营养所发现小鼠肝脏小RNA存在多种修饰并和糖尿病相关
近日,Analytical Chemistry在线发表了中科院上海生命科学研究院营养科学研究所翟琦巍研究组的最新研究进展:A high-throughput quantitative approach reveals more small RNA modifications in mouse liver and their correlation with diabetes。该研究建立了一种同时检测单个RNA样品中超过40种核苷的方法,发现小鼠肝脏小RNA中存在多种修饰,并初步发现小RNA修饰和糖尿病存在相关性。 近年来,对于蛋白质修饰和DNA修饰研究引起了大量研究者的兴趣,但对于RNA修饰的研究相对较少。对于RNA修饰的研究被认为有望成为继蛋白修饰和DNA修饰研究之后的下一个研究热点。但对于RNA修饰的研究还存在很多技术方面的困难。 从1956年假尿嘧啶(Ψ)发现至今,RNA修饰的研究主要集中在tR......阅读全文
细胞化学基础修饰碱基
又称稀有碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如:5-甲基胞苷、5,6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷:假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同,即尿嘧啶5位碳与核苷形成
限制修饰系统结构
细菌的限制修饰系统包含三个连锁基因:(1)hsd R:编码限制性核酸内切酶(2)hsd M:编码限制性甲基化酶(3)hsd S:编码限制性酶和甲基化酶的协同表达
何谓化学修饰调节
凡通过化学基因的引入或除去,而使蛋白质或核酸共价结构发生改变的现象。化学修饰(chemical modification)调节方式有别于别构调节。它以引起酶分子共价键的变化、化学结构的改变而影响酶活性。酶的化学修饰是在另一种酶的催化下完成的,是体内快速调节的另一种重要方式。化学修饰的方式包括磷酸化与
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节,这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映,这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
多肽合成与修饰技术
实验技术:多肽 合成是一个固相合成顺序一般从C端(羧基端)向 N端(氨基端)合成。过去的多肽合成是在溶液中进行的称为液相合成法。从1963年Merrifield发展成功了固相多肽合成方法以来,经过不断的改进 和完善,到今天固相法已成为多肽和蛋白质合成中的一个常用技术,表现出了经典液相合成
什么是化学修饰?
凡通过化学基团的引入或除去,而使蛋白质或核酸共价结构发生改变的现象。
细胞化学词汇DNA修饰
中文名称:DNA修饰英文名称:DNA modification定 义:DNA合成后,通过一系列化学加工使其结构发生某些改变。如DNA的甲基化等。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
组蛋白修饰的意义
通过影响组蛋白与DNA双链的亲和性,从而改变染色质的疏松或凝集状态,或通过转录因子与结构基因启动子的亲和性来发挥基因调控作用。这些修饰之间存在协同和级联效应,更为灵活地影响染色质的结构与功能,通过多种修饰方式的组合发挥其调控功能。
GSDMD的棕榈酰化修饰
GSDMD是细胞焦亡过程中的关键蛋白,此前的研究表明GSDMD在细胞焦亡发生时可被Caspase切割,从而释放出N端结构域,释放出的N端结构域进一步形成寡聚体并上膜打孔,最终造成细胞死亡。但此前的研究发现人源GSDMD的C191A突变体会影响其寡聚和造成细胞死亡的能力,因此本文作者尝试探究GSDMD
核苷酸酶简介
核苷酸酶(nucleotidase)是指水解核苷酸的糖和磷酸间的键而生成无机磷酸和核苷的特异的磷酸酯酶。5′-核苷酸酶(EC3.1.3.5)可作用于 腺苷(次黄苷)-5′-磷酸,而对3′-磷酸则无作用。含于前列腺、精液、脑、网膜、蛇毒、马铃薯、酵母和大肠杆菌中。除大肠杆菌的胞周腔(peripl
