螺旋酶Pif1促进BIR特定性DNA合成
当DNA被同源重组修复时,在后期阶段会发生DNA合成。现在,本期Nature上发表的两篇论文确定了DNA螺旋酶Pif1在这一反应中所起的一个作用。他们发现,虽然“断裂诱导的复制” (BIR)的最初阶段在没有Pif1存在时能正常发生,但来自一个迁移中的D-环中间体的合成会受到影响。BIR过程中的复制机制涉及一个独特的气泡样复制叉,它会导致新遗传材料的保守遗传;这与“S-相复制”(S-phase replication)形成对比,后者在细胞分裂前复制基因组,而且具有固有的诱变性。 ......阅读全文
关于DNA双螺旋的基本信息介绍
DNA双螺旋(外文名DNA double helix)指的是一种核酸的构象,在该构象中,两条反向平行的多核苷酸链相互缠绕形成一个右手的双螺旋结构。 DNA双螺旋的碱基位于双螺旋内侧,磷酸与糖基在外侧,通过磷酸二酯键相连,形成核酸的骨架。碱基平面与假想的中心轴垂直,糖环平面则与轴平行,两条链皆为
DNA重组(DNA-recombination)技术:工具酶
一、限制性内切酶限制性内切酶(restriction endonucleases,RE)是其中最重要的工具酶之一。它是一类核酸水解酶,能识别和切割双链DNA分子中的特定核苷酸序列。(一)命名原则限制性内切酶大多从细菌中发现,根据来源进行命名,限制酶的第一个字母(大写,斜体)为宿主菌的属名,第二、第三
DNA连接酶(DNA-ligase)介绍
DNA连接酶是1967年在三个实验室同时发现的。它是一种封闭DNA链上缺口酶,借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5'-PO4与另一DNA链的3'-OH生成磷酸二酯键。但这两条链必须是与同一条互补链配对结合的(T4DNA连接酶除外),而且必须是两条紧邻DNA链才能被DNA
结合DNA的酶
核酸酶和连接酶:核酸酶是能够切割DNA链的酶,因为它们催化磷酸二酯键的水解。从位于DNA链末端的核苷酸开始水解DNA的核酸酶称为核酸外切酶。另一方面,直接切入DNA链的那些是内切核酸酶。分子生物学中使用最广泛的核酸酶,称为限制性内切酶,以切割特定序列的DNA。在自然界中,这种酶通过在进入细菌细胞时消
DNA酶的简介
Skaggs 化学生物学院的 Gerald F. Joyce 教授领导的研究组,利用体外演化的方法将RNA 酶转化成了DNA酶,这将有助于了解有关生命的一个最基本问题,即生命如何由RNA世界演化为今天的以DNA和蛋白质为基础的细胞形式。 新研究显示RNA酶要转化成具有同等功能的为 DNA酶,仅
DNA酶切反应
一、 DNA 酶切反应1、将清洁干燥并经灭菌的eppendorf管(最好0.5ml)编号,用微量移液枪分别加入DNA 1μg和相应的限制性内切酶反应10×缓冲液2μl,再加入重蒸水使总体积为19μl,将管内溶液混匀后加入1μl酶液,用手指轻弹管壁使溶液混匀,也可用微量离心机甩一下,使溶液集中在管
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较双螺旋A-DNAB-DNAZ-DNA碱基倾角/°2067碱基间距/nm0.260.340.37螺旋直径/nm2.552.371.84每轮碱基数111012大沟很狭、很深宽、较深平坦小沟很宽、浅狭、较深很狭、很深糖苷键构象反式反式C反式、G顺式螺旋方向右右左
DNA四螺旋结构富集在基因开关区确认
继2013年发现脱氧核糖核酸(DNA)也有四螺旋结构后,英国剑桥大学研究团队再次识别出人体细胞中这些四螺旋DNA结构在基因组内的具体位点,并证明这种DNA结构将在开发新型靶向性癌症疗法中扮演重要角色。该大学官网近日公布了这一刊登在《自然·遗传学》杂志上的研究成果。 2013年,剑桥大学化学系
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较双螺旋A-DNAB-DNAZ-DNA碱基倾角/°2067碱基间距/nm0.260.340.37螺旋直径/nm2.552.371.84每轮碱基数111012大沟很狭、很深宽、较深平坦小沟很宽、浅狭、较深很狭、很深糖苷键构象反式反式C反式、G顺式螺旋方向右右左
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较
