单细胞测序新突破:北大绘制出人类胚胎基因调控图谱

北京大学第三医院的汤富酬研究员等采用先进的单细胞RNA测序技术,绘制出人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组图谱,有望在干细胞领域改善人类辅助生殖技术,以及预测潜在遗传病产生的健康影响。研究成果发表在8月11日《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。 细胞在特定阶段转录的全部RNA称为转录组,其有助于全面理解细胞中基因表达和调控的作用。同一组织中细胞基因型几乎是一致的,而转录组往往不同,这能反映细胞间甲基化和组蛋白等修饰的差异;不同组织的细胞具有不同的转录组,这些信息可从生理功能和遗传表型的角度分析基因调控网络。 单细胞测序研究胚胎发育 人类胚胎发育早期仅能收集微量的胚胎细胞和干细胞,这对于了解控制胚胎发育的基因调控网络是一个难题(因为转录组分析一般需要大量的细胞)。对此,研究人员利用单细胞RNA测序技术对转录组进行分析,从而克服......阅读全文

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。

Nature:单细胞测序(下)

  随着技术的飞速发展,成本大大降低,使得基因组测序成为常规技术。然而,大多数的人类基因组、癌症或其他仍然是通过从多个细胞中抽提DNA来进行测序,它所忽略的细胞间的差异对于控制基因表达、细胞行为和药物反应却有可能是至关重要的。   该研究小组也观测了其他类型的乳腺癌。将肿瘤作为一个整体测序,研究小

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。

如何-解读-单细胞-测序

单细胞测序是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。简介编辑细胞是生物学的基本单位,研究人员正更加努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。更大更复杂的人类细胞基因组。随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并逐个细胞比较序列正在变为现实。

单细胞测序方法汇总

单细胞生物学研究一直是当今的热门话题,而且-前沿的领域就是单细胞RNA测序了(scRNA-seq)。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序,并给出平均差异,但并没有两个细胞是完全一样的,而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变,甚至这种技术还能够阐明完整

Nature:单细胞测序(上)

  Nicholas Navin所需要的就只是一个细胞――问题是如何得到它。这是在2010年,冷泉港实验室的博士后研究员正在探究驱动乳腺癌的遗传改变。此前的大部分癌症基因组研究都是碾碎少量的肿瘤组织,一并将这些DNA进行测序,生成的是一张癌症基因组的一致图像。但Navin想要解析来自单个细胞的序

单细胞测序推进了基因组的发展领域

单细胞测序能够帮助我们了解那些难以培养的微生物的基因组功能、了解遗传镶嵌功能在普通生物学功能或是疾病发生中的作用、肿瘤内在异质性对肿瘤发展以及耐药性的影响、重新定义细胞亚型等等。  单细胞测序可以揭示出每个细胞独特的微妙变化,甚至可以揭示全新的细胞类型,测序技术可谓是科技发展的一大创举,它推进了基因

Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序

2018年11月,Namocell与CZ-Biohub(Chan Zuckerburg Biohub)合作,在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞,并且将其进行单细胞测序,为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序(scRNA-s

我国学者发表基于单细胞转录组测序数据的小鼠细胞图谱

  在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序

我国学者发表基于单细胞转录组测序数据的小鼠细胞图谱

  在国家自然科学基金项目(项目编号:31722027)等资助下,浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板测序

单细胞核RNA测序技术建立了种子早期胚乳发育的转录图谱

  种子是裸子植物和被子植物特有的繁殖体,是胚珠经过受精以后形成的结构,在植物生命周期中处于关键位置。种子主要由种皮、胚和胚乳组成。其中胚乳是大多数开花植物双受精后产生的组织,一般为三倍体(每个细胞核有三套染色体),胚乳中含有丰富的营养物质,是人类消耗热量的主要来源。  基因组印迹是一种表观遗传基因

Nature子刊发布重磅测序技术:基因组和转录组平行测序

  四月二十七日的Nature Methods杂志上发布了一项引人注目的测序技术,G&T-seq(Genome and Transcriptome Sequencing)。该技术能够实现大规模的DNA和RNA平行测序,同时展现单个细胞的基因组序列和基因活性。  研究人员用G&T-seq对220个小鼠

RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止?

