研究揭示气象变化驱动城市大气病毒组遗传多样性

中国科学院微生物研究所研究员温廷益团队研究了北京近地表的大气病毒遗传多样性阐明了不同天气条件下城市上空DNA病毒群落组成与气象变化之间的作用关系,明确了潜在的生物标志物,解析了新型病毒特征、辅助代谢网络以及病毒-宿主关系,揭示了大气病毒群落的生态作用及其可能的传播方式。相关研究近日发表于《先进科学》期刊。 土壤、水体、冰川及动植物等来源的病毒,包括流感、冠状病毒等致病病毒,能够通过气溶胶远距离扩散和传播,从而对环境和生态健康造成潜在的危害。但由于空气病毒样本收集困难、缺乏标准标记基因以及检测工具,空气病毒组的丰度、群落组成、代谢特征及传播机制等尚不清楚。因此,开展空气病毒组学研究对于理解它们在生态系统及人类和动植物健康中的作用很有必要。 温廷益团队与中国农业大学合作,从13个空气样本中收集了263.5Gb数据开展病毒宏基因组研究。通过组装和分析12484个病毒(聚类到221个病毒属、47个病毒科、19个病毒目和15个病毒......阅读全文

遗传发育所发现生物钟调节人体脂代谢个体多样性及差异性

  生物钟调节人体的脂代谢、脂肪组织功能的日节律。尽管已经知道生物钟失调和心脏代谢功能成负关联,但我们对单个个体之间节律对代谢途径调控的生物钟的变化却知之甚少。   中科院遗传与发育生物研究所税光厚等研究组通过对20个健康个人血液中263个脂分子在28小时内不同时间点的脂组学分析,发现13%的脂代

遗传多样性缺失导致少量人种被忽略-基因组学应包容性

  一个来自被忽略人种的研究  几十年来,Néstor Ruiz Hernández一直在争取认可。他在墨西哥南部太平洋沿岸的一个小镇长大。在那里,他和其他许多人都是十六世纪被人贩子从非洲贩运到墨西哥的奴隶的后代。他们认为自己是Afromexican,但该组织并未被墨西哥政府正式承认为少数族裔群体。

科研人员深度挖掘人类肠道宏基因组的古菌病毒

  北京时间12月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞团队在国际学术期刊《自然-通讯》(nature communications,IF=17.69)上发表了题为"Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of arch

中国西南与东南亚人类文化和遗传多样性国际学术研讨会召开

  近日,由中国科学院昆明动物研究所承办的中国西南与东南亚人类文化和遗传多样性国际学术研讨会(HUDSEAC)在云南昆明召开。  研讨会设有主旨报告、遗传学报告、考古学报告和民族学/语言学报告四部分交流内容。来自昆明动物所、柬埔寨皇家艺术大学、泰国科技发展署生物资源中心、马来西亚理科大学等的专家学者

人类基因组完整改组图谱绘成-深化人们对遗传多样性的理解

  冰岛基因解码公司科学家完成了一项重要研究。他们绘制了一份人类基因组完整改组图谱,即详尽的人类DNA在生殖过程中混合方式的地图。这项研究深化了人们对遗传多样性的理解,是25年来科学家探索人类基因组中新生多样性产生机制,以及与健康和疾病关联研究的延续。相关成果22日发表在《自然》杂志上。  论文的作

非洲首个大型人类基因组学研究揭示高水平遗传多样性

   南非科技部资助的“南部非洲人类基因组计划(SAHGP)”,顺利完成了对24名来自不同民族语言个体的全基因组测序,证实非洲人群存在高水平的遗传多样性,研究结果发表在《自然-通讯》期刊上。   该计划是非洲首个由政府资助开展的人类基因组学研究,旨在揭示南部非洲人群的独特遗传特征,全方位发掘各类人群

研究揭示青藏高原特有两栖类遗传多样性与气候变化关系

  愈来愈多的证据表明全球气候变化影响了生物多样性与生态系统服务,正对自然种群产生广泛的影响,导致丰度、行为、生理与物候等的变化,以及地理分布的变迁,还往往会增加灭绝风险。第四纪(260万年前至今)以来,全球气候经历了多次冰期-间冰期循环,导致物种分布范围表现出周期性的缩小与扩张,并影响物种形成与灭

