跨损伤DNA聚合酶正确跨越BPDEdG机制研究获进展
烟草、汽车尾气和燃煤排放所产生的苯并芘 (BP) 是一种常见的环境污染物,BP在体内经过代谢产生强致癌产物BPDE,BPDE与DNA上的鸟嘌呤结合形成的加合物(BPDE-dG)与肺癌发生密切相关。跨损伤 DNA 合成 (TLS)聚合酶可以直接在DNA 加合物对面掺入核苷酸,使由于DNA 损伤的存在而停滞的DNA复制得以延续。TLS 可分为无错旁路和易错旁路两种途径,无错旁路途径主要是在DNA加合物对侧掺入正确的核苷酸;而易错旁路途径在损伤的模板对侧掺入错误的核苷酸,从而引发基因组突变。 目前人体内共有大约15种DNA聚合酶,Polκ是迄今已知的唯一能正确跨越BPDE-dG加合物的聚合酶。Polκ可以在BPDE-dG 对面正确掺入dCTP,并进行有效的延伸,从而保护了细胞免受因BPDE-dG 损伤引发的基因组突变,而缺失Polκ则导致BP诱发的基因组突变率显著升高。关于Polκ正确跨越BPDE-dG加......阅读全文
细胞化学词汇DNA加合物
中文名称:DNA加合物别 名:adducts定 义:DNA加合物(adducts)是DNA片段与致癌化学物质结合形成的复合物,在科学实验中通常作为暴露的生物标注物 。
跨损伤DNA聚合酶正确跨越BPDEdG机制研究获进展
烟草、汽车尾气和燃煤排放所产生的苯并芘 (BP) 是一种常见的环境污染物,BP在体内经过代谢产生强致癌产物BPDE,BPDE与DNA上的鸟嘌呤结合形成的加合物(BPDE-dG)与肺癌发生密切相关。跨损伤 DNA 合成 (TLS)聚合酶可以直接在DNA 加合物对面掺入核苷酸,使由于DNA
北京基因组所揭示线粒体基因组氧化损伤修复分子机制
线粒体是真核生物细胞主要的能量代谢场所,其中呼吸链氧化磷酸化过程伴随有高水平的氧自由基(ROS)的产生。线粒体基因组缺乏组蛋白结合保护,所以容易受到ROS攻击而发生损伤,其突变的累积已证实与多种人类疾病(如神经退行性病变、糖尿病、心血管疾病和癌症等)的发生密切相关。有关核基因组DNA损伤修复分子
科学家发现人类肠道微生物所产基因毒素对DNA的破坏机制
近日,美国哈佛大学和明尼苏达大学的研究人员针对肠道细菌毒素破坏双链dNA的机制,在Science杂志上发表了题为“The human gut bacterial genotoxin colibactin alkylates DNA”的文章。他们利用化学合成、小鼠实验和基于非靶向质谱测定的组学分析
国外学者发现线粒体基因突变与疾病之间的关系
线粒体是一种具有自身独有DNA的细胞器,它们在能量供应中扮演的角色使得它们对氧化应激伤害很敏感,包括具有损伤DNA功能的加合物的形成。图片来源:Vincenzo Sorrentino, Mario Romani, Francesca Potenza/EPFL. 其中一种叫做M1dG的加合物就是
诺奖得主PNAS文章公布最新测序技术:重新定义DNA修复
我们身体细胞内的DNA每日都会由于各种原因而受损,因此可以说细胞间DNA修复系统是维持生命的基础,但是对于这个基础机制科学家们并没有完全弄明白。近期来自北卡罗来纳州大学教堂山分校的研究人员利用先进的测序技术,分析澄清了这些修复系统中的关键分子细节,发现了核苷酸切除修复的奥秘。 这一研究成果公布
日科学家发现可抑制基因组损伤的蛋白质
日本科学家发表于最新一期《自然》杂志网络版的论文说,他们经动物实验发现,人类以及许多动物体内都有的Zuc蛋白质在抑制转位子造成的基因组损伤过程中发挥着重要作用,这项研究成果将有助于解开不孕症发病的机制。 日本科学技术振兴机构和东京大学15日联合发表新闻公报介绍了上述成果。公报说,动物基因组
非损伤性扫描离子选择电极技术及其在后基因组...(六)
3.1. 植物生理学 SIET在植物学研究中的应用,在该技术的诞生以及发展过程中始终占有相当大的比例。这可能与植物细胞外的细胞壁对向膜片钳这样的技术来讲操作较为困难有关。而利用SIET特有的非损伤性特点,可以在不对细胞、组织甚至器官造成任何损伤的情况下测知离子分子的运输情况。正是意识到SIET的
非损伤性扫描离子选择电极技术及其在后基因组...(七)
