植物多组学比较和进化研究平台发布
近日，西北农林科技大学生命科学学院马闯教授团队发布了植物多组学数据跨物种比较和进化研究的在线分析平台，相关成果发表在Molecular Biology and Evolution上。进化是植物性状遗传多样性和适应生存环境的基础，而基因变异是物种进化的源动力。随着后基因组时代高通量技术的发展和应用，在DNA、RNA、蛋白等多个层面产生了大量的植物组学数据，为深入研究植物基因变异和物种进化机制提供了丰富的实验资源。由于不同来源的多组学数据具有规模大、维度高、噪音大、异质性强等特点，给数据的有效整合和植物进化研究造成了极大的障碍。为了解决上述问题，研究团队历时五年成功研发了用于植物多组学数据跨物种比较和进化研究的IPOP平台。该项研究涉及苔藓、单子叶和双子叶三大类植物物种，收录了包括群体基因组、三维基因组、染色质可及性、转录组、DNA修饰、RNA修饰、组蛋白修饰等多维度的组学数据，采用统一标准化的流程对组学特征进行质量控制和整合分析，......阅读全文
植物多组学比较和进化研究平台发布
近日，西北农林科技大学生命科学学院马闯教授团队发布了植物多组学数据跨物种比较和进化研究的在线分析平台，相关成果发表在Molecular Biology and Evolution上。进化是植物性状遗传多样性和适应生存环境的基础，而基因变异是物种进化的源动力。随着后基因组时代高通量技术的发展和应用，在
空间多组学技术对阐明药用植物合成途径起推进作用
陕西省西安植物园资源植物功能基因挖掘与应用团队探讨了空间多组学技术的应用对进一步阐明红豆杉、长春花等药用植物天然产物合成途径的推进作用，并系统阐明了细胞水平合成通路的解析作为合成生物学的蓝图扮演的重要角色以及未来工业化进程中面临的挑战，近日相关研究内容受邀发表在Trends in Plant Sci
植物多组学数据驱动的上下游调控因子挖掘平台发布
9月8日，The Plant Journal 期刊在线发表中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张一婧研究组搭建的挖掘植物基因及基因组位点上下游调控因子的网络平台，论文题为Plant Regulomics: A Data‐driven Interface for Retrievi
中药多组学研究取得重大突破
中药材基因资源是国家战略资源，其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期，中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景，相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上，引起了国际学术界对我国中药应用基础性研
中药多组学研究取得重大突破
中药材基因资源是国家战略资源，其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期，中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景，相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上，引起了国际学术界对我国中药应用基础性研
单细胞多组学高通量测序平台（一）
一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息，如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程，而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息（如DNA层面的基因序列），从而解读生物体运行机制，应用于疾病的诊断和治
单细胞多组学高通量测序平台（二）
虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出，但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞，早期的技术代表F
CASMS分论坛：多组学整合与大数据
分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日，首届美国华人质谱学会（CASMS）学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分论坛中，哈沃德医学院Steven Gygi博士、太平洋西北国家实验
首个免疫衰老多组学数据库设立
记者12月17日从中国科学院基因组所（国家生物信息中心）了解到，该所研究员张维绮团队、鲍一明团队与中国科学院动物研究所研究员刘光慧、曲静研究组合作，建立了免疫衰老领域首个多组学数据库Immunosenescence Inventory，旨在为整合和分析与免疫衰老相关数据提供一体化平台。随着全球人口老
解析肿瘤HiC多组学研究策略
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
多组学手段揭示苦荞“不怕冷”的奥秘
苦荞 董玉梅摄低温胁迫是影响植物生化、分子、代谢调控的主要环境因素之一。长期在暴露于低温而引导植物胁迫耐受性的提高，即耐寒性或冷驯化。阐明植物对低温响应的分子机制对育种和基因发掘至关重要。有研究表明苦荞可以通过增加花色苷和原花青素的积累增强其耐寒性。苦荞的每个器官几乎都含有芦丁，包括种子
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日，中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》（英文版）（Science Bulletin）上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径，是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日，中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》（英文版）（Science Bulletin）上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径，是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联
单细胞多组学整合技术有了新突破
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516674.shtm近日，军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能
单细胞多组学整合技术有了新突破
