上海药物所发展出基于知识图谱的计算模型
9月19日，中国科学院上海药物研究所郑明月课题组在《细胞-基因组学》（Cell Genomics）上，发表了题为Identifying compound-protein interactions with knowledge graph embedding of perturbation transcriptomics的研究论文。该研究提出了基于知识图谱的计算模型PertKGE。这一模型以数据驱动的形式在微扰转录组数据中解耦出化合物-蛋白质相互作用。化合物和蛋白质是药物发现中两个基本实体，而关于二者相互作用的建模是药物发现的基础。目前，尚无通用的计算方法来预测和解释所有的化合物-蛋白质相互作用，但科研人员可以利用不同的生物数据并从多种研究视角构建化合物-蛋白质相互作图谱。在药物发现领域，微扰转录组学连接了药物发现中最重要的实体（化合物）和组学数据，提供了化合物微扰受试体后产生的直观微扰结果，为解耦化合物-蛋白质相互作用（CPI）......阅读全文
如何阅读基因载体图谱？（一）
基因载体是基因工程的核心，也是基因治疗中强有力的生物工具，我们先来认识和阅读载体图谱吧。 一、载体分类及载体组成元件载体分类1、按属性分类：病毒载体和非病毒载体病毒载体是一种常见的分子生物学工具，可将遗传物质带入细胞，原理是利用病毒具有传送其基因组进入目的细胞，进行感染的分子机制。可发生于完整活体或
如何阅读基因载体图谱？（二）
二、选择和准备载体选择载体主要依据构建的目的，同时还要考虑载体中应有合适的限制酶切位点等。如果构建的目的是要表达一个特定的基因，则要选择合适的表达载体。选用哪种载体，还是要结合目的基因及载体特点以实验目的为准绳。 载体选择主要考虑下述3点： 1、构建DNA重组体的目的，克隆扩增/表达表达，选择合适的
激光干涉仪检测图谱
这要看交叉多大。有交叉不是说就不好。他是地位精度。你要看哪上边的数值，这是不是在一定范围，然后检完要要进行补偿，然后再捡，一般的不好的都是三遍每一遍到最后线越来越宽的。叫喇叭口，这种的不好。只要在系统的补偿值范围内就没事，机械不要做得太次，要不没法过。
分子标记基于图谱克隆基因
图位克隆(Map—bascd cloning））是近几年随着分子标记遗传图谱的相继建立和基因分子定位而发展起来的一种新的基因克隆技术。利用分子标记辅助的图位克隆无需事先知道基因的序列，也不必了解基因的表达产物，就可以直接克隆基因。图位克隆是最为通用的基因识别途径，至少在理论上适用于一切基因。基因
eis图谱怎么看阻抗
通过搭建合适的等效电路对EIS数据进行拟合，拟合可以得到电容值。发表文章，搭建拟合电路是关键，这里建议参照并引用一些文献，说服力大一点。稳定性关系：扰动不会引起系统内部结构发生变化，当扰动停止后，系统能够恢复到原先的状态，可逆反应容易满足稳定性条件，不可逆电极过程，只要电极表面的变化不是很快，当扰动
XRD图谱强度要达到多少
XRD图谱强度要达到强度2000多的峰。经常做XRD，这次奇怪的是图谱中几乎只有一个强度2000多的峰。而这个峰找不到对应的三强线。唯一接近的物质可能性不大。将jade图谱及原始数据上传，希望向高人请教、交流。样品为无机物，肯定含铁元素。基本信息第一章至第五章重点阐述X射线衍射的基本理论，第六章至第
全球首份土壤病毒图谱绘成
一个包括美国太平洋西北国家实验室在内、由全球近50个机构组成的国际联盟，成功绘制出了首份全球土壤病毒（GSV）图谱。该图谱对全球土壤病毒圈进行了全面描述，阐释了土壤病毒对全球生物地球化学过程可能的影响，并揭示了有望在哪些领域进一步开展土壤病毒生态学研究等重要信息。相关论文发表于新一期《自然·微生物学
全球首份土壤病毒图谱绘成
科技日报北京8月6日电 （记者刘霞）一个包括美国太平洋西北国家实验室在内、由全球近50个机构组成的国际联盟，成功绘制出了首份全球土壤病毒（GSV）图谱。该图谱对全球土壤病毒圈进行了全面描述，阐释了土壤病毒对全球生物地球化学过程可能的影响，并揭示了有望在哪些领域进一步开展土壤病毒生态学研究等重要信息。
