科学家构建高密度育种芯片与高通量表型组结合的葡萄高效分子育种体系

近日,中国科学院植物研究所葡萄与葡萄酒科学研发团队与合作者构建了高密度育种芯片与高通量表型组结合的葡萄高效分子育种体系。相关研究成果发表于国际学术期刊Advanced Science。 随着全球气候变化加剧,葡萄产业面临极端气候频发导致的多种环境胁迫及糖酸失衡、花色苷含量下降等严峻挑战,亟需培育具有自主知识产权的高环境韧性、高品质新品种。但是,葡萄童期较长、杂合度高,导致传统育种周期长、效率低,而现有分子标记密度不足制约着复杂性状的精细定位及其在多性状聚合育种中的应用。此外,复杂性状的表型高通量精准获取也成为育种中的瓶颈问题。因此,开发高精度分子标记和高通量表型获取工具,解析环境韧性和品质性状遗传网络,对加速葡萄品种改良具有重要意义。 对此,葡萄与葡萄酒科学研发团队开发了葡萄200K Axiom? SNP芯片,标记密度达每2.8kb一个SNP,较国际现有芯片分辨率提升10倍。配套开发的高通量表型平台可实现每秒钟获取单果1......阅读全文

凭部分基因和表型“认亲”不靠谱

 巢穴中的小山猴   Roberto F. Nespolo摄■本报记者 张文静长期以来,用物种形态特征和分子数据构建物种关系树,是很多研究常用的做法。而实际上用这两种方法推断物种演化历程时,常常出现相互矛盾的情况,但相关研究非常有限。4月20日,《细胞》刊发了一项由中国科学家领衔的中外联合团队进行的

凭部分基因和表型“认亲”不靠谱

  长期以来,用物种形态特征和分子数据构建物种关系树,是很多研究常用的做法。而实际上用这两种方法推断物种演化历程时,常常出现相互矛盾的情况,但相关研究非常有限。  4月20日,《细胞》刊发了一项由中国科学家领衔的中外联合团队进行的研究。该研究不仅公布了对有袋类哺乳动物物种辐射性大爆发过程的研究结果,

PlantScreenSC植物表型分析技术方案

植物表型分析系统PlantScreen-SC包括传送系统、成像系统、环境传感器、服务器等硬件及配套软件,适用于高70cm、宽幅50cm以内的植株。该系统是可用于生物农药、植物源生物刺激剂及土壤调理剂研发的大型表型系统。 成像系统包括叶绿素荧光成像单元和RGB成像单元。前者采用脉冲调制式叶绿素荧光成像

大田作物表型分析技术方案

有利性状能帮助作物抵抗非生物胁迫和生物胁迫。在作物胁迫抗性的研究中,我们需要快速准确的方法来实现高效和有效的野外表型测量、监测和分析。这其中包括自动化的植物形态学、生物化学和生理学的测量,以综合评估各种监测环境中作物胁迫与抗性、生长状况、潜在和实际的产量等。易科泰生态技术公司与PSI等国际知名表型分

有机体表型适应的概念

表型适应:描述的是有机体在个体水平上的变化,包括生理、行为、形态等方面,时间尺度较短,变化的特征是可逆转的。

植物表型研究文章TOP10(三)

TOP 4● 高通量表型和全基因组关联分析:研究揭示水稻的自然遗传变异(Nat Commun,2014)通过使用高通量测序技术对植物基因组学的研究迅速发展,传统的植物表型测试已远远落后。此文的作者开发了一个高通量水稻表型测定设施(HRPF),用于监测水稻生育期的13个传统农艺性状和2个新定义的性状。

人类记忆B细胞的表型分析实验

                                                                                                        B淋巴细胞                        

藻类表型研究全面解决方案

藻类是蓝藻门、眼虫藻门、金藻门、甲藻门、绿藻门、褐藻门、红藻门等一系列水生生物的总称。其形态种类众多,小至微米级的单细胞微藻,大至长达几米乃至几十米的大型褐藻。藻类作为水体中最重要的初级生产者,对整个生态系统乃至地球圈的稳定都起着极为重要的作用。莱茵衣藻、蓝藻等模式藻类为功能基因、生物进化、光合作用

《自然》:蛋白高通量定量技术

  来自美国德州大学西南医学中心的Rama Ranganathan和他的同事研发了一种能全面分析单基因突变的高通量定量技术,这对于理解蛋白结构,以及蛋白工程应用具有重要意义。相关成果公布在Nature杂志上。   生物学的一个基本原则就是蛋白的氨基酸序列能特异性构成相应的三维结构,并行使生物化

什么是高通量筛选技术

以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机分析处理实验数据,在同一时间检测数以千万的样品,并以得到的相应数据库支持运转的技术体系。高通量筛选技术具有微量、快速、灵敏和准确等特点。简言之就是可以通过一次

高通量筛选技术的简介

  高通量筛选(High throughput screening,HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机分析处理实验数据,在同一时间检测数以千万的样品,并以得到的相应数据库支持运

高通量筛选的特点简介

  高通量筛选时每天要对数以千万的样品进行检测,工作枯燥,步骤单一,操作人员容易疲劳、出错。自动化操作系统由计算机及其操作软件、自动化加样设备、温孵离心设备和堆栈4个部分组成。自动化操作系统代替人工操作显然有诸多优势,它利用计算机通过操作软件控制整个实验过程,编程过程简洁明了。

