陈玲玲研究员CellRes解析癌相关lncRNA
报道 来自中科院上海生命科学研究院、第二军医大学的研究人员在新研究中证实,人类结直肠癌特异性的CCAT1-L lncRNA调控了MYC基因位点的远程染色质相互作用。这一研究发现在线发表在3月25日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 论文的通讯作者是中科院上海生命科学院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲(Ling-Ling Chen)研究员。其主要研究方向为长非编码RNA和干细胞。 长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,因此起初被认为是基因组转录的“噪音”,不具有生物学功能。然而,近年来的研究发现,实际上lncRNA以RNA的形式在多种层面上(表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等)影响了各种重要的生物过程,且与癌症的发生存在密切的关系。尽管这些研究的结果表明,lncRNAs有可能在肿瘤形成中充当了重要的调控因子,对于lncRNAs在特......阅读全文
科学家利用迁移学习建立计算大模型预测基因调控研究
基因网络绘制需要大量转录组数据用于建立基因之间的联系,这也阻碍了一些数据有限场景(如罕见病)等研究。最近,利用迁移学习的机器学习技术在自然语言和计算机视觉等领域带来了变革性进展,其通过在大规模通用数据集上进行大模型预训练,而后迁移到数据量有限的特定任务进行微调。美国博德研究所等研究团队提出了一个
蓖麻胚乳基因组印记的表观调控机制研究获进展
被子植物特有的双受精事件产生了三倍体的胚乳(两份母源基因组和一份父源基因组,2m:1p),为胚的发育和种子的萌发提供了营养,为被子植物在陆地植被中占据主导地位奠定了重要的物质基础。同时,由于胚乳中父母源基因组剂量的失衡,产生了一系列非孟德尔遗传现象特别是基因组印记(genomic imprint
研究揭示核心基因调控紫花苜蓿适应性与产量机制
近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所饲草育种与栽培科技创新团队解析了四拷贝核心基因调控紫花苜蓿适应性与产量平衡的机制,为紫花苜蓿广适高产育种提供了重要参考。相关研究成果发表在《自然—通讯》上。紫花苜蓿作为“牧草之王”,具有同源四倍体遗传特性,该特性不仅赋予其优良的生产性能和广泛的适应性,也为挖掘逆
Scientific Reports:普通小麦TaGS2基因表达调控研究获进展
普通小麦是全球重要的粮食作物之一,含有A、B和D三个基因组,不同基因组的同源基因在多倍化过程中会出现功能分化或冗余。解析基因组同源基因表达调控机理有助于加深对功能基因的理解,为小麦新品种设计和培育奠定理论基础。中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心李俊明研究组在表观遗传学及染色质结构参
干细胞研究泰斗发国内期刊论文-解析基因调控新技术
据最新公布的SCI影响因子,中科院主办的《Cell Research》杂志从去年的8.19跃升至10.526,实现了10的突破。这份期刊主要收纳细胞生物学等领域前沿科学研究成果,近期干细胞研究领域的权威人物Rudolf Jaenisch教授带领研究组,在这一期刊上发表了关于一种新基因调控
研究揭示核心基因调控紫花苜蓿适应性与产量机制
近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所饲草育种与栽培科技创新团队解析了四拷贝核心基因调控紫花苜蓿适应性与产量平衡的机制,为紫花苜蓿广适高产育种提供了重要参考。相关研究成果发表在《自然—通讯》上。紫花苜蓿作为“牧草之王”,具有同源四倍体遗传特性,该特性不仅赋予其优良的生产性能和广泛的适应性,也为挖掘逆
器官边界区基因调控网络的系统生物学研究获进展
植物的侧生器官边界区将叶片等侧生器官(分化细胞)与顶端分生组织(干细胞)分隔开,确保器官的形成和干细胞的维持。此外,器官边界区产成侧生分生组织,进而形成侧芽,影响植物株型的建成。但由于边界区细胞数量较少,表型不易观察,因此对边界区形成的正反向遗传学研究都很困难,使得我们对边界区形成的调控机理知之
