研究人员绘制七鳃鳗单细胞转录组图谱
雷氏七鳃鳗作为现存的无颌脊椎动物代表,是一种由无脊椎动物向脊椎动物进化的过渡类型,被视为研究脊椎动物演化的重要模式生物。近日,华大生命科学研究院联合辽宁师范大学七鳃鳗研究中心等单位在《自然—通讯》发表最新研究成果,团队基于华大自主研发的DNBelab C4和 DNBSEQ测序平台,采用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术,构建了七鳃鳗全部器官的单细胞转录组图谱,系统解析了七鳃鳗在免疫系统和脂肪代谢等方面的细胞多样性及演化特征。团队采集了七鳃鳗的血液、肌肉、肝脏、心脏、脑等14种组织样本,共测序604,460个细胞,鉴定出70种细胞类型,成功绘制了迄今最为完整的七鳃鳗细胞图谱,并揭示其细胞组成的系统发育关系。雷氏七鳃鳗 研究团队供图在这项成果中,团队发现七鳃鳗肠道中存在类胰岛细胞和腺泡细胞,其中92个胰岛样细胞与哺乳动物胰腺β细胞相似,而689个腺泡样细胞的功能与哺乳动物胰腺腺泡细胞相似。这表明七鳃鳗可能通过肠道承担部分胰腺功能,......阅读全文
研究人员绘制七鳃鳗单细胞转录组图谱
雷氏七鳃鳗作为现存的无颌脊椎动物代表,是一种由无脊椎动物向脊椎动物进化的过渡类型,被视为研究脊椎动物演化的重要模式生物。近日,华大生命科学研究院联合辽宁师范大学七鳃鳗研究中心等单位在《自然—通讯》发表最新研究成果,团队基于华大自主研发的DNBelab C4和 DNBSEQ测序平台,采用单细胞RNA测
基因组研究显示七鳃鳗独立于其他脊椎动物进化
一个国际研究团队在新一期《自然·遗传学》杂志上说,他们成功破译了原始鱼类七鳃鳗的基因组,发现这种动物拥有诸多不同于其他脊椎动物和更原始的无脊椎动物的基因特征,这表明七鳃鳗是独立进化而来的。 七鳃鳗又称八目鳗,属于无腭纲,它们的嘴呈圆筒形,没有上下腭。从进化角度看,七鳃鳗处于接近脊椎动物祖先
古脊椎所等在燕辽生物群发现七鳃鳗的侏罗纪食肉祖先
由于可能保存了脊椎动物颌骨、偶鳍(如陆地脊椎动物的四肢)等重要器官的起源线索,加上对现代渔业的巨大影响,现生无颌类尤其是七鳃鳗成为演化-发育生物学家、生态学家和社会公众颇为关注的动物类群,甚至被奉为脊椎动物演化生物学研究的模式生物。七鳃鳗的摄食方式令人惊悚,“水下吸血鬼”的形象深入人心,成为一些
英国国王因它丧命!揭秘恐怖片吸血怪物的“来头”
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/12/515158.shtm在渔业领域,有一种生物“恶名远扬”。恐怖片《血湖》中的吸血恶魔就是以它为原型创作的。它有着一张酷似吸盘的圆形大嘴,嘴中密密麻麻的锋利角质齿让人望而生畏。它们最令人惊悚的捕食行为是将吸
中科院张江永研究员PNAS发表新研究成果
来自中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、北京大学的研究人员,发现了白垩纪早期的七鳃鳗(lamprey)幼虫化石,由此揭示了它三个阶段的生命周期。研究结果发布在10月13日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。 中国科学院古脊椎动物与古人类研究所的张江永(Jiangyong Zhang)研究员
中科院张江永研究员PNAS发表新研究成果
来自中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、北京大学的研究人员,发现了白垩纪早期的七鳃鳗(lamprey)幼虫化石,由此揭示了它三个阶段的生命周期。研究结果发布在10月13日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。 中国科学院古脊椎动物与古人类研究所的张江永(Jiangyong Zhang)研究员
Nature新文章:古老的免疫细胞
通过研究七鳃鳗生物学家们可以拟想进化的过程,因为它们代表了鲨鱼和鱼类之前进化树的早期分支。 尽管它们的外表不起眼,研究人员发现七鳃鳗有着复杂的免疫系统,其三种类型的白血细胞与我们的B细胞和T细胞相似。 来自埃默里大学医学院和德国马普免疫学与实验胚胎学研究所的科学家们,发现七鳃鳗的一种