简述高通量测序的意义

  高通量测序技术的诞生可以说是基因组学研究领域一个具有里程碑意义的事件。该技术使得核酸测序的单碱基成本与第一代测序技术相比急剧下降, 以人类基因组测序为例, 上世纪末进行的人类基因组计划花费 30 亿美元解码了人类生命密码, 而第二代测序使得人类基因组测序已进入万(美)元基因组时代。如此低廉的单碱

高通量组织研磨仪介绍

中药材质量最主要的体现在农药残留的问题上,不仅影响民众的健康,也是阻碍进出 口贸易发展的最大问题。开发快速高效,高灵敏度的中药材农残检测方法,同时对中药材质量进行评价显得尤为重要。金银花为忍冬科多年生藤本植物忍冬的花蕾。别名忍冬花、银花、二花、双花、鹭鸶花、苏花、双苞花、金藤花。花(金银花)、茎藤(

高通量测序分的原理

对DNA分子进行序列测定。1.对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。2.根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony S

高通量筛选有哪些种类?

该技术使用较低剂量,在短时间内完成对大量化合物的生物活性筛选,由于具有微量化,快速,高效等特点,被国内外多数医药研究机构广泛采用。国外许多大型农药公司亦将这种技术用于新农药的筛选。高通量筛选和组合化学(combinatorialchemistry)、自动化操作系统等技术的有机结合,可以缩短新农药创制

高通量细胞分析设备简介

  仪器主要用途:可用于细胞的定性和定量分析(包括检测细胞表面和细胞浆抗原、细胞因子、细胞内DNA、RNA含量等,定量分析细胞内pH值,蛋白总含量、DNA及RNA含量、免疫表现、细胞周期动力学、细胞特殊配体、细胞生物活性鉴定、细胞凋亡研究、细胞功能分析、钙流等),并将具有将特定形状或功能的细胞从混合

高通量测序的相关介绍

  高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。  名词解释  根据发展历史、影响力、测序原

高通量测序的实验过程

1.样本准备(sample fragmentation)2.文库构建(library preparation)3.测序反应(sequencing reaction)4.数据分析(data analysis)

高通量测序技术SOLiD简介

目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligat

高通量测序的实验过程

1.样本准备(sample fragmentation)2.文库构建(library preparation)3.测序反应(sequencing reaction)4.数据分析(data analysis)

高通量测序技术及原理

高通量测序技术及原理介绍如下:1.什么是高通量测序高通量测序技术也被称作二代测序技术(Next Generation Sequencing, NGS),这是相对一代测序技术(Sanger Sequencing)而言的,同时由于高通量测序的出现使得我们能对一个物种的基因组和转录组进行全面、细致的分析成

高通量测序发展史

人类基因组计划(human genome project, HGP)  在介绍高通量测序发展之前,需要先为大家介绍一个人类发展史上的一项重要创举——人类基因组计划(human genome project, HGP)。HGP的完成对测序技术的推动作用意义重大。  HGP是由美国科学家于1985年率先

高通量筛选技术简要综述

  药物高通量筛选(HTS)技术,是发现创新药物的重要技术手段之一,已受到药学同行的极大关注。现将近年来药物高通量筛选技术的研究进展做一综述。  发展中的高通量筛选技术  高通量筛选的组合模式近年来,由于自动化技术特别是机器人的应用,在新药研究中出现了高通量筛选技术,该技术将化学、基因组研究、生物信

什么是高通量筛选技术

官方的定义是:高通量筛选技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机分析处理实验数据,在同一时间检测数以千万的样品,并以得到的相应数据库支持运转的技术体系。简单来说,就是用机器来替代人工,高效的

高通量筛选神经毒性实验

优点:完全自动化的图像获取与分析 快速得到每个细胞的多表型参数 实时监测活细胞的毒性,可持续几分钟至几天 神经系统对许多毒性化合物以及自然环境中生成的有害物质非常敏感。在疾病发生过程中,神经毒性可以对大脑或者外周神经系统造成短暂或持续性的损伤,例如脊髓损伤,中风,创伤性脑损伤等。同时这种神经毒性

高通量测序技术的应用

  测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行重头测序(de novosequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测

高通量药物筛选的简介

1. 化合物样品库化合物样品主要有人工合成和从天然产物中分离纯化两个来源。其中,人工合成又可常规化学合成和组合化学合成两种方法。2.自动化的操作系统自动化操作系统利用计算机通过操作软件控制整个实验过程。操作软件采用实物图像代表实验用具,简洁明了的图示代表机器的动作。自动化操作系统的工作能力取决于系统

《自然.通讯》发表华中农业大学水稻表型组学团对成果

  2014年10月8日,《自然•通讯》(Nature Communications)发表了我校作物遗传改良国家重点实验室水稻表型组研究团队和华中科技大学生物医学光子学研究中心最新研究成果,题为“结合高通量表型测量技术和全基因组关联分析技术促进水稻遗传结构解析”(Combining high-thr

高通量组织研磨仪种子高通量前处理理想的解决方案

我们知道,在种子真实性和纯度检测中,种子高通量前处理是一项十分基础也是十分重要的工作,而且在这项工作中,每个品种需要做一定数量的重复,尤其是纯度检测时,至少需要100粒种子。这么一项繁重的手工劳动如果是采用人工操作,那么不仅效果差,而且需要的时间还长,但是如果将高通量组织研磨仪加入劳动的话,那么工作