开发新型微滴反应筛选技术并开展单细胞分析应用

中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的微流控界面纳升注射技术(Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。针对这一技术创新,团队申请了多项中国发明ZL和美国ZL,并研制了基于INJ技术的小型桌面系统。该系统和国外同类产品如美国Labcyte公司的Echo超声纳升移液系统以及美国TTP Labtech公司的mosquito HTS微量筛选系统相比,在仪器成本、耗材成本、最小液滴体积、流式细胞仪兼容性、操作的灵活性以及污染控制等方面,均具有显著优势,适用于各类单细胞微体积反应分析,也可应用于其他微体积反应分析,在微生物培养筛选、合成生物学、药物筛选、蛋白结晶条件筛选等方面均具有应用潜力。 在性能方面,INJ系统通过高精密度的微体积控制实现不同试剂组分的纳升体积分步添加,兼容9......阅读全文

单细胞分选效率的分析

引言在单克隆细胞培养时,手动有限稀释法是最经典的分离单细胞手段之一。这种方式分离单细胞,每个孔中落进去的细胞数目符合泊松分布。依靠单细胞分选仪器分离单细胞的效率,无论从分选能力还是重复性都要明显优于手动的有限稀释方法。测定一款设备分选效率的标准方法,是用荧光校准微球来分选检验。实验方法Namocel

新型单细胞活性分析技术

  近日,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究论文中,来自加利福尼亚大学的研究人员通过运用一种分析单一细胞基因活性的先进技术,鉴别出了人类大脑脑细胞的特性,该研究揭示,如今进行大规模的细胞调查分析比过去我们所认为的要更加高效,而且廉价。  研究者Arnold

单细胞分析重大突破

生物学家对单个细胞的行为而不是对整个细胞群体的行为越来越感兴趣。在一项新的研究中,来自瑞士联邦理工学院(ETH)的研究人员开发出一种新方法可能引发单细胞分析变革。这一技术利用世界上zui小的注射器来对单个细胞的内含物进行取样以便进行分子分析。相关研究结果发表在2016年7月14日那期Cell期刊上,

单细胞分离技术应用于众多领域的单细胞分析

  单细胞分离目前主要有三种选择:手动分离、荧光激活细胞分选和微流体技术。当然,除了成熟的方法,巧妙的新方法也在不断涌现,能以更高的准确性和特异性来分离单细胞。  将细胞分散到悬液中,会失去它们在组织里的位置信息。如果想了解单细胞所处的环境,就需要用到激光捕获显微切割技术,这种技术通过扫描组织切片来

结肠癌亚型单细胞分析

  一项由新加坡(通讯作者Shyam Prabhakar和Iain Beehuat Tan)、印度、美国(通讯作者Paul Robson)三国共同开展的计算基因组学项目,鉴定了11种结肠癌肿瘤和附近临近的非癌细胞的细胞组成。为更有针对性的结肠癌诊断和治疗开启了一扇门。  来自杰克逊实验室的科学家,本

单细胞分析技术的应用前景

单细胞分析技术具有广阔而令人振奋的应用前景,主要体现在以下几个重要方面:癌症研究与治疗:肿瘤异质性分析:能够揭示肿瘤内部不同细胞的基因表达、突变和细胞周期状态等的差异,帮助理解肿瘤的发生、发展、转移机制以及耐药性的产生。精准治疗:指导个性化的癌症治疗方案,例如确定对特定药物敏感的肿瘤细胞亚群,从而提

单细胞分析技术的应用前景

单细胞分析技术具有广阔而令人振奋的应用前景:在医学领域:疾病的早期诊断:能够在疾病症状出现之前检测到细胞层面的细微变化,实现超早期诊断。例如,在癌症的萌芽阶段,识别出具有恶变倾向的单个细胞,大幅提高患者的生存率。精准医疗:根据患者肿瘤细胞的单细胞特征,为其定制个性化的治疗方案,包括选择最有效的药物和

单细胞转录组高级分析之细胞谱系分析

基于单细胞转录组数据的细胞轨迹分析常见形式有细胞变化轨迹分析和细胞谱系分析,在上一篇中,我们详细介绍了常规拟时间序列分析的相关内容(具体内容查看链接)。在这里,我们主要就细胞谱系分析进行介绍和解读。细胞谱系分析,最简明的理解就是细胞领域的进化树,通常指的是某类祖源细胞,在特定条件下,有多个发育轨迹和