3.3. 生理学肌肉可以产生运动的特性使得许多生理学技术,特别是需要插入细胞内的电极技术,对于它们都一筹莫展。可喜的是,SIET技术的非损伤性,为其在研究肌肉运动中的缓慢过程提供了用武之地。Pelc et al.利用SIET技术测量到了 (Mytilus edulis ,一种软体动物) 平滑肌在ca
非损伤性扫描离子选择电极技术及其在后基因组...(四)
2.5. 影响SIET正确使用的主要外部因素 2.5.1.缓冲溶液中离子流动速率的测量在使用SIET技术过程中,通常要在溶液中加入一些缓冲剂成份,如:MES,Tris或EDTA等,用以稳定被测离子以便离子选择电极进行测量。然而,如果离子缓冲剂选择或者使用不当,被测离子会与缓冲剂相互干扰,破坏被测离子
非损伤性扫描离子选择电极技术及其在后基因组...(九)
3.6. 药理学美国哈佛大学医学研究院的研究人员正利用SIET技术,结合分子生物学方法对ChineseHamsterOvary细胞进行研究,试图了解某些药物的作用机理,阐明某些动物细胞的生化信号传导路径(个人通讯)。 美国北卡WAKE-FOREST医学院MIKE TYTELL教授,应用SIET研究H
非损伤性扫描离子选择电极技术及其在后基因组...(十)
3.9. 环境科学浮萍(Duckweed)具有积累和聚集水环境中重金属离子(如:镉)的作用,但其作用机理却存在争论,一方面认为浮萍本身具有吸收重金属的功能,另一方面认为是与其共生的微生物使然。麻省州立大学微生物系(http://www.bio.umass.edu/micro/nusslein/sto
非损伤性扫描离子选择电极技术及其在后基因组...(三)
2.3.2.时间分辨率如图2所示,离子选择电极在V1和V2位置停留的时间通常为1到10秒,而且测得离子流动速率Jo至少需要测量两点的数据,决定了SIET技术的时间分辨率。另外的原因还包括:a) 如果离子电极移动过快将使被测样品周围的溶液受到干扰而破坏离子梯度。电极的移动大致要占去一个测量周期的10%
非损伤性扫描离子选择电极技术及其在后基因组...(八)
3.4. 神经生物学在神经组织中,维持Ca2+浓度平衡、局部区域的反应及调控是极为重要的,如信号整合及临床状况等等 [27]。SIET技术在神经生物学的应用为研究运输现象开辟了一条崭新的道路。例如,在近乎实时的情况下,在细胞表面的运输过程可以被较全面的记录下来,以及由离子泵和其他运输载体活性所产生的
非损伤性扫描离子选择电极技术及其在后基因组...(一)
非损伤性扫描离子选择电极技术及其在后基因组时代的应用许越1,2,3) Joseph G. Kunkel3) Alan Shipley4) 张平5) 王世强6) 张旭家7) 何奕昆8) 印莉萍8) 杨黄恬9) 上官宇1) 叶鑫生10) ( 1)美国扬格公司,YoungerUSA Com
非损伤性扫描离子选择电极技术及其在后基因组...(二)
2. SIET原理2.1. 物理学及数学基础物质在液体环境中有从高浓度到低浓度扩散的趋势。对于带电粒子而言,还有从高电化学电势到低的电化学电势运动的趋势。如果,离子电极的移动距离dx在几十微米以下,生物材料实验证明,影响带电粒子运动的电化学电势的梯度可以忽略不计,那么,该离子的扩散运动速率可以通过F
非损伤性扫描离子选择电极技术及其在后基因组...(五)
2.6. SIET的数据分析自从SIET诞生以来,在数据分析方面一直是其较为薄弱的环节,在一定程度上也制约了SIET的推广和应用。这主要是由于各个实验室在离子电极的制作、电极的校正、电极的测量效率、电极相对于被测材料的位置、电极的运动方式定义以及缓冲溶液成份方面存在着或多或少的差异。而且,即使在同一
《Science》揭示大肠杆菌与癌症的神秘关联
十多年来,科学家们一直致力于研究大肠杆菌素(一种由某些大肠杆菌菌株产生的化合物)与结直肠癌之间的联系,但由于他们无法分离出这种化合物,这种联系受到了阻碍。 所以Emily Balskus决定把注意力集中在大肠杆菌素留下的“烂摊子”上。 Balskus是化学和化学生物学教授,她和同事们是一项新
Nature揭示膀胱肿瘤基因组突变中DNA修复及损伤的关键角色
在过去几十年里,全世界的科学家们都在对癌细胞的基因组进行全方位解析,试图揭开驱动肿瘤生长的基因密码;随着对成千上万个在肿瘤细胞DNA中积累的基因突变进行精确分析,研究人员如今发现的致癌基因的数量越来越多了;近日科学家们就将研究目光转移到了其它关键问题上,即什么样的生物学过程会引发DNA发生突变?