近日，军事科学院军事医学研究院应晓敏团队在国际著名学术期刊《自然·生物技术》以Article类长文形式在线发表重大原创研究成果。该团队自主研发的用于单细胞多组学数据马赛克整合的人工智能算法取得新突破。细胞是生物体内发挥功能的基本结构单元。单细胞测序技术是近年来生命科学领域的突破性技术，能够检测单个细
多组学研究助力玉米种质资源创新利用
近日，中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》（英文版）（Science Bulletin）上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径，是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析（GWAS）是通过推断
空间多组学质谱技术研讨会（2023）
空间多组学技术结合了组学技术（如基因组学、转录组学、蛋白质组学、金属组学等）和组织学技术，有助于更好地理解生物体内各种生物分子与金属元素在空间上的分布、相互作用及其对生理功能和疾病发生发展的影响。 质谱成像技术是近年来快速发展的空间多组学技术之一，可以在组织的空间层面上同时测定多种生物分子（如
P4－China－2016多组学与系统生物学论坛
P4 China 2016国际精准医疗大会将于2016年12月16-18日于北京召开，由中国生物工程学会，上海商图信息咨询有限公司（BMAP）等多家单位联合举办。峰会将会邀请近60位演讲嘉宾，预计近800位精准医疗行业与临床科研资深人士与会。 个体化精准诊疗医学是近年卫生保健领域发展最广泛、最
P4－China－2016多组学与系统生物学论坛
自从精准医学概念提出以来，它一直都是全球最热的研究领域，政府的大力支持也了推动精准医疗行业的蓬勃发展。对于任意一项划时代的大工程而言，基础科研永远是其第一驱动力。P4 China 2016 多组学与系统生物学论坛，从系统生物学出发，对生物信息学与生命组学技术进行了深入探讨，并分享了科研成果应用于
动物所等建立衰老生物学多组学数据库
随着人口老龄化程度加剧，实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题。近年来，随着衰老相关研究成果的不断增多以及高通量测序技术的日益发展，衰老相关多组学数据层出叠见。然而，目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。 中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组，与北京基因组研
研究人员建立衰老生物学多组学数据库
随着人口老龄化程度加剧，实现健康老龄化是亟待解决的社会问题和科学问题。近年来，随着衰老相关研究成果的不断增多和高通量测序技术的日益发展，衰老相关多组学数据层出叠见。然而，目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。 中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组，与北京基因组研究所（
研究团队部合作建立衰老生物学多组学数据库
随全球人口老龄化程度加剧，实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题.近年来，随衰老相关研究成果不断增多及高通量测序技术日益发展，衰老相关多组学数据逐渐增多.然而目前，尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库. 中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）研究员鲍一明研
科学家合作构建再生生物学多组学数据库
随着细胞重编程、基因编辑、合成生物学、高通量测序等技术的快速发展，再生生物学进入前所未有的蓬勃发展时期，助力解决组织替代、功能修复、衰老干预、疾病治疗等一系列生命医学领域的重要科学难题。面对科学数据的爆炸式增长，亟需建立以再生生物学为核心的开放数据库，以存储世界范围内的组学研究数据为基础，推动再
多组学数据库“齐聚荟”－助力油菜“全能”竞技
油菜产业集观赏、蜜源、生态、经济作物等多种功能于一身，是新兴的“全能选手”。围绕油菜，我国科学家近年来实现了从理论、技术、产品到转化的链式创新，推动了我国油菜基础研究与应用步入世界第一方阵。 然而，如何将基础研究中长期积累的资源和多组学数据优势转化成育种优势，仍是当前乃至未来很长一段时期油
科学家开发出新型空间多组学技术
5月25日，中国科学院广州生物医药与健康研究院彭广敦课题组在《自然-方法》（Nature methods）上，发表了题为Simultaneous profiling of spatial gene expression and chromatin accessibility during mou
多组学大数据与医学发展论坛在南宁召开
7月2-3日，多组学大数据与医学发展论坛在广西南宁召开，主题为“多组学大数据促进生物医药创新发展”。论坛围绕基因等多组学大数据整合与标准化、新药靶点挖掘、数据安全与隐私保护，数据可视化与交互、基因大数据伦理与法律问题、医药产业转化等领域的现状与未来发展，展开跨学科学术研讨。论坛坚持学术为本的原则，组
布鲁克质谱：拓展多组学研究边界－推动临床转化
--布鲁克中国区经理何磊先生专访 分析测试百科网讯，自2017年推出timsTOF以来，布鲁克每年都在为科学家们带来创新的产品，今年六月就推出了第二代timsTOF Pro 2和单细胞蛋白质组研究平台timsTOF SCP。布鲁克质谱中国区业务快速增长，不仅来源于创新的产品，也同中国团队的努力
犬科动物多组学资源库iDog－2.0建立
近日，国家生物信息中心研究员赵文明团队与昆明动物研究所副研究员柳延虎团队合作，发布犬科动物多组学资源库iDog 2.0，提供了更加全面的多组学数据资源及更加丰富的在线分析工具，为全球犬类研究者提供更高质量的数据服务。家犬是自然界中种内遗传多样性最为丰富的物种之一，也是研究人类遗传性疾病的重要动物模型
GCMS+多组学软件包高效开展合成生物学代谢途径分析
合成生物学领域是备受关注的新兴领域。通过设计和构建新的生物系统，或者改造现有的生物系统，合成生物技术能够实现生物体的功能改造和新功能的创造。合成生物学在医药领域具有巨大的应用潜力。通过合成基因组和基因编辑技术，设计特定的药物合成途径，并改造微生物，使其能够高效地生产药物及中间体。这对于药物开发和生
大咖云集，共襄单细胞多组学及空间组学线上峰会
2009年，第一篇单细胞mRNA测序的文章的发表，标志着单细胞转录组测序的时代正式来临。2013年，单细胞测序技术被《Nature Methods》评为年度技术。同年，《Science》将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首，认为该技术将改变生物界和医学界的许多领域。 目前，基于单细胞技