不同螺旋形式DNA分子主要参数比较双螺旋A-DNAB-DNAZ-DNA碱基倾角/°2067碱基间距/nm0.260.340.37螺旋直径/nm2.552.371.84每轮碱基数111012大沟很狭、很深宽、较深平坦小沟很宽、浅狭、较深很狭、很深糖苷键构象反式反式C反式、G顺式螺旋方向右右左
DNA聚合酶及DNA连接酶的功能和区别
DNA聚合酶,以已有的核酸序列作为模板,将4种脱氧核苷酸(A、T、G、C)按照模板的碱基排列顺序,以“碱基互补原则”依次连接,聚合成为一条新的DNA链。 DNA连接酶,是将DNA片段上的缺刻连接起来的酶。 一、DNA聚合酶 (一)DNA聚合酶I DNA聚合酶I(DNA pol
可以DNA结合的酶聚合酶
聚合酶:聚合酶是从核苷三磷酸合成多核苷酸链的酶。它们通过向链上存在的先前核苷酸的3'-OH添加核苷酸起作用。因此,所有聚合酶都以5' - 3'方向起作用。DNA复制需要DNA依赖的DNA聚合酶,实现DNA序列的完美拷贝。有些DNA聚合酶具有校对功能,能够检测含氮碱基之间的错配
DNA的酶学操作
DNA的酶学操作DNA Modifying Enzymes (Michael Blaber)Introduction to bacterial restriction/modification system. It provides very useful background knowledge
DNA重组技术-酶切
实验概要 通过酶切获得可进行体外重组的载体和外源DNA实验原理 DNA重组技术是用内切酶分别将载体和外源DNA切开,经分离纯化后,用链接酶将其连接,构成新的DNA分子。 限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DN
DNA连接酶简介
DNA 连接酶是生物体内重要的酶,其所催化的反应在DNA的复制和修复过程中起着重要的作用。DNA连接酶分为两大类:一类是利用ATP 的能量催化两个核苷酸链之间形成磷酸二酯键的依赖ATP的DNA 连接酶,另一类是利用烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+) 的能量催化两个核苷酸链之间形成磷酸二酯键的依赖NAD
DNA的酶切实验
采用粘末端连接必须对目的DNA分子和载体分子进行酶切以获得相应的粘末端进行连接。酶切可以是单酶切也可以是双酶切。单酶切操作比较简单,但双酶切如果两种酶所用缓冲液成分不同(主要是盐离子浓度不同)或反应温度不同,这时可以采用如下措施解决:1)先用一种酶切,然后乙醇沉淀回收DNA分子后再用另外一种酶切;2
DNA酶切问题集锦
我们在进行分子生物学实验,常需要对DNA片段进行酶切。在此,我们对酶切实验中遇到的一些问题做了相应归纳。带型原因结果分析DNA完全没有被内切酶切割内切酶失活标准底物检测酶活性DNA不纯,含有SDS,酚,EDTA等内切酶抑制因子将DNA过柱纯化,乙醇沉淀DNA条件不适(试剂、温度)检查反应系统是否最佳
DNA酶切及鉴定
实验概要限制酶主要存在原核细胞中。多数来源于细菌,有的来源于蓝藻和链霉菌,极少数来源于支原体等微生物中,存在原核细胞的限制酶能在特异的识别位点切断外源DNA,如感染的噬菌体。而宿主细胞内的DNA则因它的一些特异识别位点常常由于其中一个碱基的甲基化被保护起来,从而使此位点不再成为限制酶的底物。限制性内
DNA酶切实验(图)
采用粘末端连接必须对目的DNA分子和载体分子进行酶切以获得相应的粘末端进行连接。酶切可以是单酶切也可以是双酶切。单酶切操作比较简单,但双酶切如果两种酶所用缓冲液成分不同(主要是盐离子浓度不同)或反应温度不同,这时可以采用如下措施解决: 1)先用一种酶切,然后乙醇沉淀回收DNA分子后再用另外一种酶切
DNA的酶切与连接——DNA片段连接
实验方法原理核酸片段可以通过连接酶的作用连接起来而获得重组分子。实验材料λDNA EcoT14I:由11条DNA片段组成试剂、试剂盒T4 DNA连接酶及其配套的10×连接缓冲液 0.5×TBE电泳缓冲液 6×Loading Buffer Goldview 琼脂糖仪器、耗材电泳仪 水浴锅 移液器 微波
酶联法检测梅毒螺旋体抗体
[检测方法] ELISA法 [方法学原理] 用精制的基因工程表达的梅毒螺旋体特异性抗原包被固相载体,加患者血清后,如患者血清中有相应抗体,可形成抗原抗体复合物。在此基础上加入酶标记抗原,即可形成抗原—抗体—酶标记复合物。再加入酶底物,底物经酶分解后显色,即为阳性反应。反之,若患者血清中
谈及DNA,仍然只想起双螺旋结构,那你Out了!
