大规模基因组CNE鉴定与进化评估新工具被开发
近日，中国科学院成都生物研究所李家堂团队开发了集全基因组比对、保守非编码元件（Conserved Non-coding Elements，CNEs）鉴定和快速进化评估于一体的模块化分析工具CNEwrap，相关成果发表在《核酸研究》。CNEs是一类不编码蛋白质、但在长期进化过程中保持高度保守的DNA序列，在基因表达调控等生物学过程中发挥重要作用。随着基因组测序数据快速积累，如何从大规模、跨物种基因组数据中高效、准确地鉴定CNEs，并解析其进化模式，成为比较基因组学和生物信息学研究面临的重要挑战。该研究创新性地提出了快速进化评估算法EvoAcc，能够精确高效地鉴定指定物种或谱系中CNEs的快速进化信号。研究人员在不同进化情景下对EvoAcc与现有主流快速进化检测算法进行了比较。结果显示，EvoAcc具有较高的预测准确率和精确率，且CPU占用和内存消耗的增长速率均低于其他同类算法。CNEwrap实现了从全基因组比对、CNEs鉴定到快速......阅读全文
大规模基因组CNE鉴定与进化评估新工具被开发
近日，中国科学院成都生物研究所李家堂团队开发了集全基因组比对、保守非编码元件（Conserved Non-coding Elements，CNEs）鉴定和快速进化评估于一体的模块化分析工具CNEwrap，相关成果发表在《核酸研究》。CNEs是一类不编码蛋白质、但在长期进化过程中保持高度保守的DNA序
华南理工、上海交大发现新病毒感染机制
EB病毒（Epstein-Barr virus，EBV）是一种普遍存在的4型疱疹病毒，与许多肿瘤的发生密切相关，包括Burkitt淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、胃癌、鼻咽癌等等。据统计，全球超过90%的成人体内潜伏着这种病毒。 EBV能够感染易感性的B淋巴细胞和非易感的上皮细胞（EC）。目前已知的E
有记载的哪些细胞曾被Hela污染？
lnt-407、HEp-2、WISH（人羊膜细胞）、Acc-M（人原发性延腺癌细胞）、Bcap-37 （人乳腺癌细胞）、HAC-84（人肺腺癌克隆）、Hepatoma（人肝癌细胞）、HUL-42（人肺腺癌细胞）、CNE（人鼻咽癌细胞）、SPC-A-1（人肺腺癌细胞）、Tca-8113（人舌鳞癌细胞）
爱泼斯坦巴尔病毒相关肿瘤的治疗潜在的新靶点
爱泼斯坦-巴尔病毒(Epstein-Barr virus，EBV)是一种大的双链DNA病毒，属于γ疱疹病毒亚科。作为第一个被发现的人类致癌病毒，EBV约占全世界所有癌症病例的1.5%，包括淋巴癌和上皮癌。与EBV感染关系最密切的恶性肿瘤是未分化鼻咽癌(NPC)。 近日，中山大学肿瘤中心的研究者
RNA提取实验方法流程
总RNA（total RNA）和信使RNA(mRNA)的抽提（自己的总结）1、实验目的提取人体细胞的总RNA和mRNA。 2、本实验所需试剂1）、CNE-2细胞及培养细胞的一系列条件，2）、PBS缓冲液， TRIZOL试剂，3）、DEPC处理过的水、大、中、小Tip及1.5 ml EP管,4）、新的
RNA提取实验方法流程
1、实验目的提取人体细胞的总RNA和mRNA。 2、本实验所需试剂 1）、 CNE-2细胞及培养细胞的一系列条件， 2）、PBS缓冲液， TRIZOL试剂， 3）、DEPC处理过的水、大、中、小Tip及1.5 ml EP管, 4）、新的氯仿、异丙醇和乙醇， 5）、mRNA分离
RNA提取实验方法
总RNA（total RNA）和信使RNA(mRNA)的抽提（自己的总结）1、实验目的提取人体细胞的总RNA和mRNA。 2、本实验所需试剂1）、CNE-2细胞及培养细胞的一系列条件，2）、PBS缓冲液， TRIZOL试剂，3）、DEPC处理过的水、大、中、小Tip及1.5 ml EP管,4）、新的
进行细胞鉴定（Cell－Authentication）的根本原由－细胞错误识别被污染的危害及现状
2009年Nature号召建立细胞STR数据库、2010年IJC（Int J Cancer）期刊开始要求作者提供细胞鉴定报告、2011年ATCC的标准发展组织 (Standards Development Organization, SDO) 颁布了ASN-0002标准《Authentication
如何提取mrna