单细胞RNA性能分析新方法

  人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教

单细胞RNA性能分析新方法

  人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教

Science:单细胞分析?并行测序技术可以

  近日,一项发表于国际杂志Science上的研究论文中,来自美国的研究者描述了一种新型的大规模并行技术,通过利用新一代测序技术来在单细胞水平上实现对基因表达的监测;研究者表示,单细胞分析对于理解人类造血系统的必要性及重要性不断凸显,如果没有这种分析的话,来自少许细胞的大量表达改变就和来自许多细胞的

单细胞分析技术的应用前景分享

单细胞分析技术具有广阔而令人期待的应用前景:在医学领域:疾病的早期诊断:能够更灵敏地检测到疾病早期阶段细胞层面的细微变化,比如在癌症早期,识别出少量的肿瘤细胞或癌前病变细胞。精准医疗:根据患者肿瘤细胞的单细胞特征,制定个性化的治疗方案,提高治疗效果和减少副作用。例如,针对特定肿瘤细胞的基因突变或蛋白

单细胞分析揭示癌症异质性

  2013年度基因组生物学大会(The Biology Of Genomes 2013)于5月7日晚在美国纽约冷泉港实验室召开。这是基因组学领域最大的会议之一,吸引了多个著名研究所的大牛参加。会议主题包括高通量基因组学和遗传学、复杂性状的遗传学、功能和癌症基因组学、计算基因组学、进化基因组学以

单细胞分析之全攻略(上)

均值虽然有用,但无法准确反映单个细胞的表型,它们有时差异甚大。而这些表达上的差异也许包含了重要的信息,有助于我们了解癌症、确定治疗是否有效、鉴定免疫反应等。近两年,单细胞分析发展迅速,文章数以每年40%的速度增长。单细胞方法让微生物学家能够着手研究无法培养且数量有限的微生物,同时也让干细胞研究人员能

-GEN报告重磅解析单细胞分析技术

  本期GEN Market & Tech Analysis报告的重点是单细胞分析(Single Cell Analysis ,SCA)市场。  SCA的应用涉及多个的领域,包括癌症、神经科学等。目前,SCA主要应用于生命科学的研究领域,但报告认为,在未来的5-7年,SCA将对诊

单细胞分析色谱仪分类方法

单细胞分析色谱仪种类有多种。1、按流动相物理状态可分:气相单细胞分析色谱仪和液相单细胞分析色谱仪。2、按洗脱方式可分:等度洗脱单细胞分析色谱仪和梯度洗脱单细胞分析色谱仪。3、按产地可分:国产单细胞分析色谱仪和进口单细胞分析色谱仪。4、按分离规模可分:微型单细胞分析色谱仪、小型单细胞分析色谱仪和大型单

单细胞分析之全攻略步骤

分离单个细胞在您研究单个细胞之前,您需要将它可靠地分离。显微抽取、流式细胞术(FACS)、激光捕获显微切割(LCM)都可用来收集单个细胞。每种方法都各有利弊。FACS将细胞分选到PCR板上,与RT-qPCR仪器兼容。此外,FACS可利用特定的细胞标志物实现细胞富集。FACS的通量也比LCM高得多,但

单细胞分析技术的几种方法

单细胞分离技术:流式细胞分选术(Flow Cytometry Sorting):通过细胞表面标志物的特异性抗体标记细胞,利用流体力学和激光技术,对细胞进行快速、准确的分离和分选。激光捕获显微切割技术(Laser Capture Microdissection,LCM):利用激光束从组织切片中精确地切

单细胞分析技术的成本高吗?