全球首份土壤病毒图谱绘成
一个包括美国太平洋西北国家实验室在内、由全球近50个机构组成的国际联盟，成功绘制出了首份全球土壤病毒（GSV）图谱。该图谱对全球土壤病毒圈进行了全面描述，阐释了土壤病毒对全球生物地球化学过程可能的影响，并揭示了有望在哪些领域进一步开展土壤病毒生态学研究等重要信息。相关论文发表于新一期《自然·微生物学
红外光谱图谱记忆口诀
红外可分远中近，中红特征指纹区， 1300来分界，注意横轴划分异。 看图要知红外仪，弄清物态液固气。 样品来源制样法，物化性能多联系。 识图先学饱和烃，三千以下看峰形。 2960、2870是甲基，2930、2850亚甲峰。 1470碳氢弯，1380甲基显。 二个甲基
如何阅读基因载体图谱？（三）
三、改造载体 1、改造启动子：一般在过表达载体中CMV属于广谱型的强启动子，具体可根据实验需求，选用不同启动子，尤其是对于AAV载体构建时选用组织特异性启动子。 启动子名称启动子大小组织特异性ALB2.4kb肝脏特异性CAG944bp广泛表达的强启动子CamKIIa1.2kb大脑皮层和海马神经元特异
XPS图谱之自旋轨道分裂
由于电子的轨道运动和自旋运动发生耦合后使轨道能级发生分裂。对于l＞0的内壳层来说，用内量子数j（j=｜l±ms｜）表示自旋轨道分裂。即若l=0 则j=1/2；若l=1则j=1/2或3/2。除s亚壳层不发生分裂外，其余亚壳层都将分裂成两个峰。
液相图谱怎么看
液相色谱图：①横坐标是时间轴，每个峰顶点对应的时间为该物质（峰）保留时间；②纵坐标是响应强度，即在一定波长下被检测物质的反应强度（紫外），响应强度通常用峰高或者峰面积表示，最常用的是峰面积大小，代表物质的量，与物质的量成正比；③分离度（两峰之间分离程度）、是否拖尾还是前沿峰、信噪比等这些参数也需要看
移液知识
在实验室工作的每一个人都会移液，但你真的会吗?或者不是每一个人都认为他会正确的移液，你可以从本文中得知移液过程中最重要的是什么，如何得到可以重复再现的移液结果。 在实验室中，几乎没有一项工作像移液一样普通了。也许正是因为如此普通、如此简单而没有得到人们的关注吧。但就是这样一个最为普通、简单工作却
凝血检验知识
问：出现凝血酶原时间（PT）、活化的部分凝血活酶时间（APTT）或凝血活酶时间（TT）延长，应注意哪些事项： （一）PT和/或APTT延长 1. 了解患者有否家族出血史、个人出血史、肝病史、病人服药情况（医疗史）。病人如有瘀点、紫癜、黏膜出血多提示血管或血小板异常；若为关节出血、胃肠道出血常提示单个
凝血检验知识
问：出现凝血酶原时间（PT）、活化的部分凝血活酶时间（APTT）或凝血活酶时间（TT）延长，应注意哪些事项： （一）PT和/或APTT延长 了解患者有否家族出血史、个人出血史、肝病史、病人服药情况（医疗史）。病人如有瘀点、紫癜、黏膜出血多提示血管或血小板异常；若为关节出血、胃肠道出血常提示单个因子缺
薄层色谱知识
薄层色谱又叫薄板层析，是色谱法中的一种，是快速分离和定性分析少量物质的一种很重要的实验技术，属固—液吸附色谱，它兼备了柱色谱和纸色谱的优点，一方面适用于少量样品（几到几微克，甚至0.01微克）的分离；另一方面在制作薄层板时，把吸附层加厚加大，因此，又可用来精制样品，此法特别适用于挥发
查尿知识
尿无小事，很多健康信息都藏在小小的一杯尿检中。不论男性还是女性，都会出现泌尿系统问题，出现尿频尿急尿痛等症状。但是不同疾病，尿检时间和方法也有不同。查蛋白尿：一定要清晨第一尿其实一般的尿常规并不需要一定是早晨起来的第一次排尿，什么时候的尿液都可以的，但是如果有症状需要排查，比如蛋白尿，总是看到排尿后
PH计知识
一、定义： PH计|酸度计是一种常用的仪器设备。酸度计简称pH计，由电极和电计两部分组成。主要用来测量液体介质的酸碱度值,配上相应的电极可以测量电位MV值，广泛应用于工业,农业,科研,环保等领域. 使用中若能够合理维护电极、按要求配制标准缓冲液和正确操作电计,可大大减小pH示值误差，从而提高化
移液器维修知识
