青岛能源所单细胞功能分选技术取得新进展
现有基于荧光染色的活体单细胞分选技术(Fluorescence-Activated Cell Sorting; FACS)一般需要外加荧光标记，在单位时间只能获得个别分子所代表的表型，且通常难以直接进行“原位”观测。而基于拉曼显微光谱技术的单细胞分选方法无需外加标记，可无损获得整个单细胞的化学物质指纹图谱，从而迅速识别活体单细胞的种系发生、生理特性和代谢产物变化等，因此对于难培养微生物的功能鉴定和资源开发具有重要意义。 近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心功能基因组团队助理研究员王允、籍月彤等通过优化光路、提高激光强度等方式显著提高了单细胞拉曼光谱的采集速度，首次将微生物细胞拉曼图谱获取时间降低到毫秒级，为高通量单细胞拉曼分选奠定了基础。同时，结合激光诱导向前转移(LIFT)原理，发明了拉曼激活细胞弹射(Raman-activated Cell Ejection;RACE)技术，可用于将特......阅读全文
单细胞全基因组扩增技术大比武
2013年，权威技术期刊《Nature Methods》将年度技术授予了单细胞测序。正如社论中所说，每个细胞都是独一无二的--它占据了独特的空间位置，它的复制基因组中携带了独特的错误。然而，过去以细胞群体为对象的研究只获得了平均值，而忽略了异质性。目前多种新型分析技术，如NGS，都是为细胞群
单细胞拉曼光谱发力－土壤解磷微生物获进展
磷作为促进植物生长的三大元素之一，对植物的根、花、果实都有益处，它能使树木生长良好发育，同时还能提高植物抗寒、抗旱的能力。合理施用磷肥，可增加作物产量，改善作物品质，因此磷是农作物养殖中要重点添加的养分。但是随着磷肥的大量施用，土壤中积累了很多固定态磷，大大降低了磷素的生物有效性。这不仅造成了磷肥的
开发出非标记液滴单细胞微生物生长表型筛选技术
微生物生长表型筛选是工业育种、酶定向进化和合成生物学等领域面临的限速步骤。精准的单细胞精度生长表型测量是突破上述瓶颈的关键。近日，中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心开发了低成本、非标记的微型液滴微流控平台。该平台可通过单细胞微液滴培养、液滴自荧光检测、目标微液滴自动分选等步骤完成单细胞
微生物所开发新型微滴反应筛选技术及单细胞分析应用
微生物所微生物资源前期开发国家重点实验室杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的微流控界面纳升注射技术（Interfacial Nanoinjection, INJ），该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。针对这一技术创新，团队申请了多项中国发明专利和美国
谢晓亮：单细胞全基因组测序曙光初现
谢晓亮 12月21日出版的美国《科学》杂志发表了题为《单细胞全基因组测序探索精子重组规律和遗传缺陷》的论文。同时，该期《科学》杂志也将单细胞全基因测序列为2013年六大值得关注的科学领域之一。 该论文由美国科学院院士、哈佛大学教授谢晓亮课题组与北京大学生物动态光学成像中心（
单细胞基因组，一个新时代的到来
单细胞基因组旨在通过组学方法研究单个细胞。近年来随着技术的发展，这一年轻的领域正在迅速成熟起来。单细胞基因组研究的前身可以追溯到用芯片检测单细胞的基因表达。不过，新一代DNA测序才是单细胞基因组学的大功臣，这些技术的出现让单细胞基因组研究最终一飞冲天。 2012年7月，Nature Biote
首次揭示单细胞水平大豆根瘤基因表达的动态特征
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/5/500742.shtm近日，中国农业科学院作物科学研究所大豆优异基因资源发掘与创新利用创新团队与国内高校合作，首次在单细胞水平解析了大豆根瘤成熟过程中基因表达的动态变化，并在未成熟的根瘤侵染细胞中成功鉴定到
单细胞基因组，一个新时代的到来
单细胞基因组旨在通过组学方法研究单个细胞。近年来随着技术的发展，这一年轻的领域正在迅速成熟起来。单细胞基因组研究的前身可以追溯到用芯片检测单细胞的基因表达。不过，新一代DNA测序才是单细胞基因组学的大功臣，这些技术的出现让单细胞基因组研究最终一飞冲天。 2012年7月，Nature Biote
单细胞基因组测序：从实验到分析，步步解析
随着生命科学研究的微观化，基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域（如肿瘤异质性、早期胚胎发育等）。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序，解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题，为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。【应用概览】从20
Namocell单细胞分离仪应用——单细胞测序
2018年11月，Namocell与CZ-Biohub（Chan Zuckerburg Biohub）合作，在单细胞测序领域做出了新的尝试。CZ-Biohub利用Namocell单细胞分离仪分选出目的B细胞，并且将其进行单细胞测序，为抗体新药的发现迈出了重要一步。单细胞RNA测序（scRNA-s
开发新型微滴反应筛选技术并开展单细胞分析应用
中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的微流控界面纳升注射技术（Interfacial Nanoinjection, INJ），该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。针对这一技术创新，团队申请了多项中国
新型微流控界面纳升注射技术还可以这么拓展应用？
中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的微流控界面纳升注射技术（Interfacial Nanoinjection, INJ），该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。针对这一技术创新，团队申请了多项中国
拉曼光谱结合人工智能无损表征微生物研究取得进展
