木乃伊肺部DNA发现肺结核基因揭示古代疾病史

英国华威大学的研究人员利用宏基因组学技术,从一个215年历史的木乃伊中发现了肺结核(TB)基因组。这项成果于2013年7月18日发表在《新英格兰医学杂志》上。1994年,匈牙利发现了一个包含242具尸体的地下墓室。许多尸体被自然木乃伊化,包括Terézia Hausmann的遗体,她死于1797年12月25日,享年28岁。之前对其胸部样本的分子分析证实了肺结核的诊断,并暗示TB DNA在其体内保存得非常完好。 于是,Mark Pallen教授领导的研究小组从肺部组织中提取出DNA,并在Illumina MiSeq上对DNA进行测序,获得了550万个末端配对读取。他们发现,不到1%的读取定位到人类基因组,而8%定位到结核分枝杆菌(M.tuberculosis)参考菌株H37Rv。 由于Pallen教授所在的实验室未培养结核分枝杆菌,也没有开展相关的PCR分析,同时他们获得了深度且均一的基因组覆盖,故他们......阅读全文

常用微生物菌株

常用微生物菌株 /质控菌株/对照菌株  菌种编号菌种名称菌种编号菌种名称ATCC 16404黑曲霉CMCC(B) 51105痢疾志贺氏菌CMCC(F) 98003黑曲霉CMCC(B) 51572福氏志贺氏菌As 3.2788桔青霉CMCC(B) 51592宋氏志贺氏菌MIG3.104绳状青霉ATCC

常用微生物菌株

常用微生物菌株 /质控菌株/对照菌株  菌种编号菌种名称菌种编号菌种名称ATCC 16404黑曲霉CMCC(B) 51105痢疾志贺氏菌CMCC(F) 98003黑曲霉CMCC(B) 51572福氏志贺氏菌As 3.2788桔青霉CMCC(B) 51592宋氏志贺氏菌MIG3.104绳状青霉ATCC

研究发现千年前四株菌导致中国今天结核病疫情

  复旦大学基础医学院高谦教授带领柳清云博士后,与中国疾病预防控制中心结核病控制中心赵雁林副主任以及美国威斯康星大学麦迪逊分校Caitlin S. Pepperell教授等合作,对中国31个省76个研究现场来源的4578株结核菌株进行基因分型和测序,并整合51个国家地区的15591株结核菌基因组数据

研究发现千年前四株菌导致中国今天结核病疫情

  复旦大学基础医学院高谦教授带领柳清云博士后,与中国疾病预防控制中心结核病控制中心赵雁林副主任以及美国威斯康星大学麦迪逊分校Caitlin S. Pepperell教授等合作,对中国31个省76个研究现场来源的4578株结核菌株进行基因分型和测序,并整合51个国家地区的15591株结核菌基因组数据

北京基因组所等全景解析我国耐多药结核病

  近日,中国科学院北京基因组研究所陈非研究组与北京胸科医院暨国家结核病临检实验室许绍发、黄海荣课题组合作,针对我国首次“全国结核病耐药性基线调查”采集的4600份样本所获取的357株耐多药 (Multi-drug resistance, MDR) 结核病菌株,进行了大规模基因组测序,结合迄今为止最

自然子刊综览

  《自然—纳米技术》   新型药用纳米粒子结构可分解排出体外   将DNA链和纳米粒子当作构件,组装成一种可以增强摄取小鼠体内肿瘤的纳米结构,并在之后发生分解,改善体内清洁度,最终降低潜在毒性。发表在《自然—纳米技术》上的这项研究结果为抗癌药物投递的安全、可控提供了一种新策略。   为了改进

全基因组测序鉴定非洲结核杆菌病原体早期感染情况

  最近,发表在《PNAS》杂志上的一项研究检查了南非地区爆发的广泛耐药结核病流行株LAM4 / KZN的进化和流行病学历史。   该菌株首次报道于2005年在夸祖鲁-纳塔尔省的图格拉渡轮,此后已在全省广泛传播。这项新研究确定了促进XDR-TB菌株疫情爆发的关键宿主,病原体和环境因素,以及可以采

PNAS:全基因组测序鉴定非洲结核杆菌病原体早期感染

  最近,发表在PNAS的一项研究检查了南非地区爆发的广泛耐药结核病流行株LAM4 / KZN的进化和流行病学历史。  该菌株首次报道于2005年在夸祖鲁-纳塔尔省的图格拉渡轮,此后已在全省广泛传播。这项新研究确定了促进XDR-TB菌株疫情爆发的关键宿主,病原体和环境因素,以及可以采取的早期发现和遏

一种肺结核菌在压力下会“休眠”

