Science:揭示大脑回路的表观基因组成

表观基因组学的变化,包括DNA的化学修饰,可以作为基因组的一层额外信息。表观基因组学在学习和记忆及年龄相关的认知度方面扮演着重要的角色。新的研究发现DNA甲基化,一种特殊的表观基因组学修饰的形式。从出生到成年,DNA甲基化形式在大脑细胞中是动态变化的。从而帮助理解大脑细胞中基因组学的信息是如何控制胎儿的发育的。大脑比其它器官复杂,这项发现使科学家们可以更深一层的了解大脑中错综复杂的连接是如何形成的。 Joseph R. Ecker表示:“这项研究结果扩展了我们的知识,使我们进一步的了解DNA甲基化在大脑发育和功能方面所起的作用。研究者们提供了一个新的框架,用于测试表观基因组学在健康和疾病状态下在神经回路中起的作用。” 一个健康的大脑是一种需要长期开发的产品。大脑最前面的一部分称为额叶皮质,额叶皮质对我们思考,行动能力的形成起着重要的作用。大脑实现这一切通过特殊细胞的交互如神经元和神经胶质。我们知道这些细胞有独......阅读全文

两篇Nature论文挑战流行表观遗传学观点

  Friedrich Miescher生物医学研究所(FMI)的Dirk Schübeler和他的研究团队,确定了沿着基因组设置表观遗传学标记的决定因素。这项发表在《自然》(Nature)杂志上的新研究表明,基因活性和DNA序列在对表观遗传标记的调控中发挥了比以往认为更大的作用。这对流行的观点:外

棉花“甲基化基因图谱”首次绘成

  30日出版的《基因组生物学》杂志刊登了中美科学家合作的一项重要研究成果:他们首次绘制出棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”,即野生棉和种植棉之间500多种表观遗传基因的差异,为生物技术公司通过表观修饰育种培育出高产优质棉花提供了重要线索。  几十年来,科学家们发现,许多动植物的表观特征,既可用基

dna甲基化与rna甲基化的区别

DNA甲基化和组蛋白修饰的相同点:都有包含甲基化修饰;不同点:修饰对象不同,一个是对DNA修饰,一个是对蛋白:组蛋白修饰。而RNA干扰是对RNA的降解,与前两者差异较大。

世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱

  记者25日从北京大学第三医院获悉,该院生殖医学中心乔杰研究组与北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组合作,绘就了世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱。这一成果日前已在线发表于《自然》,影响因子达38.597。  据介绍,哺乳动物的胚胎发育起始于单个受精卵细胞,父母的表观遗传记

续写十大科学突破-Science公布重要甲基化图谱

  来自耶路撒冷希伯来大学的科学家们在一项最新研究中,重构了尼安德特人与丹尼索瓦人的DNA甲基化图谱,并将其进行了比对,这对于深入探索表观遗传学调控机制,以及表观遗传差异造成的形态学差异具有重要意义。   2010年,2012年Science十大科学突破接连聚焦于古人类的DNA基因组序列测定结果,

DNA甲基化研究方法的回顾与评价

摘要: DNA甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:基因组整体水平的甲

稳定性与可塑性:细胞命运的“天平”

表观遗传指的是在不改变DNA序列的情况下,基因表达和生物性状的可继承变化。细胞命运决定包括细胞身份的维持和转换,这就涉及到表观遗传信息的继承性和可塑性,是生命科学领域的重点前沿方向。生命的"天平"  人体内有约十万亿个细胞,上千种功能各异的细胞类型,但它们拥有同样的基因组。那么,为什么同样的基因组会

DNA甲基化研究方法的回顾与评价(图)

摘要: DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:整体水平的甲

甲基化领域重要研究成果解读!

