦投入临床应用,可提高骨头骨细胞重建手术成功率。 报道称,“骨画笔”原理类似3D打印机,先逐层打印出活性细胞、海藻酸钠或海藻
红外光谱图,可以看出有亚硝基吗
红外光谱(InfraredSpectroscopy,IR)的研究始于20世纪初,自1940年红外光谱仪问世,红外光谱在有机化学研究中广泛应用。新技术(如发射光谱、光声光谱、色红联用等)出现,使红外光谱技术得到发展。可以用来检测物质具有的化学键及官能团。当一束具有连续波长的红外光通过物质,物质分子中某
科学家绘制调控人类大脑基因功能的网络图
一组研究人员绘制了有精神障碍以及无精神障碍的人脑中最大、最先进的基因调控网络多维图谱。这些图谱详细描述了协调大脑生物通路和细胞功能的许多调节元件。这项由美国国立卫生研究院(NIH)支持的研究使用了2500多名捐赠者的死亡后脑组织,绘制了大脑发育不同阶段和多种与大脑相关疾病的基因调控网络。 “这
Nature:首次绘制出大脑蕈状体中的完整神经连接图
在过去几年,通过与美国霍华德-休斯医学研究所珍妮莉亚研究园区密切合作,来自美国哥伦比亚的L. F. Abbott、德国康斯坦茨大学的Andreas Thum和英国剑桥大学的Marta Zlatic、Albert Cardona利用高分辨率三维电子显微镜技术重建神经细胞和它们通过突触形成的连接组(
新型3D技术可使得祖细胞分化成为微型胰腺组织
新型的3D技术可使得祖细胞分化成为微型胰腺组织。 (Credit: Image courtesy of University of Copenhagen) 2013年10月16日 讯 /生物谷BIOON/ --一项刊登在国际杂志Development上的研究论文中,来自哥本哈根大学的
悬浮培养细胞生长曲线的绘制实验
实验方法原理以三种不同细胞浓度进行系列细胞培养,每天计数细胞直至平台期。实验步骤材料无菌悬浮细胞培养培养液,l00 mlD-PBSA(细胞计数用)24 孔板非无菌装培养板的塑料盒CO2 温箱或 5% C02 以充盈塑料盒操作步骤1. 如单层培养那样(见方案 21.8 ) 将生长液中的细胞悬液以不同浓
悬浮培养细胞生长曲线的绘制实验
实验方法原理以三种不同细胞浓度进行系列细胞培养,每天计数细胞直至平台期。实验步骤 材料 无菌 悬浮细胞培养 培养液,l00 ml D-PBSA(细胞计数用) 24 孔板 非无菌 装培养板的塑料盒 CO2 温箱或 5% C02 以充盈塑料盒 操作步骤 1. 如单层培养那样(见方案 21.8
悬浮培养细胞生长曲线的绘制实验
实验方法原理 以三种不同细胞浓度进行系列细胞培养,每天计数细胞直至平台期。实验步骤 材料无菌悬浮细胞培养培养液,l00 mlD-PBSA(细胞计数用)24 孔板非无菌装培养板的塑料盒CO2 温箱或 5% C02 以充盈塑料盒操作步骤1. 如单层培养那样(见方案 21.8 ) 将生长液中的细胞悬液以不
我自主研发出可打印人体细胞的3D打印机
上图 打印出来的活细胞组织。 最新发现与创新 来自杭州电子科技大学等高校的科学家自主研发出一台生物材料3D打印机。科学家们使用生物医用高分子材料、无机材料、水凝胶材料或活细胞,目前已在这台打印机上成功打印出较小比例的人类耳朵软骨组织、肝脏单元等。 该生物材料3D打印机研发
微纳3D打印高通量类器官芯片,解决细胞生长难题
近日,来自南昌大学第一附属医院、复旦大学、摩方精密、昆明医科大学等联合研究团队,成功研发出一款新型类器官培养平台,可用于培养厘米级肿瘤或器官源。该类器官芯片由摩方精密面投影微立体光刻(PμSL)技术3D打印制备,内部集成微米级仿生微血管网络,并引入灌注装置以模拟血流动力学特征,在实现营养液持续供给与
澳大利亚科学家绘制出考拉基因图谱
拯救和保护考拉是澳大利亚科学家,以及社会各界人士所关注并在积极努力开展的工作。澳媒10日报道说,澳科学家根据考拉数量逐渐减少的情况,为使考拉的疾病得到及时、切实的治疗,已在绘制考拉基因图谱方面取得新进展。 据报道,考拉的遗传基因研究受到国际关注。由澳大利亚博物馆和昆士兰科技大学的科学家经过
内分泌系统老化过程中血管密度和内皮细胞亚群的动态...
内分泌系统由位于全身各处的多种腺体组成,参与生物体每日新陈代谢、生长发育等诸多生理活动,是生命变化的重要组成部分。而随着生物体的年龄增长,内分泌系统也在发生变化,影响激素分泌等功能。内分泌腺是高度血管化的组织,血管系统控制着激素的分泌。有研究表明,胰岛β细胞的复制能力会随着老化而下
无需分离细胞器,新技术可定量解析亚细胞脂质合成与运输途径
中国科学院上海有机化学研究所研究员朱正江团队、陈以昀团队合作,开发了亚细胞定位邻近标记脂质组学技术,首次系统性定量解析了多种脂质合成通路与运输途径对细胞器脂质组成贡献,为深入探索亚细胞层次的脂质代谢规律及相关疾病机制提供了技术支撑。相关研究8月6日发表于《自然-化学》。作为生命活动的核心物质之一,脂
亚纳米膜可实现同步自组装
据美国物理学家组织网近日报道,未来学家曾设想过一种分子通道聚合物膜,可用来捕获碳,生产以太阳能为基础的燃料,或进行海水淡化处理,不过前提是这类聚合物膜可以很容易地大规模制造。美国科学家最近开发出一种具有高度均匀亚纳米通道的自组装聚合物膜,首次实现了在宏观尺度上利用有机纳米管制备功能