AI设计噬菌体将改变整个行业

核心影响:生成式AI模型Evo 2在无需人工干预的情况下,端到端设计出能杀死大肠杆菌的全新噬菌体基因组,为抗耐药性抗生素开辟了新路径。 问题提出:抗生素的耐药困境 现代抗生素面临细菌耐药性的普遍弱点。随着多年大量使用,细菌会对药物演化出免疫力,抗生素逐渐失效。化学工程师布莱恩·希(Brian Hie)与生物工程研究生塞缪尔·金(Samuel King)将目光投向噬菌体——一类能杀死细菌的病毒——希望借此工程化改造DNA,作为新型抗生素的突破口。 深入分析:Evo 2如何设计噬菌体 他们选择噬菌体ΦX174,因为其全基因组不足6000个碱基对,相比人类基因组的30亿碱基对相对简单,却仍能杀死细菌,是检验Evo 2设计能力的理想样本。Hie是斯坦福化学工程助理教授,也是Evo 2的创造者。Evo 2是一种生成式AI模型,能给出新的DNA序列以解决复杂生物学难题。给定ΦX174最短的一小段DNA,Evo 2就能写出可杀死大肠杆......阅读全文

AI设计噬菌体将改变整个行业

核心影响:生成式AI模型Evo 2在无需人工干预的情况下,端到端设计出能杀死大肠杆菌的全新噬菌体基因组,为抗耐药性抗生素开辟了新路径。 问题提出:抗生素的耐药困境 现代抗生素面临细菌耐药性的普遍弱点。随着多年大量使用,细菌会对药物演化出免疫力,抗生素逐渐失效。化学工程师布莱恩·希(Brian

Transformation-of-E.-coli-by-Electroporation

实验概要        Electrocompetent bacteria are prepared by growing cultures to mid-log phase, washing the bacteria extensively at low temperature, and

Sauer:Lysing-E.-coli-with-Lysozymes

Getting The Most Out Of Your BugsNative lysis is a staple protocol in practically every biochemistry lab, yet there is significant variability in the

Phospholipid-Biosynthesis-in-E.-Coli-Pathway

The biosynthesis of membrane phospholipids occurs through distinct pathways in mammals and bacteria. In the mammalian pathway for the synthesis of pho

Antibiotic-concentrations-for-E.-coli-selection

Antibiotic ConcentrationsThe following list shows recommended antibiotic concentrations for LB media or agar plates.AntibioticConcentrationAmpicillin1

ChIPChip-E.-coli

AbstractChIP-Chip stands for Chromatin Immunoprecipitation and chip in the sense of DNA microarray. It is a technique to determine the genome-wide bin

Sauer:RNA-Purification-from-E.-coli

My Experience Purifying RNA from E. coliRegarding RNA extraction, there is a horrible tendency of people to use kits for RNA extraction with bacteria.

Maxiprep-of-plasmid-DNA-from-E.-coli

IngredientsIngredients are per culture; make enough for one extra culture to allow for pipetting error).150μL sterile 50% glycerol1mL TEG (25mM Tris-C

Analysis-of-total-E.-coli-protein-by-SDS-PAGE

1. In microfuge tubes, spin down 0.1 ml of uninduced cells grown to near saturation or 0.15 ml of IPTG induced cells. Remove YT (or LB) media with a p

Transformation-of-Electrocompetent-E.-coli-with-Blue/White-selection

Desalt DNA template by EtOH precipitation in NaOAc followed by at least 2x washes with 70% EtOH.  Resuspend in 5 - 15 µL of sterile H2O.Rinse cuvettes

PNAS:用CRISPR解决世界性难题

   近年来致病菌的抗生素抗性越演越烈,这已经成为了一个世界性的难题。科学家们日前在CRISPR技术的基础上,开发了一个双噬菌体系统,能够使耐药菌敏感化,并且有选择的杀死它们。这项研究发表在五月十八日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。  传统的噬菌体疗法是用一种或多种噬菌体去感染和裂解相应的细菌菌

AEM:噬菌体可扩散抗生素耐药性

  近日,来自维也纳兽医大学(University of Veterinary Medicine)的研究人员通过对从奥地利超市、街边市场等处购买的50份鸡肉样本进行分析,发现有将近一半的样本都被噬菌体污染了,而且这种噬菌体还有能力将抗生素耐药性基因从一种细菌转移到另一种细菌;相关研究发表于Appli

生成式AI带来的新思考

过去几个月,ChatGPT为人工智能技术按下加速键。这个聊天程序证明了超大参数模型和通用型人工智能的可行性,谷歌、亚马逊等巨头纷纷推出自主研发的相关平台,国内也已有十数家企业在该领域有所布局。  它们被统称为“生成式人工智能”。简单来说,这种AI可以通过算法生成新内容,包括图像、文字、音乐,甚至视频

生成式AI进军基因编辑领域

OpenCRISPR-1的物理结构,这是一种由Profluent的AI技术创建的基因编辑器。图片来源:singularityhub.com制图、写歌、作诗、编程、生成视频……生成式人工智能(AI)技术与各行业的结合不断为人们带来惊喜,在各领域掀起革新浪潮。现在,AI的应用场景再次拓展:美国AI蛋白质

生成式AI引发治理新思考

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499199.shtm

Purifying-Large-E.-coli-Restriction-Fragments-from-PulsedField-Gels

DNA PreparationE. coli chromosomal DNA is prepared following the method of Heath et al. ( J. Bacteriol., 174, 1992). Cells are embedded in agarose, th

