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针对一些乳腺癌亚型和携带常见突变如PIK3CA和TP53突变的肿瘤，分析结果揭示出了一些新的蛋白质标记物和信号通路。另外将一些基因中的拷贝数改变与蛋白质水平联系一起，从而鉴别出了10个新的候选调控因子。其中两个候选基因SKP1和 CETN3可能与癌基因EGFR有关联。EGFR是一种特别具有侵袭性的乳腺癌亚型——“基底细胞样”肿瘤的标志物。除此之外，通过孤立点分析了一些激酶的磷酸化状态，凸显出了乳腺癌样本中一些异常活化的激酶，如HER2, CDK12, PAK1, PTK2, RIPK2和TLK2。分析的结果是用于人类乳腺癌研究的一个高质量的蛋白质组学资源，是利用能够说明基因组与蛋白质组之间联系的技术和分析方法获得的。这些数据缩小了大的删除区域和扩增区域内候选驱动基因的范围，识别出了潜在的治疗目标。 而在Cell题为“Integrated Proteogenomic Characterization of......阅读全文
申请课题缺创新点？撰写论文没思路？急着毕业时间紧？别怕，对于吉凯，一切都是套路！更有甚者，对于宇宙终极难题：“屌丝如何逆袭白富美？”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。从前，在生物学研究领域，有一个白富美叫基因组学（Genomics），她有一项强大的技能：DNA测序，凭借这项技能，她完成了对多种物
硅藻是一类重要的单细胞光合真核生物，分布广泛，提供了地球上约20%的初级生产力，对整个地球生物圈意义重大。三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)是海洋硅藻的模式生物，其基因组序列于2008年公布，但目前基因组的注释仍很不完善。蛋白基因组学(Proteogenomics)
分析测试百科网讯 东方人的思维更偏向于实用主义，比如大家常认为创新来自于应用驱动；世界上还有一种创新首先来自于技术或理论的突破，然后再去寻找应用的方向，布鲁克的timsTOF便是后者。2016年发布Trapped Ion Mobility捕集离子淌度质谱后，引起了组学和临床领域科学大咖们的广泛兴
《Nature Methods》盘点2015年度技术，选出了最受关注的技术成果：单粒子低温电子显微镜（cryo-EM）技术。 除此之外，也整理出了2016年最值得关注的几项技术，分别为：细胞内蛋白标记（Protein labeling in cells）、细胞核结构（Unraveling nuc
两个独立研究小组绘制了人体组织和细胞系质谱分析图谱，公布了近乎完整的人类蛋白质组草图。 日前，两个国际小组均在《自然》杂志上公布了人类蛋白质组第一张草图，这些在大部分非患病人体组织和器官中表达的精选蛋白，为更好的理解疾病状态下发生的机体变化，奠定了坚实的基础。这两项最新研究揭示了人类基因组的更多复
为加强第二代测序技术检测试剂的规范和指导，进一步保证和提高相关产品的质量，8月8日，中国食品药品检定研究院（中检院）组织制定了《第二代测序技术检测试剂质量评价通用技术指导原则》（下称《指导原则》）。 该文件是中检院发布的首个质量评价技术指导原则，旨在对产品设计、研发及验证的各关键环节进行规范，
逐次修正基因组法：有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略随着高通量测序技术的不断崛起，全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前，主要有两种获得研究物种参考基因组的策略：de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正，mapping是指将所有测序读段通过序列比对定
一．前言 本指导原则主要针对第二代测序（next generation sequencing，NGS）技术检测试剂（以下简称“NGS检测试剂”）产品质量提出指导性要求，涉及基本原则、主要原材料、检测流程及性能评价等方面。 本指导原则是对企业和检验人员的指导性文件，但不包括注册审批所涉及的行政
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验 实验步骤
第三届全国质谱分析学术报告会”在厦门翔鹭国际大酒店举办。 活动现场 分析测试百科网讯 2017年12月9日，由中国化学会质谱分析专业委员会主办，厦门大学承办，中国质谱学会和中国分析测试协会协办的“第三届全国质谱分析学术报告会”在厦门翔鹭国际大酒店举办（相关报道：千人质谱会再次来袭 看“高
转移性乳腺癌(MBC)是一种极具侵袭性的三阴性肿瘤(TNBC)，其定义为梭形、鳞状或肉瘤样组织学的转移性成分。支撑MBC病理亚型和转移行为的蛋白质谱尚不清楚。本期iProteome为大家带来的是今年发表在Nature Communications上的一项关于乳腺癌的研究，本研究中，研究者采用基于
——访中国蛋白质组学专业委员会副主任、复旦大学杨芃原教授 不久前，第六届中国蛋白质组学大会在江苏泰州成功召开，会议盛况空前，可以看出我国的蛋白质组学研究队伍的壮大。会后的间隙，我们有幸采访到了主要参与会议组织的中国蛋白质组学专业委员会副主任、复旦大学杨芃原教授，希望杨教授为大家介绍一下国际
分析测试百科网讯 在新冠肺炎COVID-19疫情肆虐全球之际，PCR技术在快速筛查中已大显神威，但进入临床后如何更早地区分轻症和重症患者，从而更准确地治疗和用药？5月27日中国研究人员在《Cell》发表文章，利用蛋白质组学和代谢组学的全景式分析，发现了重症患者体内应对病毒进攻特征性的分子改变，并
