CRISPR新应用:寻找基因调控元件

人体内所有的组织都是由蛋白质构成的,每一种蛋白质都是由人类基因组中一段DNA“编码”的。 但是这些编码区仅占基因组的大约百分之1,而分散在基因组中的其他百分之99的序列,参与了调节基因的表达,或决定哪些编码区将被翻译成蛋白质,以及何时被翻译。 1月25日在《Nature Biotechnology》杂志发表的一项研究中,麻省理工学院(MIT)和哈佛医学院的研究人员描述了一种新的技术,可系统而有效地在长的基因组片段中寻找调控元件。在这项技术的第一次应用过程中,他们发现了证据表明,当前人们对于基因调控的看法是不完整的。 本文资深作者、麻省理工学院电气工程和计算机科学教授David Gifford说:“传统的检测方法是将基因组切成小片段,并探讨它们是否足以推动基因的表达。这有两个局限性。第一,可能一些事情足以激活基因,但这并不意味着它是必要的。反之亦然:如果有什么事情是必要的,它可能就不是充足的。所以这些实验确实没有揭示关于......阅读全文

基因的分类及对应基因编码蛋白质的作用

把基因区分为结构基因和调节基因是着眼于这些基因所编码的蛋白质的作用:凡是编码酶蛋白、血红蛋白、胶原蛋白或晶体蛋白等蛋白质的基因都称为结构基因;凡是编码阻遏或激活结构基因转录的蛋白质的基因都称为调节基因。但是从基因的原初功能这一角度来看,它们都是编码蛋白质。根据原初功能(即基因的产物)基因可分为:①编

NRG1基因编码蛋白质的结构和作用

该基因编码的蛋白质是一种膜糖蛋白,可调节细胞信号传导,并在多器官系统的生长和发育中起到关键作用。通过选择性启动子的使用和剪接,该基因产生了一种不同亚型的特殊变体。这些亚型以组织特异性的方式表达,在结构上有显著差异,分为I型、II型、III型、IV型、V型和VI型。这种基因的失调与癌症、精神分裂症和双

科学家首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质

  中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员刘兴国团队与合作者,首次发现线粒体可使用细胞质标准密码翻译第14个功能蛋白,打破了传统观点认为的线粒体基因只翻译13个蛋白的定律。相关研究近日发表于《细胞-代谢》。  “我们在研究中发现并证实,除13个线粒体基因编码的蛋白质外,线粒体基因细胞色素b(CYT

科学家首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质

5月3日,《细胞—代谢》(Cell Metabolism)刊发了中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员刘兴国团队与合作者最新研究成果。他们改写了教科书中“线粒体基因组编码13个蛋白”的论断,首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质的“线粒体约定”新模式。“我们在研究中发现并证明了线粒体基因细胞色素b(

我国科学家首次发现线粒体基因编码第14个蛋白质

热热闹闹的线粒体大厂中,线粒体基因细胞色素b(CYTB)兄弟的一项全新能力,已被我国科学家解锁出来。5月3日,国际期刊《细胞-代谢》刊发了中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国课题组的该项研究成果。他们首次发现并证实了线粒体基因细胞色素b可编码一个新的线粒体基因编码胞质翻译的蛋白CYTB-187A

相同基因编码的不同蛋白质亚型或许发挥着多样的功能

对于兄弟姐妹而言他们看似相似但实际上却并不相同,比如有些会成为花匠,有些会成为笛手,又有些会成为物理学家;当然相同的多样性也同样适用于人类单一细胞产生的蛋白质中,近日一项刊登于杂志Cell上的一项研究论文中,来自加利福尼亚大学等处的科学家进行了一项大规模性的研究,结果发现,由相同基因编码产生的“兄弟

基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT

  中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员,带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。该研究成果发表在Biochemical and Biop

《Nature-Biotechnology》新发现一批人类特异性蛋白质编码基因

2001年,人类基因组计划(Human Genome Project)的研究人员绘制了人类的基因蓝图,他们惊讶地发现,只有大约2万个基因能产生蛋白质。难道人类的基因只有普通小苍蝇的两倍吗?科学家们预期,远不止这些。现在,来自世界各地20个机构的研究人员汇集了超过7200个未被识别的基因片段,这些片段

-牛津大学校刊:人类蛋白质编码基因数量降至1.9万

  7月10日消息,据Science Daily报道,人体蛋白质的编码基因数量最早估计有10万个左右,人类基因组计划将其数量减少到了2万个左右。而最新研究再次将这一数量减少到了1.9万。  研究负责人、西班牙国立癌症研究中心的Alfonso Valencia说,几年前无人会想到,如此少的基因会创造出

广州健康院发现线粒体基因编码第14个蛋白质的“线粒体约定”新模式

5月3日,中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国课题组在《细胞-代谢》(Cell Metabolism)上发表了题为A novel protein CYTB-187AA encoded by the mitochondrial gene CYTB modulates mammalian early

调整基因编码蛋白的检测

实验步骤             展开

调整基因编码蛋白的检测

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Science、EMBO重要发现:编码蛋白质的lncRNAs