关于基因表达的翻译调控和翻译后调控的介绍
1、基因表达的翻译调控 翻译调控的效果不如转录调控或调控mRNA的稳定性,但也偶尔得到使用。抑制蛋白质翻译是毒素和抗生素的主要作用目标,因此它们可以通过超越其正常的基因表达控制来杀死细胞。蛋白质合成抑制剂包括抗生素新霉素和毒素蓖麻毒素。 2、基因表达的翻译后调控 翻译后修饰(PTM)是对蛋
简述基因治疗中外源基因表达的调控
研究人员大都不希望导入的外源基因过度表达,尤其在基因治疗中,我们希望外源基因表达的诱导和抑制能够得到控制。目前这方面的研究主要包括两个方面:效应元件调节和生理活动调节。效应元件的作用,例如类固醇类激素诱导的效应元件中,在卵清蛋白启动子5′远端019kb 处有一个雌激素效应元件,将具有此元件的基因
基因表达调控的方式有哪些
基因表达调控分为很多水平:1.DNA和染色体水平:基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化.2.转录水平调控(主要调控方式):转录起始、延伸、终止均有影响.原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作...
割裂基因的调控序列种类介绍
①在5′端转录起始点上游约20~30个核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。 TATA框是一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序,它是RNA聚合酶的重要的接触点,它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时,
简述基因调控的实用意义
细菌通过基因调控可以避免合成过量的氨基酸、核苷酸等物质。人们要利用细菌来生产这些物质,就必须使它们丧失有关的基因调控作用。在一般的野生型细菌中,阻遏蛋白和氨基酸等代谢最终产物结合后便作用于操纵基因而使转录停止。有两类突变型可以使细菌处于消阻遏状态而合成过量的氨基酸等物质。一类是操纵基因突变型,由
关于基因表达调控的技术简介
基因调控是现代分子生物学研究的中心课题之一。因为要了解动植物生长发育规律。形态结构特征及生物学功能,就必须搞清楚基因表达调控的时间和空间概念,掌握了基因调控机制,就等于掌握了一把揭示生物学奥秘的钥匙。基因表达调控主要表现在以下几个方面: ①转录水平上的调控; ②mRNA加工、成熟水平
基因表达的转录调控的介绍
可分为三种主要途径: 1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用); 2)调控转录因子与转录机制相互作用; 3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。 通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合
基因表达的翻译调控的介绍
翻译调控的效果不如转录调控或调控mRNA的稳定性,但也偶尔得到使用。抑制蛋白质翻译是毒素和抗生素的主要作用目标,因此它们可以通过超越其正常的基因表达控制来杀死细胞。蛋白质合成抑制剂包括抗生素新霉素和毒素蓖麻毒素。
基因的主要作用和调控方式
关系基因指导蛋白质合成;基因控制生物体;生物体性状由蛋白质直接体现。调控方法a.基因通过控制酶的合成来控制代谢过程,进而控制生物体性状;b.基因通过指导蛋白质的合成,控制蛋白质结构进而直接控制生物体的性状。
基因组合调控的作用
组合调控:一个调控元件不仅能控制一个基因的表达,还能同时控制其他基因的表达。作用:可以结合在基因上,启动多个基因的共同表达。
《科学》:首次发现调控人类睡眠基因
为揭示人类睡眠谜团打开了一扇窗户 美国加州大学旧金山分校网站8月13日发布新闻公告称,该校研究人员发现了调控人类睡眠时间的第一个基因。该发现为揭示人类睡眠谜团打开了一扇窗户,无疑将对未来人们的身心健康产生重大影响。相关研究成果刊登在8月14日出版的美国《科学》杂志上。 睡眠是每个人每
基因表达调控的基本规律