非洲首个大型人类基因组学研究揭示高水平遗传多样性

  南非科技部资助的“南部非洲人类基因组计划(SAHGP)”,顺利完成了对24名来自不同民族语言个体的全基因组测序,证实非洲人群存在高水平的遗传多样性,研究结果发表在《自然-通讯》期刊上。   该计划是非洲首个由政府资助开展的人类基因组学研究,旨在揭示南部非洲人群的独特遗传特征,全方位发掘各类人群

武汉病毒研究所在食虫蝙蝠肠道中发现多种新型病毒

  中科院武汉病毒研究所石正丽研究员带领的研究团队采用宏基因组学方法,对我国蝙蝠肠道病毒首次进行了系统研究,结果发表在《病毒学杂志》(Journal of Virology)上(2012, 86(8):4620. DOI: 10.1128/JVI.06671-11)。  蝙蝠是哺乳动

如何通过计算多样性指数评估苔藓物种多样性

通过计算多样性指数来评估苔藓物种多样性,通常可以按照以下步骤进行:数据收集首先,需要通过实地调查、标本采集等方法,确定研究区域内苔藓的物种组成以及每个物种的个体数量。选择多样性指数常见的用于评估苔藓物种多样性的指数包括香农 - 威纳指数(Shannon-Wiener Index)、辛普森指数(Sim

人类肠道宏基因组的古菌病毒研究新进展

  2022年12月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞团队在《自然-通讯》(Nature Communications)上,发表了题为Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of archaeal virome in

广东省人工驯养竹鼠体内的病毒组结构特征获揭示

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512863.shtm

我科学家进一步揭示乙脑病毒组装机制

  近日,中国农业科学院哈尔滨兽医研究所重要人兽共患病与烈性外来病团队通过研究进一步完善了乙型脑炎等黄病毒复制生命周期的机制细节,加深了宿主因子与病毒相互作用的理解,为研制新的抗病毒药物提供了新思路与方向。相关研究成果在线发表在病毒学国际期刊《病毒学杂志(Journal of Virology)》上

深海沉积物病毒多样性和辅助代谢功能研究获进展

  在海洋环境中,病毒是仅次于原核生物的第二大生物量成分。它们的生态意义不仅限于宿主裂解,还包括水平基因转移和通过辅助代谢基因调节宿主代谢。这些辅助代谢基因可以编码关键的代谢酶,在感染期间有效地重塑细胞过程,并可能影响生物地球化学循环。  近日,中国科学院海洋研究所研究团队揭示了深海不同冷泉和海山沉

抗体的多样性

  人血清中的抗体多种多样,B淋巴细胞可产生的抗体种类在108以上,可与众多不同抗原发生特异性结合。抗体多样性的原因主要有两方面:  1.外源性因素环境中抗原种类甚多,每种大分子抗原又有多种抗原表位,每种抗原表位均可选择激活体内一个B细胞克隆,产生一种特异性抗体。  2.内源性因素抗体多样性的另一个

抗体的多样性

人血清中的抗体多种多样,B淋巴细胞可产生的抗体种类在108以上,可与众多不同抗原发生特异性结合。抗体多样性的原因主要有两方面:1.外源性因素环境中抗原种类甚多,每种大分子抗原又有多种抗原表位,每种抗原表位均可选择激活体内一个B细胞克隆,产生一种特异性抗体。2.内源性因素抗体多样性的另一个原因是由基因

物种多样性指数

物种多样性指数类别名称计算公式物种多样性指数Simpson指数D=1-∑Ni2Shannon-Wiener指数H=-∑PilogPi备注:式中,N为群落中所有物种个体总数,Pi=ni/N,ni为物种i的重要值,Ni为物种i的个体数。

我国科学家发现214种全新脊椎动物相关病毒

  近日,我国科学家张永振带领的研究团队新发现了214种RNA病毒。这对于提高我国乃至世界对新发突发传染病的防控能力,甚至为进一步研究生命的起源进化具有重大意义。  神奇“探测器”搜寻病毒  在我们生活的地球上,病毒的历史非常古老,甚至参与了生命起源和地球重大进化转变的进程。在很多科学家的眼中,病毒

国际生物多样性日:保护生物多样性全球在行动

5月22日,是国际生物多样性日,而今年又是联合国确定的国际生物多样性年。        生物多样性与人类息息相关。如果没有生物多样性,人类难以感受到树林的绿意,还可能失去空气、食物和水。如果没有多姿多彩的其他生命形式,不仅生活会变得索然无味,而且人类可能

