科学家系统评估AlphaFold3在药物开发中的预测能力

中国科学院上海药物研究所研究员徐华强团队,在前期评估AlphaFold3蛋白相互作用预测精度的基础上,进一步聚焦其新近开源的小分子配体预测功能,系统评估了AlphaFold3在G蛋白偶联受体(GPCR)-小分子配体复合物结构预测中的表现,并深入揭示了其在药物设计应用中的局限性。相关研究7月9日发表于《中国药理学报》。当前,AlphaFold3在真实药物开发场景中的预测能力尚缺乏全面评估。GPCR是重要的药物靶标,其与小分子配体的相互作用在药物研发中占据核心地位。研究团队收集了AlphaFold3发布后公开的74个GPCR-小分子配体复合物实验结构,比较了AlphaFold3预测结果与实验结构之间的差异。分析结果显示,AlphaFold3在整体受体骨架预测方面表现优秀,但在关键配体结合模式的预测上仍存在明显不足。AlphaFold3在预测数据库中已有同类复合物时表现较好,而在面对新型化合物或未被充分表征的结合模式时预测准确性大幅下......阅读全文

650多名学者批评AlphaFold3不透明

当地时间5月8日,谷歌DeepMind发布其生物学预测工具AlphaFold的最新版本——AlphaFold 3。这一重大成果在科学界引起了巨大轰动。在蛋白质预测领域专家看来,AlphaFold 3是“变革性的”和“令人印象深刻的”。他们表示,这项工作可以用于测序蛋白质、DNA、RNA、小分子等几乎

科学家系统评估AlphaFold3在药物开发中的预测能力

中国科学院上海药物研究所研究员徐华强团队,在前期评估AlphaFold3蛋白相互作用预测精度的基础上,进一步聚焦其新近开源的小分子配体预测功能,系统评估了AlphaFold3在G蛋白偶联受体(GPCR)-小分子配体复合物结构预测中的表现,并深入揭示了其在药物设计应用中的局限性。相关研究7月9日发表于

谷歌AlphaFold-3重磅问世,预测精准度提高100%,AI-能帮助治疗癌症和免疫病

  刚刚,顶级科学期刊英国《Nature》(自然)杂志发表了一份重磅、突破性研究论文。  北京时间5月8日23点,谷歌DeepMind和其英国子公司Isomorphic Labs联合团队在《自然》杂志上发表一份共46页的成果,推出全新AI蛋白质结构预测模型AlphaFold 3,可准确预测生物分子相

积算科技推出AlphaFold3“即点即用”算力服务,现已开放免费试用!

  近日,北京积算科技有限公司(以下简称“积算科技”)推出一站式AlphaFold3在线算力服务,现已开放免费使用。其内置优化后的AlphaFold3模型,支持图形化界面创建容器、低代码启动任务,通过在线服务让科研人员绕开繁琐的部署、设置和调试,实现零门槛使用,以最简单、高效的方式完成蛋白质结构预测

研究构建核小体结合蛋白在线数据库并揭示染色质调控新机制

  染色质是真核细胞中DNA包装和基因表达调控的核心结构。核小体作为染色质的基本单位,与各种蛋白质的相互作用决定了基因表达的精确调控。理解核小体结合蛋白的结构特征和相互作用机制,对揭示表观遗传调控、疾病发生机制以及开发新型治疗策略具有重要意义。然而,传统实验方法在解析这些复杂相互作用时面临成本高、耗

科学家揭示人类甜味受体结构与功能机制

上海科技大学iHuman研究所研究员华甜、刘志杰团队,系统揭示了甜味受体的结构特征、激动剂结合模式及潜在激活机制,为理解甜味感知提供了关键的分子基础,也为设计新型人工甜味剂和靶向甜味受体的药物研发策略提供了新思路。6月24日,相关研究以“加速预览”形式在线发表于《自然》。对甜味的追求是人类与生俱来的