基因编辑、噬菌体疗法与抗生素耐药性

  一项概念验证研究提出,噬菌体疗法可能提供一种方法从而解决长期以来难以处理的抗生素耐药性问题。以瞄准病原细菌的定制病毒为基础的噬菌体疗法可能帮助应对抗生素耐药性的激增,但是这种策略也受到一些缺点的影响,尤其是向受感染组织提供噬菌体的困难,以及耐噬菌体基因在细菌之间的频繁转移。Udi Qimron及

生成式AI投融资热潮席卷全球

最近,由微软投资的开放人工智能研究中心(OpenAI)开发的聊天机器人ChatGPT引发广泛关注,它能够利用大型语言模型技术,快速生成精雕细琢的文本,如散文或诗歌等。一石激起千层浪。包括谷歌、元宇宙、亚马逊公司等在内的科技巨头纷纷开始推出或开发自己的聊天机器人,并投资相关初创企业,针对生成式AI的投

警惕生成式AI推动虚假信息运动

生成式人工智能(AI)横空出世,可能给人类带来巨大的影响。美国高盛集团今年早些时候警告称,超过3亿个全职工作岗位可能会受到波及。美国国会研究服务局5月发布的一份报告指出,AI的最新创新也提出了新的版权问题,即如何界定AI创建或使用的内容属于侵权还是合理使用等。美国《福布斯》网站在6月9日的报道中指出

AI找到全新抗生素-可杀死超级耐药菌

  今日,顶尖学术期刊《细胞》杂志刊登了一篇来自麻省理工学院(MIT)的研究论文。科学家们通过一种深度学习系统,让人工智能“慧眼识珠”,发现了一种潜在糖尿病药物的抗菌潜力。在动物实验中,这种全新的抗生素能有效杀死一种对已知所有抗生素都耐药的超级细菌。这一重磅发现也登上了当期《细胞》杂志的封面。  科

生成式AI实现护肤品虚拟试用

  位于爱沙尼亚塔林市的Haut.AI是一家专门为皮肤、头发和健康进行人工智能(AI)分析的公司。据美国科学促进会Eurekalert网站19日消息,该公司刚刚发布的用于建模皮肤状况的新生成式AI技术——SkinGPT,允许用户上传他们的照片,并应用AI来模拟其皮肤在使用护肤品时如何随时间变化。Sk

中外青年热议生成式AI的局限

  近日,国家网信办发布了《生成式人工智能(AI)服务管理办法(征求意见稿)》,针对面向中国境内公众提供服务的生成式人工智能产品,包括其研发及服务,向社会公开征求管理意见。  生成式AI正是当前以ChatGPT等智能聊天机器人为代表的技术。自去年11月ChatGPT发布以来,其展示的与人类高度相似的

中外青年热议生成式AI的局限

近日,国家网信办发布了《生成式人工智能(AI)服务管理办法(征求意见稿)》,针对面向中国境内公众提供服务的生成式人工智能产品,包括其研发及服务,向社会公开征求管理意见。生成式AI正是当前以ChatGPT等智能聊天机器人为代表的技术。自去年11月ChatGPT发布以来,其展示的与人类高度相似的对话能力

国内首家近视儿童AI生成式病历问世

暑期就诊高峰期,病历撰写占用大量医生资源,导致诊疗效率下降、患者体验受损问题,如何应对?复旦大学附属眼耳鼻喉科医院率先推出了一个解决方案——人工智能(AI)生成式病历系统。该系统深度整合了眼视光学知识体系与AI技术,建立了眼视光专业术语库,通过训练模型,对海量病历数据、眼视光学学科文献以及病种知识体

生成式AI破解医学数据分析难题

在一项早期真实世界测试中,加州大学旧金山分校(UCSF)和韦恩州立大学的研究者发现,生成式人工智能处理庞杂医学数据集的速度,远超传统的计算机科学团队,在某些情况下甚至得出更强的分析结果。而人类专家此前已花费数月时间,仔细分析着同一批信息。为了直接比较性能,研究者把完全相同的任务分派给不同小组:一部分

生成式AI赋能脑网络构建新范式

近日,中国科学院深圳先进技术研究院数字所王书强课题组在《IEEE模式分析与机器智能汇刊》发表研究成果,实现了基于生成式AI优化模型的End-to-End脑网络构建。生成式AI通过从数据中自动学习提取隐藏的模式和规律,在模拟复杂自然过程、分析和预测科学数据等方面表现出巨大潜力。相较于传统方法,生成式A

ChatGPT爆火,生成式AI意味着什么?

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494048.shtm

“帮手”还是“帮凶”?生成式AI学术使用须关注

图片来源:《自然》网站生成式人工智能(AI)工具快速普及,在学术写作领域呈现爆炸式应用势头。使用基于大语言模型(LLM)的生成式AI工具能节省时间,减少语言障碍,让论文更加明白通畅。但这些工具的应用也让剽窃问题变得更复杂。英国《自然》网站在近日的报道中指出,对利用AI写作是否构成剽窃,以及在什么情况

生成式AI下一站:文本转视频

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498451.shtm 聊天机器人ChatGPT的爆红,让生成式人工智能(AI)成为科技领域的“当红炸子鸡”。除了如今“霸屏”的类似ChatGPT的语言模型之外,生成式AI领域还有大量其他技术:文本生成

生成式AI时代,大模型数据安全如何保障?

在生成式AI(人工智能)时代,数据安全的出路可能会是“用魔法打败魔法”,知识产权保护也可能要提前到token(字符串)层面。4月26日,在2024中关村论坛上,人工智能企业与学者就AI大模型的数据安全问题进行了讨论。中关村论坛数据安全治理与发展论坛现场  澎湃新闻记者 秦盛 摄“在生成式人工智能时代