Cell新突破:CRISPR技术助力转录调控研究

CRISPRs 技术成为了最近的新宠儿,这种基因组编辑技术更易于操作,也具有更强的扩展性,近期来自加州大学旧金山分校,伯克利分校等处的研究人员发表了题为 “CRISPR-Mediated Modular RNA-Guided Regulation of Transcription in Eukaryotes”的文章,指出CRISPR技术可以用于真核细胞转录调控研究,CRISPRi可以作为真核细胞基因表达精确调控的一种通用工具。这一研究成果公布在Cell杂志在线版上。 领导这一研究的是加州大学旧金山分校的Jonathan S. Weissman研究组,华裔科学家齐磊(Lei S. Qi,音译)博士也参与了该项研究。 CRISPRs全称为规律成簇间隔短回文重复(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats),这是一类广泛分布于细......阅读全文

转录因子MdERF2调控苹果表皮蜡质合成

近日,山东理工大学农业工程与食品科学学院教授李富军团队完成的研究在《农业科学学报(英文)》 (Journal of Integrative Agriculture,JIA)正式发表。该研究发现了转录因子MdERF2调控苹果表皮蜡质合成的分子机制。表皮蜡质是影响果蔬品质形成与保持的重要因子。植物激素乙

植物所揭示果实成熟的转录后调控机制

  成熟是果实发育的重要阶段,伴随着颜色、香气及硬度等一系列变化。这一过程受到内外因素的共同调控,机制非常复杂。对果实成熟调控的有关机制开展研究,对于提高果实品质、优化贮藏保鲜技术具有很大的指导意义。近年来,有关果实成熟的转录调控已有较多报道,鉴定到多个重要的转录因子,对它们的作用机制也进行了较多研

玉米转录因子和籽粒重要转录因子互作协同调控醇溶蛋白

玉米(Zea mays)原产于墨西哥和中美洲地区,是一种由古印第安人(Indians)在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍(Euchlaenamexicana)(现存在于墨西哥和尼加拉瓜)杂交而来的品种。但是,作为一类重要的粮食作物,天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有的文献报道,玉米籽粒

玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2-调控醇溶蛋白

  玉米(Zea mays)原产于墨西哥和中美洲地区,是一种由古印第安人(Indians)在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍(Euchlaenamexicana)(现存在于墨西哥和尼加拉瓜)杂交而来的品种。但是,作为一类重要的粮食作物,天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有

中国科大揭示细胞有丝分裂期转录调控动态机制

中国科学技术大学生命科学与医学部教授瞿昆课题组和合肥微尺度物质科学国家研究中心特任研究员王志凯团队合作,揭示了细胞有丝分裂期转录调控动态机制。相关成果日前果发表于《科学进展》。细胞在进入有丝分裂时,通常伴随着染色质的逐渐固缩和基因转录的显著减少,而当细胞退出有丝分裂时,子细胞的染色质状态和基因转录又

研究揭示噬菌体蛋白调控宿主转录的分子机制

  7月11日,国际学术期刊《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所合成生物学重点实验室张余研究组与浙江大学医学院冯钰研究组合作完成的题为Structural basis for transcription anti

植物所在植物光形态建成转录调控方面取得进展

  转录调控是生物体内由转录因子和其他调节蛋白协同或拮抗调控基因表达的重要生化机制。光信号是高等植物早期生长发育中光形态建成的决定性因素,其信号通路中光敏色素互作因子PIF为负向调控因子,HY5为正向调控因子。PIF和HY5分别是bHLH型和bZIP型转录因子,在植物生长发育及环境响应中具有广泛的功

中科院JBC文章揭示转录调控新机制

  来自中科院广州生物医药与健康研究院、吉林大学等机构的研究人员证实,凝集蛋白复合体负向调控了基因组调控蛋白CTCF介导的核糖体RNA基因转录。这项工作发表在7月24日的《生物化学杂志》(JBC)上。   中科院广州生物医药与健康研究院的姚红杰(Hongjie Yao)是这篇论文的通讯作者。其主要

