CRISPR新应用:寻找基因调控元件

人体内所有的组织都是由蛋白质构成的,每一种蛋白质都是由人类基因组中一段DNA“编码”的。 但是这些编码区仅占基因组的大约百分之1,而分散在基因组中的其他百分之99的序列,参与了调节基因的表达,或决定哪些编码区将被翻译成蛋白质,以及何时被翻译。 1月25日在《Nature Biotechnology》杂志发表的一项研究中,麻省理工学院(MIT)和哈佛医学院的研究人员描述了一种新的技术,可系统而有效地在长的基因组片段中寻找调控元件。在这项技术的第一次应用过程中,他们发现了证据表明,当前人们对于基因调控的看法是不完整的。 本文资深作者、麻省理工学院电气工程和计算机科学教授David Gifford说:“传统的检测方法是将基因组切成小片段,并探讨它们是否足以推动基因的表达。这有两个局限性。第一,可能一些事情足以激活基因,但这并不意味着它是必要的。反之亦然:如果有什么事情是必要的,它可能就不是充足的。所以这些实验确实没有揭示关于......阅读全文

基因的分类及对应基因编码蛋白质的作用

把基因区分为结构基因和调节基因是着眼于这些基因所编码的蛋白质的作用:凡是编码酶蛋白、血红蛋白、胶原蛋白或晶体蛋白等蛋白质的基因都称为结构基因;凡是编码阻遏或激活结构基因转录的蛋白质的基因都称为调节基因。但是从基因的原初功能这一角度来看,它们都是编码蛋白质。根据原初功能(即基因的产物)基因可分为:①编

NRG1基因编码蛋白质的结构和作用

该基因编码的蛋白质是一种膜糖蛋白,可调节细胞信号传导,并在多器官系统的生长和发育中起到关键作用。通过选择性启动子的使用和剪接,该基因产生了一种不同亚型的特殊变体。这些亚型以组织特异性的方式表达,在结构上有显著差异,分为I型、II型、III型、IV型、V型和VI型。这种基因的失调与癌症、精神分裂症和双

科学家首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质

5月3日,《细胞—代谢》(Cell Metabolism)刊发了中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员刘兴国团队与合作者最新研究成果。他们改写了教科书中“线粒体基因组编码13个蛋白”的论断,首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质的“线粒体约定”新模式。“我们在研究中发现并证明了线粒体基因细胞色素b(

科学家首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质

  中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员刘兴国团队与合作者,首次发现线粒体可使用细胞质标准密码翻译第14个功能蛋白,打破了传统观点认为的线粒体基因只翻译13个蛋白的定律。相关研究近日发表于《细胞-代谢》。  “我们在研究中发现并证实,除13个线粒体基因编码的蛋白质外,线粒体基因细胞色素b(CYT

我国科学家首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质

热热闹闹的线粒体大厂中,线粒体基因细胞色素b(CYTB)兄弟的一项全新能力,已被我国科学家解锁出来。5月3日,国际期刊《细胞-代谢》刊发了中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国课题组的该项研究成果。他们首次发现并证实了线粒体基因细胞色素b可编码一个新的线粒体基因编码胞质翻译的蛋白CYTB-187A

相同基因编码的不同蛋白质亚型或许发挥着多样的功能

对于兄弟姐妹而言他们看似相似但实际上却并不相同,比如有些会成为花匠,有些会成为笛手,又有些会成为物理学家;当然相同的多样性也同样适用于人类单一细胞产生的蛋白质中,近日一项刊登于杂志Cell上的一项研究论文中,来自加利福尼亚大学等处的科学家进行了一项大规模性的研究,结果发现,由相同基因编码产生的“兄弟

基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT

  中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员,带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。该研究成果发表在Biochemical and Biop

《Nature-Biotechnology》新发现一批人类特异性蛋白质编码基因

2001年,人类基因组计划(Human Genome Project)的研究人员绘制了人类的基因蓝图,他们惊讶地发现,只有大约2万个基因能产生蛋白质。难道人类的基因只有普通小苍蝇的两倍吗?科学家们预期,远不止这些。现在,来自世界各地20个机构的研究人员汇集了超过7200个未被识别的基因片段,这些片段

-牛津大学校刊:人类蛋白质编码基因数量降至1.9万

  7月10日消息,据Science Daily报道,人体蛋白质的编码基因数量最早估计有10万个左右,人类基因组计划将其数量减少到了2万个左右。而最新研究再次将这一数量减少到了1.9万。  研究负责人、西班牙国立癌症研究中心的Alfonso Valencia说,几年前无人会想到,如此少的基因会创造出

广州健康院发现线粒体基因编码第14个蛋白质的“线粒体约定”新模式

5月3日,中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国课题组在《细胞-代谢》(Cell Metabolism)上发表了题为A novel protein CYTB-187AA encoded by the mitochondrial gene CYTB modulates mammalian early

调整基因编码蛋白的检测

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调整基因编码蛋白的检测

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Science、EMBO重要发现:编码蛋白质的lncRNAs

  不久之前,研究人员还认为RNA分为两类:生成蛋白质的编码RNAs和发挥结构作用的非编码 RNAs。发现小分子RNAs开启了全新的研究领域。然而现在研究人员兜了个圈又回到了原地,推测一些长链非编码RNAs可能生成了具有生物功能的小蛋白。近期发表在《EMBO Journal》杂志上的一项研究

GenOrigin——一种多物种蛋白质编码基因起源与演化的数据库

  2021年6月14日,JGG在线发表了华中农业大学陈振夏教授课题组题为“GenOrigin: A Comprehensive Protein-coding Gene Origination Database on the Evolutionary Timescale of Life”的研究论文。