科学家揭示人类甜味受体结构与功能机制

上海科技大学iHuman研究所研究员华甜、刘志杰团队,系统揭示了甜味受体的结构特征、激动剂结合模式及潜在激活机制,为理解甜味感知提供了关键的分子基础,也为设计新型人工甜味剂和靶向甜味受体的药物研发策略提供了新思路。6月24日,相关研究以“加速预览”形式在线发表于《自然》。对甜味的追求是人类与生俱来的

提出好问题,才是科学研究的根本

人工智能时代,提问能力越来越重要,当我们需要和人工智能“共事”时,我们提出的问题“聪明”与否,也许决定了我们的“同事”聪明与否。在科研领域,提出一个好问题更为重要,直接关乎项目的成败,关乎创新的根本。那么,如何提出好的科学问题?这不仅需要具备批判性思维,而且在信息爆炸、技术快速迭代的当下,更需要科研

诺奖团队重磅新作!AI从头设计「肿瘤克星」,将创立新公司!

  肿瘤免疫治疗群雄并起,TCR疗法在实体肿瘤治疗中展现出了巨大潜力。  自2024年一来,TCR蛋白药Kimmtrak和TCR-T细胞药Tecelra陆续上市,尤其是Kimmtrak实现了Q1大卖近7亿元的壮举后,该疗法已成为肿瘤界的又一新星。  近日,David Baker携团队成功通过使用生成

中山大学团队首次发现EB病毒感染新受体

  7月25日,中山大学肿瘤防治中心教授曾木圣、副研究员孙聪团队与中山大学医学院副教授张华团队合作,首次发现桥粒芯胶黏蛋白2(DSC2)可以介导EB病毒(EBV)感染非人源细胞系,为后续构建感染EBV动物模型提供了重要理论基础和关键靶点。相关成果在线发表于《自然-微生物学》(Nature Micro

AI强势入侵生物医药界-如何看待变革浪潮下的创新与挑战?

AI正在入侵科学界,特别是生物科技方向。瑞典皇家科学院在2024年10月宣布了当年诺贝尔化学奖的获奖者,出乎意料的是—— AI又是大赢家。2024年的诺贝尔化学奖被授予了Google旗下DeepMind人工智能实验室的首席执行官Demis Hassabis和总监John Jumper ,以及华盛顿大

为什么诺贝尔化学奖又被人工智能学者拿了?

  今天诺贝尔化学奖开奖,三位得奖者均是因为对蛋白质的杰出贡献获奖,其中华盛顿大学西雅图分校的 David Baker是因为 “计算蛋白质设计”,另后两位是英国伦敦 Google DeepMind 的 Demis Hassabis 和John M. Jumper在“蛋白质结构预测”的贡献。  我在昨

创造奇迹的高科技公司有哪些特点

2024年的诺贝尔奖可以说是人工智能(AI)全面崛起之年,有4位科学家由于AI的贡献而获得诺贝尔奖。其中,杰弗里·辛顿获得诺贝尔物理学奖,大卫·贝克、戴米斯·哈萨比斯和约翰·江珀获得诺贝尔化学奖。当前传统科学世界的版图开始出现分水岭——前AI时代的科学与AI时代的科学,前者是个人英雄主义的舞台,后者

直播预告-|-蛋白质结构与功能预测及设计

  直播时间:2024年8月22日(周四)19:00——21:40 直播平台:科学网APP(科学网微博直播间链接)https://weibo.com/l/wblive/p/show/1022:2321325069047447289984科学网微博科学网视频号 【直播简介】8月22日(周四)晚19:0

盘点:新冠与中国科学的2020

学界十大热议事件  01 P3实验室怎么建,才能最大发挥其作用?  生物安全三级和四级(P3、P4)的高等级生物安全实验室可保护实验人员免受感染、防止病原体泄露。在新冠病毒这样的新兴烈性传染病毒肆虐时,病毒机理研究、疫苗研发等工作都离不开高等级生物安全实验室的支持。  5月21日,国家发改委、国家卫