科学家揭示细胞更新转录调控新机制

中国科学技术大学教授刘行、姚雪彪,研究员王志凯合作,发现了书签标识因子FOXA1在细胞有丝分裂期过程中DNA结合模式转变的磷酸化调控机制,以及FOXA1转录凝聚体的形成与功能发挥的分子基础。9月13日,相关研究成果在线发表于《细胞报告》。细胞更新是生命的源泉,其质量控制是个体发育与生命健康的基础。细

探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究

  ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞,在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而,hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚,妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此,对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。   研究思

科学家揭示水稻转录因子高产抗病调控机制

  近日,《科学》在线发表了四川农业大学陈学伟团队、中科院遗传与发育生物学研究所李家洋院士团队及美国加州大学戴维斯分校Pamela Ronald团队合作在水稻产量与抗病协同调控机制研究领域取得的最新进展,揭示了水稻理想株型建成的关键基因IPA1既能提高产量又能提高稻瘟病抗性的调控新机制。  高产抗病

关于染色质结构对转录调控的影响介绍

  真核细胞中染色质分为两部分,一部分为固缩状态,如间期细胞着丝粒区、端粒、次溢痕,染色体臂的某些节段部分的重复序列和巴氏小体均不能表达,通常把该部分称为异染色质。与异染色质相反的是活化的常染色质。真核基因的活跃转录是在常染色质进行的。转录发生之前,常染色质往往在特定区域被解旋或松弛,形成自由DNA

The-Plant-Cell:茉莉酸信号转录调控机理研究取得进展

  作为一种重要的植物激素,茉莉酸不仅调控植物对于机械损伤、昆虫取食和腐生型病原菌侵害的防御反应,还参与调控诸多生长发育过程。basic Helix-Loop-Helix(bHLH)类型转录因子MYC2是茉莉酸信号通路的核心转录因子,其所指导的转录调控过程是整个茉莉酸信号通路的核心事件。目前人们对M

植物所在植物光形态建成转录调控方面取得进展

  转录调控是生物体内由转录因子和其他调节蛋白协同或拮抗调控基因表达的重要生化机制。光信号是高等植物早期生长发育中光形态建成的决定性因素,其信号通路中光敏色素互作因子PIF为负向调控因子,HY5为正向调控因子。PIF和HY5分别是bHLH型和bZIP型转录因子,在植物生长发育及环境响应中具有广泛的功

分子植物卓越中心揭示天然反义转录本调控机制

  近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在Nature Communications上,发表题为Natural antisense transcripts of MIR398 genes suppress microR398 processing and a

研究揭示纤维小体转录调控因子的结构功能机制

  纤维小体是一类可以高效降解木质纤维素生物质的多酶复合体,在生物质能源与合成生物学中具有广泛的应用价值。产纤维小体细菌根据底物种类调控纤维小体组分的表达,从而实现对特定底物类型的高效降解。在典型的产纤维小体细菌热纤梭菌中,一类特殊的σ和anti-σ因子SigI-RsgI负责感应底物并调控纤维小体基

探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究

  ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞,在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而,hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚,妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此,对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。   研究思

新一代CRISPRs有望成为2015年重磅技术

  当人们提到所谓的使能技术(enabling technologies),类似印刷机的发明,或者麻醉药的发现就会浮现在我们脑海中。而对于科学家来说,CRISPR-Cas9 系统就是这样一种系统。  这种细菌免疫系统能通过将病毒DNA中的短重复片段整合到细菌基因组中,来抵抗病毒。当细菌(或其后代)第

雄穗和果穗发育提前的转录调控变化获揭示

  近日,华南农业大学生命科学学院、岭南现代农业科学与技术广东省实验室王海洋课题组与中国农业科学院生物技术研究所合作,解析了玉米响应模拟密植条件下雄穗和果穗发育提前的转录调控变化,鉴定到一个以UB2/UB3/TSH4为核心的转录调控网络调控玉米花序发育响应密植遮荫信号。相关研究发表于The Plan

拟南芥转录复合物参与调控植物盐害反应机制

  在自然界中植物的生长发育往往受到各种环境胁迫(Environmental stresses)的影响,如高温、低温及干旱等。其中土壤的盐碱化(Salinity stress)是限制农作物栽培及产量的重要环境因子,但是人们对植物耐盐害的潜在分子机制仍不十分清楚。WRKY家族是一类植物特有的转

