“超级增强子”调控关键基因科学家为其编目录
据物理学家组织网10月10日报道，最近，美国怀特黑德生物医学研究所科学家发现了一套称为“超级增强子”的基因调控器，能控制、影响人类和小鼠的大量细胞型。研究人员指出，超级增强子富集在基因组的变异区，而这些变异区与多种疾病谱系密切相关，所以它们最终可能在疾病诊断与治疗方面发挥重要作用。相关论文在线发表于当天的《细胞》杂志网站上。 今年4月，该研究所的理查德·杨首次在《细胞》杂志上发表了关于超级增强子的研究。论文称，虽然基因控制元素的整体数量可能达数百万之多，但只有几百个超级增强子控制着关键基因，赋予每个细胞本身独特的属性和功能。当时杨曾表示，他的发现主要建立在胚胎干细胞研究的基础上，有助于解决所有人类细胞的调控线路问题。最近的研究则向这一目标迈进了一大步：为近百种人类细胞和组织内的超级增强子编制了一份目录。 “我们已经从几个细胞跨越到大范围的人类细胞型，据此编制了这一目录，其他生物医学研究团体也能获得这一资源。”杨说......阅读全文
控制基因敲除法
【探针技术用于检测由siRNA介导的基因调制】 为了研究基因功能，科学家们常常会有针对性地关断某些特定的基因。 而要验证这种基因沉默的有效性, 就需要运用适当的具特异性的检测方法。理想的检测方法不仅要测量准确, 而且还要能让细胞保持完好无损。 利用诸如RNA(核糖核酸)技
增强子的特点作用
① 具有远距离效应。② 无方向性。③ 顺式调节。④ 无物种和基因的特异性。⑤ 具有组织特异性。⑥ 有相位性。⑦ 某些增强子可以应答外部信号。
增强子的特点作用
① 具有远距离效应。② 无方向性。③ 顺式调节。④ 无物种和基因的特异性。⑤ 具有组织特异性。⑥ 有相位性。⑦ 某些增强子可以应答外部信号。
增强子元件的定义
中文名称增强子元件英文名称enhancer element定 义存在于高等真核生物和各种病毒的基因组中的一种DNA序列。通常位于基因转录起始位点的上游,在与专一的转录因子结合后能提高该基因的转录水平。与启动子不同,单独的增强子元件不足以使基因表达。它们在两个方向和与启动子的任何距离处都能发挥作用。
简述增强子的发现
1981年Benerji在SV40DNA中发现一个140bp的序列,它能大大提高SV40DNA/兔β—血红蛋白融合基因的表达水平,这是发现的第一个增强子。它位于SV40早期基因的上游,由两个正向重复序列组成,每个长72 bp。发现的增强子多半是重复序列,一般长50bp,通常有一个8—12bp组成
增强子元件的定义
中文名称增强子元件英文名称enhancer element定 义存在于高等真核生物和各种病毒的基因组中的一种DNA序列。通常位于基因转录起始位点的上游，在与专一的转录因子结合后能提高该基因的转录水平。与启动子不同，单独的增强子元件不足以使基因表达。它们在两个方向和与启动子的任何距离处都能发挥作用。
增强子的基本结构
增强子是DNA上一小段可与蛋白质结合的区域，与蛋白质结合之后，基因的转录作用将会加强。增强子可能位于基因上游，也可能位于下游。且不一定接近所要作用的基因，这是因为染色质的缠绕结构，使序列上相隔很远的位置也有机会相互接触。
LSC功能和特性的染色质三维调控景观获揭示
角膜缘干细胞（limbal stem cell，LSC）位于角膜与结膜交界处的角膜缘区域，在角膜上皮稳态维持、角膜透明性和完整性中发挥关键作用。近日，中山大学中山眼科中心欧阳宏团队研究发现影响LSC功能和特性的染色质三维调控景观。相关研究发表于《自然-通讯》。李名森副研究员为该论文第一作者，欧阳宏教
陈玲玲研究员Cell－Res解析癌相关lncRNA
报道 来自中科院上海生命科学研究院、第二军医大学的研究人员在新研究中证实，人类结直肠癌特异性的CCAT1-L lncRNA调控了MYC基因位点的远程染色质相互作用。这一研究发现在线发表在3月25日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 论文的通讯作者是中科院上海生命科学院
上海生科院揭示长非编码RNA对MYC基因转录调控的分子机制
5月5日，中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲课题组在《细胞研究》(Cell Research)发表当期封面文章Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin
Nature：可怕，单一DNA碱基就可让恶性脑癌觉醒
近日，来自费城儿童医院的科学家通过研究发现，对单个DNA碱基的关键性改变不仅可以使得儿童罹患恶性的脑癌—神经细胞瘤，而且还会使得该疾病进展迅速，相关研究刊登于国际杂志Nature上；研究者指出，名为LMO1基因的改变会形成一种超级增强子，从而引发该基因生物活性的异常增加，最终引发肿瘤形成且进展迅
华大基因自制产品“超级测序仪”亮相
6月6日，华大基因全资子公司、总部位于美国加利福尼亚的CG在欧洲人类遗传学会议上首次推介该公司新推出的完全集成式的“超级测序仪”Revolocity，并宣布澳大利亚健康服务公司Mater和荷兰奈梅亨大学医学中心成为Revolocity测序系统的首批用户。 新面世的Revolocity系统结合了
科学家发现小鼠通过染色体聚集辨别气味
1月9日，美国哥伦比亚大学科研人员在Nature上发表了题为“LHX2 -and LDB1-mediated trans interactions regulate olfactory receptor choice”的文章，发现在小鼠嗅觉感觉神经元中（olfactory sensory neu
Science：相分离与基因转录间存在怎样的关联？
DNA结合转录因子（TF）是真核基因表达的典型调节因子。针对转录因子的早期研究揭示出它们的结构良好的DNA结合结构域（DNA binding domain, DBD）并鉴定出转录所需的功能上至关重要的激活结构域（activation domain, AD）。后来很明显的是，许多激活结构域包含着固
控制结构基因的种类
控制结构基因的转录速度，位于结构基因的附近，本身不能转录成mRNA。大肠杆菌乳糖操纵子包括4类基因：①结构基因，能通过转录、翻译使细胞产生一定的酶系统和结构蛋白，这是与生物性状的发育和表型直接相关的基因。乳糖操纵子包含3个结构基因：lacZ、lacY、lacA。lacZ合成β—半乳糖苷酶，lacY合
光可以控制基因开关
虽然人类基因组大约有两万多个基因，但是只有一小部分基因是持续进行转录和翻译的。这是根据细胞的状态决定的，而细胞的状态是随时变化的。研究人员希望寻找快速控制基因的开关，以探究基因的表达情况。 哈佛-麻省理工博德研究所(Broad Institute of MIT and Harvard)
关于增强子的分类介绍
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类： ①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性，只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下，才能发挥其功能。 ②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如，金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录，又可受类固醇
概述增强子的特点作用
① 具有远距离效应。 ② 无方向性。 ③ 顺式调节。 ④ 无物种和基因的特异性。 ⑤ 具有组织特异性。 ⑥ 有相位性。 ⑦ 某些增强子可以应答外部信号。 增强子能大大增强启动子的活性。增强子有别于启动子处有两点:[1]增强子对于启动子的位置不固定,而能有很大的变动；[2]它能在两个
增强子捕获的方法特点
中文名称增强子捕获英文名称enhancer trapping定 义用于确定DNA序列中是否包含增强子功能的一项技术。用做检测的载体含有启动子和报道基因可作表达的标记，但缺乏增强子，将拟检测的DNA序列克隆入这种载体的适当位置，导入细胞或个体，从报道基因表达的程度可分析出增强子的存在与否及其强弱。应
增强子的基本分类