  本文中,小编整理了近年来科学家们在甲基化研究领域取得的重要研究成果,与大家一起学习!  【1】Science:重大进展!揭示DNA甲基化增强基因转录机制  doi:10.1126/science.aar7854  DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不

Science:表观遗传学的“神秘花园”

  许多研究者都在探寻各种复杂性状背后的遗传学基础。然而,大家往往忽视了天然表观遗传学变化为表型带来的多样性。表观遗传学突变发生在DNA序列之外,将其与DNA序列突变区分开是一项富有挑战性的工作。   在本期Science杂志上Cortijo等人向人们展示,表观等位基因( epialleles

PNAS热点文章:表观基因组可因环境而改变

  长期以来,人们普遍认为作为有机体发育关键步骤的甲基化只是静态地DNA修饰,不会随环境条件变化而改变。Salk生物研究所的研究人员发现,处于逆境下植物的DNA甲基化模式会发生变化,从而改变对基因的调控。 科学家发现植物遭遇致病菌后,其表观遗传学密码会发生广泛的大量改

Science解读甲基化组新观点

  在真核生物中,DNA甲基化通常发生在CG中的胞嘧啶上。由于甲基化不会改变DNA序列,它被视为一种表观遗传学标志。DNA甲基化可以在细胞分裂过程中延续到子代细胞,这一机制现在已经相当明确。而这种继承性使DNA甲基化成为储存表观遗传学记忆的潜在途径,这种记忆包括环境或发育过程中的基因调控。不过要证实

顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱

  基因组中表观遗传变化是能遗传的,近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析,从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。   文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E

中科院Cell发表表观遗传突破性发现

  来自中科院北京基因研究所的研究人员在斑马鱼实验中证实,早期胚胎过程中维持了精子而非卵母细胞的DNA甲基化组(Methylome)。这一突破性的研究发现以封面文章形式发表在5月9日的《细胞》(Cell)杂志上。   来自中科院北京基因研究所的刘江(Jiang Liu)博士和慈维敏(Weimin

Nature子刊:基于纳米孔的新甲基化检测技术

  Mayo诊所与Illinois大学的研究人员合作,开发出了一种检测甲基化DNA的新单分子检测技术,这种技术以固态的纳米孔为基础。文章发表在Nature旗下的Scientific Reports杂志上。   表观遗传学修饰可以不改变基因编码,而影响基因的开启或关闭。甲基化是表观遗传学修饰的一

科学家开发新的表观遗传通路统计算法

  11月30日,国际学术期刊Nature Methods 发表了中国科学院上海营养与健康研究院计算生物学研究所Andrew Teschendorff组的研究论文“Identification of differentially methylated cell types in epigenome-

我国学者揭示发育过程中表观遗传修饰的协同调控

  近期,哈尔滨工业大学和哈尔滨医科大学的研究人员利用生物信息学方法,整合高通量的表观基因组数据,发现了在小鼠发育过程中CpG岛上各种表观遗传修饰的协同变化,并揭示了其对发育基因的共调控。相关成果公布在Nature出版集团旗下期刊Scientific Reports杂志上。   CpG岛是指基

我国学者揭示发育过程中表观遗传修饰的协同调控

  近期,哈尔滨工业大学和哈尔滨医科大学的研究人员利用生物信息学方法,整合高通量的表观基因组数据,发现了在小鼠发育过程中CpG岛上各种表观遗传修饰的协同变化,并揭示了其对发育基因的共调控。相关成果公布在Nature出版集团旗下期刊Scientific Reports杂志上。   CpG岛是指基

南京农业大学国家重点实验室联合发表《Genome-Biology》

  中国南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室、美国德州大学和德州A&M大学的科学家们分析了驯养的异源四倍体棉花和其4倍体和2倍体亲缘植物的1200万个差异甲基化胞嘧啶的综合表观基因和功能。  生物通报道:中国约有2000年的棉花种植历史,是世界三大产棉国之一。长绒棉(纤维柔长)是纺高支纱的关

Genome-Biol:DNA破裂或会重新调节癌症基因的控制机制

  理解介导癌症基因组中广泛DNA损伤的机制一直以来都是癌症研究人员非常感兴趣的研究领域,近日,一项刊登在国际杂志Genome Biology上的研究报告中,来自贝勒医学院等机构的科学家们通过研究发现,基因组结构的变异或许能作为人类癌症中DNA甲基化改变(基因控制的一种形式)的一种特殊机制。  文章