近日，中科院微生物研究团队在微生物表征研究上取得进展，在线发表两项研究成果，利用拉曼光谱结合人工智能技术实现了微生物单细胞水平的快速准确鉴定并证明了使用拉曼光谱表征基因转录的可行性。 拉曼光谱作为化学分子的“指纹图谱”，可以对生物样品在溶液中进行无损、非标记、非接触的原位检测分析。在微生物研究
微生物基因有助昆虫生存繁衍
数亿年前，微生物和植物可能通过水平基因转移将基因传递给了昆虫，从而给昆虫带来了进化优势。浙江大学与美国范德堡大学科学家合作发现，蝴蝶、飞蛾等218种昆虫的1400多个基因来自细菌、病毒、真菌和植物。这项研究认为，这些基因可能对昆虫的进化至关重要，使它们在交配、营养、生长和适应环境变化等方面发展出有益
单细胞测序技术应用和发展现状研究
一背景概况单细胞测序技术是指能够在单个细胞的水平上，对基因组或转录组进行高通量测序分析的一项新技术。与传统高通量测序相比，单细胞测序不仅能够分析相同表型细胞的异质性，还能获取难以培养微生物的遗传信息以及珍贵的临床样本的信息，具有广阔的应用前景。细胞是生命的单位，目前大部分的基因检测均是从组织中抽提D
华大基因完成肠道微生物基因组关联分析
从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征，这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日，国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期
CloneSelect 单细胞分离系统 OR 传统单细胞克隆方法
CloneSelect™ Single-Cell Printer™ f.sight™ （ f.sight ）被开发用于满足这些需求， 它可以柔和地接种单个细胞至微孔，同时记录整个细胞接种过程，提供单克隆性的图像证据以及优异的接种后细胞生长用于细胞株开发在这个研究中，我们开展了六组实验，用无血清培养基
单细胞测序新突破:－北大绘制出人类胚胎基因调控图谱
北京大学第三医院的汤富酬研究员等采用先进的单细胞RNA测序技术，绘制出人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组图谱，有望在干细胞领域改善人类辅助生殖技术，以及预测潜在遗传病产生的健康影响。研究成果发表在8月11日《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular
单细胞RNAseq发现调节干细胞发育的新基因
最近，Wellcome Genome Campus的一项新研究演示了单细胞基因组学的力量，揭示了它如何能帮助科学家了解细胞的早期发育。这项研究发现了参与干细胞调控网络的新基因，以及新 的细胞亚群，可让我们深入了解干细胞多能性——成为几乎所有不同类型细胞的能力。研究人员还为干细胞群落开发了新的资源
单细胞基因测序技术ZL布局中的“中国力量”
高通量单细胞基因测序技术是一项在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的新技术。有关研究显示，该技术对于筛选新冠病毒特异性中和抗体具有独特优势。中和抗体是指当病原微生物侵入机体时，由B淋巴细胞产生的某些抗体；该抗体能够阻止病原微生物侵入细胞。 3月20日，来自北京知识产权运营管理有限公司（以下简称
Nature论述：单细胞基因组学揭开“免疫新世界”
人类对生命的好奇，从来没有减退。一个多世纪以来，科学家们一直试图解析构成我们机体的成千上万亿个细胞，从一米长的神经元到8微米宽的红细胞。他们希望从中找到解析重要生理、病理过程，挖掘重要的细胞类型和信号通路。 但是，过去几十年，包括荧光抗体标记技术、DNA和RNA测序技术等在内的研究工具却不能解
单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转
一种单细胞藻类细胞中有7个基因组
一种50多年前收集并在实验室中生长的单细胞藻类，原来是一个由曾经独立的生物组成的奇怪的集合体，里面有不少于7个不同的基因组。4月27日，相关成果发表于《当代生物学》。“据我所知，单个细胞中有7个不同的基因组是创纪录的。” 在加拿大不列颠哥伦比亚大学进行这项研究的Emma George说。这种藻类被称
单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转
单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转
单细胞基因组学：通往个体化医疗之门
随着第二代测序技术的普及，单细胞测序迎来了迅猛发展。 近日，南方科技大学生物学系副教授贺建奎在美国冷泉港参加了单细胞分析会议后，在科学网博客里写道：“这是一个非常令人激动的前沿学术会议，我深深地体会到了单细胞基因组学时代的来临。” 他对《中国科学报》表示：“单细胞基因测序技术的突破，只是开了
新型CUT＆RUN技术实现单细胞全基因组定位
在一项新的突破性研究中，来自美国匹兹堡大学和马萨诸塞大学医学院的研究人员对一种称为CUT&RUN（cleavage under targets and release using nuclease）的方法进行改进，使得在使用少量细胞（包括单细胞和单个植入前胚胎）的情形下，它适合用来研究转录因子和
单细胞测序的重要性及应用方向（一）
单细胞测序研究一直是当今的热门话题，想知道单细胞技术有哪些重要的应用？想深入了解当今主流的单细胞测序技术吗？华大智造《单细胞测序技术讲堂》开讲啦！跟着小造一起寻找这些问题的答案。单细胞测序的重要性随着第二代测序(next generation sequencing，NGS) 技术和第三代测序(
新型微生物群体单细胞分辨率高通量空间转录组分析技术
近日，美国加州理工学院研究团队开发了一种新的高通量空间转录组成像方法——并行连续荧光原位杂交par-seqFISH（parallel sequential fluorescence in situ hybridization）技术，能够在单细胞水平鉴定和观察微生物基因表达谱和微尺度环境中的空间信
单细胞拉曼结合重水标记技术实现土壤解磷微生物筛选
磷是一种至关重要但不可再生的资源。磷肥是作物生长必须三大营养元素（氮、磷、钾）之一，但磷矿是有限资源，据估计，以目前的磷矿储备，大概还能继续开采100年，因此，磷又被称为“正在消失的元素”。随着长期大量的磷肥施用，土壤中积累了大量固定态磷，大大降低了磷素的生物有效性，加剧了磷资源短缺的问题，对土