分析测试百科网讯 近日，The Scientist Magazine评选出了2015年度生命科学领域十大创新产品，包含了7个基因组学、1个蛋白组学和2个代谢组学进入该名单。该奖项旨在表彰对科学和医学领域产生巨大影响的
近日，由广东省农业科学院作物研究所梁炫强研究员、陈小平博士，山东省农业科学院花生研究所所长禹山林研究员及国际半干旱热带作物研究所(ICRISAT)基因组中心负责人Rajeev Kumar Varshney等完成的花生转录组de novo测序的结果发表于Plant Biotechnology
基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据，一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”（ proteogenomic）研究，将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起，并帮助确定了一些驱动癌症的基因。 这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然
——timsTOF Pro™系统进一步增强用于4D蛋白质组学的MBR-ddaPASEF和diaPASEF性能——timsTOF Pro超高灵敏度的4D蛋白质组学和4D脂质组学性能推进单细胞生物学研究——在ASMS 2019上还发布了用于4D蛋白质组学的新消耗品、软件合作伙伴及软件产品 分析测试百科
分析测试百科网讯 布鲁克一直以MALDI技术闻名全球，并已在成像领域占据领导地位；自去年推出timsTOF Pro创新组学系统后，在深度覆盖和高通量蛋白质组学分析中取得了突破性的进展，并且迅速和国内院校和企业开展了一系列深度的合作。比如timsTOF系列，已和北京大学、清华大学、复旦大学、厦门大
第二代测序技术， 又称新一代测序技术， 是相应于以Sanger 测序法为代表的第一代测序技术而得名。第二代测序中3种主流测序技术分别为依次出现的 Roche/454 焦磷酸测序(2005 年)、Illumina/Solexa 聚合酶合成测序(2006 年)和 ABI/SOLiD 连接酶测序(
截至2019年12月23日，中国学者在Cell，Nature及Science在线发表了107篇文章（2019年的Cell ，Nature 及Science 已经全部更新），iNature团队对于这些文章做了系统的总结： 按杂志来划分：Cell 发表了31篇，Nature 发表了44篇，Scie
分析测试百科网译 代谢组学致力于研究生物系统中存在的小分子或代谢物。通过分析生物体或细胞内存在的代谢物来得到其生理状态的化合物指纹谱。 从营养、食品科学到了解人类疾病，代谢组学表征在许多领域中具有广泛的应用。随着分析技术的不断发展和功能的增强，这个应用领域将会越来越广。 为了进一步了解代谢组
第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛圆满闭幕 2011年4月15～17日，第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛在美丽的杭州成功召开。本次会议由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)、国际蛋白质组学论坛(
蛋白质组（Proteome）指由一个基因组或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质全谱分析目的在于鉴定样本中尽可能多的肽和蛋白质混合物的组分。基于质谱技术的全谱鉴定，可为蛋白高通量的定量和修饰分析提供参考信息。传统的方法如蛋白质微量测序、氨基酸组成分析（如Edman降解法）费时费力、通量低，存在不容
实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webt
全新MALDI-2离子源大幅提高小分子检测灵敏度；CCS值加持让4D-蛋白质组学技术更加强大MALDI-2离子源将小分子分析灵敏度提升1-2个数量级新的prm-PASEF方法增强4D-蛋白质组学分析大规模高精度CCS值测量用于机器深度学习短梯度dia-PASEF方法进一步提高4D-蛋
6 基因组信息6.1 数据库6.1.1 Entrez GenomeEntrez Genome数据库收录了850多种微生物、3100多种病毒以及1600多种真核生物细胞器的完整基因组数据以及将近50种动物、绿色植物和真菌的700多条染色体信息，总共收录有6200多条序列，其中有882条是去年新增的序列
蛋白基因组学(Proteogenomics) 是基于高精度的串联质谱数据对基因组进行注释，不仅能在蛋白质水平上验证基因表达和模式，还能提供蛋白质组层面特有的信息，如翻译后修饰、信号肽等。目前，蛋白基因组学已成为功能基因组学研究不可或缺的重要工具。然而，对海量质谱数据实现全面和精准的解读仍是当前蛋
随着越来越多的物种基因组测序完成，对全蛋白质组与相互作用组的解释已经成为近期研究的热点。虽然蛋白质组研究阐述了表达蛋白质的所有组成成分，但是相互作用组包括了生物体内存在或者可能存在的成对蛋白质-蛋白质相互作用，因此，形成了庞大且稀疏的网状结构。伦敦帝国理工学院生物信息学中心的WP Ke
蛋白质组（Proteome）的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时，一个基因可以多种mRNA形式剪接，一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物，蛋白质组中蛋
1 植物群体遗传蛋白质组学 1.l 遗传多样性蛋白质研究基于基因组学的一些遗传标记，如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen