全球最大结直肠癌多组学研究:如何让疾病分类更准确

·“在AI多组学模型建立的过程中通过深度学习可以判断出一个符合预期的结果,但这个结果具体是由什么机制推导出来的AI并不能给出特别具体的答案,也就是所谓的‘黑箱’,如果没有科学性的预测依据,可能结果不能完全令人信服。”准确的疾病分类能够帮助医生对病人的病情、治疗手段以及预后(即预估治疗结果)进行快速和有效的判断。疾病分类的基础是致病机制,而在以前,分类往往是通过症状、病灶形态等表面现象进行的。现在,随着组学技术的发展,科学家能够深入基因,追本溯源,对疾病进行更为精准的分类,为诊疗作出贡献。近日,一项研究通过全球最大规模的结直肠癌多组学数据分析,发现了多个与该疾病相关的关键基因,并在此基础上重构了结直肠癌类型学。该研究于2024年8月7日发表在《自然》(Nature)杂志上,作者是来自瑞典乌普萨拉大学、华大生命科学研究院以及华大基因智慧医学研究院的Tobias Sj?blom、林从、李甫强等多名研究者组成的团队。结直肠癌发病率居所有......阅读全文

lovo细胞|-lovo人结直肠癌细胞-处理方法

培养步骤:          1)复苏细胞:将含有1mL细胞悬液的冻存管在37℃水浴中迅速摇晃解冻,加入5mL培养基混合均匀。在1000RPM条件下离心5分钟,弃去上清液,补加4-6mL完全培养基后吹匀。然后将所有细胞悬液加入培养瓶中培养过夜(或将细胞悬液加入6cm皿中),培养过夜。第二天换液并检查

与结直肠癌相关的JUN基因编码功能描述

该基因是禽肉瘤病毒17的假定转化基因。它编码一种与病毒蛋白高度相似的蛋白质,并与特定靶DNA序列直接相互作用以调节基因表达。这个基因是无内含子的,被定位到1P32-P31,一个涉及人类恶性肿瘤易位和缺失的染色体区域。This gene is the putative transforming gen

阿司匹林通过改变结直肠癌进化预防这种癌症发展

  癌症是在细胞开始不受控制地分裂时开始的。科学家们已经知道,服用阿司匹林可以帮助预防结直肠癌发展,但阿司匹林具有这种效果的确切原因大多是个谜。  在一项新的研究中,来自美国加州大学欧文分校的研究人员首次揭示阿司匹林改变了结直肠癌细胞群体随时间进化的方式,使它们的生存和增殖能力降低。相关研究结果近期

与结直肠癌相关的KDR基因编码功能描述

KDR所编码的蛋白也命名为血管内皮生长因子受体-2(Vascular endothelial growth factor receptor-2,VEGFR-2),是血管生长因子重要信号转导的重要受体,迄今已发现的VEGF信号转导的主要受体包括fms样酪氨酸激酶VEGFR-1,即Flt- 1,胎儿肝激

科学家揭示结直肠癌T细胞动态变化

  北京大学张泽民研究团队与美国安进公司欧阳文军团队、北京大学人民医院申占龙课题组合作,在结直肠癌浸润T细胞的特征与动态变化研究方面取得了突破性进展,相关成果于10月30日在线发表于《自然》。  T细胞在肿瘤免疫和免疫治疗中占据核心地位,如何系统刻画人体内T细胞的动态变化一直是研究难点。张泽民团队等

与结直肠癌相关的ALCAM基因编码功能描述

该基因编码激活的白细胞粘附分子(alcam),也称为CD166(分化簇166),是免疫球蛋白受体的一个亚家族的成员,在细胞外区域有五个免疫球蛋白样结构域(vvc2c2c2)。该蛋白与T细胞分化抗原CD6结合,参与细胞粘附和迁移过程。发现了编码不同亚型的多种选择性剪接转录变体。This gene en

FexD分子激活肠道FXR可抑制结直肠癌发展

  在工业国家癌症导致的死亡中,结直肠癌排第三位,发达国家直肠癌的发生率在下降,而发展中国则仍在迅速提高。索尔克生物研究院的科学家们最近的一项研究表明,高脂肪饮食可以通过扰乱肠道中胆汁酸的平衡来触发激素信号,让潜在的癌细胞生长,从而促进结直肠癌细胞的生长。这一研究成果发表在2019年2月21日国际著

早筛是提升结直肠癌患者诊治效果“利器”

  “作为所有健康服务的基石,健康科普要覆盖全人群和全生命周期,这是健康科普未来的发展方向。”近日,在“爱要趁早”肠治久安4.15全国肿瘤防治宣传周科普主题展活动上,中国医师协会医学科普分会会长郭树彬指出,科普的客户体系很重要,过去做科普很困难,而如今,有更多的专家和媒体都参与其中。今年科普主题展的

NCB-|-结直肠癌中抑制细胞凋亡的新通路

  蛋白质的合成水胞内和胞外两方面信号调控。其中,在翻译起始时,eIF4F对信使RNA的识别并形成三元复合体(ternary complex,简称TC)是其中至关重要的一步【1,2】。在压力信号下,TC的成分之一,eIF2a发生磷酸化,并与eIF2B结合,从而抑制TC的形成【3-6】。直肠癌细胞(c

与结直肠癌相关的MET基因编码功能描述

MET基因编码的蛋白为肝细胞生长因子受体HGFR,具有酪氨酸激酶活性,与多种癌基因产物和调节蛋白相关,参与细胞信息传导、细胞骨架重排的调控,是细胞增殖、分化和运动的重要因素。目前认为,c-met与多种癌的发生和转移密切相关,研究表明,许多肿瘤病人在其肿瘤的发生和转移过程中均有c-met过度表达和基因

与结直肠癌相关的TYMS基因编码功能描述

胸苷酸合成酶利用5,10-亚甲基四氢叶酸(亚甲基四氢叶酸)作为辅因子催化脱氧尿苷酸甲基化为脱氧胸苷酸。此功能维持DNA复制和修复的关键DTMP(胸腺嘧啶-5-一磷酸素)池。这种酶作为肿瘤化疗药物的靶点一直备受关注。它被认为是5-氟尿嘧啶、5-氟尿嘧啶-2-原脱氧尿苷和一些叶酸类似物的主要作用部位。该

与结直肠癌相关的AREG基因编码功能描述

这个基因编码的蛋白质是表皮生长因子家族的一员。它是一种自分泌生长因子,也是星形细胞、雪旺细胞和成纤维细胞的有丝分裂原。与表皮生长因子(egf)和转化生长因子α(tgfα)有关。该蛋白与EGF/TGFα受体相互作用,促进正常上皮细胞的生长,抑制某些侵袭性癌细胞系的生长。在乳腺、卵母细胞和骨组织发育中也

JCO:吸烟让结直肠癌幸存患者更接近死神

  近日,刊登在国际杂志Journal of Clinical Oncology上的一篇研究论文中,来自国外的研究人员通过研究表明,相比不吸烟的结直肠癌幸存者而言,吸烟的患者死亡的风险是前者的2倍,这就揭示了吸烟和结直肠癌患者死亡直接相关,该研究为后期开发有效的干预措施来预防结直肠癌患者的死亡风险提

与结直肠癌相关的PTEN基因编码功能描述

PTEN基因编码的蛋白具有蛋白磷酸酶和脂质磷酸酶活性,是第一个具有磷酸酶活性的抑癌基因,也是是继p53和Rb基因之后,与肿瘤发生密切相关的一种抑癌基因,其主要机制因为PTEN是PI3K/Akt通路的主要负调控因子。PTEN的功能缺陷在人类多种肿瘤中广泛存在。

粪便检测在结直肠癌筛查中的进展

粪便是反映消化道病变的一个常见窗口,消化道以外的肿瘤细胞一般不可能从粪便中排出。因此,粪便的检测在消化道疾病的诊断中有重要意义,尤其对结直肠癌的筛查,已成为国内外各学者研究的热点。新的方法,新的检测项目,新的项目组合的临床研究不断在发展中。     一、粪便潜隐血试验(FOBT)     粪便潜血通

JCO:改善结直肠癌预后从健康的饮食开始

  美国有140多万结直肠癌(CRC)幸存者。以往的研究表明,饮食质量对疾病预后有很大的影响,并且一些诊断前和诊断后的饮食成分与CRC患者的生存率有关。但是评估总体饮食质量和CRC特异性死亡率的饮食模式的研究是不一致的,这使得为CRC幸存者制定基于证据的建议变得困难。为了解更多信息,由美国癌症协会博

与结直肠癌相关的NRAS基因编码功能描述

NRAS基因是GDP/GTP结合蛋白,比较重要的同家族基因还包括KRAS和HRAS。NRAS与GTP结合呈激活状态,与GDP结合呈关闭状态,该基因的突变与黑色素瘤密切相关,机制为该基因的突变导致其下游基因的如Raf激酶的异常持续激活。

他汀类药物预防结直肠癌新机制

上海交通大学医学院附属仁济医院教授房静远团队首次揭示了他汀类药物塑造的肠道微环境预防结直肠癌发生潜在机制。相关研究近日发表于《自然-微生物学》。结直肠癌是一种由腺瘤-腺癌缓慢进展的恶性肿瘤。流行病学统计显示,他汀类药物与患结直肠癌风险降低有关,因此了解他汀类药物发挥作用的具体机制,有助在结直肠癌预防

与结直肠癌相关的ARAF基因编码功能描述

丝氨酸/苏氨酸 - 蛋白激酶A-Raf或简称A-Raf是人类中由ARAF基因编码的酶。[5] A-Raf是丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶的Raf激酶家族的成员。 与该家族的其他成员(Raf-1和B-Raf)相比,对A-Raf知之甚少。它似乎具有其他同种型的许多特性,但其生物学功能尚未得到彻底研究。所有

基于人工智能的结直肠癌研究获进展

近年来,在人工智能的各大产业中,医疗加人工智能方向已然成为瞩目焦点,备受关注。人工智能在医疗中的应用能够有效缓解我国医疗资源严重短缺、分布失衡的现状,提高医疗系统的运行效率,甚至推动整个医疗行业的变革。 近日,中国科学院苏州生物医学工程技术研究所医学影像室高欣、简俊明、夏威等人提出了一种基于全卷

植物多组学比较和进化研究平台发布

近日,西北农林科技大学生命科学学院马闯教授团队发布了植物多组学数据跨物种比较和进化研究的在线分析平台,相关成果发表在Molecular Biology and Evolution上。进化是植物性状遗传多样性和适应生存环境的基础,而基因变异是物种进化的源动力。随着后基因组时代高通量技术的发展和应用,在

水稻多器官单细胞多组学图谱问世

  记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉,该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构,构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱,系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用,有力助力水稻设计育种。相关研究成果近日发表在国际学术期刊《自然》上。  单细胞组学是近年来生命科学

单细胞多组学高通量测序平台(一)

一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息,如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程,而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息(如DNA层面的基因序列),从而解读生物体运行机制,应用于疾病的诊断和治

CASMS分论坛:多组学整合与大数据

  分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分论坛中,哈沃德医学院Steven Gygi博士、太平洋西北国家实验

单细胞多组学高通量测序平台(二)

虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出,但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞,早期的技术代表F

解析肿瘤HiC多组学研究策略

Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S

Illumina完成收购SomaLogic,强势整合多组学版图

  美通社消息,2026年1月30日 ,Illumina公司(纳斯达克股票代码:ILMN)今日宣布,已完成对数据驱动的蛋白质组学技术领导者SomaLogic的收购。此次收购将高度互补的蛋白质组学能力纳入Illumina的多组学产品组合,加强客户大规模获取蛋白质组学洞察的途径,以助力加速药物发现并对医

首个免疫衰老多组学数据库设立

记者12月17日从中国科学院基因组所(国家生物信息中心)了解到,该所研究员张维绮团队、鲍一明团队与中国科学院动物研究所研究员刘光慧、曲静研究组合作,建立了免疫衰老领域首个多组学数据库Immunosenescence Inventory,旨在为整合和分析与免疫衰老相关数据提供一体化平台。随着全球人口老

武汉大学发现一个新的结直肠癌的致癌转录因子

  结直肠癌是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤之一。近日,武汉大学生命科学学院的一项最新研究成果,揭示了一个新的结直肠癌的致癌转录因子,为结直肠癌的研究提供了重要的表观基因组数据和新的关键调控因子,相关论文近日在线发表于《自然—通讯》。  据介绍,目前关于结直肠癌的多组学研究广泛集中在基因组学和转

与结直肠癌相关的基因突变类型TYMS基因

胸苷酸合成酶利用5,10-亚甲基四氢叶酸(亚甲基四氢叶酸)作为辅因子催化脱氧尿苷酸甲基化为脱氧胸苷酸。此功能维持DNA复制和修复的关键DTMP(胸腺嘧啶-5-一磷酸素)池。这种酶作为肿瘤化疗药物的靶点一直备受关注。它被认为是5-氟尿嘧啶、5-氟尿嘧啶-2-原脱氧尿苷和一些叶酸类似物的主要作用部位。该