CRISPR新应用:寻找基因调控元件
人体内所有的组织都是由蛋白质构成的,每一种蛋白质都是由人类基因组中一段DNA“编码”的。 但是这些编码区仅占基因组的大约百分之1,而分散在基因组中的其他百分之99的序列,参与了调节基因的表达,或决定哪些编码区将被翻译成蛋白质,以及何时被翻译。 1月25日在《Nature Biotechnology》杂志发表的一项研究中,麻省理工学院(MIT)和哈佛医学院的研究人员描述了一种新的技术,可系统而有效地在长的基因组片段中寻找调控元件。在这项技术的第一次应用过程中,他们发现了证据表明,当前人们对于基因调控的看法是不完整的。 本文资深作者、麻省理工学院电气工程和计算机科学教授David Gifford说:“传统的检测方法是将基因组切成小片段,并探讨它们是否足以推动基因的表达。这有两个局限性。第一,可能一些事情足以激活基因,但这并不意味着它是必要的。反之亦然:如果有什么事情是必要的,它可能就不是充足的。所以这些实验确实没有揭示关于......阅读全文
基因的分类及对应基因编码蛋白质的作用
把基因区分为结构基因和调节基因是着眼于这些基因所编码的蛋白质的作用:凡是编码酶蛋白、血红蛋白、胶原蛋白或晶体蛋白等蛋白质的基因都称为结构基因;凡是编码阻遏或激活结构基因转录的蛋白质的基因都称为调节基因。但是从基因的原初功能这一角度来看,它们都是编码蛋白质。根据原初功能(即基因的产物)基因可分为:①编
NRG1基因编码蛋白质的结构和作用
该基因编码的蛋白质是一种膜糖蛋白,可调节细胞信号传导,并在多器官系统的生长和发育中起到关键作用。通过选择性启动子的使用和剪接,该基因产生了一种不同亚型的特殊变体。这些亚型以组织特异性的方式表达,在结构上有显著差异,分为I型、II型、III型、IV型、V型和VI型。这种基因的失调与癌症、精神分裂症和双
科学家首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质
5月3日,《细胞—代谢》(Cell Metabolism)刊发了中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员刘兴国团队与合作者最新研究成果。他们改写了教科书中“线粒体基因组编码13个蛋白”的论断,首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质的“线粒体约定”新模式。“我们在研究中发现并证明了线粒体基因细胞色素b(
科学家首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质
中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员刘兴国团队与合作者,首次发现线粒体可使用细胞质标准密码翻译第14个功能蛋白,打破了传统观点认为的线粒体基因只翻译13个蛋白的定律。相关研究近日发表于《细胞-代谢》。 “我们在研究中发现并证实,除13个线粒体基因编码的蛋白质外,线粒体基因细胞色素b(CYT
我国科学家首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质
热热闹闹的线粒体大厂中,线粒体基因细胞色素b(CYTB)兄弟的一项全新能力,已被我国科学家解锁出来。5月3日,国际期刊《细胞-代谢》刊发了中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国课题组的该项研究成果。他们首次发现并证实了线粒体基因细胞色素b可编码一个新的线粒体基因编码胞质翻译的蛋白CYTB-187A
相同基因编码的不同蛋白质亚型或许发挥着多样的功能
对于兄弟姐妹而言他们看似相似但实际上却并不相同,比如有些会成为花匠,有些会成为笛手,又有些会成为物理学家;当然相同的多样性也同样适用于人类单一细胞产生的蛋白质中,近日一项刊登于杂志Cell上的一项研究论文中,来自加利福尼亚大学等处的科学家进行了一项大规模性的研究,结果发现,由相同基因编码产生的“兄弟
基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT
中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员,带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。该研究成果发表在Biochemical and Biop
《Nature-Biotechnology》新发现一批人类特异性蛋白质编码基因
2001年,人类基因组计划(Human Genome Project)的研究人员绘制了人类的基因蓝图,他们惊讶地发现,只有大约2万个基因能产生蛋白质。难道人类的基因只有普通小苍蝇的两倍吗?科学家们预期,远不止这些。现在,来自世界各地20个机构的研究人员汇集了超过7200个未被识别的基因片段,这些片段
-牛津大学校刊:人类蛋白质编码基因数量降至1.9万
7月10日消息,据Science Daily报道,人体蛋白质的编码基因数量最早估计有10万个左右,人类基因组计划将其数量减少到了2万个左右。而最新研究再次将这一数量减少到了1.9万。 研究负责人、西班牙国立癌症研究中心的Alfonso Valencia说,几年前无人会想到,如此少的基因会创造出
广州健康院发现线粒体基因编码第14个蛋白质的“线粒体约定”新模式
5月3日,中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国课题组在《细胞-代谢》(Cell Metabolism)上发表了题为A novel protein CYTB-187AA encoded by the mitochondrial gene CYTB modulates mammalian early
调整基因编码蛋白的检测
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调整基因编码蛋白的检测
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Science、EMBO重要发现:编码蛋白质的lncRNAs
不久之前,研究人员还认为RNA分为两类:生成蛋白质的编码RNAs和发挥结构作用的非编码 RNAs。发现小分子RNAs开启了全新的研究领域。然而现在研究人员兜了个圈又回到了原地,推测一些长链非编码RNAs可能生成了具有生物功能的小蛋白。近期发表在《EMBO Journal》杂志上的一项研究
