时空组学技术助力生物学和医学发展
一直以来，科学家们努力解读由30亿碱基对组成的生命“天书”。随着细胞组学向时空组学的全面突破，人们可以在时间和空间的维度上，清晰地看到身体每个细胞的全景特征，为理解基因组“天书”以及生物学和医学研究带来新机遇。 8月22日，《细胞》刊发了华大生命科学研究院团队的综述文章。该文章系统阐述了时空组学技术如何帮助理解人类基因组、推动生物学认知和医学变革。 生命“中心法则”向“时空法则”迈进 1958年，英国科学家弗朗西斯·克里克首次提出生命“中心法则”，揭示了DNA中的遗传信息如何流动，这是遗传、变异、演化和适应背后的生物学基础。在此基础上，人类基因组计划解析了人类遗传密码的30亿个DNA碱基对和大约25000个基因，开启了研究遗传信息如何决定生物功能的新时代。 然而，即使知道了这30亿个碱基对，科学家们却依旧不能完整地理解基因组。如何将时间和空间因素加入考虑范畴，从中心法则推演到生命的时空规律？ 测序技术的进步使大规模......阅读全文
布鲁克最新发布－|－4D代谢组学和4D脂质组学新突破
新型VIP-HESI离子源将4D-代谢组学、4D-脂质组学和小分子定量筛选工作流程的灵敏度提高了10倍以上； 数据库全新发布包含CCS值的代谢物数据库METLIN-4D； 数据处理软件集成了代谢物CCS值预测功能CCS-Predict Pro； 新款代谢组学软件MetaboScape 20
岛津LCMS9030－QTOF质谱仪重新定义脂质组学和糖组学研究
分析测试百科网讯 近日，岛津和PREMIER Biosoft宣布利用LCMS-9030四极杆飞行时间质谱系统推出的脂质组学和糖组学数据分析软件解决方案。 两家公司表示，他们将支持彼此的技术相结合，推进脂质组学和糖组学研究。LCMS-9030四极杆飞行时间质谱系统 与PREMIER Biosof
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（三）
人类尚未充分认识复杂的癌症基因组是如何转化为导致复发和死亡的驱动生物学的，将蛋白质组学与基因组学结合在一起能够让我们获得对癌症的新认识，同时提供一种有价值的资源以便科学界能够用来提出关于这些疾病的新假设，以及治疗它的手段。蛋白质基因组学终有一天会被证明是一种强大的临床工具，使得人类能够横跨癌症基因组
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（二）
针对一些乳腺癌亚型和携带常见突变如PIK3CA和TP53突变的肿瘤，分析结果揭示出了一些新的蛋白质标记物和信号通路。另外将一些基因中的拷贝数改变与蛋白质水平联系一起，从而鉴别出了10个新的候选调控因子。其中两个候选基因SKP1和 CETN3可能与癌基因EGFR有关联。EGFR是一种特别具有侵
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（一）
申请课题缺创新点？撰写论文没思路？急着毕业时间紧？别怕，对于吉凯，一切都是套路！更有甚者，对于宇宙终极难题：“屌丝如何逆袭白富美？”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。从前，在生物学研究领域，有一个白富美叫基因组学（Genomics），她有一项强大的技能：DNA测序，凭借这项技能，她完成了对多种物
岛津携手质谱专家，北京共话组学发展 ——2023北京质谱专家沙龙组学专题会议
2023年8月17日，岛津企业管理（中国）有限公司举办的“2023质谱专家沙龙-组学专题会议”在北京成功召开。会议旨在促进质谱及组学行业专业人士交流、学习与合作。来自于国内各大高校及科研院所的四十余位专家学者参加了本次会议。 会议现场 主持人 岛津企业管理（中国）有限公司，分析计测事业部营业部，北京
肠道宏基因组学及代谢组学标志物或可诊断早期结直肠癌
在大多数散发性结直肠癌病例中，肿瘤的发生是一个多阶段的过程，包括基因组的改变和形态学的改变。近年来，越来越多的证据显示，人类肠道微生物组与结直肠癌的发生具有一定的关联，更多的科学研究试图从粪便中分析肠道菌群的特点，以期找到有关肠道微生物与结直肠癌的线索。今年4月，两个科学团队在Nature Me
捕捉时空涟漪－LISA项目启动