探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究(三)

5. PHB与HIRA复合体共同作用控制着IDH的表达研究者随后探究了PHB,HIRA对IDH-a-KG代谢通路的影响。研究发现,PHB,HIRA缺失导致了IDH表达显著减低,并伴随着细胞内α酮戊二酸的显著降低。而α酮戊二酸对于hESC干性的自我维持具有重要的作用。6. PHB和HIRA共同调控H3

雄穗和果穗发育提前的转录调控变化获揭示

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/12/491056.shtm 近日,华南农业大学生命科学学院、岭南现代农业科学与技术广东省实验室王海洋课题组与中国农业科学院生物技术研究所合作,解析了玉米响应模拟密植条件下雄穗和果穗发育提前的转录调控变化,

Cell:武汉大学阐明真核基因中的转录调控机制

  近日,来自武汉大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员在新研究中证实,SR蛋白与7SK和启动子相关新生(Nascent )RNA协同作用,促进了转录过程中停顿的聚合酶释放。这一研究发现为阐明真核基因中的转录调控机制,深入了解相关疾病提供了重要的理论依据。相关论文发表在5月9日的《细胞》(Cell

分子植物卓越中心揭示抗铝毒转录因子调控机制

  10月21日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心研究员黄朝锋研究组在Plant Cell上在线发表题为Regulation of Aluminum-Resistance in Arabidopsis Involves the SUMOylation of the Zin

探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究(一)

ESC在体外可无限自我更新和分化为机体内任何种类的细胞,在器官再生和细胞替代治疗中具有广阔的应用前景。然而,hESC维持自我更新及发育多能性的分子调控机制还有很多问题尚不清楚,妨碍了将其分化的细胞安全有效地应用于临床。因此,对人ESC如何维持其自身特性的机制进行深入的研究尤为重要。研究思路 研究结果

效应性Treg细胞分化的转录调控研究中取得进展

  调节性T细胞(Treg)是具有免疫抑制功能的T细胞,其主要的功能是抑制效应T细胞介导的免疫反应及维持机体的免疫耐受。效应性Treg只占次级淋巴器官和外周循环Treg细胞的较少一部分,大多数分布于各种组织脏器,效应性Treg是一群已经接受过抗原刺激、活化程度比较高且具有较强的免疫抑制功能的Treg

效应性Treg细胞分化的转录调控研究中取得进展

  调节性T细胞(Treg)是具有免疫抑制功能的T细胞,其主要的功能是抑制效应T细胞介导的免疫反应及维持机体的免疫耐受。效应性Treg只占次级淋巴器官和外周循环Treg细胞的较少一部分,大多数分布于各种组织脏器,效应性Treg是一群已经接受过抗原刺激、活化程度比较高且具有较强的免疫抑制功能的Treg

效应性Treg细胞分化的转录调控研究中取得进展

  调节性T细胞(Treg)是具有免疫抑制功能的T细胞,其主要的功能是抑制效应T细胞介导的免疫反应及维持机体的免疫耐受。效应性Treg只占次级淋巴器官和外周循环Treg细胞的较少一部分,大多数分布于各种组织脏器,效应性Treg是一群已经接受过抗原刺激、活化程度比较高且具有较强的免疫抑制功能的Treg

探究转录因子对于hESC代谢调控新机制研究(二)

 3. PHB与HIRA复合体相互作用为了研究清楚PHB在hESC中如何发挥作用,研究者采用IP和MS的技术发现除了线粒体的一些相关蛋白外,HIRA也与PHB相互作用。进一步研究发现,PHB结构域介导了PHB与HIRA的结合。由于HIRA复合体的成员还有UBN1和CABIN1,研究者继续研究了PHB

转录中介体复合物如何调控茉莉酸信号途径

  转录中介体 (Mediator)是由多个在进化上高度保守的亚基组成的蛋白复合物。在基因转录过程中,转录中介体分别与基因特异的转录因子和RNA聚合酶II相互作用,广泛参与二者之间的信息传递,被称为真核生物基因转录的中央控制器。在植物激素信号转导研究中,人们主要关注激素特异的转录因子的作用,但对