核糖核苷的功能特点
中文名称核糖核苷英文名称ribonucleoside定 义由除胸腺嘧啶(T)外的嘌呤或嘧啶与核糖分子共价结合而成的化合物。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
核苷的生理功能
核苷是核酸的主要组分。有些核苷及其衍生物具有显著的生理功能,如次黄嘌呤核苷(肌苷)可治疗急性和慢性肝炎及风湿性心脏病,并有增加白血球等功效。5-氟尿嘧啶脱氧核苷能抗肿瘤,毒性比5-氟尿嘧啶低,对肝癌、胃癌、直肠癌、卵巢癌、膀胱癌有一定疗效。胞嘧啶阿拉伯糖苷对缓解白血病有显著效果。5′-脱氧-5′-碘
稀有核苷的分布情况
大部分稀有碱基主要存在tRNA中,主要有假尿嘧啶核苷(ψ),各种甲基化的嘌呤和嘧啶核苷,二氢尿嘧啶(hU或D)和胸腺嘧啶(T)核苷等。它们功能不十分清楚。
核苷的生理功能
核苷是核酸的主要组分。有些核苷及其衍生物具有显著的生理功能,如次黄嘌呤核苷(肌苷)可治疗急性和慢性肝炎及风湿性心脏病,并有增加白血球等功效。5-氟尿嘧啶脱氧核苷能抗肿瘤,毒性比5-氟尿嘧啶低,对肝癌、胃癌、直肠癌、卵巢癌、膀胱癌有一定疗效。胞嘧啶阿拉伯糖苷对缓解白血病有显著效果。5′-脱氧-5′-碘
核苷的理化性质
一般核苷为无色的高熔点结晶;易溶于热水,难溶于冷水,嘧啶核苷较嘌呤核苷更易溶于水,难溶于有机溶剂,苯甲酰化后可溶于醇。腺嘌呤核苷、胞嘧啶核苷为弱碱性,尿嘧啶核苷为弱酸性,溶于强碱中;可制成铅盐、银盐、苦味酸盐、苦酮酸盐。核苷上的羟基可起烷基化反应,如二苯甲基化、甲基化、苄基化、硅烷化等反应;也可进行
核苷的制备方法介绍
核苷可从水解核酸来制备。用吡啶水溶液、氧化铝或酶促水解核糖核酸RNA,可得到核糖核苷;用氧化铝或酶水解脱氧核糖核酸DNA可得到脱氧核糖核苷。核苷也可用化学方法合成。适当保护的核糖或脱氧核糖与碱基衍生物缩合,可得到相应的核糖核苷和脱氧核糖核苷。或在糖的C1上先形成碳-氮和碳-碳键,然后闭环成杂环碱基而
核苷三磷酸的代谢
NTPS到DNTPS的转化只能在二磷酸盐形式进行。通常,NTP将一个磷酸盐除去以成为NDP,然后通过核糖核苷酸还原酶的酶转化为DNDP,然后添加磷酸盐以提供DNTP。嘌呤合成一个称为次黄嘌呤的氮基被直接组装到PRPP上。这导致一个核苷酸,称为肌苷一磷酸(IMP)。然后将IMP转化为AMP或GMP的前
核苷三磷酸的定义
核苷三磷酸(NTP)是一种含有三个磷酸基团的核苷酸。自然界常见的型态包括腺苷三磷酸(ATP)、鸟苷三磷酸(GTP)、胞苷三磷酸(CTP)、胸腺苷三磷酸(TTP)以及尿苷三磷酸(UTP)等。这些分子中包含一个核糖,若是将核糖替换常去氧核糖,那么会使核甘三磷酸变成去氧核苷三磷酸,写成dNTP,如去氧腺苷
核苷的形成与结构
核酸中的核苷由嘌呤或嘧啶碱与核糖或脱氧核糖缩合而成。核糖分子中的碳原子(C1)与嘧啶分子中的氮原子(N1)或嘌呤分子中的氮原子(N9)之间形成苷键,生成N-糖苷,即嘧啶或嘌呤的呋喃核糖苷,称为核糖核苷。2-脱氧核糖分子中的碳原子(C1)与嘧啶分子中的氮原子(N1)或嘌呤分子中的氮原子(N9)之间形成
胸腺嘧啶核苷的原理
在单抗制备中,由于需要进行选择性杀死非目标细胞,所以使用添加HAT的选择性培养基。
关于核苷的结构介绍
常见的核苷有:尿嘧啶核苷(尿嘧啶-1-β-D-呋喃核糖核苷)(见结构式a)、腺嘌呤核苷(腺嘌呤-9-β-D-呋喃核糖核苷)(b)、胞嘧啶核苷(胞嘧啶-1-β-D-呋喃核糖核苷)(c)、鸟嘌呤核苷(鸟嘌呤-9-β-D-呋喃核糖核苷)(d)、胸腺嘧啶核苷(胸腺嘧啶-1-β-D-2′-脱氧呋喃核糖核苷
核苷三磷酸的性质
核苷三磷酸是一种分子,含有与5-碳糖结合的氮基,三个磷酸基团与糖结合。(1)它们是DNA和RNA的构建模块,(2)他们是通过DNA 复制和转录过程产生的核苷酸链。(3)核苷三磷酸盐也作为细胞反应的能量来源,并参与信号传导途径。(4)核苷三磷酸不能被很好的吸收,因此它们通常在细胞内合成。(5)合成途径
什么是核苷三磷酸?
