研究更接近了对脆性X综合征的破解
研究脆性X综合征——这是对某些自闭症及智力迟钝病例的一种基因触发因子——的研究人员发现,信使RNA(mRNA)对该病的起病起着某种关键性的作用。以往的研究显示,某种被称作CGG三核苷酸重复序列的特别的核苷酸三联体的异常扩增可令脆性X智力迟钝-1基因或FMR1沉寂并导致脆性X综合症。但是,在此之前,这一串遭到损坏的CGG三核苷酸重复序列会令这一重要的基因沉寂的机制却是一直未知的。 应用人类胚胎干细胞来追踪发育过程,Dilek Colak 及其同事发现,当过多的核苷酸重复序列出现时,它们会被转录至mRNA,而后者转而会与FMR1基因的相应的CGG-重复序列部分相融合。他们说,正是这一RNA/DNA双链形成了一个基因路障并中断了FMR1的活性。然而,当研究人员阻断了mRNA与FMR1的CGG-重复序列部分之间的相互作用时,该基因就不会沉寂。......阅读全文
低度重复序列的概念
低度重复序列在单倍体基因组中只出现一次或数次,因而复性速度很慢。单拷贝顺序在基因组中占50-80%,如人基因组中,大约有60-65%的顺序属于这一类。单拷贝顺序中储存了巨大的遗传信息,编码各种不同功能的蛋白质。尚不清楚单拷贝基因的确切数字,但是是有其在单拷贝顺序中只有一小部份用来编码各种蛋白质,其他
中度重复序列的概念
中度重复序列(moderately repetitive sequence )一般是非编码序列,有十个到几百个拷贝,如 rRNA基因和 tRNA 基因等。这类重复序列的平均长度大约为 300bp ,往往构成序列家族,常以回文序列形式出现在基因组的许多位置上,有些同单一序列间隔排列。大部分中度重复序列
反向重复[序列]的定义
存在于双链核酸分子中排列顺序方向相反的一段核苷酸序列。
串联重复[序列]的定义
中文名称串联重复[序列]英文名称tandem repeat定 义首尾相连的重复序列。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
重复[DNA]序列的概念
中文名称重复[DNA]序列英文名称repetitive [DNA] sequence定 义DNA分子中重复出现的核苷酸序列。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
高度重复序列的概念
高度重复序列是一组基因序列,在基因组中重复频率高,可达百万(10^6)以上,因此复性速度很快。在基因组中所占比例随种属而异,约占10-60%,在人基因组中约占20%。
Alu重复序列的概念
中文名称Alu重复序列英文名称Alu repetitive sequence;Alu family定 义哺乳动物和人基因组中的一种中等重复序列,因该序列中有限制性内切酶Alu的切点而得名。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
简单重复序列的概念
简单重复序列(Simple Sequence Repeat,简称SSR),是指重复单位长度和碱基组成基本一致,只 有少数基因出现微小的差异的一类短串联重复序列。
散在重复序列的概念
散在重复序列是与串联重复序列的组织形式不同的另一类重复序列,是散在方式分布于基因组内的散在重复序列。
散在重复序列的定义
散在重复序列是与串联重复序列的组织形式不同的另一类重复序列,是散在方式分布于基因组内的散在重复序列。
同向重复[序列]的概念
中文名称同向重复[序列]英文名称direct repeat定 义核苷酸排列次序一致的重复序列。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
简单重复序列的功能特点
SSR 标记具有高度重复性、丰富的多态性、共显性、高度可靠性等优点,但由于其需要对所研究物种的一系列微卫星位点进行克隆和测序分析,以便设计相应的引物,这是非常费时、费力和代价昂贵的工作,没有足够的投资、人力和时间,是不可能实现的,因而给它的利用带来了一定困难。
长末端重复序列的定义
长末端重复序列(long terminal repeats,LTRs)是相同的DNA序列,重复数百或数千次发现在两端retrotransposons或前病毒的DNA由反转录的RNA逆转录病毒。
高度重复序列的结构特点
倒位(反向)重复序列这种重复顺序复性速度极快,即使在极稀的DNA浓度下,也能很快复性,因此又称零时复性部分,约占人基因组的5%。反向重复序列由两个相同顺序的互补拷贝在同一DNA链上反向排列而成。变性后再复性时,同一条链内的互补的拷贝可以形成链内碱基配对,形成发夹式或“+”字形结构。倒位重复(即两个互
末端反向重复[序列]的定义
中文名称末端反向重复[序列]英文名称inverted terminal repeat;ITR定 义排列顺序相反的、等同的或密切相关的核苷酸序列。常出现于某些转座子的末端。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
