科学家Nature子刊研发出高通量单细胞转录组测序新方法

单细胞转录组测序技术在单个细胞水平上对转录组进行高通量测序分析,从而揭示单个细胞内所有基因的表达和细胞间的异质性。单细胞转录组测序目前存在的挑战是如何高效地操控单个细胞,如何对大量的低拷贝数mRNA进行无偏倚扩增,如何避免背景游离mRNA的污染,以及如何同时对大量的单细胞进行并行测序以降低成本。 来自厦门大学杨朝勇研究团队与美国斯坦福大学理查德·杰尔(Richard N. Zare)等团队合作,在高通量单细胞转录组测序新方法新器件研究方面取得重要进展。相关研究成果以Highly parallel and efficient single cell mRNA sequencing with paired picoliter chambers (基于皮升级腔室配对的高效单细胞mRNA并行测序方法)为题公布在Nature Communications杂志上。 杨朝勇课题组与合作者开发了一种全新的高通量单细胞......阅读全文

科学家Nature子刊研发出高通量单细胞转录组测序新方法

  单细胞转录组测序技术在单个细胞水平上对转录组进行高通量测序分析,从而揭示单个细胞内所有基因的表达和细胞间的异质性。单细胞转录组测序目前存在的挑战是如何高效地操控单个细胞,如何对大量的低拷贝数mRNA进行无偏倚扩增,如何避免背景游离mRNA的污染,以及如何同时对大量的单细胞进行并行测序以降低成本。

安诺开年力作:单细胞转录组测序登陆Nature子刊

  X染色体失活(XCI)是指雌性哺乳类细胞中,两条X染色体的其中之一失去活性的现象,过程中X染色体会被包装成异染色质,进而因功能受抑制而沉默化。Xist RNA是能引发X染色体沉默的长片段ncRNA,尽管Xist对XCI是必要的,但其对胚胎植入前的印记XCI的精确作用尚存争议。近日,安诺优达与法国

高通量单细胞转录组测序发展与展望

单细胞转录组测序技术这几年的发展之快,运用之广已众所周知。为更好的在国内推广该技术,也为更好的将该技术运用到广大科研工作者的实际工作中,上海生物芯片有限公司生物信息团队通过对该技术的整理和归纳,在《生命科学》杂志上发表了名为“高通量单细胞转录组测序发展与展望”综述文章,希望能进一步提升科研工作者对该

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

转录组高通量测序

  (第二代高通量测序技术-454)   转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu

转录组高通量测序

(第二代高通量测序技术-454)  转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titanium第二代

Nature子刊:癌症单细胞测序新技术

  只有通过近距离观看修拉(Seurat)的绘画,你才能鉴别出点描法背后的复杂性。其在模式中应用了不同的纯色小点,从远处看就形成了一幅图像。与之相似,生物学家们和遗传学长期以来也在寻求在单细胞水平上分析基因的图谱,然而技术局限性使得直到现在也只能在远处遥望。   发布在7月22日《自然生物技术》(

华人学者Nature子刊单细胞基因组测序新突破

  在加州大学圣地亚哥分校生物工程师们的领导下,研究人员生成了来自单个大肠杆菌细胞以及人类大脑单个神经元的最完整基因组序列。采用一项新的单细胞基因组测序技术,他们在只有12纳升体积、充满液体的小孔中完成了基因组扩充,从而获得了这一突破性的成果。该项研究发表在11月10日的《自然生物技术》(Natur

中国科学家Nature子刊基因组测序新成果

  感染结核病永远都不会有一个最合适的时间,近年来形势变得更加的糟糕。   尽管已经开展了数十年的抗生素研究,随着结核耐药菌株的增长,当前的治疗方案仍然非常的有限。在2010年,至少有65万结核病例对两种最有效的一线抗生素耐药。在2012年,在印度发现了完全耐药和无法有效治疗的结核分枝杆菌。  

Nature-子刊:用高通量免疫测序诊断病毒感染

  药明康德合作伙伴 Adaptive Biotechnologies 宣布在《自然》子刊《Nature Genetics》上发表创新型研究论文,结果证明可提供一种潜在的新颖方法诊断慢性病毒感染。  Adaptive Biotechnologies 是高通量测序领域的先驱性公司和领军企业之一,其专长

Nature子刊:外显子组测序揭示体细胞突变

  半侧巨脑综合症HME是一种罕见的严重大脑发育畸形,患者大脑两个半球之一过度生长,造成大脑发育不对称。在患有严重癫痫的儿童中常常诊断出这种疾病,而其病因还鲜为人知。目前该疾病的治疗手段是通过手术摘除大脑的患病部分,但手术会对患者的语言和认知能力造成损害。   加利福尼亚大学的研究团队发现,半侧巨

Nature子刊:测序循环肿瘤细胞的外显子组

  科学家们首次对循环肿瘤细胞(CTC)进行了单细胞外显子组测序,这样的技术可以为人们展示肿瘤演化、转移和应答药物的具体过程。   前列腺肿瘤很容易转移到骨组织,而这样的转移很难用传统方法进行检测。这个问题大大影响了医生们对癌症的监控和治疗。现在一项新研究指出,只需要简单抽血就可以解决这个问题,监