揭示全基因组DNA甲基化、半甲基化与遗传突变的新方法

  5月31日,中国科学院北京生命科学研究院研究员孙中生团队与北京大学肿瘤医院合作,在Briefings in Bioinformatics上,发表了题为A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneousl

Nature:北大绘就首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱

  近日,北京大学交叉研究取得重要研究成果:绘就出世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱。此项研究工作为人们提供了一个全面的人类早期胚胎DNA甲基化调控网络的研究框架,对于人类认识自身早期胚胎发育过程中表观遗传调控机制、辅助生殖技术的安全性评估与改善,以及临床上疑难病例的诊治均具有非常重要的意义

植物DNA去甲基化的机理和功能

  10月19日,Journal of Integrative Plant Biology(JIPB)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组题为The mechanism and function of active DNA demethylation i

Nature-Methods发表单细胞重亚硫酸盐测序技术

  Babraham研究所和Wellcome Trust Sanger研究所的科学家们开发了一个单细胞表观遗传学检测技术,并将其发表在七月二十日的Nature Methods杂志上。这一成果可以帮助人们解读,环境怎样影响人类的发育和遗传性状。  “表观遗传学标志”是指DNA上的化学或蛋白标签,它们在

《Nature》子刊:植物“永生”细胞甲基化重编程机制

  生殖细胞通常被认为是“不朽的”,因为它们的遗传物质可被后代完全继承。  DNA甲基化是DNA的一种修饰,能在不改变基因序列的前提下改变DNA活性。以DNA甲基化等修饰为核心的表观遗传学是当代生命科学发展最快的领域之一,在改善人类和植物健康等方面具有很高潜力。  DNA甲基化重编程是动物体内最常见

北京基因组所等揭示Y染色体表观信息遗传机制

  表观遗传学是与传统遗传学相对应的概念。遗传学以基于DNA序列的中心法则来传递遗传信息,在人群中,遗传信息在世代之间稳定遗传,那么表观遗传信息是否像遗传信息一样可被子代继承,尚缺少相关有力证据。DNA甲基化是非常重要的表观遗传信息,是表观遗传学研究的重要内容。目前,鲜少有DNA甲基化在人群中的继承

中国科学院生物物理研究所朱冰研究团队等获国家自然科学奖二等奖

奖 日前,2023年度国家科学技术奖在京揭晓。中国科学院生物物理研究所研究员朱冰作为第一完成人的项目“细胞命运稳定性与可塑性的表观遗传调控机制”被授予2023年度国家自然科学奖二等奖。“每一个人的基因组都来自于父亲和母亲,但爸爸妈妈给我们的基因组效果一样吗?”朱冰告诉《中国科学报》,这个看上去简单的

遗传发育所在G蛋白提高水稻氮利用率的研究中取得进展

  哺乳动物受精后由一个受精卵发育成一个完整的个体,DNA甲基化则是指导受精卵发育成早期胚胎、进而发育成完整个体的最重要表观遗传调控方式之一。中国科学院北京基因组研究所刘江团队2013年揭示模式生物斑马鱼继承父代精子的甲基化图谱,但哺乳动物子代如何继承表观遗传信息仍知之甚少。刘江团队与南京大学黄行许

甲基化芯片在表观遗传学中的应用

  表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。    CpG岛的异常甲基化是导致基

甲基化芯片在表观遗传学中的应用

表观遗传改变可以定义为基因的遗传性或获得性改变,但是这种改变和DNA序列改变无关。DNA甲基化是最为常见的表观遗传改变;启动子或第一外显子CpG岛中的甲基化改变将导致基因表达失活;组蛋白的化学修饰也可以作为表观遗传改变;组蛋白发生乙酰化改变的基因通常被开启。CpG岛的异常甲基化是导致基因沉默和过度表