  据最新一期《自然·通信》杂志报道,美国研究人员发现了细菌在受压时自行关闭并进入维持状态的一种机制。这种控制机制有助细胞在紧急情况下迅速转移资源。此项新发现将有助于开发出针对结核病等疾病的新抗生素。  许多细菌包括引起结核病的菌株,使用这种策略进入休眠状态,从而使其在缺乏氧气或营养的恶劣环境中继续

一种肺结核菌在压力下会“休眠”

  据最新一期《自然·通信》杂志报道,美国研究人员发现了细菌在受压时自行关闭并进入维持状态的一种机制。这种控制机制有助细胞在紧急情况下迅速转移资源。此项新发现将有助于开发出针对结核病等疾病的新抗生素。  许多细菌包括引起结核病的菌株,使用这种策略进入休眠状态,从而使其在缺乏氧气或营养的恶劣环境中继续

质控菌株及其保存与应用

一.菌种类型   (一)标准茵株    要搞好临床微生物学检验质控,必须保存有一批标准菌株,作为对仪器、培养基、染色液、试剂和诊断血清的质控菌株,也可作为从事细菌检验的工作人员熟悉某些菌株的教具。    1.标准菌株的条件     (1)形态、生理、生化及血清学特性典型,并相当稳定。   (2)菌株

实验室菌株保存方法

菌种作为一项重要的生物资源,对微生物学教学和研究是必不可少的。菌种保存方法因微生物的不同而异。在菌种保存过程中,必须使微生物的代谢处于最不活跃或相对静止的状态,才能在一定的时间内不发生变异而又保持生活能力。低温、干燥和隔绝空气是使微生物代谢能力降低的重要因素,故菌种保存方法多依据这三个因素而设计。菌

生物学标准菌株来源

是由国内或国际菌种保藏机构保藏的,遗传学特性得到确认和保证并可追溯的菌株。生物学特性敏感的标准菌株可用于培养基、试剂、染色液和抗血清的质控,对抗菌药敏感的标准株可用于做药敏试验的质控,标准菌株还可用于鉴定未知被检菌时作为对照使用,还可作为制备诊断用抗血清的抗原以及用来测定商品抗血清的效价等。

益生菌菌株和数量怎样认识?

  益生菌的最大特点是其作用和疗效具有菌株特异性和剂量依赖性,  也就是说,某些特定的益生菌菌株具有的效果并不代表所有该种或该属的益生菌均具有这一效果。  有的实验显示,同一菌种不同菌株的作用差别很大,甚至可能出现相反的作用。  另外相同的益生菌菌株,由于剂量不同,其效果也有明显的差异。  这可以解

标准菌株存活性怎么进行?

标准菌株存活性就是其的复活过程,我们购买的标准菌株一般是冻干粉或者冻干管,然后我们要对其进行复活培养,这个过程是必须的,否则我们没有办法使用。针对其存活性的验证,所有的标准法规中都是其存活性的判断,一个定性的判断。复活的过程对其进行打管,按照标准要求进行培养,如果接种到液体培养,有肉眼可见的浑浊或者

简述菌株的主要特征

  ①菌株实为一个物种内遗传多态性的客观反映,其数目几乎是无数的;  ②菌株这一各词所强调的是遗传型纯的谱系;  ③菌株与克隆(即无性繁殖系)的概念相同;  ④在同一菌种的不同菌株间,作为鉴定用的一些主要性状虽个个相同,但不作为鉴定用的一些“小”性状却可有很大差异,尤其是一些生化性状、代谢产物(抗生

标准菌株的管理与控制!

  一、目的  规范用于微生物实验质量控制和操作评估的标准菌株管理与使用程序,尽量减少交叉污染确保实验结果可靠与实验室安全。  二、范围  本工作指引适用于微生物实验室所有标准菌株的管理与使用。  三、参考  四、内容  4.1 程序  1.标准菌株的复壮  a.将复壮所用的0.5-1ml液体培养基

利用454技术进行结核杆菌全基因组测序有效追踪疫情传播

  众所周知,肺结核多数是由结核分枝杆菌感染肺部引起的肺部感染性疾病,已成为一个严重威胁人类健康的疾病。世界卫生组织(WHO)统计表明,全世界每年发生结核病800~1000万,每年约有300万人死于结核病,是造成死亡人数最多的单一传染病。1993年WHO宣布“全球结核病紧急状态”, 认为结核病已

科学家携手合作共同发现结核病起源新说

  复旦大学上海医学院{谦教授带领他的博士研究生罗涛等与瑞士、英国等9国科学家开展合作,经3年多艰苦研究,纠正了学术界以往 “结核病是在约1万年前的新石器时期由圈养的野生动物传给人类”的观点,并以确凿的证据证明“结核病早在7万年前就与人类共存于现代人的发源地――非洲,并伴随着人类的大迁移‘走出非