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类：①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性，只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下，才能发挥其功能。②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如，金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录，又可受类固醇激素、锌、镉
关于增强子的分类介绍
增强子可分为细胞专一性增强子和诱导性增强子两类： ①组织和细胞专一性增强子。许多增强子的增强效应有很高的组织细胞专一性,只有在特定的转录因子(蛋白质)参与下,才能发挥其功能。 ②诱导性增强子。这种增强子的活性通常要有特定的启动子参与。例如,金属硫蛋白基因可以在多种组织细胞中转录,又可受类固醇
关于增强子的作用介绍
增强子具有组织特异性，例如免疫球蛋白基因的增强子只有在B淋巴胞内，活性才最高。除此以外，在胰岛素基因和胰凝乳蛋白酶基因的增强子中都发现了有很强的组织特异性。此外，所有的增强子中均有一段由交替的嘧啶-嘌呤残基组成的DNA，这种DNA极易形成Z-DNA型；故有人认为在形成一小段Z-DNA后，增强子才
关于增强子序列的简介
增强子是指能使和它连锁的基因转录频率明显增加的DNA序列。作为基因表达的重要调节元件，增强子序列大多为重复序列，一般长约50bp，适合与某些蛋白因子结合。其内部常含有一个核心序列：（G）TGGA/TA/TA/T（G），是产生增强效应时所必需的。 1981年Benerji在SV40DNA中发现一
关于增强子的特点介绍
① 具有远距离效应。 ② 无方向性。 ③ 顺式调节。 ④ 无物种和基因的特异性。 ⑤ 具有组织特异性。 ⑥ 有相位性。 ⑦ 某些增强子可以应答外部信号。 增强子能大大增强启动子的活性。增强子有别于启动子处有两点:[1]增强子对于启动子的位置不固定，而能有很大的变动；[2]它能在两个
研究发现非编码RNA控制高毒力超级细菌感染致病
8月13日，中国科学院上海免疫与感染研究所晁彦杰研究组在《自然-通讯》（Nature Communications）上发表了题为RNA interactome of hypervirulent Klebsiella pneumoniae reveals a small RNA inhibito
科学家发现功能增强子导致染色体外致癌基因扩增
近日，美国克利夫兰凯斯综合癌症中心等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Functional Enhancers Shape Extrachromosomal Oncogene Amplifications”的文章，发现功能增强子导致染色体外致癌基因扩增 跨越致癌基因边界的非编码区扩增一
上海生科院首次揭示一条新lncRNA调控MYC转录的新机制
3月25日，国际学术期刊《细胞研究》(Cell Research)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组的最新研究论文Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-ran
前列腺癌中转录因子动态平衡机制研究获新成果
近日，山东大学第二医院检验医学中心研究员郭海洋等在Nature Communications发表了文章，报道了转录因子AR和MYC活性的相互平衡对前列腺癌发展的重要作用，并详细揭示了其具体作用机制。 据了解，世界范围内，前列腺癌在男性实体肿瘤中发生率居第二位。雄激
研究证明增强子活性的维持不依赖H3K27乙酰化修饰
2月21日，Genome Biology 在线发表了中国科学院生物物理研究所朱冰课题组的研究论文“Histone H3K27 acetylation is dispensable for enhancer activity in mouse embryonic stem cells”。组蛋白H3
“超级细菌”的耐药性基因可遗传
德国科学家日前发布的一项研究成果显示，让细菌具有耐药性的基因不仅能够跨越不同物种传播，还能通过接触染色体而遗传。 以某些大肠杆菌为代表的革兰氏阴性菌已对多种抗生素具有耐药性。目前，多粘菌素是对抗耐药性细菌的最后一道防线，但是一个名为MCR－1的基因会让细菌对多粘菌素也产生耐药性，变成“超级细