核苷三磷酸(NTP)是一种含有三个磷酸基团的核苷酸。自然界常见的型态包括腺苷三磷酸(ATP)、鸟苷三磷酸(GTP)、胞苷三磷酸(CTP)、胸腺苷三磷酸(TTP)以及尿苷三磷酸(UTP)等。这些分子中包含一个核糖,若是将核糖替换常去氧核糖,那么会使核甘三磷酸变成去氧核苷三磷酸,写成dNTP,如去氧
核苷酸的合成
核苷酸是核糖核酸及脱氧核糖核酸的基本组成单位,是体内合成核酸的前身物。核苷酸随着核酸分布于生物体内各器官、组织、细胞核及细胞质中,并作为核酸的组成成分参与生物的遗传、发育、生长等基本生命活动。生物体内还有相当数量以游离形式存在的核苷酸。三磷酸腺苷在细胞能量代谢中起着主要的作用。体内的能量释放及吸收主
核苷三磷酸的代谢
鉴于它们在细胞中的重要性,核苷三磷酸的合成和降解受到严格的控制。本概述着重于人类核苷三磷酸代谢,但该过程在物种间是相当保守的。三磷酸核苷不能被很好地吸收,因此所有的核苷三磷酸盐通常是从头合成的。ATP和GTP(嘌呤)的合成不同于CTP、TTP和UTP(嘧啶)的合成。嘌呤和嘧啶合成都使用磷酸核糖焦磷酸
关于核苷的形成介绍
核酸中的核苷由嘌呤或嘧啶碱与核糖或脱氧核糖缩合而成。核糖分子中的碳原子(C1)与嘧啶分子中的氮原子(N1)或嘌呤分子中的氮原子(N9)之间形成苷键,生成N-糖苷,即嘧啶或嘌呤的呋喃核糖苷,称为核糖核苷。2-脱氧核糖分子中的碳原子(C1)与嘧啶分子中的氮原子(N1)或嘌呤分子中的氮原子(N9)之间
核苷酸的定义
一类由嘌呤碱或嘧啶碱基、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物,又称核甙酸。五碳糖与有机碱合成核苷,核苷与磷酸合成核苷酸,4种核苷酸组成核酸。核苷酸主要参与构成核酸,许多单核苷酸也具有多种重要的生物学功能,如与能量代谢有关的三磷酸腺苷(ATP)、脱氢辅酶等。某些核苷酸的类似物能干扰核苷酸代谢,可
稀有核苷的常见类型
常见的核苷有:尿嘧啶核苷(尿嘧啶-1-β-D-呋喃核糖核苷)(见结构式a)、腺嘌呤核苷(腺嘌呤-9-β-D-呋喃核糖核苷)(b)、胞嘧啶核苷(胞嘧啶-1-β-D-呋喃核糖核苷)(c)、鸟嘌呤核苷(鸟嘌呤-9-β-D-呋喃核糖核苷)(d)、胸腺嘧啶核苷(胸腺嘧啶-1-β-D-2′-脱氧呋喃核糖核苷)(
胸腺嘧啶核苷的性质
一般核苷为无色的高熔点结晶;易溶于热水,难溶于冷水,嘧啶核苷较嘌呤核苷更易溶于水,难溶于有机溶剂,苯甲酰化后可溶于醇。腺嘌呤核苷、胞嘧啶核苷为弱碱性,尿嘧啶核苷为弱酸性,溶于强碱中;可制成铅盐、银盐、苦味酸盐、苦酮酸盐。核苷上的羟基可起烷基化反应,如二苯甲基化、甲基化、苄基化、硅烷化等反应;也可进行
核苷的生理功能
核苷是核酸的主要组分。有些核苷及其衍生物具有显著的生理功能,如次黄嘌呤核苷(肌苷)可治疗急性和慢性肝炎及风湿性心脏病,并有增加白血球等功效。5-氟尿嘧啶脱氧核苷能抗肿瘤,毒性比5-氟尿嘧啶低,对肝癌、胃癌、直肠癌、卵巢癌、膀胱癌有一定疗效。胞嘧啶阿拉伯糖苷对缓解白血病有显著效果。5′-脱氧-5′-碘