Nature子刊发布重磅测序技术:基因组和转录组平行测序

  四月二十七日的Nature Methods杂志上发布了一项引人注目的测序技术,G&T-seq(Genome and Transcriptome Sequencing)。该技术能够实现大规模的DNA和RNA平行测序,同时展现单个细胞的基因组序列和基因活性。  研究人员用G&T-seq对220个小鼠

复旦大学Nature子刊绘制大鼠转录组图谱

  来自复旦大学、美国食品药品监督管理局(FDA)国家毒理学研究中心、洛马林达大学等机构的研究人员,成功绘制出了涵盖11种器官和4个发育阶段的大鼠RNA测序转录组图谱,这一重要的研究成果发表在2月10日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。   复旦大学的石乐明(

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。

单细胞测序和转录组测序的区别

单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。

科学家构建空间转录组测序新方法

  中科院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾课题组新近创立了一种技术方法,可以获得具有空间位置信息的少量细胞转录组图谱。相关研究成果日前在线发表于《自然—实验室指南》。  无论是体内组织还是体外细胞系,不同细胞之间都存在着差异性,即细胞的异质性。细胞的异质性对解释肿瘤的发生、干细胞或前体细胞的多能性与

中国科学家Nature子刊测序新文章

  来自西南大学、深圳华大基因研究院等10家研究机构的研究人员,成功绘制出了川桑(Morus notabilis)的基因组序列草图,从而为推动桑树改良提供了一个宝贵的资源。相关论文发表在9月19日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。   西南大学的向仲怀(Z

Nature子刊:基因组测序揭示脑瘤驱动基因

  通过大规模基因组测序,来自Dana-Farber癌症研究所和Broad研究所的科学家们揭示了两个DNA突变,其似乎驱动了15%的脑膜瘤。这一研究发现有可能促成针对这类肿瘤的第一个有效药物治疗。   脑膜瘤是一种形成于脑膜及脑膜间隙,生长缓慢的肿瘤,通常为良性。但当脑膜瘤长到极大时,可导致癫痫发

北京大学Nature子刊单细胞RNA测序新成果

  来自北京大学第三医院、教育部辅助生殖重点实验室的研究人员,采用先进的单细胞RNA测序技术绘制出了人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组全景图,这一重要的研究成果发表在8月11日的《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。   

科学家开发单细胞全转录组测序新技术

  北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表题为“Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing”的论文。该研究利用微流控芯片技术实现了高质量单细胞的全转录组测序样品准备,全面提高了单细胞全

针对稀有样本——新方法提高单细胞转录组测序的效率

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院医工所微纳系统与仿生医学研究中心研究员陈艳和南加州大学教授钟江帆合作,在针对稀有细胞样本的单细胞测序技术方面取得新进展。相关研究成果以Improving single-cell transcriptome sequencing efficiency with a

Nature子刊报道单细胞技术突破

  人类肠道是一件了不起的事情。每周,肠道都会再生一层新的内皮细胞,脱落的表面面积相当于一个小型公寓,并用新的细胞进行修复。几十年来,研究人员已经知道,负责这一改头换面行为的是肠道干细胞,但是直到今年,美国北卡大学教堂山分校(UNC)医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne

复旦钟扬教授Nature子刊基因组测序成果

  青藏高原(Qinghai-Tibet Plateau,QTP)引起极端环境而具有最高的生物多样性,为研究适应性进化提供了一个理想的天然实验室。近期,来自复旦大学、云南大学、青海民族大 学、中科院水生生物研究所、牛津大学等处的研究人员,在Nature子刊《Scientific Reports》在线

华人学者Nature子刊:人类转录组跨平台靶向分析

  来自普林斯顿大学等处的研究人员发表了题为“Targeted exploration and analysis of large cross-platform human transcriptomic compendia”的文章,公布了一种新研发的针对转录组数据的搜索引擎,利用这一平台,研究人员可

Nature子刊:新型单细胞测序方法可有效追踪癌症免疫细胞

  近年来,随着精准医疗的发展,癌症治疗已经取得了长足的进步,其中借助免疫系统开发的多种治疗方法被人们寄予厚望。虽然部分治疗方法在临床治疗中已经获得一定的成功,但大多数只对部分患者有效,并且还会导致耐药、超进展以及免疫相关严重不良反应等问题。因此,了解免疫系统在癌症治疗中的表现,准确筛选最有可能获益

Nature子刊发布单细胞转录组开创性研究成果

  来自苏黎世大学的生物学家们开发出了一种可在单细胞中显像基因活性的新方法。这种方法如此的高效,从而使得研究人员第一次在1万个人类单细胞中平行研究了 1000种基因,揭示出基因的活性和生成的转录分子的空间结构在单细胞之间存在显著差异。这一新方法可广泛应用于基础研究和医学诊断等领域。   当细胞