Nature汇总两个大规模项目提出重要标准

来自加拿大蒙特利尔大学IRCM,美国哈佛大学医学院等处的研究人员根据两个大型研究项目:癌症基因组计划CGP,和癌细胞系百科全书CCLE的研究数据,指出药物筛选研究中标准化的重要性,这对于提高筛选研究的可重复性,寻找更多新型治疗性药物具有重要的意义。 这篇文章发表在Nature杂志上,文章的通讯作者是一位来自IRCM的生物信息学家Benjamin Haibe-Kains。他在这篇文章中强调了标准化药物筛选的重要性,这项研究表明需要进一步发展和标准化药物筛选研究的重现性,因为这对于寻找新的治疗药物及潜在的药物组合非常重要。 癌症基因组计划(CGP)是一项针对主要癌症遗传变异的全面整合分析的计划。最早出现在2005年,目的是绘制一个有关各种癌症基因异常特征的“一览表”,以便通过系统分析找到新方法对抗这一顽疾。 而癌细胞系百科全书(CCLE)整合了来自大约1000个人类癌细胞系的基因表达,染色体拷贝数和大规模平......阅读全文

美吉生物引领生物信息挖掘进入交互时代

  “大数据、云计算、免费”这些在互联网行业司空见惯的字眼,如果我们把它们融入到基因测序行业会出现什么样的新鲜事物?有一家公司就把互联网的理念灌输到了基因测序行业里,它就是上海美吉生物医药科技有限公司(以下简称“美吉生物”)。  互联网思路玩转基因测序行业  近日,一则“生物信息挖掘进入交互时代”的

生物芯片技术用于生物信息学研究

人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的

生物芯片技术用于生物信息学研究

人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的

成都生物所开发新型生物信息学软件

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm       近年来,随着测序技术的快速发展,动物(尤其是非模式动物)全基因组数据(WGS)获取变得简单、便宜,这使得数据库中全基因组数据量呈指数态势增长。全基因组测序数据往往同时包含

关于基因的基本信息介绍

  基因(遗传因子)是产生一条多肽链或功能RNA所需的全部核苷酸序列。基因支持着生命的基本构造和性能。储存着生命的种族、血型、孕育、生长、凋亡等过程的全部信息。环境和遗传的互相依赖,演绎着生命的繁衍、细胞分裂和蛋白质合成等重要生理过程。生物体的生、长、衰、病、老、死等一切生命现象都与基因有关。它也是

基因指纹的基本信息

基因指纹,不同人之间、同一个人的正常细胞与癌变细胞之间的基因也不相同,这种差异可像指纹一样具有“唯一性”,被形象地称为基因指纹。根据基因密码,在经过电脑特殊处理后,会显现出条形码状而黑白相间的条文。这就是基因指纹。

韩国研究团队探明秃鹫基因信息

  据韩国未来创造科学部消息,由国立中央科学馆、韩国生命工学研究院国家生命研究资源信息中心等研究机构共同承担的“秃鹫基因信息分析”项目取得成功,研究解开了为什么秃鹫嗜食腐肉却不得病的原因。   目前,秃鹫被列为全球性濒危动物。此次,韩国研究团队是通过对两只活秃鹫的血液进行DNA和RNA序列生成,分

谁出卖了我的“基因信息”?

  2015年,美国知名影星安吉丽娜·朱莉切除了乳腺,因其两年前做基因检测时查出携带一个“缺陷”基因,这会使其患癌风险大增。一夜间,基因检测技术广为人知。在我国,随着基因大健康时代到来,从癌症、慢性病到孩子天赋等基因检测项目也是异军突起。  基因检测项目的神秘性使其拥有了众多拥趸,济南市民王女士也不