过表达,即表达过度,当基因表达(转录)的严格控制被打乱时,基因可能不恰当被“关闭”,或以高速度进行转录。高速转录导致大量mRNA产生,大量蛋白质(protein)产物出现。在RNA聚合酶的催化下,以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录。在双链DNA中,作为转录模板的链称为模板链或反义链;而不作为转
CRISPR新应用:寻找基因调控元件
人体内所有的组织都是由蛋白质构成的,每一种蛋白质都是由人类基因组中一段DNA“编码”的。 但是这些编码区仅占基因组的大约百分之1,而分散在基因组中的其他百分之99的序列,参与了调节基因的表达,或决定哪些编码区将被翻译成蛋白质,以及何时被翻译。 1月25日在《Nature Biotechnol
Science新文章:复杂的基因调控
由于人类和黑猩猩很大程度上共享相同的DNA,因此一直以来研究人员都采用基因调控变化来研究两者之间的进化分歧。然而现在来自芝加哥大学的科学家们发现,长期以来被视作是基因调控差异标志的mRNA表达水平,通常不能反映人类和黑猩猩之间蛋白质表达以及生物学功能差异。这项工作发表在《科学》(Science)
Nature揭示基因调控新机制
由来自新加坡国立癌症中心、法国国家科研中心分子细胞及遗传学研究所等处的科学家们组成的一个研究小组,获得了一项有关基因调控机制的重要研究发现。这项研究发表在1月30日的《自然》(Nature)杂志上。 利用新加坡国立癌症中心炎症生物学实验室Patrick Reilly博士开发的一种转基因
基因表达转录调控的主要途径
基因表达转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。
基因表达调控的方式有哪些
基因表达调控分为很多水平:1.DNA、染色体水平调控:基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化。2.转录水平调控(主要调控方式):转录起始、延伸、终止均有影响。原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作用元件和反式作用因子相互作用进行调控。3.转录后水平调控:主要指真核生物原初转录产物经
陈鹏博士PNAS基因的表达调控
魔法师的学徒开启了一个输水系统,但是却不能够停止它,很快水浸没到了他的脖子,他陷入到困境中。不同于这个无能的学徒,活细胞具有更好的设计:当它们激活一种基因时,它们就会将一种系统留作备用来关闭基因。细胞不想浪费能源来生成它们不再需要的蛋白。康奈尔大学的研究人员在新研究中确定了细胞利用的两种机制,并
关于基因表达的转录调控介绍
基因表达的转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。 通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白
基因表达调控的定义和方式
基因表达调控是生物体内基因表达的调节控制,使细胞中基因表达的过程在时间、空间上处于有序状态,并对环境条件的变化作出反应的复杂过程。基因表达的调控可在多个层次上进行,包括基因水平、转录水平、转录后水平、翻译水平和翻译后水平的调控。基因表达调控是生物体内细胞分化、形态发生和个体发育的分子基础。
基因表达调控的方式有哪些
基因表达调控分为很多水平:1.DNA和染色体水平:基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化.2.转录水平调控(主要调控方式):转录起始、延伸、终止均有影响.原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作...
原核生物基因表达调控途径
真核:转录和翻译分地点进行,转录在核,翻译在基质,翻译是第一个氨基酸是甲硫氨酸,调控方式复杂,多层次,区间性原核:转录和翻译都在基质甚至没转录完就开始翻译,翻译是第一个氨基酸为甲酰甲硫氨酸,调控机制多为操纵子原核生物没有内含子,dna复制和转录相对较容易也比较简单,调控几乎完全由基因上游的rna聚合
PNAS描述新型基因表达调控系统
报道:科学家们开发了一个调控基因表达的新系统,该系统只需将特定DNA序列简单插入到基因的任意一侧,就可以实现剂量依赖性的基因表达抑制。这项成果发表在美国国家科学院院刊PNAS杂志上,文章认为这一系统有望替代Tet基因表达调控系统。 这是首次采用适体酶核糖开关有条件地knockdown病毒基