近日，欧洲空间局（ESA）批准了首个观测太空引力波的实验——激光干涉仪空间天线（LISA）项目。LISA的任务是寻找由超大质量黑洞合并引起的巨大时空涟漪以及其他事件。 据《自然》报道，ESA宣布，这项耗资数十亿欧元的任务将于2025年开始建设，计划于2035年发射LISA。有研究者称，LISA
捕捉时空涟漪－－－LISA项目启动
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516874.shtm LISA任务想象图。图片来源：NASA本报讯 近日，欧洲空间局（ESA）批准了首个观测太空引力波的实验——激光干涉仪空间天线（LISA）项目。LISA的任务是寻找由超大质量黑洞合并引
蛋白质的时空特性
可通过抑制蛋白了解新发现蛋白的功能，在空间和时间上更为完整地描绘了蛋白质组学在个体细胞中的变化，为测量和解释单个细胞和亚细胞水平之间的蛋白质组变异提供了基础
简述细胞分化的时空性
同源细胞一旦进入分化，因其所有细胞所处空间位置不同，环境也不尽一致，因此出现形态上的差异和机能上的特化，因而会形成类型不同的细胞，这种现象称为分化的时空性。在不同的发育阶段，一个细胞可以有不同的形态和功能，这是时间上的分化。单细胞生物只有时间上的分化，多细胞生物不仅有时间上的分化，而且还有空间上
细胞分化的时空性介绍
同源细胞一旦进入分化，因其所有细胞所处空间位置不同，环境也不尽一致，因此出现形态上的差异和机能上的特化，因而会形成类型不同的细胞，这种现象称为分化的时空性。在不同的发育阶段，一个细胞可以有不同的形态和功能，这是时间上的分化。单细胞生物只有时间上的分化，多细胞生物不仅有时间上的分化，而且还有空间上的分
布鲁克US－HUPO会议最新发布|－4D免疫肽组学、4D糖组学、血蛋白组学、实时数据库检索重大升级
· Novor V2.0软件采用了一种针对HLA肽段优化的先进机器学习算法，能从从头测序的多肽中发掘免疫肽段信息，并进一步提升鉴定水平 · TwinScapeTM结合iRTTM标准多肽的数字化监测技术智能反馈功能确保 timsTOF最高性能 – 远远超出“正常运行时间” · 新型glyco-
“系统生物学与遗传组学”研讨会在京开幕
3月31日，由中国科学院和德国拜耳作物集团共同主办的“系统生物学与遗传组学”研讨会在京开幕。中国科学院副院长李家洋出席开幕式并致辞。 李家洋首先代表中科院对研讨会的顺利召开表示了祝贺。李家洋回顾了中科院与拜耳集团自2001年签署双边框架协议以来的合作历程和成果，并表示中科院
蛋白质组学在病原体学研究中的应用
最近，《Molecular & Cellular Proteomics》期刊两篇文章分别报道了一种性传播寄生虫“阴道毛滴虫（Trichomonas vaginalis）”和HIV相关机会肺真菌“曲霉菌（Aspergillus）”的致病机理。 文章一、脂肪酸让寄生虫如虎添翼 根据疾病控制和预防
前沿：空间转录组学研究案例简析
上一期，我们介绍了空间转录组测序产品，对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品，用起来到底好不好使呢？我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子：11.878 发表时间：2018.06 发表期刊：Nat C
Gotham成立－表观转录组学进入转化阶段
10月11日，纽约的Gotham Therapeutics获得5400万美元A轮投资，正式挂牌成立。Gotham的技术平台是表观转录组学（epitranscriptomics）、即调控RNA的化学修饰。Gotham主要关注一种叫做m6A(6-甲基腺苷)的常见mRNA修饰，这个修饰在RNA代谢中起
蛋白质组学技术的功能介绍
“读”，在字典里的意思是识取、读取，放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。 自2003年4月14日人类基因组计划（HGP）宣告完成以来，基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据，但实际上绝大
中药与组学将碰撞出什么火花？
2020年，全世界人民最关心的问题就是健康，在中国几千年的历史长河中，中药的发展与国人的健康息息相关。中药作为中华民族的瑰宝，有非常多的研究人员用新的思路、新的方法将其研究得更加透彻，从而更好的发挥中药的作用，为人类健康做出更多的贡献。图片来源网络 在组学研发迅速发展的今天，中药如何更好的与其
代谢组学：一项艰巨的任务