1 细胞总RNA的提取1）、6孔板细胞（CNE-2）汇合度为90-100%时,取出无菌室,去其上清,用PBS洗两次后,每孔加TRIZOL试剂（Gibco公司） 1 ml,摇匀,无菌罩内消化3-5分钟（观察：液体变粘稠,细胞脱壁）.2）、将各孔内消化好的细胞裂解液吸到一DEPC处理过的1.5 ml E
ADVHR（病毒助感染试剂）使用说明书
一、产品概述： 产品名称: ADV-HR（病毒助感染试剂） 产品货号：FH880805 规格：1ml（标准规格）/100ul（赠送规格） 浓度：1mg/ml 二、储存条件： 建议分装后保存于-20℃，一周内使用4℃储存即可。注意避免反复冻融！反复冻融会严重影响实验效果，
ADVHR（病毒助感染试剂）使用说明
一、概述：产品名称: ADV-HR（病毒助感染试剂） 产品货号：FH880805规格：1ml（标准规格）/100ul（赠送规格） 浓度：1mg/ml 二、储存条件：建议分装后保存于-20℃，一周内使用4℃储存即可。注意避免反复冻融！反复冻融会严重影响实验效果，请予一周内使用！三、产品
海马基因组及环境适应进化机制获揭示
记者从中国科学院南海海洋研究所获悉，由该所研究员林强课题组主导，联合德国康斯坦茨大学、新加坡国家科技局和华大基因等共同揭示了海马在海洋近岸和岛礁栖息过程中的体型特化和繁殖适应性进化特征。相关研究12月15日以封面文章的形式发表在《自然》杂志上。 林强团队在国际上率先完成了海马的全基因组研究，揭
科学家发现27T稳态强磁场影响人体细胞有丝分裂纺锤体
近日，中国科学院合肥物质科学研究院强磁场科学中心张欣课题组与陆轻铀课题组以及哈佛医学院Timothy Mitchison合作，利用强磁场科学中心大科学装置四号水冷磁体，首次发现27T强稳态磁场能够显著改变人类细胞有丝分裂纺锤体的排布方向及形态，这也是目前国际上唯一一例20T以上强稳态磁场下的细胞
Hopx甲基化通过激活SNAIL转录而促进鼻咽癌细胞的迁移－二
4、HOPX抑制鼻咽癌细胞的EMT过程在N2-Tert,，NP69 和SH cells敲低HOPX后，细胞形态发生显著变化。SUNE1细胞系中过表达HOPX后，检测发现ECADHERIN显著上调。5、鼻咽癌细胞中HOPX抑制SNAIL转录由于EMT-TFs在EMT过程中起着重要的角色，研究者检测了H
警惕！使用问题细胞致多篇SCI文章在Pubpeer上备受质疑！
小编继续为大家盘点因使用问题细胞而被同行在Pubpeer上“照顾”的SCI文章。以下五篇文章，两篇已经因此被撤稿，另外三篇也岌岌可危。2013年，台湾长庚纪念医院在PLoS One.期刊发表一篇文章。由于使用“鼻咽癌细胞株”Hone1以及其他原因，文章发表7年后（2020年1月份）仍惨遭被撤稿！撤稿
常用细胞的中英文名对照表
一、遗传变异细胞和正常细胞1.小鼠类3T3 胚胎成纤维细胞 L929 成纤维细胞 3T3/e 成纤维细胞 Mo-MuLV/3T3 Mo-MuLV感染的3T3 3T3TK 成纤维细胞 NIH3T3 NIH Swiss小鼠胚细胞 3T6 胚胎成纤维细胞 *PA317 胚胎成纤维细胞 Ana-1 巨噬细胞
清华大学张雅鸥教授：癌症小分子RNA
来自清华大学生科院，深圳研究生院，加拿大多伦多大学的研究人员分析了一种重要的癌症相关小分子RNA：miR-210在细胞周期调控中靶基因，从中发现了一系列的靶基因，并深入分析了miR-210对有丝分裂的影响，指出miR-210能干扰有丝分裂过程，这也许解释了其对肿瘤形成的抑制作用。相关成果公布在N
曾毅：与病毒战斗一辈子
曾毅（1929年— ） 曾毅，广东揭西人。1952年毕业于上海第一医学院。1956~1960年，从事脊髓灰质炎病毒，减毒性疫苗免疫，肠道病毒、麻疹病毒的研究。1960年起从事肿瘤病毒研究。从1973年开始研究EB病毒与鼻咽癌的关系，建立了一系列鼻咽癌的血清学诊断方法，并获得卫生部的试剂生产证。在
肿瘤动物模型建立实验
一、肿瘤动物模型建立的意义： （1）评价抗肿瘤免疫治疗的疗效； （2）作为抗肿瘤药物筛选模型； （3）为肿瘤转移研究提供更好的研究平台； （4）为研发抗肿瘤转移性药物提供良好的实验工具。 二、诱发性肿瘤动物模型 实验方法原理:诱发性肿瘤动物模型是指研究者用化学致癌剂、放射线、致癌病
肿瘤动物模型建立实验
一、肿瘤动物模型建立的意义： （1）评价抗肿瘤免疫治疗的疗效； （2）作为抗肿瘤药物筛选模型； （3）为肿瘤转移研究提供更好的研究平台； （4）为研发抗肿瘤转移性药物提供良好的实验工具。 二、诱发性肿瘤动物模型 实验方法原理:诱发性肿瘤动物模型是指研究者用化