北京基因组所等揭示REV1在DNA损伤应答中的功能
REV1是真核生物一种特殊的DNA聚合酶,其可以作为一个有效靶标用于肿瘤治疗,降低REV1水平不仅能增强肿瘤细胞对化疗的敏感性,还能有效降低肿瘤细胞耐药性的产生。前期研究显示REV1能参与跨损伤DNA合成并引发基因组突变。最近一些研究发现,在出芽酵母、鸡DT40细胞、黑腹果蝇细胞及人类细胞中RE
肝细胞损伤的损伤形式介绍
1、肝细胞膜损伤: 细胞膜的结构和功能维持正常是细胞行使生理功能的一个重要保证,生物膜流动性异常可造成细胞功能紊乱或崩溃。在肝脏,由于肝细胞膜和线粒体膜的脂质富含多不饱和脂肪酸,而多不饱和脂肪酸不仅比饱和脂肪酸更易被氧化,也比饱和脂肪酸更易合成磷脂和甘油三酯,加之肝细胞线粒体代谢活跃,这使得肝
黄曲霉毒素的致突变性介绍
黄曲霉毒素具有致突变性,能使人成纤维细胞发生程序外DNA合成,动物实验可见染色体畸变,染色体断裂,某些染色体4q、13q、14p发生缺失。AFB1是一种能导致生物体遗传物质发生变化的致突变化合物,但 AFB1本身不能引起突变,而必须在机体内经过代谢活化后才具有致突变作用,称为间接致突变物。AFB
电子顺磁共振波谱仪在防晒方面的应用
众所周知,长期暴露于紫外辐射下,皮肤不仅会老化、产生皱纹、损伤血管和淋巴,甚至发生DNA损伤。紫外辐射能穿透入更深层的皮肤,并能引起对更深层的真皮和表皮的损伤。辐射穿透入皮肤层后,产生自由基或活性氧族(ROS),例如羟基自由基(·OH)、单线态氧(1O2)和超氧阴离子自由基(·O2-)。这些物质能引
概述自由基与癌变的分析内容
高级生物才会患癌,因此癌与氧之间必有某种关系。 [6] 已发现癌变的两个阶段都有氧自由基的参与。致癌物质必须经过代谢,经物理化学因素作用使之成为自由基后才会致癌。生成自由基的能力与致癌能力之间有平行关系。一些药物所以能抗癌也与氧自由基有关。这并不矛盾,因为无论致癌或抗癌,其分子基础都是共同的,即
生态环境中心DNA损伤研究取得系列进展
图1 独立研制的毛细管电泳-激光诱导荧光偏振检测装置 图2 DNA缠绕-局部解链模型 中国科学院生态环境研究中心环境化学与生态毒理学国家重点实验室汪海林课题组在DNA损伤研究方面取得了一系列重要进展。 DNA损伤是诱发基因突变、癌症发生和发育畸形的关键因素。由于缺少
吸烟危害有多大?当心你的基因被永久损害!
先前的研究已证明,吸烟引起DNA损伤,导致肺癌。日前,UNC医学院的科学家们首次创建了一种在基因组水平以高分辨率有效反应DNA损伤修复位点的技术。 UNC医学院生物化学和生物物理学实验室的Sarah Graham Kenan教授发明该技术。 在“美国国家科学院院刊”上发表的一项研究中,Sanc
吸烟危害有多大?当心你的基因被永久损害!
先前的研究已证明,吸烟引起DNA损伤,导致肺癌。日前,UNC医学院的科学家们首次创建了一种在基因组水平以高分辨率有效反应DNA损伤修复位点的技术。 UNC医学院生物化学和生物物理学实验室的Sarah Graham Kenan教授发明该技术。 在“美国国家科学院院刊”上发表的一项研究中,Sanc
Aβ损伤模型
取出生1-2d的乳鼠,用麻醉剂处死。在D-hanks液中取大脑并分离海马组织,胰蛋白酶消化,获得细胞悬液,胎盘蓝染色进行死活细胞记数,将细胞以5×105/ml的密度接种于预先经L-多聚赖氨酸处理的96孔和24孔培养板,其中24孔板中预先放置有盖玻片。细胞维持在培养液中,置入5%CO2,饱和湿度的培养
结直肠损伤及并发血管损伤处理原则
结肠损伤(coloninjuries)与其他空腔脏器损伤相似,结肠与直肠损伤较常见于穿透性腹部损伤,而少见于闭合性损伤。结肠是穿透性腹部损伤常累及的器官,与其他空腔脏器损伤相似,结肠损伤常在血流动力学不稳定或穿透性损伤后行剖腹探杳时首先发现。直肠指诊指套染血或可见穿透性弹道提示直肠损伤、需要进
《Nature》-小酌怡情大错特错!酒精代谢物诱使干细胞突变!
关于酒精的危害,《Nature》今天发表的这篇文章会再度刷新你的认知。 这篇文章中研究人员阐明了乙醛(一种内源性和醇衍生代谢物)会引起的DNA损伤和突变现象。这种损伤导致DNA双链断裂,这些细胞中DNA损伤的积累促进了细胞自身的降解,而这种损伤的引起的错误修复会引发恶性肿瘤。 酒精的消耗导致