研究揭示基于剪接功能异常的儿童急性髓系白血病耐药新机制

尽管治疗儿童急性髓系白血病的化疗方案不断优化,但仍有约30%的患儿在初始治疗后复发,且这类复发患儿的生存率极低。目前,耐药突变仅能解释部分患者对治疗产生耐药的原因,而大部分患儿产生治疗耐药的分子机制尚不明晰,因此亟需进一步解析儿童急性髓系白血病治疗耐药的潜在机制。近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)等研究团队,对702例儿童急性髓系白血病患者的转录组测序数据进行了深入分析。研究发现,约36%的患儿存在序列依赖的RNA剪接功能异常,这一异常与化疗缓解率明显降低、病人总体生存结局更差相关,这提示其在疾病进展和治疗响应中具有重要作用。此前,有研究显示,儿童急性髓系白血病中观测到的90%剪接缺陷,已在成人急性髓系白血病中被证实具有促癌作用,且这类缺陷由成人急性髓系白血病的剪接因子突变诱导发生,而儿童急性髓系白血病中,剪接因子突变较为罕见。机制研究表明,U2AF2功能失调是驱动儿童急性髓系白血病异常剪接的关键因素。这类异常......阅读全文

酵母剪接体分析实验

前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体,它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成,每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑晓飞。实验方法原理前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋

纯化剪接因子SR蛋白实验

前体 mRNA ( pre-mRNA ) 剪接因子 SR(serine/argininc rich,富含丝/苏氨酸)蛋白家族是将剪接体组装到前体 mRNA 上的重要参与者。SR 蛋白是重要的剪接因子,该家族的不同成员可以在体外或体内指导选择性剪接位点的选择。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编:郑

关于RNA剪接的定义介绍

  RNA剪接是真核细胞基因表达中非常重要的一个生物过程,通过RNA剪接,可以产生许多具有功能的,带有编码信息的mRNA,它对生物的发育及进化至关重要。所以RNA剪接识别是正确理解基因表达过程的重要一步,而剪接的识别的关键是依赖于剪接位点的判定。真核细胞pre-mRNA的剪接位点处存在一定的序列保守

关于基因剪接的基本介绍

  基因剪接是通过一些酶学操作使一条DNA分子与另一条DNA分子相连。即在mRNA成熟期,切除基因的内含子,连接基因的外显子的过程,称为基因剪接。而天然基因的某些片段被合成的DNA链所取代或连成整体的过程称为基因剪辑。一个基因为它的等位基因所替换,而其他基因则保持不变称为基因置换。

酵母剪接体分析实验

            实验方法原理 前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体,它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成,每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。

纯化剪接因子SR蛋白实验

实验方法原理 前体 mRNA ( pre-mRNA ) 剪接因子 SR(serine/argininc rich,富含丝/苏氨酸)蛋白家族是将剪接体组装到前体 mRNA 上的重要参与者。SR 蛋白是重要的剪接因子,该家族的不同成员可以在体外或体内指导选择性剪接位点的选择。实验材料 超纯硫酸铵

纯化剪接因子SR蛋白实验

            实验方法原理 前体 mRNA ( pre-mRNA ) 剪接因子 SR(serine/argininc rich,富含丝/苏氨酸)蛋白家族是将剪接体组装到前体 mRNA 上的重要参与者。SR 蛋白是重要的剪接因子,该家族的不同成员可以

我国揭示硬骨鱼RLRs和NLRs受体信号上基因剪接和免疫功能

  先天免疫是机体抵御病原微生物感染的第一道防线,它主要是通过在进化上高度保守的一系列模式识别受体来识别微生物表面保守的、而又在宿主中不存在的病原相关分子模式来发挥作用。RLRs受体和NLRs受体家族是脊椎动物两类重要的胞内模式识别受体。中国科学院水生生物研究所昌鸣先研究员学科组对硬骨鱼类的这两类模

与白血病相关的CBL基因编码功能描述

这个基因是一个原癌基因,编码一个无名指E3泛素连接酶。编码蛋白是蛋白酶体降解底物所需的酶之一。该蛋白介导泛素从泛素结合酶(E2)转移到特定底物。该蛋白还包含一个N端磷酸酪氨酸结合域,使其与许多酪氨酸磷酸化底物相互作用,并以蛋白酶体降解为靶点。因此,它作为许多信号转导途径的负调节器发挥作用。该基因在包

