“超级增强子”调控关键基因科学家为其编目录
据物理学家组织网10月10日报道,最近,美国怀特黑德生物医学研究所科学家发现了一套称为“超级增强子”的基因调控器,能控制、影响人类和小鼠的大量细胞型。研究人员指出,超级增强子富集在基因组的变异区,而这些变异区与多种疾病谱系密切相关,所以它们最终可能在疾病诊断与治疗方面发挥重要作用。相关论文在线发表于当天的《细胞》杂志网站上。 今年4月,该研究所的理查德·杨首次在《细胞》杂志上发表了关于超级增强子的研究。论文称,虽然基因控制元素的整体数量可能达数百万之多,但只有几百个超级增强子控制着关键基因,赋予每个细胞本身独特的属性和功能。当时杨曾表示,他的发现主要建立在胚胎干细胞研究的基础上,有助于解决所有人类细胞的调控线路问题。最近的研究则向这一目标迈进了一大步:为近百种人类细胞和组织内的超级增强子编制了一份目录。 “我们已经从几个细胞跨越到大范围的人类细胞型,据此编制了这一目录,其他生物医学研究团体也能获得这一资源。”杨说......阅读全文
转基因技术会导致超级杂草问题吗?
有人认为,种植转基因作物违背了大自然的规律,会破坏生态环境,认为转基因作物将会诞生无法处理的“超级杂草”和“超级害虫”。但事实上,任何使用单一农药等手段进行抗虫抗草处理都会引发抗性的诞生,与转基因技术并没有太大关联。转基因农业作物在种植时已经针对相应担忧采取了措施,包括建立生物庇护所,多性状基因策略
“超级细菌”的耐药性基因可遗传
德国科学家日前发布的一项研究成果显示,让细菌具有耐药性的基因不仅能够跨越不同物种传播,还能通过接触染色体而遗传。 以某些大肠杆菌为代表的革兰氏阴性菌已对多种抗生素具有耐药性。目前,多粘菌素是对抗耐药性细菌的最后一道防线,但是一个名为MCR-1的基因会让细菌对多粘菌素也产生耐药性,变成“超级细
纳米孔测序搞定超级难搞的基因
Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一台MinION测序仪的。他所在的康涅狄格大学实验室是首批获得Oxford Nanopore Technologies测序仪的客户。尽管准确性不稳定,通量也不高,但Graveley和他的同事决定立刻就试试。 对于MinION,众多讨论
研究证明增强子活性的维持不依赖H3K27乙酰化修饰
2月21日,Genome Biology 在线发表了中国科学院生物物理研究所朱冰课题组的研究论文“Histone H3K27 acetylation is dispensable for enhancer activity in mouse embryonic stem cells”。组蛋白H3
最新研究:表观遗传变化的肺腺癌病人分类模型被建立
近期,Genome Biology在线发表了复旦大学附属肿瘤医院主任孙艺华、中国科学院上海营养与健康研究所研究员邵振和中科院分子细胞科学卓越创新中心研究员季红斌、孟飞龙等的合作研究成果——A systematic dissection of the epigenomic heterogeneit
建立基于表观遗传异质性的肺腺癌病人分型模型
近期,Genome Biology在线发表了复旦大学附属肿瘤医院主任孙艺华、中国科学院上海营养与健康研究所研究员邵振和中科院分子细胞科学卓越创新中心研究员季红斌、孟飞龙等的合作研究成果——A systematic dissection of the epigenomic heterogeneit
控制基因能改变衰老吗
生老病死,在我们看来似乎是命中注定的,但这并没有打消一些科学家研究衰老的热情。在他们看来,一个很简单的出发点就是:同是动物,为什么有的昆虫只能活几天,猫狗能活十几年,而乌龟的寿命却能长达一两百岁? “不同物种之间,最根本的区别是什么?它们的基因!所以我想,衰老的秘密也许就藏在基因里。它们里
分子遗传学词汇增强子
中文名称:增强子外文名称:enhancer定义:增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域,与蛋白质结合之后,基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游,也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因,这是因为染色质的缠绕结构,使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