利用LCMS/MS等方法-发现线粒体基因组编码蛋白质的新模式
图 线粒体编码基因CYTB的双重翻译模式 在国家自然科学基金项目(批准号:92254301、92357302、32025010)等资助下,中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国研究员团队在线粒体基因组编码研究方面取得进展,研究成果以“线粒体基因CYTB编码的新蛋白质CYTB-187AA调控哺乳动
GenOrigin——一种多物种蛋白质编码基因起源与演化的数据库
2021年6月14日,JGG在线发表了华中农业大学陈振夏教授课题组题为“GenOrigin: A Comprehensive Protein-coding Gene Origination Database on the Evolutionary Timescale of Life”的研究论文。
EGFR负相关基因编码功能描述
EGFR编码的蛋白是一种跨膜糖蛋白,也是表皮生长因子受体家族中的一员,该家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(erbB3)及HER4(erbB4),也属于受体酪氨酸激酶家族。EGFR作为细胞表面蛋白可与配体如表皮生长因子(EGF)结合,EGFR可被激活,
PTEN负相关基因编码功能描述
PTEN基因编码的蛋白具有蛋白磷酸酶和脂质磷酸酶活性,是第一个具有磷酸酶活性的抑癌基因,也是是继p53和Rb基因之后,与肿瘤发生密切相关的一种抑癌基因,其主要机制因为PTEN是PI3K/Akt通路的主要负调控因子。PTEN的功能缺陷在人类多种肿瘤中广泛存在。
常见癌基因编码蛋白的检测
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ITPA基因编码功能及结构描述
该基因编码一种肌苷三磷酸焦磷酸水解酶。编码蛋白水解肌苷三磷酸和脱氧肌苷三磷酸,得到一磷酸核苷酸和二磷酸。这种蛋白质是ham1 ntpase蛋白家族的一员,存在于细胞质中,起着同二聚体的作用。编码蛋白的缺陷可导致肌苷三磷酸焦磷酸化酶缺乏,从而导致红细胞中itp的积聚。交替剪接导致多个转录变体。[由Re
GOPC基因编码功能及结构描述
该基因编码一个具有PDZ结构域的高尔基蛋白PDZ结构域是球状的,含有它们的蛋白质通过C末端附近的短基序与其他蛋白质结合缺乏原代蛋白的小鼠有球形精子症,并且不育。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2011年12月]This gene encodes a Golgi prot
MGMT基因编码功能及结构描述
烷基化剂是一种有效的致癌物,可导致细胞死亡、突变和癌症。该基因编码的蛋白质是一种DNA修复蛋白,参与细胞抵御烷基化剂的诱变和毒性。这种蛋白催化甲基从O(6)-烷基鸟嘌呤和DNA的其他甲基化部分转移到它自己的分子,从而修复毒性损伤。基因启动子甲基化与多种癌症类型有关,包括结直肠癌、肺癌、淋巴瘤和胶质母
GAST基因编码功能及结构描述
胃泌素是一种激素,其主要功能是刺激胃粘膜分泌盐酸,从而抑制胃泌素的形成这种激素也是胃肠道上皮细胞有丝分裂因子胃泌素有两种生物活性肽形式,G34和G17[由RefSeq提供,2008年7月]Gastrin is a hormone whose main function is to stimulate
HGF基因编码功能及结构描述
该基因编码转录因子缺氧诱导因子-1(hif-1)的α亚单位,是由α亚单位和β亚单位组成的异二聚体。HIF-1通过激活许多基因的转录,包括那些参与能量代谢、血管生成、细胞凋亡和其他蛋白质产物增加氧气输送或促进对缺氧的代谢适应的基因,作为细胞和全身对缺氧的稳态反应的主要调节器。因此,HIF-1在胚胎血管
MAGOh基因编码功能及结构描述
果蝇的mago-nashi(无孙)基因突变产生的后代在种质组合和种系发育方面存在缺陷这个基因编码哺乳动物的mago-nashi同源基因在哺乳动物中,mRNA的表达并不局限于原生质,而是在成体组织中广泛表达,可通过血清刺激静止成纤维细胞诱导表达[由RefSeq提供,2008年7月]\Drosophil
CYLD基因编码功能及结构描述
该基因编码一种细胞质蛋白,具有三个细胞骨架相关蛋白-甘氨酸保守(cap-gly)结构域,作为一种去氢酶。该基因突变与圆筒状瘤、多发性家族性毛发上皮瘤和brooke-spiegler综合征有关。交替转录剪接变体,编码不同的亚型,已经被描述出来。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene
GUSB基因编码功能及结构描述
该基因编码一种降解糖胺聚糖的水解酶,包括硫酸乙酰肝素、硫酸皮肤素和硫酸软骨素。这种酶形成一个定位于溶酶体的四聚体该基因突变导致粘多糖病第七型。选择性剪接导致多个转录变体人类基因组中有许多这个位点的假基因。[由RefSeq提供,2014年5月]This gene encodes a hydrolase
FANCL基因编码功能及结构描述
这个基因编码泛素连接酶,它是范科尼贫血互补组(FANC)的成员。这一组的成员通过组装成一个共同的核蛋白复合物而不是通过序列相似性来联系。该基因编码互补群L的蛋白,该蛋白介导FANCD2和FANCI的单泛素化。范科尼贫血是一种遗传异质性隐性疾病,其特征是细胞遗传不稳定、对dna交联剂过敏、染色体断裂增
GGH基因编码功能及结构描述
该基因通过去除γ链多聚谷氨酸盐和谷氨酸盐来催化叶酸聚γ-谷氨酸盐和抗多聚γ-谷氨酸盐的水解。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene catalyzes the hydrolysis of folylpoly-gamma-glutamates and antifolylpoly-ga
ARFRP基因编码功能及结构描述
该基因编码的蛋白是一种膜相关gtp酶,定位于质膜,与adp核糖基化因子(arf)和arf样蛋白(arl)有关。这个基因在跨高尔基体网络和内切体之间的膜运输中起作用。另外,还发现了编码不同亚型的剪接转录变体。[由RefSeq提供,2012年5月]The protein encoded by this