学生化的孩子真是伤不起。糖代谢、脂代谢、核酸代谢，一系列代谢通路，一大堆代谢产物，简直让人头晕眼花。然而，这又不能跳过。毕竟，DNA编码蛋白质，而蛋白质在小分子上发挥其魔力。但很多时候，科学界对这些分子一无所知。 “如果你测定一滴血中的小分子，大约60% 所检测到的峰都无法与任何代谢物相匹配，
实质等同性（转录组学）实验（三）
3.5 cDNA 合成( 1 ) 加 100 μg DNA 酶处理过的总 RNA ( 不超过 20 μl) 、8 μl oligo (dT)23 锚定引物和无核酸酶水至终体积 28 μl。( 2 ) 将启动反应混合物在 70℃ 孵育 10 min，置于冰上 5 min。( 3 ) 向启动反应混合物
定量蛋白质组学的研究内容
1.蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。 2.翻译后修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化，糖基化，酶原激活等。翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式，因此对蛋白质翻译后修饰的研究对
实质等同性（转录组学）实验（二）
3.4 RNA 提取3.4.1 小麦胚乳总 RNA 提取提取方法根据 Chang 等 [ 11 ] 改编而来。( 1 ) 用预冷的研钵和杵（-70°C ) 在液氮里将 2~3 g 组织磨成粉末（见注 8 ) 。( 2 ) 室温下迅速将磨碎组织转移到有 15 ml 提取缓冲液（加入 300 μl β-
Nature年度技术：定向蛋白质组学
时近岁末，各大杂志接连进行了年终盘点，此前出版的《Nature》杂志也对2012年进行了回顾，评点了2012年的科技进展，科技政策以及重要人物，中国科学家王俊入选了人物篇。同时《Nature Methods》也盘点了今年与明年的技术热点，选出了2012年度技术成果：定向蛋白质组学(targe
临床代谢组学研究常见问题（一）
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。 Q：如何设置验证集和测试集？ A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
基因组学:－跨越癌症研究国界
1982年11月，在尼日利亚海军医院外足球场上踢球的一名军官，突然摔倒死亡。这名男子被带到急诊室时，当时还是一个新人的 Olufunmilayo Funmi Olopade医生正在值班。“我们搞不明白为什么他死亡，这让我感到震惊，从那时开始我意识到，我需要做更多的工作来理解和帮助人们。”Ol
前沿：空间转录组学研究案例简析
上一期，我们介绍了空间转录组测序产品，对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品，用起来到底好不好使呢？我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子：11.878 发表时间：2018.06 发表期刊：Nat
表观基因组学研究指南（一）
今年九月，对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份，因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature，Genome Biology，Genome Research等杂志上公布了三十多份论文，还有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
岛津非靶向代谢组学解决方案
本文内容非商业广告，仅供专业人士参考。关于岛津 岛津企业管理（中国）有限公司是（株）岛津制作所于1999年100%出资，在中国设立的现地法人公司，在中国全境拥有13个分公司，事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心，并拥有覆盖全国30个省的销售代理
临床代谢组学研究常见问题（一）
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。 Q：如何设置验证集和测试集？ A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这