汤森路透:靶向药物在三阴乳腺癌模型上显示有效
2016年1月6日《自然》(Nature)杂志在线发表的一项研究称,抑制bromodomain和extraterminal motif(BET)蛋白BRD4可以使三阴乳腺癌(TNBC)异种移植模型肿瘤消退。 如果这个结果能够在临床上复制,那么BET抑制剂有可能成为首个用于TNBC的靶向治疗药物
癌基因的关键——染色体外环状DNA(eccDNA)
实验方法:环状DNA-seq, RNA-seq(云序生物提供以上服务)1. ecDNA是环状结构为了了解ecDNA的结构,作者通过环状DNA-seq(云序生物提供以上服务)方法研究了三种人类癌细胞系和来自于TCGA的临床肿瘤样品。通过这种方法检测到了GBM39细胞中的圆形扩增子游离于染色体之外,并且
科学家揭示超级细菌产生耐药基因原因
[提要] 自然界(非临床环境)中本来就存在大量的“天然耐药基因”,而人类对抗生素的滥用如同“筛选压力”,选择并进化这些整合有“耐药基因”的病菌,使得后者最终成为人类的噩梦――临床上的“耐药菌”。 自然界(非临床环境)中本来就存在大量的“天然耐药基因”,而人类对抗生素的滥用如同“筛选压力
英培育超级小麦-无基因改造可增产30%
据英国广播公司5月12日报道,总部位于英国剑桥大学的英国国家农业植物学研究所的科学家们最近培育出一种“超级小麦”,可使小麦产量提高30%。 这些科学家们介绍,通过把一种远古时代的小麦品种与现代小麦品种杂交,用异花授粉和种胚移植的方法,使现代小麦具有了古代小麦更强的适应能力,最终培育出
超级耐盐碱非转基因巨型稻天津插秧
20日下午,由袁隆平团队培育的超级耐盐碱新型高杆高产“巨型稻”在天津市宁河区东白庄鱼场开始插秧,这也是华北环渤海地区首次在盐碱地上试种非转基因“巨型稻”品种。 随着插秧机开过稻田,东白庄鱼场内一片忙碌。“‘巨型稻’是由袁隆平团队水稻专家、中国科学院亚热带农业生态研究所夏新界研究员历经十余年所创制
美研究发现保持干细胞本性有关键作用的蛋白质因子
干细胞是细胞界“永远的少女”。人们认为它会一直保持静止状态,直到有某种信号迫使它分裂,产生差异而形成高度特化的细胞。理论上它们能发育成任何类型的成熟细胞,因而在组织与器官再生领域有着光明前景,但人们还需要更充分地掌握干细胞生理学。 据物理学家组织网9月25日报道,纽约大学朗格尼医学中心一项最新
细胞质基因受核基因的控制实例
1、玉米埃型条斑的遗传:玉米第7染色体上有一个条纹基因ij,当起处于隐性纯合时(ijij),能引起质体突变率增加,使正常的质体突变为败育的质体,不能全部形成叶绿素,表现出白色和绿色相间的条斑性状的植株或是白化苗不能成活。当条斑为母本与正常株IjIj为父本杂交时,其F1(Ijij)表型由种:绿色苗、条
DNA研究或可揭示遗传突变引发人类疾病的机制
近日,刊登于国际杂志Nature Communications上的一篇研究论文中,来自爱丁堡大学的研究人员通过研究开发了一种新技术,其可以鉴别基因被控制的方式,从而来帮助科学家们寻找诱发人类疾病的遗传错误。 这种技术主要针对DNA的部分区域,即增强子区域,该区域可以调节基因的活性并且指导对机体
分子遗传学词汇转录增强子
中文名称:转录增强子英文名称:transcriptional enhancer定 义:能提高基因转录效率的顺式调节序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
增强子鉴定新技术研发成功
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/515099.shtm
关于增强子的基本信息介绍
增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域,与蛋白质结合之后,基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游,也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因,这是因为染色质的缠绕结构,使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
关于增强子的基本概念介绍