科研人员在橡胶树种质遗传多样性和产胶进化研究上取得新进展

目前橡胶生产上的主要栽培品种均可追溯到来自橡胶树属(Hevea)巴西橡胶树(H. brasiliensis)种内的22株1876(年)魏克汉种质,遗传资源狭窄是橡胶树杂交育种进展缓慢的一个重要因素。同时,在橡胶树属的其他种,以及巴西橡胶树种内的野生种质中报道存在丰富的产胶、抗病、速生和耐旱等重要农艺

野生小型哺乳动物病毒组组成和病毒播散研究方面取得进展

  在国家自然科学基金项目(批准号:32130002、31930001、32041004、U22A20526)等资助下,粤港澳大湾区精准医学研究院(广州)、复旦大学生命科学学院张永振教授团队在野生小型哺乳动物中的病毒多样性、进化、生态及其播散规律研究方面取得进展。研究成果以“宿主特征决定野生小型哺乳

11月Science精华-我国科学家揭示非洲猪瘟病毒组装机制

  本周又有一期新的Science期刊(2019年11月1日)发布,它有哪些精彩研究呢?让小编一一道来。图片来自Science期刊。  1.我国科学家在Science期刊上解析出非洲猪瘟病毒的高分辨率三维结构并揭示它的组装机制  doi:10.1126/science.aaz1439  非洲猪瘟(A

流感病毒来自鱼吗

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495397.shtm   ?人类细胞感染了流感病毒。图片来源:Steve Gschmeissner/Science Photo Library流感病毒是季节性流感的罪魁祸首。一项近日发表于预印本服

7月15日《自然》杂志精选

封面故事: 猴与人的分化   灵长类的化石记录很稀少,仍然存在实质性的缺口。其中一个缺口是“旧世界”的猴子与“新世界”高等灵长类的类人猿和人类的分化。这种分化以前仅限于“非洲—阿拉伯大陆”的渐新世,但在沙特西北一个新的、处在进化树根部的狭鼻猿的发现缩小了这个缺口。沙特发现的

如何利用多样性指数评估苔藓物种多样性的恢复速度?

以下是利用多样性指数评估苔藓物种多样性恢复速度的一般步骤:选择合适的多样性指数常见的用于评估物种多样性的指数包括香农 - 威纳指数(Shannon-Wiener Index)、辛普森指数(Simpson Index)、皮卢均匀度指数(Pielou's Evenness Index)等。香农

如何利用多样性指数评估苔藓物种多样性的恢复速度?

以下是利用多样性指数评估苔藓物种多样性恢复速度的一般步骤:选择合适的多样性指数常见的用于评估物种多样性的指数包括香农 - 威纳指数(Shannon-Wiener Index)、辛普森指数(Simpson Index)、皮卢均匀度指数(Pielou's Evenness Index)等。香农

Nature重大成果:揭示125000个病毒基因组

  在地球的内部、地球之上以及地球的周围,微生物的数量达到了10^30,估计超过了银河系中的星星。微生物已知在调控碳固定,维持全球氮、硫、磷和其他营养素的循环中起至关重要的作用,但目前大多数的微生物仍然是无法培养和未知的。美国能源部正以这一“微生物暗物质”作为目标,更好地了解地球微生物的多样性,收集

多基因遗传与数量遗传

  多基因遗传(polygenic inheritance)是指生物和人类的许多表型性状由不同座位的较多基因协同决定,而非单一基因的作用,因而呈现数量变化的特征,故又称为数量性状遗传。多基因遗传时,每对基因的性状效应是微小的,故称微效基因(minor gene),但不同微效基因又称为累加基因

抗体多样性的原因

抗体多样性的原因主要有两方面:1.外源性因素环境中抗原种类甚多,每种大分子抗原又有多种抗原表位,每种抗原表位均可选择激活体内一个B细胞克隆,产生一种特异性抗体。2.内源性因素抗体多样性的另一个原因是由基因的结构及功能特征所决定的。编码人Ig重链及κ、λ型轻链的基因分别位于第14、2、22号染色体上。

物种多样性的定义

物种多样性是指地球上所有生物有机体的多样化程度,其在分布上具有明显的时间格局和空间格局。在时间维度上,大到物种进化,小到群落演替、季节性变化,物种多样性均呈现出一定的规律性或周期性的变化。在空间维度上,受热量、水分、地表等环境因子的影响,物种多样性的分布呈现出纬度地带性、海拔地带性等特点。物种多样性