-mBio:宏基因组学揭示700年前男性骨架中的布鲁氏菌感染

  华威大学的研究人员和意大利人类学家Raffaella Bianucci一起,从意大利一个中世纪村庄的废墟中找到了一个700年的人类骨架,并且从中分离出了致病性细菌——布鲁氏菌,获得了其全部基因组信息。  布鲁氏菌是能够引发人畜共患病的一种致命细菌,通常是从未经高温消毒的奶制品或者直接接触感染的动

人肠道菌株资源库建立

   肠道微生物与宿主健康和生长发育密切相关。微生物所供图  近日,中科院微生物所研究员刘双江团队构建了包含400个不同物种的健康人群肠道微生物菌株资源库(hGMB),相关成果发表于《微生物组》期刊。  越来越多的证据表明,肠道微生物与宿主健康和生长发育密切相关。目前,仅有不足半数的肠道微生物物种,

关于大肠杆菌菌株的简介

  大肠杆菌(Escherichia coli)大肠埃希氏菌,它是一种普通的原核生物,根据不同的生物学特性将致病性大肠杆菌分为6类:肠致病性大肠杆菌(EPEC)、肠产毒性大肠杆菌(ETEC)、肠侵袭性大肠杆菌(EIEC)、肠出血性大肠杆菌(EHEC)、肠黏附性大肠杆菌(EAEC)和弥散粘附性大肠杆菌

关于菌株的基本信息介绍

  菌株(在非细胞型的病毒中则称毒株或株)是指从不同来源的标本中分离而得的相同菌种,它表示任何由一个独立分离的单细胞(或单个病毒体)通过无性繁殖而成的纯遗传型群体及其一切后代。因此,一种微生物的每一不同来源的纯培养物或纯分离物均可称为某菌种的一个菌株。如培养伤寒杆菌时可从血液中、骨髓中、粪便中、胆汁

盆腔结核的抗结核药物治疗

  抗结核药物的出现,使结核病的治疗发生了大的变革和飞跃,其他治疗措施已大多废弃,以往需要手术的病例也为安全、简便、更有效的药物治疗所替代。但为了要达到理想疗效,必须贯彻合理化治疗的五项原则,即早期、联合、适量、足程和规则使用敏感药物。早期结核病变处于细菌繁殖阶段,病变愈早愈新鲜,血供愈佳,药物愈易

全基因组测序揭示结核分枝杆菌的抗生素“预抗性”特征!

  细菌全基因组测序的最新进展让研究人员成功绘制出了结核分枝杆菌抗生素耐药基因组特征的完整目录;近日,一篇发表在国际杂志Nature Communications上题为“Genomic signatures of pre-resistance in Mycobacterium tuberculosi

结果当天可取,基因测序让结核病检测廉价迅捷

  日前,英国牛津大学的研究人员利用全基因组测序技术,开发出一种创新结核病 (Tuberculosis, TB) 诊断检测方法。这一检测方法可以在24小时之内检测出患者是否患有结核病,并且确定结核病菌的抗药性,对改善结核病治疗和防止结核病扩散都有非常重大的影响。  结核病是世界范围的流行性传染病。据

结核分枝杆菌鉴定方法

1.1 萋尼氏抗酸染色痰涂片显微镜检查 目前萋尼氏抗酸染色痰涂片显微镜检查是我国结核病实验室使用最为 普遍的方法,其操作简单快捷,特异性高,设备要求低,但是灵敏度较低,不能及时发现病人。1.2 发光二极管荧光显微镜(LED荧光显微镜)发光二极管荧光显微镜管利用二极管光源,延长了显微镜使用寿命,不需要

结核分枝杆菌鉴定方法

1.1 萋尼氏抗酸染色痰涂片显微镜检查 目前萋尼氏抗酸染色痰涂片显微镜检查是我国结核病实验室使用最为 普遍的方法,其操作简单快捷,特异性高,设备要求低,但是灵敏度较低,不能及时发现病人。1.2 发光二极管荧光显微镜(LED荧光显微镜)发光二极管荧光显微镜管利用二极管光源,延长了显微镜使用寿命,不需要

Nature关注俄罗斯的超级耐药菌

  俄罗斯是耐药结核杆菌的重灾区,现在科学家们发现,这些耐药菌中的新突变可以让它们在多重耐药的同时,保持很强的传染性。   近年来,抗生素滥用现象使耐药菌日渐增多,目前这已经成为了一个全球性的公共健康问题。现在,超级细菌变得更加厉害了。研究人员分析了1,000个结核杆菌分离株的基因组,发现俄罗斯结

概述盆腔结核的抗结核药物治疗

  抗结核药物的出现,使结核病的治疗发生了大的变革和飞跃,其他治疗措施已大多废弃,以往需要手术的病例也为安全、简便、更有效的药物治疗所替代。但为了要达到理想疗效,必须贯彻合理化治疗的五项原则,即早期、联合、适量、足程和规则使用敏感药物。早期结核病变处于细菌繁殖阶段,病变愈早愈新鲜,血供愈佳,药物愈易