增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域,与蛋白质结合之后,基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游,也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因,这是因为染色质的缠绕结构,使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。 1981年Benerji在SV40DNA中发现一个140bp的序列,它能
分子遗传学词汇增强子元件
中文名称:增强子元件英文名称:enhancer element定 义:存在于高等真核生物和各种病毒的基因组中的一种DNA序列。通常位于基因转录起始位点的上游,在与专一的转录因子结合后能提高该基因的转录水平。与启动子不同,单独的增强子元件不足以使基因表达。它们在两个方向和与启动子的任何距离处都能发挥
控制基因活动的“空间语法”发现
美国科学家发现了DNA内长期潜伏的“空间语法”,这是理解基因活动如何在人类基因组中编码的关键。这项研究或重塑科学家对基因调控的理解,更深入地揭示遗传变异如何影响发育或疾病中的基因表达。相关论文发表于《自然》杂志。 转录因子是一种蛋白质,控制人基因组中哪些基因被打开或关闭,在编码中起着至关重要作
Cell:癌基因控制干细胞活性
近日,刊登在国际杂志Cell上的一项研究论文中,来自海德堡干细胞研究所等机构的研究人员通过对胚胎干细胞进行研究发现了可以控制胚胎发育暂停的因子。我们都知道,在很多类型的癌症中都会产生大量的MYC(癌基因),而且MYC产生地越多,肿瘤的恶性程度就会愈发明显。 研究者指出,MYC同样在胚胎干细胞中
控制基因活动的“空间语法”发现
科技日报北京8月21日电 (记者刘霞)美国科学家发现了DNA内长期潜伏的“空间语法”,这是理解基因活动如何在人类基因组中编码的关键。这项研究或重塑科学家对基因调控的理解,更深入地揭示遗传变异如何影响发育或疾病中的基因表达。相关论文发表于《自然》杂志。转录因子是一种蛋白质,控制人基因组中哪些基因被打开
-Cell:癌基因控制干细胞活性
近日,刊登在国际杂志Cell上的一项研究论文中,来自海德堡干细胞研究所等机构的研究人员通过对胚胎干细胞进行研究发现了可以控制胚胎发育暂停的因子。我们都知道,在很多类型的癌症中都会产生大量的MYC(癌基因),而且MYC产生地越多,肿瘤的恶性程度就会愈发明显。 研究者指出,MYC同样在胚胎干细胞中
是什么在控制基因的表达
在生物体的每一个细胞中都含有该生物体的所有遗传物质,但在细胞中并不是所有基因都会成功表达而是在由受精卵发育而来时细胞分化过程中基因中的片段有目的的进行隐藏和表现从而形成不同的组织,形成各自不同的功能特点。遗传物质存在于外显子部分,内含子的作用不明但其所包含的遗传信息几乎没有,如在基因重组工程中为了得
Science:受基因控制的免疫反应
对于同种病原体,为何我们人体的免疫系统会做出不同的应答反应呢?来自麻省理工和哈佛大学Broad研究院,加州大学等处的研究人员近期完成了三百多个健康个体T细胞表达分析研究,从中找到了一些特殊的作用模式,也许能用于回答这一问题。 这一研究成果公布在9月12日Science杂志上。 很早科学家们就
方显杨研究组与合作者共同开发了一种新型活细胞DNA成像技术
三维基因组互作与表观遗传修饰是基因表达调控的重要因素,其动态变化与细胞生长发育及癌症等疾病的发生发展密切相关。解析染色质在活细胞内的时空动态,是理解基因调控机制的重要科学问题。现有基于CRISPR-Cas系统的成像方法可靶向内源基因序列,但仍受系统复杂性和灵敏度的限制,在非重复序列成像,多位点成
Nature子刊:用CRISPR操控表观基因组
杜克大学的研究人员开发出了一种新方法,可以精确地控制基因开启及激活的时间。借助这一新技术研究人员可通过化学操控包装DNA的蛋白,来开启特异的基因启动子和增强子——控制基因活性的基因组片段。 研究人员说,拥有操控表观基因组的能力将有助于他们探究特殊启动子和增强子在细胞命运或遗传病风险中所起的作用
3D地图揭示了人类视网膜细胞内的DNA组织
美国国家眼科研究所(NEI)的科学家绘制了人类视网膜细胞染色质的组织。这些纤维将30亿个长如核苷酸的DNA分子打包成紧密的结构,并与每个细胞核内的染色体相匹配。由此产生的全面的基因调控网络为基因表达的一般调控和视网膜功能的调控提供了见解,包括罕见和常见的眼病。这项研究于今天(2022年10月7日