关于基因治疗的信息介绍

  遗传病的基因治疗(Gene Therapy)是指应用基因工程技术将正常基因引入患者细胞内,以纠正缺陷基因而根治疾病。纠正的途径既可以是原位修复有缺陷的基因,也可以是用有功能的正常基因转入细胞基因组的某一部位,以替代缺陷基因来发挥作用。基因是携带生物遗传 信息的基本功能单位,是位于染色体上的一段特

割裂基因的基本信息介绍

  真核生物的基因组十分复杂,DNA的含量也比原核生物的大得多。噬菌体由于基因组很小,但又要编码一些必不可少的蛋白,碱基显然不够用,这样不仅几乎所有的碱基都参加编码,而且在进化中还出现了“重叠基因”,以有限的基因编码更多的遗传信息。真核基因组正好相反,DNA十分富余,这样不仅无需“重叠基因”,而且很

myc基因的基本信息介绍

  myc基因首次在Burkitt淋巴瘤中发现,可通过染色体易位而活化,最常见的是通过8号染色体与14号染色体间易位,使得8号染色体上的myc基因或其相邻区域与14号染色体的免疫球蛋白重链融合而被活化。myc基因还可以通过染色体2:8或8:22间易位与免疫球蛋白轻链序列融合而被活化。尽管不同肿瘤中影

《生物制药基因学》:吸烟可“开关”基因

刊登在最新一期《生物制药基因学》杂志上的一份研究报告显示,吸烟者身体健康会因吸烟受到“永久性损害”。路透社9月30日援引这份研究报告说,吸烟可“开启”一些有害基因或“关闭”一些有益基因,且戒烟后这些基因的不正常状态数年内不能得到修复。这解释了戒烟者肺癌发病率仍居高不下的原因。 加拿大不列颠哥伦比亚癌

国家生物信息中心合作发布面向流感病毒的基因组语言模型

近日,国家生物信息中心正式发布了面向流感病毒的基因组语言模型Influ-BERT。该模型基于Transformer架构,针对流感病毒基因组特征进行了深度优化,为流感病毒亚型鉴定、致病性预测等应用提供了一种高效、智能的计算解决方案。甲型流感病毒具有宿主范围广、抗原变异频繁等特点,对全球公共卫生构成持续

组学期刊三巨头:《基因组、蛋白质组与生物信息学报》

近年来GPB的中国风封面 冯丽妃摄  从编委到现任执行副主编,美国费城儿童医院和宾夕法尼亚大学教授邢毅与《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics,以下简称GPB)期刊结缘已近10年。前些年,该刊编辑部不时找他约稿子,以解“缺米之炊”

关于生物技术疫苗—生物疫苗的基本信息介绍

  自2004年美国麻省理工教授罗伯特兰格发明超声透药技术(2004年8月美国著名科技杂志《popular science》评价其为“世纪最具创新意义的科研成果”;同年获得科技杰出贡献最高奖‘海因兹大奖’)以来,美国、德国、日本、英国、中国等12个肝病诊疗技术较为发达的国家,先后投入了大量的人力物力

生物芯片技术应用与生物信息学研究

人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的

基因导入的生物学法

  主要通过构建病毒载体来完成。  1 逆转录病毒(retrovirus,Rv)  构建简单,装载外源基因容量最大达8kb,整合入宿主细胞基因组而无病毒蛋白表达。但仅能感染分裂期细胞,体外制备滴度较低,且其随机整合有引起“插入性突变”的可能。  2 腺病毒(adenovirus,Adv)  为近年肝

生物芯片用于基因诊断

从正常人的基因组中分离出DNA与DNA芯片杂交就可以得出标准图谱。从病人的基因组中分离出DNA与DNA芯片杂交就可以得出病变图谱。通过比较、分析这两种图谱,就可以得出病变的DNA信息。这种基因芯片诊断技术以其快速、高效、敏感、经济、平行化、自动化等特点,将成为一项现代化诊断新技术。例如Affymet