提起DNA,我们还是想起经典的双螺旋结构?那你Out了。利用DNA中的碱基配对原则,科学家们能够利用DNA分子构建出各种各样的结构,而且这些结构具有远非我们能够想象的用途。 DNA是大自然中一种最为神奇的分子之一。从微观而言,它携带的遗传指令是产生地球上几乎任何一种生物所必需的。如今,科学家们
Nature子刊:科学大发现-DNA不只双螺旋
DNA双螺旋结构的发现证实了我们的遗传密码是以更复杂的对称性制造的,这些分子变体的形式影响我们的生物学功能。 “大多数人想到DNA时,首先想到的是双螺旋,这项新研究提醒我们,存在完全不同的DNA结构,对我们的细胞很重要。”来自澳大利亚加文医学研究所的抗体疗法研究员丹尼尔·克里斯特说。 该团队
英在人体细胞中发现四螺旋DNA结构
据物理学家组织网1月21日(北京时间)报道,DNA双螺旋结构早已为人熟知,而英国剑桥大学科学家21日在《自然·化学》杂志上发表的论文显示,四螺旋DNA结构,即G-四联体同样存在于人类基因组中。它们形成的区域具有丰富的鸟嘌呤基础构件,因此通常缩写为“G”。 物理学家在过去数十年中已经证明四螺
英国研究首次发现人类DNA存在四链螺旋结构
人类DNA(脱氧核糖核酸)具有双链螺旋结构,这是英国剑桥大学科学家沃森和克里克在1953年发表的震惊世界的成果。60年后,剑桥大学研究人员又宣布首次发现了人类DNA还存在四链螺旋结构。 剑桥大学的尚卡尔・巴拉苏布拉马尼安等人在新一期《自然・化学》杂志上报告说,过去研究者能在实验室中制出四链
DNA双螺旋六十周年-Nature,Cell发文点评
今天(美国时间4月25日)是DNA分子结构被发现的六十周年钻石纪念日,在1953年两位学者:Francis Crick和James Watson揭示了遗传信息如何通过双螺旋结构被编码的,从而开启了 “基因组时代”。然而时间过去了超过半个世纪,当时由这篇Nature论文引发的人类基因组计划
DNA聚合酶外切酶活性─校对作用
外切酶活性──校对作用:这种酶活性的主要功能是从3'→5'方向识别和切除不配对的DNA 生长链末端的核苷酸。当反应体系中没有反应底物dNTP时,由于没有 聚合作用而出现暂时的游离现象,从而被3'→5'外切酶活性所降解。如果提高反应体系的温度可以促进这种作用,这表明
DNA拓扑异构酶(DNA-topoisomerase)的相关介绍
为催化DNA拓扑学异构体相互转变的酶之总称。催化DNA链断开和结合的偶联反应,为了分析体外反应机制,用环状DNA为底物。在闭环状双链DNA的拓扑学转变中,要暂时的将DNA的一个链或两个链切断,根据异构体化的方式而分为二个型。切断一个链而改变拓扑结构的称为Ⅰ型拓扑异构酶(top -oisomera
DNA-连接酶的用途
DNA连接酶主要用于基因工程,将由限制性核酸内切酶“剪”出的粘性末端重新组合,故也称“基因针线”。人教版高中生物选修3中提到的E·coliDNA连接酶,来源于大肠杆菌,可用于连接粘性末端;T4DNA连接酶,来源于T4噬菌体,可用于连接粘性末端和平末端,但连接效率低。