单细胞分析技术的成本相对较高,但随着技术的进步和普及,成本在逐渐降低。在早期,单细胞分析技术所需的仪器设备、试剂耗材以及专业的数据分析等都需要大量的资金投入。例如,单细胞 RNA 测序需要专门的微流控设备、高质量的反转录试剂和测序平台,这些都使得单个样本的分析成本较高。然而,随着技术的不断发展和市场

单细胞分析技术的应用领域

肿瘤研究:有助于鉴别癌前侵袭、分析原发性肿瘤的克隆进化、研究肿瘤内异质性、解析肿瘤微环境的重编程、探索肿瘤转移机制和治疗抵抗(耐药性)等。与常规的 RNA 测序分析相比,其优势在于更容易找出在治疗和预后条件下有差异表达基因的细胞,同时可以重建分化谱系和差异表达亚型,推断描述克隆亚结构、克隆谱系、重建

单细胞分析技术的发展趋势

更高的分辨率和灵敏度:不断改进技术以实现对单个细胞内更微量的生物分子(如核酸、蛋白质、代谢物等)进行更精确的检测和定量分析。例如,新一代的测序技术能够检测到更低丰度的 RNA 分子,从而更全面地揭示细胞的转录组信息。多组学整合分析:不再局限于单一类型生物分子的分析,而是将基因组学、转录组学、蛋白质组

低成本单细胞分析新型“移动”设备

  近年来人们发现研究单细胞如何影响疾病和治疗反应的潜力越来越大,但是由于缺乏富于成本效益和便于操作的仪器,现阶段单细胞分析的应用发展尚比较受限。  新年伊始,纽约基因组研究中心和纽约大学2月23日在《Nature Communications》发表文章,向我们介绍了一款3D打印便携式低成本微流控单

单细胞分析技术的发展历程如下:

单细胞分析技术的发展历程如下: -早期阶段:在单细胞分析技术出现之前,人们只能通过显微成像或者流式细胞技术进行细胞水平的研究。显微镜观测或者HE染色、免疫组化、免疫荧光等技术可观察的细胞数量有限。流式细胞术可以高速分析上万个细胞,并同时从一个细胞中测得多个参数,但参数类型和数量都比较局限。 - 单细

单细胞分析促进了分析流程的开发和使用

 单细胞分析涵盖了数据导入、存储单细胞实验数据的通用数据结构和用于将原始单细胞数据转换为适合下游分析、交互式数据可视化和下游分析的快速而强大的方法。  基本数据的低维形式和描述细胞或特征属性的元数据也可以存储,数据和结果存储在单个实例中,通过单细胞数据和结果的标准化存储,促进了程序包之间的交互性,并

单细胞测序基准数据集对单细胞分析方法的发展有哪些影响?

单细胞测序基准数据集对单细胞分析方法的发展具有多方面的重要影响:促进方法的比较和评估为不同的单细胞分析方法提供了共同的测试平台,使得研究人员能够客观地比较各种方法的性能,从而筛选出更优的方法。推动方法的改进和优化当新的分析方法在基准数据集上表现不佳时,能够促使开发者反思和改进算法,以提高准确性和可靠

单细胞代谢组分析有了新技术

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518065.shtm

ICPMS-单细胞纳米多元素分析

  不同元素在细胞中的作用,是目前细胞生物学中前沿的研究领域之一。在相关的研究当中,如果能在一次分析中得到单个细胞中的多个元素的信息,将会在提高实验效率的同时,也为研究人员提供更多的研究空间。本期向您介绍高灵敏度、多元素的单细胞分析方案,为帮助您检测单个细胞中的阿克 (ag, 1.0 × 10-

单细胞生信分析,新的高分热点

    关于单细胞测序(Single cell sequencing,ScRNA-seq),相信大家或多或少都听过,粗略的说,这几点是出现频率比较高的关键词:“很火”、“高端,是发大文章的利器”、“价格贵”。不过,大家如果留意最近单细胞测序相关的文章进展,就会发现这样的一个问题:现在只做单细胞测序,

单细胞分析技术的主要挑战有哪些?

单细胞分析技术面临的主要挑战包括:技术复杂性和可重复性:单细胞实验操作流程复杂,需要高度熟练的技术人员。例如,单细胞的分离、捕获和处理过程中的细微差异都可能影响结果的准确性和可重复性。不同实验室之间采用的技术和设备存在差异,导致结果难以直接比较和验证。数据解读和分析的困难:单细胞分析产生的海量数据需

张新荣教授:单细胞质谱分析

  清华大学化学系 张新荣教授  2014年4月26日,首届全国质谱分析学术研讨会在北京西郊宾馆盛大开幕。来自清华大学化学系的张新荣教授为大家带来题为《单细胞质谱分析》的报告。据张新荣教授介绍,2013年12月Science杂志专门出了一个专刊“Single-