11脱氧皮质醇功能介绍
类固醇生成,显示从胆固醇到皮质醇的途径中存在11-脱氧皮质醇。11-脱氧皮质醇作为一种糖皮质激素,但不如皮质醇有效。11-脱氧皮质醇由17α-羟基孕酮通过21-羟化酶合成,并通过11β-羟化酶转化为皮质醇。11-脱氧皮质醇在哺乳动物中具有有限的生物学活性并主要充当代谢中间体的内糖皮质激素途径,导致皮
PNAS:miRNA揭示脊椎动物进化起源
美英科学家的一项最新研究表明,脊椎动物这种复杂生命形式的出现源于miRNA。调控基因表达的miRNA的不断进化是早期脊椎动物出现的背后原因。相关论文近日在线发表于美国《国家科学院院刊》(PNAS)上。 论文高级作者、美国达特茅斯学院的Kevin Peterson表示,“新的研究不仅为认识人类自身的进
中科院团队完整呈现4.1亿年前玉海翼角鱼全貌
中新网北京11月1日电 (记者 孙自法)记者11月1日从中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(中科院古脊椎所)获悉,该所四代古鱼类学家薪火相传、接力研究30年,最新完成对产自云南曲靖“古鱼王国”、约4.1亿年前盔甲鱼类“玉海翼角鱼”新化石材料的深入研究,终于使玉海翼角鱼的全貌得以完整呈现,并填补了盔甲
2月3日《自然》杂志内容精选
杂志封面 封面故事:太阳系外的“太阳系” NASA的Kepler航天器是一个设计用来检测和研究太阳系外行星的空间天文台,是当这些行星在穿越其主星的盘时对其进行检测和研究的。最近该航天器有一个重大发现:它发现了一个由六个行星组成的体系,该体系绕一个名叫Kepler-11的、与太
2月3日《自然》杂志精选
封面故事:太阳系外的“太阳系” NASA的Kepler航天器是一个设计用来检测和研究太阳系外行星的空间天文台,是当这些行星在穿越其主星的盘时对其进行检测和研究的。最近该航天器有一个重大发现:它发现了一个由六个行星组成的体系,该体系绕一个名叫Kepler
单细胞转录组制备仪的功能
fluidigm C1 单细胞自动制备仪用于 mRNA 测序 更完整的流程 -首尾相连的流程对单细胞进行全转录组分析 最高的通量 -每次运行可前所未有的平行处理 96 个单细胞 更容易的操作 -直接从单细胞开始,简化的样本制备,只需 3 小时手工操作时间,没有 片段化和纯化步骤 更节省的成
棘皮动物、低等脊索动物、圆口纲动物观察试验
实验方法原理1. 通过对海盘车(即海星)的外形观察与内部解剖,了解棘皮动物的基本特征;认识棘皮动物门各纲的一些习见代表种。2. 通过观察柱头虫、海鞘、文昌鱼等标本,了解棘皮动物的基本特征,认识其常见代表种。3. 通过观察七鳃鳗浸制标本,了解圆口纲动物的主要特征。实验材料液浸标本仪器、耗材显微镜
棘皮动物、低等脊索动物、圆口纲动物观察试验
实验方法原理 1. 通过对海盘车(即海星)的外形观察与内部解剖,了解棘皮动物的基本特征;认识棘皮动物门各纲的一些习见代表种。2. 通过观察柱头虫、海鞘、文昌鱼等标本,了解棘皮动物的基本特征,认识其常见代表种。3. 通过观察七鳃鳗浸制标本,了解圆口纲动物的主要特征。实验材料 液浸标本仪器、耗材
空间转录组和单细胞转录组测序联合应用的典型案例
单细胞转录组测序技术的如火如荼,伴随着空间转录组测序技术的蓬勃发展,可以看到,在现有的高通量检测技术领域,这两种技术已为科学研究的发展提供了前所未有的技术支撑。从2019年单细胞多组学被评为《Nature Methods》年度技术进展,到2020年空间转录组技术也被评为年度技术进展,相信在接
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。
家蚕丝腺单细胞转录组图谱绘成
中新网重庆6月15日电 (记者 钟旖)记者15日从家蚕基因组生物学国家重点实验室(西南大学)获悉,我国家蚕研究又有新进展。该实验室徐汉福教授课题组近日在国际知名期刊Nature Communications《自然通讯》上发表相关主题研究论文,以单细胞分辨率揭示了家蚕丝腺的全细胞异质性及其基因转
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞转录组重要研究文献汇总(二)