生物芯片与基因发现

    最新一期《Science》发表K.K.Jain的文章Biochips for Gene Spotting,全文如下:发表生物芯片是目前生物技术中主要的技术之一。研究人员从计算机技术中借用了微型化、整合、平行化处理的技术来发展在芯片上的实验室装置和处理过程。一般地,在芯片上的靶标是有序排列

生物芯片用于基因测序

基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列,这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列,准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异,

如何去除核糖体rna-生物信息

则箭表示遗传信息传递流RNARNA指通RNA复制遗传信息由RNA传递RNARNA病毒才种传递式

信息素生物合成激活肽的定义

中文名称信息素生物合成激活肽英文名称pheromone biosynthesis activating neuropeptide;PBAN定  义由脑和食道下神经节分泌的神经肽,由33个氨基酸组成,控制信息素的生物合成与分泌。应用学科生态学(一级学科),化学生态学(二级学科)

致病性生物的基本信息

中文名称致病性生物英文名称pathogenic organism定  义能引起人类感染性疾病的微生物和寄生虫。应用学科免疫学(一级学科),免疫病理、临床免疫(二级学科),感染免疫(三级学科)

关于生物病毒的基本信息介绍

  病毒(Biological virus)是一种个体微小,结构简单,只含一种核酸(DNA或RNA),必须在活细胞内寄生并以复制方式增殖的非细胞型生物。  病毒是一种非细胞生命形态,它由一个核酸长链和蛋白质外壳构成,病毒没有自己的代谢机构,没有酶系统。因此病毒离开了宿主细胞,就成了没有任何生命活动、

-距离中国生物信息中心还有多远

  10月1日,由于美国民主、共和两党尚未解决新财年的政府预算分歧,联邦政府的非核心部门被迫关门。其中就包括医学、药学及生命科学从业者及研究者依赖度甚高的NCBI(美国国立生物技术信息中心)网站。   NCBI 是由美国参议员Claude Pepper于上世纪80年代后期发起成立。旨在发展新的

生物信息学新进展

计算机技术和人类基因组计划的发展,应运而生了一门新兴的学科——生物信息学,该学科包含了两个交叉领域的工作:用于建立现代生物学所需信息系统框架(支持生物学的信息管理系统、分析工具和通讯网络)的研究开发工作,即传统意义上的生物信息学(bioinformatics);旨在理解基本生物学问题的基于计算的研究

生物信息学技术的原理

生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析,也是蛋白质组研究的重要内容。生物信息学是蛋白质组学研究中不可缺少的一部分。生物信息学的发展,已不仅是单纯的对基因组、蛋白质组数据的分析,而且可以对已知的或新的基因产物进行全面分析。在蛋白质组数据库中储存

关于生物活性肽的基本信息

  现代营养学研究发现:人类摄食蛋白质经消化道的酶作用后,大多是以低肽形式消化吸收的,以游离氨基酸形式吸收的 比例很小。进一步的试验又揭示了肽比游离氨基酸消化更快、吸收更多,表明肽的生物效价和营养价值比游离氨基酸更高。这也正是活性肽的无穷魅力所在。  生物活性肽(Bioact ive Peptide

关于生物监测的基本信息介绍

  1、生物监测利用生物个体、种群或群落对环境污染或变化所产生的反应阐明环境污染状况,从生物学角度为环境质量的监测和评价提供依据。  2、生物监测对环境素质的优劣更具有直接和指示作用。但由于生物监测的监测对象(生态系统)的复杂性,使生物监测的操作面临许多问题。其灵敏性、快速性和精确性等都需进一步提高

关于生物蛋白的基本信息介绍

  生物蛋白,也称生物活性蛋白,活性蛋白肽,是蛋白质中25个天然氨基酸以不同组成和排列方式构成的从二肽到复杂的线性、环形结构的不同肽类的总称,是源于蛋白质的多功能化合物。活性肽具有多种人体代谢和生理调节功能,易消化吸收,有促进免疫、激素调节、抗菌、抗病毒、降血压、降血脂等作用,食用安全性极高,是当前