与白血病相关的CBFB基因编码功能描述

该基因编码的蛋白质是属于pebp2/cbf转录因子家族的异二聚体核心结合转录因子的β亚单位,该转录因子家族主要调控造血(例如runx1)和成骨(例如runx2)特异性基因的宿主。β亚单位是一种非DNA结合调节亚单位;当复合物与各种增强子和启动子(包括小鼠白血病病毒、多瘤病毒增强子、T细胞受体增强子和

与白血病相关的GNAS基因编码功能描述

GNAS作为一个重要的信号转导蛋白,主要功能是在G蛋白偶联受体信号转导途径中,激活腺苷酸环化酶,导致cAMP水平的升高,参与调控细胞生长和细胞分裂。

与白血病相关的KRAS基因编码功能描述

KRAS (Kirsten Rat Sarcoma Viral Oncogene Homolog)基因是GDP/GTP结合蛋白,比较重要的同家族基因还包括HRAS和NRAS。KRAS与GTP结合呈激活状态,与GDP结合呈关闭状态,KRAS可被生长因子或酪氨酸激酶(如EGFR)短暂活化,活化后的KRA

与白血病相关的KRAS基因编码功能描述

KRAS (Kirsten Rat Sarcoma Viral Oncogene Homolog)基因是GDP/GTP结合蛋白,比较重要的同家族基因还包括HRAS和NRAS。KRAS与GTP结合呈激活状态,与GDP结合呈关闭状态,KRAS可被生长因子或酪氨酸激酶(如EGFR)短暂活化,活化后的KRA

与白血病相关的PDGFRA基因编码功能描述

PDGFRA基因编码的蛋白全名为血小板源性生长因子受体α,是一种细胞表面受体酪氨酸激酶,PDGFRA可以与其相应的配体PDGF结合后活化,再激活磷脂酰肌醇、cAMP及多种蛋白质的磷酸化途径,调控细胞的分裂和增殖,当基因激活异常时,则会导致肿瘤的发生并促进肿瘤血管生成,PDGFRA的突变与胃肠道间质瘤

与白血病相关的EGFR基因编码功能描述

EGFR编码的蛋白是一种跨膜糖蛋白,也是表皮生长因子受体家族中的一员,该家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(erbB3)及HER4(erbB4),也属于受体酪氨酸激酶家族。EGFR作为细胞表面蛋白可与配体如表皮生长因子(EGF)结合,EGFR可被激活,

与白血病相关的BTK基因编码功能描述

Bruton的酪氨酸激酶(缩写为Btk或BTK)也称为酪氨酸 - 蛋白激酶BTK,是人类中由BTK基因编码的酶。 BTK是一种在B细胞发育中起关键作用的激酶。 BTK通过高亲和力IgE受体在B细胞成熟以及肥大细胞活化中起关键作用。 Btk含有结合磷脂酰肌醇(3,4,5) - 三磷酸(PIP3)的PH

与白血病相关的BRAF基因编码功能描述

该基因编码蛋白属于raf/mil家族的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,参与调控MAP/ERKs信号通路,在细胞分裂、分化和分泌起重要作用。BRAF基因的突变与各种癌症相关,包括非霍奇金淋巴瘤,结直肠癌,恶性黑色素瘤,甲状腺癌,非小细胞肺癌,肺腺癌。

与白血病相关的DGKH基因编码功能描述

该基因编码二酰甘油激酶(DGK)酶家族的一个成员。这个家族的成员参与调节二酰甘油和磷脂酸的细胞内浓度。这种基因的变异与双相情感障碍有关。另外,还发现了剪接转录变体。This gene encodes a member of the diacylglycerol kinase (DGK) enzyme

与白血病相关的ASNS基因编码功能描述

这个基因编码的蛋白质参与天冬酰胺的合成。这个基因补充了温度敏感型仓鼠突变体TS11的突变,该突变体在非耐受温度下阻止细胞周期G1期的进展。另外,还描述了该基因的剪接转录变体。The protein encoded by this gene is involved in the synthesis o

与白血病相关的CEBPA基因编码功能描述

这个无内含子基因编码一个转录因子,该转录因子包含一个碱性亮氨酸拉链(bzip)结构域,并识别目标基因启动子中的ccaat基序。编码蛋白在具有CCAAT/增强子结合蛋白β和γ的同二聚体和异二聚体中起作用。这种蛋白的活性可以调节参与细胞周期调节和体重平衡的基因表达。该基因突变与急性髓系白血病有关。在非a