4.单细胞转录组测序在植物领域崭露头角相比动物的单细胞研究,由于植物具有细胞壁的特点,使得植物的单细胞研究相比较难,但是继2月份的拟南芥根组织单细胞转录组学研究[8],本月在《Developmental Cell》上又发表了一篇基于拟南芥根组织的单细胞转录组学研究报道[9]。来自德国图宾根大学植
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞测序和转录组测序的区别
单细胞测序不同于传统的高通量测序,它是对于一个细胞群中的某一个细胞进行测序分析。单细胞转录组测序就是对单个细胞转录组水平进行测序,它的优势是准确地分析每一个细胞的基因表达,能准确区分细胞群体,并进行细胞分类间比较,以及能找到稀有的细胞的表达情况。
单细胞转录组重要研究文献汇总(一)
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程,继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐,本月在《Nature
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程,继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐,本月在《Nature
玉米单细胞转录组测序,11种细胞类型
近日,广东省科学院南繁种业研究所生物育种研究室在玉米单细胞转录组测序研究方面取得新进展。相关研究在线发表于《作物学报》(The Crop Journal)。广东省科学院南繁种业研究所李旭辉博士为该论文第一作者,齐永文研究员为通讯作者。玉米是全球重要的粮食和能源作物,而其产量形成的基础依赖其特殊的根系
单细胞转录组制备仪的技术指标
将 C1 应用于单细胞 mRNA 测序,可以从多个细胞个 体平行处理多达 96 个 cDNA 文库,在任何 Illumina 测序仪上对 mRNA表达进行相对定量。此系统的主要特征包括: 高通量 -可对 96 个单细胞进行大规模平行、连贯的制备, 引入条形码序列标记(Barcode),可将测序
单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析
基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析,在上一篇中,我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容(具体内容查看链接)。在这里,我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。细胞谱系分析,最简明的理解就是细胞领域的进化树,通常指的是某类祖源细胞,在特定条件下,有多个发育轨迹和
3月单细胞转录组重要研究文献汇总
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热 精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程,继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐,本月在《Nature
高通量单细胞转录组测序发展与展望
单细胞转录组测序技术这几年的发展之快,运用之广已众所周知。为更好的在国内推广该技术,也为更好的将该技术运用到广大科研工作者的实际工作中,上海生物芯片有限公司生物信息团队通过对该技术的整理和归纳,在《生命科学》杂志上发表了名为“高通量单细胞转录组测序发展与展望”综述文章,希望能进一步提升科研工作者对该
蛙类变态发育中呼吸器官转变的细胞分子机制获揭示
近日,中国科学院成都生物研究所研究员江建平团队以饰纹姬蛙为研究对象,综合采用组织切片、透射电镜、荧光原位杂交、转录组和单细胞转录组等方法技术,通过整合分析多维数据,对饰纹姬蛙变态发育中呼吸器官转变的细胞分子机制进行了深入探究。相关成果分别发表在《动物学前沿》和《通讯生物学》上。 这项研究显示,