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成都生物所开发新型生物信息学软件

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm 近年来,随着测序技术的快速发展,动物(尤其是非模式动物)全基因组数据(WGS)获取变得简单、便宜,这使得数据库中全基因组数据量呈指数态势增长。全基因组测序数据往往同时包含线粒体序列和核基因序列,通过生物信息学的方法从中提取并组装完整的线粒体基因组,是非常好的技术手段。虽然已有部分学者开发了一些生物信息学软件用以实现此目的,但是,其大都具有自身的局限性,包括需要人工提供参考序列(“种子”)、数据兼容性差、准确率低等难点,未能高效、准确、便捷地完成相关任务。为克服这一难点,提升研究人员的工作效率,近日,中国科学院成都生物研究所(以下简称成都生物所)李家堂课题组开发了一种不依赖“种子&am......阅读全文

成都生物所开发新型生物信息学软件

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm       近年来,随着测序技术的快速发展,动物(尤其是非模式动物)全基因组数据(WGS)获取变得简单、便宜,这使得数据库中全基因组数据量呈指数态势增长。全基因组测序数据往往同时包含

成都生物所成功开发用于非目标型筛查的软件平台

  食品安全是社会公共安全的重要环节,近年来,食品安全事件中出现的危害物种类逐年增加,从三聚氰胺毒奶粉和苏丹红事件,到各种添加剂的使用、农药残留、瘦肉精滥用、转基因作物的种植与安全、塑化剂和地沟油事件,无论深度和广度,涉及的危害物已不拘泥于食品添加剂和农兽药残留物质。   食品危害物种类繁多,如何

常用生物软件介绍

一、Microarray软件1. Array Designer 4.25 Build 42501,为微阵列批量设计cDNA引物和寡核苷酸引物的工具,适用于Windows和Linux系统。斯坦福编写的软件系列:2. ScanAlyze,Microarray图像分析软件,从单一或双色荧光杂交产生的荧光图

成都生物所发明利用生物质发酵

  -光合藕联产氢的方法        3月5日,从中科院成都生物研究所科技处获悉,该所科研人员发明出一种生物质发酵-光合藕联产氢方法,并获国家知识产权局发明专利授权。   该方法具体为:在同一反应器中,利用红薯、薯蓣等生物质发酵-光合藕联产氢,该过程先后经过生物质热处理、接种发酵细

常用生物软件(windows)全面介绍

常用生物软件(windows)全面介绍一、基因芯片1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 7.0 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件,不仅可以进行图像分析,还可以进行数据处理,方便protocol的管理功能强大,商业版正式版:6900美元。 Arraypro 4.0 Media Cyb

世界生物材料大会在成都举行

  有世界生物材料领域“奥运会”之称的第九次世界生物材料大会今天(6月1日)在成都举行,这是该大会创办32年来首度在中国举办。在5天的会期中,来自57个国家和地区的3000多名专家学者将以“新型生物材料及其与再生医学交叉的前沿”为主题,进行广泛深入的交流研讨,推动生物材料的研究和应用。   第九次

成都生物所发现生物启发的烷基转移反应

  仿生合成即指在分子水平上模拟生物的功能,将生物的功能原理用于化学合成,借以改善现有的和创造崭新的化学原理和工艺的科学。仿生合成以其反应条件的温和化、无污染、立体专一性强、快速催化、副产物少、产率高、能耗低等突出特点和优势成为绿色化学的重要体现。仿生合成的核心内容是酶的利用和化学模拟。NAD(P)

成都生物所发明出公厕除臭生物制剂

        中国科学院成都生物研究所“一种用于公厕除臭的复合生物制剂、制备方法及其应用”获国家知识产权局发明专利(专利号:ZL 201210190627.9)。  随着我国经济的快速发展,人口流动日益频繁,尤其是旅游业的快速发展,城市公厕和景区公厕数量不断增多,已成为体现城市和景区管理水平和文明

Agilent扩展生物学分析软件

新增遗传关联和拷贝数变异分析功能   2009年12月22日,北京 —安 捷 伦科技公司(纽约证券交易所:A)发布了其广受欢迎的可用于微阵列数据可视化分析的最新一代桌面软件产品--GeneSpring GX 11,以及其企业版本-- GeneSpring Workgroup 11。   Gene

成都生物所微生物除臭菌剂获专利

  中科院成都生物研究所开发的一种畜禽粪污微生物除臭菌剂近日获国家知识产权局发明专利。   目前,针对畜禽粪便恶臭脱除研究可分为化学除臭和生物除臭两大方面,化学除臭应用范围小且易引起二次污染。生物除臭能持久消除恶臭,无二次污染,使用方便,成本低廉,成为恶臭控制的研究热点。成都生物所研究人员针对畜禽