与白血病相关的PRKCB基因编码功能描述

蛋白激酶C(PKC)是一个丝氨酸和苏氨酸特异性蛋白激酶家族,可被钙和第二信使二酰甘油激活。pkc家族成员磷酸化多种蛋白质靶点,已知参与多种细胞信号传导途径。PKC家族成员也作为一类肿瘤启动子佛波酯的主要受体。pkc家族的每一个成员都有一个特定的表达谱,并且被认为在细胞中起着独特的作用。该基因编码的蛋

与白血病相关的ATM基因编码功能描述

ATM基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,这种蛋白是一种重要的细胞周期检查点激酶,通过磷酸化调控下游一系列重要蛋白,包括抑癌蛋白p53和BRCA1、检查点激酶CHK2、检查点蛋白RAD17和RAD9以及DNA修复蛋白NBS1。ATM和与其密切相关的蛋白ATR被认为是在细胞周期调控以及DNA损伤

与白血病相关的EPOR基因编码功能描述

该基因编码红细胞生成素受体,红细胞生成素受体是细胞因子受体家族的一员。在促红细胞生成素结合后,该受体激活JAK2酪氨酸激酶,激活不同的细胞内途径,包括:ras/map激酶、磷脂酰肌醇3激酶和stat转录因子。受刺激的促红细胞生成素受体似乎在红细胞存活中起作用。红细胞生成素受体缺陷可导致红白血病和家族

与白血病相关的REL基因编码功能描述

该基因编码一种属于rel同源域/免疫球蛋白样折叠、丛蛋白、转录因子(rhd/ipt)家族的蛋白质。这个家族的成员调节参与细胞凋亡、炎症、免疫反应和致癌过程的基因。这种原癌基因在B淋巴细胞的存活和增殖中起作用。这种基因的突变或扩增与B细胞淋巴瘤,包括霍奇金淋巴瘤有关。该基因的单核苷酸多态性与溃疡性结肠

与白血病相关的mTOR基因编码功能描述

雷帕霉素(mTOR)的哺乳动物靶标,也称为雷帕霉素和FK506结合蛋白12-雷帕霉素相关蛋白1(FRAP1)的机制靶标,是人类中由MTOR基因编码的激酶。 mTOR是蛋白激酶的磷脂酰肌醇3-激酶相关激酶家族的成员。 mTOR与其他蛋白质结合,并作为两种不同蛋白质复合物的核心成分,mTOR复合物1和m

与白血病相关的mYB基因编码功能描述

该基因编码一种具有三个HTH-DNA结合域的蛋白质,作为转录调节器。这种蛋白在造血调节中起着重要作用。该基因可能在白血病和淋巴瘤中异常表达、重排或易位,被认为是癌基因。选择性剪接导致多个转录变体。This gene encodes a protein with three HTH DNA-bindi

与白血病相关的ALK基因编码功能描述

ALK基因编码一种受体酪氨酸激酶(eceptor tyrosine kinase ,RTK),为跨膜蛋白,属于胰岛素受体超家族,在大脑发育与及特定的神经元中起重要作用。最初在间变性大细胞淋巴瘤(anaplastic large cell lymphoma, ALCL)发现ALK-NPM1融合蛋白,目

与白血病相关的NRAS基因编码功能描述

NRAS基因是GDP/GTP结合蛋白,比较重要的同家族基因还包括KRAS和HRAS。NRAS与GTP结合呈激活状态,与GDP结合呈关闭状态,该基因的突变与黑色素瘤密切相关,机制为该基因的突变导致其下游基因的如Raf激酶的异常持续激活。

与白血病相关的LYN基因编码功能描述

酪氨酸蛋白激酶Lyn是人类中由LYN基因编码的蛋白质。 Lyn是Src蛋白酪氨酸激酶家族的成员,该蛋白酪氨酸激酶主要在造血细胞,神经组织肝脏和脂肪组织中表达。在各种造血细胞中,Lyn已成为参与细胞活化调节的关键酶。 在这些细胞中,少量LYN与细胞表面受体蛋白相关,包括B细胞抗原受体(BCR),CD4

与白血病相关的KIT基因编码功能描述

KIT基因编码的蛋白是干细胞因子受体SCFR,也被称为原癌基因c-kit或酪氨酸蛋白激酶kit或CD117,是一种受体酪氨酸激酶,这个基因突变与胃肠道间质瘤,肥大细胞病,急性髓性白血病有关。