  近日,南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化(polyadenylation)的转录本在

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

转录组高通量测序

(第二代高通量测序技术-454)  转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titanium第二代

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

转录组测序流程步骤

以真核转录组测序为例,实验流程为总RNA提取-mRNA分离-建库试剂-定量-文库回收-桥式扩增-上机测序;项目分析流程为数据产出数据=数据去杂-转录组拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注释-基因表达差异分析-差异基因表达模式聚类-差异基因富集分析。

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

谢晓亮:单细胞全基因组测序曙光初现

   谢晓亮  12月21日出版的美国《科学》杂志发表了题为《单细胞全基因组测序探索精子重组规律和遗传缺陷》的论文。同时,该期《科学》杂志也将单细胞全基因测序列为2013年六大值得关注的科学领域之一。  该论文由美国科学院院士、哈佛大学教授谢晓亮课题组与北京大学生物动态光学成像中心(

单细胞基因组测序:从实验到分析,步步解析

随着生命科学研究的微观化,基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域(如肿瘤异质性、早期胚胎发育等)。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序,解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题,为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。【应用概览】从20

上海欧易生物医学-单细胞转录组测序和分析申报ANTOP奖啦

带着三月的未完成,在四月奔跑起来,即使道路泥泞,也会收获遍野的烂漫。2023年ANTOP奖的申报和评审工作如火如荼的开展。由上海欧易生物医学科技有限公司申报的“高通量单细胞转录组测序杰出分析”ANTOP奖,现在进入大众评审阶段,诚邀各位伙伴们的投票!  奖项名称:高通量单细胞转录组测序杰出分析奖  

单细胞转录组制备仪的功能

  fluidigm C1 单细胞自动制备仪用于 mRNA 测序 更完整的流程  -首尾相连的流程对单细胞进行全转录组分析 最高的通量  -每次运行可前所未有的平行处理 96 个单细胞 更容易的操作  -直接从单细胞开始,简化的样本制备,只需 3 小时手工操作时间,没有 片段化和纯化步骤 更节省的成

科学家Nature子刊研发出高通量单细胞转录组测序新方法

  单细胞转录组测序技术在单个细胞水平上对转录组进行高通量测序分析,从而揭示单个细胞内所有基因的表达和细胞间的异质性。单细胞转录组测序目前存在的挑战是如何高效地操控单个细胞,如何对大量的低拷贝数mRNA进行无偏倚扩增,如何避免背景游离mRNA的污染,以及如何同时对大量的单细胞进行并行测序以降低成本。

单细胞测序新突破:-北大绘制出人类胚胎基因调控图谱

  北京大学第三医院的汤富酬研究员等采用先进的单细胞RNA测序技术,绘制出人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组图谱,有望在干细胞领域改善人类辅助生殖技术,以及预测潜在遗传病产生的健康影响。研究成果发表在8月11日《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular

单细胞基因测序技术ZL布局中的“中国力量”

  高通量单细胞基因测序技术是一项在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的新技术。有关研究显示,该技术对于筛选新冠病毒特异性中和抗体具有独特优势。中和抗体是指当病原微生物侵入机体时,由B淋巴细胞产生的某些抗体;该抗体能够阻止病原微生物侵入细胞。  3月20日,来自北京知识产权运营管理有限公司(以下简称

单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna

深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列,如测序前将dna打成小的片段,测序是从这个片段的两端测的,即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组,这要看你做什么了,一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转,这其实要看你想做什么分析,如做转

单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna

深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列,如测序前将dna打成小的片段,测序是从这个片段的两端测的,即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组,这要看你做什么了,一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转,这其实要看你想做什么分析,如做转

单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna

深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列,如测序前将dna打成小的片段,测序是从这个片段的两端测的,即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组,这要看你做什么了,一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转,这其实要看你想做什么分析,如做转

全转录组测序文章

研究背景       长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)普遍被认为是一类不能编码蛋白的长链RNA。由于其序列较长,所以可以有较大的潜力形成多种复杂构象,从而通过不同生物学途径发挥其作用。此外,由于其不具备蛋白编码能力,因此此类RNA也主要由其碱基序列形成的高级

如何让单细胞测序变得简单?

单细胞生物学研究一直是当今的热门话题,而且最前沿的领域就是单细胞RNA测序了(scRNA-seq)。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序,并给出平均差异,但并没有两个细胞是完全一样的,而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变,甚至这种技术还能够阐明完整