1容量超差故障分析与排除：（1）容量调节器内位置不对。用专用把手调节移液器尾部的容量调节孔，反复多次，直至合格。为提高工作效率，避免盲目调整，现总结几种常见品牌的移液器调节方法：Gilson、Eppendorf逆时针调大，顺时针调小； Finnpipette、Thermo、Labsystem、Bio
CDMA系统知识
1 CDMA系统概念 CDMA系统是基于码分技术（扩频技术）和多址技术的通信系统，系统为每个用户分配各自特定地址码。地址码之间具有相互准正交性，从而在时间、空间和频率上都可以重叠；将需传送的具有一定信号带宽的信息数据，用一个带宽远大于信号带宽的伪随机码进行调制，使原有的数据信号的带宽被扩展，
仪表安全知识
仪表工安全通则1．在一般情况下不准带电作业，必要时须穿戴好绝缘鞋、手套，并须二人以上方能操作。 2．操作有毒气体的仪表管道时，需打开通风装置，站在上风向，穿戴好规定的防护用品、用具，并须二人以上方能操作。 3． 所有仪表要定期校验，合格后方准使用。使用中经常检查仪表指示是否灵敏，运转是否良好。严禁超
Fevik冻干机知识
真空冷冻干燥是将含水物质先冻结成固态，然后使其中的水份从固态升华成气态，从而除去水份而保存物质的方法。一、冻干机系统1. 控制系统控制系统有可编程程序控制器、触摸屏、外围继电器、传感器等组成。2. 制冷系统制冷系统由制冷压缩机及辅助设施构成，为干燥箱和冷阱提供冷源。（制冷系统中，除装有显示的高、低压
膜分离知识
膜技术知识膜分离技术是一项新兴的分离技术，自从60年代开始大规模工业化应用，发展十分迅速，其品种日益丰富，应用领域不断扩展，是21世纪初最有发展前途的高新技术之一。反渗透RO纳滤NF超滤UF微滤MF膜类型非对称膜非对称膜非对称膜对称；非对称膜厚度薄膜厚度150µm1µm150µm1µm150-250
密封知识定义
密封知识是人们在生产和生活中为了防止流体或固体微粒从相邻结合面间泄漏以及防止外界杂质如灰尘与水分等侵入机器设备内部的零部件或措施日积夜累起来的经验，称之为密封知识。 1.1泄露 泄露是机械设备常产生的故障之一。造成泄露的原因主要有两方面：一是由于机械加工的结果，机械产品的表面必然存在各种
仪表知识小结
1、显示仪与电位差计测量出现4℃的差值是什么原因造成的？ 显示仪的冷端温度补偿电阻不是安装在端子外边，而是安装在仪表内部，由于表内的温度高于表外的温度，仪表工程师把显示仪的输入端子短接，此时仪表没有输入信号，其显示的就是冷端补偿电阻附近的温度，所以这4℃的差值就是环境温度的差值，即表内温度高于表外温
细胞消化知识
无论是原代细胞还是细胞系或癌细胞，细胞长满瓶后，需要对细胞进行传代或将细胞收集起来用作其他实验。贴壁生长的细胞必须要做的一步便是消化过程，下面便对细胞消化、中和、洗涤等过程做个简单介绍。1、绝大部分细胞消化的时候是只需用胰酶润洗一遍即可，吸去胰酶后，残留胰酶附着在细胞表面在37度一般不到2min足够
薄层色谱知识
薄层色谱又叫薄板层析，是色谱法中的一种，是快速分离和定性分析少量物质的一种很重要的实验技术，属固—液吸附色谱，它兼备了柱色谱和纸色谱的优点，一方面适用于少量样品（几到几微克，甚至0.01微克）的分离；另一方面在制作薄层板时，把吸附层加厚加大，因此，又可用来精制样品，此法特别适用于挥发性较小或较高温度
硬度知识大全
生活中，大家经常接触到2B铅笔，时而互相调侃。铅笔其实除了2B，还有HB等等。学工科以后就会去猜想：这个2B到底是什么意思？ 作为一个理论力学刚好及格出头的小编，直观的思维就是：硬度。想当年物理老师还告诉我们，zui软的是滑石、石墨，比较硬的有铂金啊，钢铁，zui硬的那些就是很贵很贵各种高大上的宝
科普小知识——在线质谱分析基本知识
质谱分析的特点及质谱仪分类 (1)质谱学、质谱分析及质谱仪 质谱学(mass spectroscopy，MS)是研究如何使中性样品形成离子，并使这些具有不同质荷比的离子在特定的电磁场中运动，从而将它们分离的科学。 质谱分析是应用质谱学的原理，通过对被测样品含有的离子质荷比的测定分析其组成的种