利用LCMS/MS等方法-发现线粒体基因组编码蛋白质的新模式

图 线粒体编码基因CYTB的双重翻译模式  在国家自然科学基金项目(批准号:92254301、92357302、32025010)等资助下,中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国研究员团队在线粒体基因组编码研究方面取得进展,研究成果以“线粒体基因CYTB编码的新蛋白质CYTB-187AA调控哺乳动

CAST基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白质是一种内源性钙蛋白酶(钙依赖半胱氨酸蛋白酶)抑制剂它由一个N-末端结构域L和四个重复的钙蛋白酶抑制结构域(结构域1-4)组成,参与淀粉样前体蛋白的蛋白水解。calpain/calpastatin系统参与许多膜融合事件,如神经囊泡胞吐、血小板和红细胞聚集编码的蛋白质也被认为会影响编码

GAPDH基因编码功能及结构描述

这个基因编码甘油醛-3-磷酸脱氢酶蛋白家族的一个成员。编码的蛋白质已被鉴定为一个月光蛋白的基础上,它能执行机械上不同的功能该基因产物在糖代谢过程中起着重要的产能作用,在无机磷和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)的存在下,可逆的氧化磷酸化作用。编码的蛋白质在细胞核中还具有尿嘧啶DNA糖苷酶活性此外,这种蛋

CASR基因编码功能及结构描述

这个基因编码的蛋白质是一种质膜G蛋白偶联受体,能感觉到循环钙浓度的微小变化。编码的蛋白质将这些信息与细胞内的信号传导途径结合起来,这些信号传导途径可以调节甲状旁腺激素的分泌或肾离子的处理,因此这种蛋白质在维持矿物离子的稳态中起着至关重要的作用该基因突变是家族性低钙血症、新生儿重度甲状旁腺功能亢进和常

POLE正相关基因编码功能描述

该基因编码DNA聚合酶epsilon的催化亚单位。这种酶参与DNA修复和染色体DNA复制。该基因突变与结直肠癌12和面部畸形、免疫缺陷、利维多和身材矮小有关。This gene encodes the catalytic subunit of DNA polymerase epsilon. The

NFKBIA基因编码功能及结构描述

该基因编码NF-Kappa-B抑制剂家族的一个成员,该家族包含多个Ankrin重复结构域。编码蛋白与rel二聚体相互作用,抑制参与炎症反应的nf-kappa-b/rel复合物。编码蛋白通过核定位信号和crm1介导的核输出在细胞质和细胞核之间移动。在外胚层发育不良伴T细胞免疫缺陷常染色体显性遗传病的无

CROT基因编码功能及结构描述

这个基因编码肉碱/胆碱乙酰转移酶家族的一个成员。编码的蛋白质将4,8-二甲基壬酰基-CoA转化为相应的肉碱酯这种酯交换反应发生在过氧化物酶体中,是将长链酰基-CoA分子从过氧化物酶体转运到细胞质和线粒体所必需的。因此,蛋白质在脂质代谢和脂肪酸β氧化中起作用。已经描述了选择性剪接的转录变体。[由ref

FANCI基因编码功能及结构描述

fanconi贫血互补组(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也称为brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也称为brip1)、fancl、fancm和fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相

ENG基因编码功能及结构描述

该基因编码一种同二聚体跨膜蛋白,是血管内皮的主要糖蛋白。该蛋白是转化生长因子β受体复合物的一个组成部分,它与beta1和beta3肽具有高亲和力。该基因突变导致遗传性出血性毛细血管扩张症,也称为Osler-Rendu-Weber综合征1,常染色体显性遗传性多系统血管发育不良这个基因也可能与子痫前期和

CREBBP基因编码功能及结构描述

该基因广泛表达,参与多种不同转录因子的转录共激活。首先作为一种结合cAMP反应元件结合蛋白(creb)的核蛋白被分离出来,该基因通过将染色质重塑与转录因子识别结合,在胚胎发育、生长控制和体内平衡中发挥关键作用。该基因编码的蛋白质具有固有的组蛋白乙酰转移酶活性,也作为支架稳定与转录复合物的额外蛋白质相

常见癌基因编码蛋白的检测

实验步骤展开 经验交流

ITGAL基因编码功能及结构描述

ITGAL编码整合素αL链整合素是由α链和β链组成的异二聚体膜蛋白含有α整合素的I-结构域与β2链(ITGB2)结合形成整合素淋巴细胞功能相关抗原-1(LFA-1),在所有白细胞上表达LFA-1通过与其配体ICAMs 1-3(细胞间粘附分子1-3)的相互作用,在白细胞间粘附中发挥中心作用,并在淋巴细

FASLG基因编码功能及结构描述

这个基因是肿瘤坏死因子超家族的成员编码的跨膜蛋白的主要功能是通过与fas结合诱导细胞凋亡。Fas/FasLG信号通路是免疫系统调节的关键,包括T细胞的活化诱导的细胞死亡(AICD)和细胞毒性T淋巴细胞诱导的细胞死亡。它也与一些癌症的进展有关。该基因缺陷可能与系统性红斑狼疮(sle)有关。另外,已经描

常见癌基因编码蛋白的检测

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FANCL基因编码功能及结构描述

这个基因编码泛素连接酶,它是范科尼贫血互补组(FANC)的成员。这一组的成员通过组装成一个共同的核蛋白复合物而不是通过序列相似性来联系。该基因编码互补群L的蛋白,该蛋白介导FANCD2和FANCI的单泛素化。范科尼贫血是一种遗传异质性隐性疾病,其特征是细胞遗传不稳定、对dna交联剂过敏、染色体断裂增