核苷酸序列的概念
核苷酸序列,就是指DNA或RNA中碱基的排列顺序。这意味着DNA中A,T,G,C的排列顺序,或者mRNA中A,U,G,C的排列顺序,也包括rRNA,tRNA中碱基的排列顺序。
核苷酸序列的结构
核苷酸序列,就是指DNA或RNA中碱基的排列顺序。这意味着DNA中A,T,G,C的排列顺序,或者mRNA中A,U,G,C的排列顺序,也包括rRNA,tRNA中碱基的排列顺序。
长散在重复序列的概念
中文名称长散在重复序列英文名称long interspersed repeated sequences定 义以散在方式分布于基因组中的较长的重复序列。重复序列的单元长度在1000bp以上。常具有转座活性。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
细胞化学词汇末端反向重复[序列]
中文名称:末端反向重复[序列]英文名称:inverted terminal repeat;ITR定 义:排列顺序相反的、等同的或密切相关的核苷酸序列。常出现于某些转座子的末端。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
短散在重复序列的概念
中文名称短散在重复序列英文名称SHORT INTERSPERSED REPEATED SEQUENCE定 义以散在方式分布于基因组中的较短的重复序列。重复序列单元长度在50BP以下。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
核苷酸序列的分析方法
根据核苷酸序列频率分布的特点和离散傅立叶变换所固有的“栅栏效应”,提出采用调频Z变换的分析方法,定义了相应的表达式,同时构造了短时调频Z变换用于识别基因区域中的外显子部分和内含子部分。与已有的基因区域识别算法相比,该方法不需要依赖于训练样本序列。测试结果表明了该方法的有效性。
核苷酸序列的分析方法
根据核苷酸序列频率分布的特点和离散傅立叶变换所固有的“栅栏效应”,提出采用调频Z变换的分析方法,定义了相应的表达式,同时构造了短时调频Z变换用于识别基因区域中的外显子部分和内含子部分。与已有的基因区域识别算法相比,该方法不需要依赖于训练样本序列。测试结果表明了该方法的有效性。
简单重复序列多态性的概念
中文名称简单重复序列多态性英文名称simple sequence repeat polymorphism;SSRP定 义由组成比较简单的(如二、三核苷酸或四核苷酸序列)串联重复所具有的拷贝数不同而造成的多态现象。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)
重复序列长度多态性的定义
中文名称重复序列长度多态性英文名称repeat sequence length polymorphism定 义亚种、品系或个体间相同或相似重复单元的重复拷贝数不同而造成的多态现象。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
高度重复序列的主要功能
a.参与复制水平的调节反向序列常存在于DNA复制起点区的附近。另外,许多反向重复序列是一些蛋白质(包括酶)和DNA的结合位点。b.参与基因表达的调控DNA的重复顺序可以转录到核内不均一RNA分子中,而有些反向重复顺序可以形成发夹结构,这对稳定RNA分子,免遭分解有重要作用.c.参与转位作用几乎所有转
核苷酸序列的基本概念
由A、T、C、G四种字符组成的核苷酸序列本质上是生物分子的一种符号表示。在计算生物学中,常采用离散傅立叶变换进行频谱分析。
核苷酸序列的分析方法介绍
核苷酸序列,就是指DNA或RNA中碱基的排列顺序。这意味着DNA中A,T,G,C的排列顺序,或者mRNA中A,U,G,C的排列顺序,也包括rRNA,tRNA中碱基的排列顺序。 根据核苷酸序列频率分布的特点和离散傅立叶变换所固有的“栅栏效应”,提出采用调频Z变换的分析方法,定义了相应的表达式,同
散在重复序列的结构分布特点
散在重复序列是与串联重复序列的组织形式不同的另一类重复序列,是散在方式分布于基因组内的散在重复序列。
DNA核苷酸序列冈崎片段的介绍
冈崎片段是相对较短的DNA核苷酸序列(真核生物中大约有150到200个碱基对长),它们的合成是不连续的,并随后通过DNA连接酶连接在一起,形成DNA复制过程中的滞后链。冈崎片段是20世纪60年代两位日本分子生物学家、名古屋大学的一对校友夫妇冈崎令治和冈崎恒子共同发现的。
Nature:DNA重复序列是否致病取决于什么?
DNA重复序列在人类基因组中是很常见的。重复序列已经被提出作为一种进化机制,但是它们可能与人类疾病相关。现在,马克斯-普朗克分子遗传学研究所和Charité – Universitätsmedizin Berlin的科学家已经证明,DNA重复序列是否与人类疾病相关,取决于它们在基因组中的位置,序