  不久之前,研究人员还认为RNA分为两类:生成蛋白质的编码RNAs和发挥结构作用的非编码 RNAs。发现小分子RNAs开启了全新的研究领域。然而现在研究人员兜了个圈又回到了原地,推测一些长链非编码RNAs可能生成了具有生物功能的小蛋白。近期发表在《EMBO Journal》杂志上的一项研究

利用LCMS/MS等方法-发现线粒体基因组编码蛋白质的新模式

图 线粒体编码基因CYTB的双重翻译模式  在国家自然科学基金项目(批准号:92254301、92357302、32025010)等资助下,中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国研究员团队在线粒体基因组编码研究方面取得进展,研究成果以“线粒体基因CYTB编码的新蛋白质CYTB-187AA调控哺乳动

GenOrigin——一种多物种蛋白质编码基因起源与演化的数据库

  2021年6月14日,JGG在线发表了华中农业大学陈振夏教授课题组题为“GenOrigin: A Comprehensive Protein-coding Gene Origination Database on the Evolutionary Timescale of Life”的研究论文。

INHA基因编码功能及结构描述

这个基因编码tgfβ(转化生长因子β)超家族的一个成员。编码的前蛋白经蛋白质水解处理产生多肽产物,包括抑制素a和b蛋白复合物的α亚单位。这些复合物对垂体分泌的促卵泡激素负性调节。抑制素还参与调控许多细胞过程,包括细胞增殖、凋亡、免疫反应和激素分泌。该基因突变可能与男性不育和女性卵巢早衰有关。[由Re

CBFB基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白质是属于pebp2/cbf转录因子家族的异二聚体核心结合转录因子的β亚单位,该转录因子家族主要调控造血(例如runx1)和成骨(例如runx2)特异性基因的宿主。β亚单位是一种非DNA结合调节亚单位;当复合物与各种增强子和启动子(包括小鼠白血病病毒、多瘤病毒增强子、T细胞受体增强子和

MCC基因编码功能及结构描述

该基因是一个候选的大肠肿瘤抑制基因,被认为是负调控细胞周期进程小鼠的同源基因表达一种与质膜和膜细胞器相关的磷蛋白,而小鼠蛋白的过度表达抑制了进入s期。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene is a candidate colorectal

CRKL基因编码功能及结构描述

该基因编码一个包含sh2和sh3(SRC同源)结构域的蛋白激酶,该结构域已被证明激活ras和jun激酶信号通路并以ras依赖的方式转化成纤维细胞。是bcr-abl酪氨酸激酶的底物,在bcr-abl的成纤维细胞转化中起作用,可能致癌。This gene encodes a protein kinase

GOPC基因编码功能及结构描述

该基因编码一个具有PDZ结构域的高尔基蛋白PDZ结构域是球状的,含有它们的蛋白质通过C末端附近的短基序与其他蛋白质结合缺乏原代蛋白的小鼠有球形精子症,并且不育。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2011年12月]This gene encodes a Golgi prot

MPL基因编码功能及结构描述

MPL基因编码的蛋白为促血小板生成素受体,与NF-κB以及JAK/STAT信号通路相关。

ITK基因编码功能及结构描述

该基因编码在t细胞中表达的细胞内酪氨酸激酶。该蛋白包含sh2和sh3两个结构域,它们通常存在于细胞内激酶中。它被认为在t细胞增殖和分化中起作用。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene encodes an intracellular tyrosine kinase expresse

CYBA基因编码功能及结构描述

细胞色素b由轻链(α)和重链(β)组成该基因编码光,α亚基,已经提出作为吞噬细胞的杀微生物氧化酶系统的主要成分。该基因的突变与常染色体隐性遗传性慢性肉芽肿性疾病(CGD)有关,其特征在于活化的吞噬细胞的失败产生超氧化物,这对于这些细胞的杀微生物活性是重要的。[由RefSeq提供,2008年7月]Cy

AREG基因编码功能及结构描述

这个基因编码的蛋白质是表皮生长因子家族的一员。它是一种自分泌生长因子,也是星形细胞、雪旺细胞和成纤维细胞的有丝分裂原。与表皮生长因子(egf)和转化生长因子α(tgfα)有关。该蛋白与EGF/TGFα受体相互作用,促进正常上皮细胞的生长,抑制某些侵袭性癌细胞系的生长。在乳腺、卵母细胞和骨组织发育中也

ATIC基因编码功能及结构描述

该基因编码一种双功能蛋白,对从头嘌呤生物合成途径的最后两个步骤进行催化。N-末端结构域具有磷酸核糖氨基咪唑甲酰胺甲酰转移酶活性,C-末端结构域具有IMP环水解酶活性。该基因突变导致AICA核糖尿症。[由RefSeq提供,2009年9月]This gene encodes a bifunctional

LTK基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白质是酪氨酸激酶ros/胰岛素受体家族的成员。蛋白质酪氨酸特异性磷酸化是控制细胞生长和分化的多种途径的关键。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2008年10月]The protein encoded by this gene is a member of t

ATM正相关基因编码功能描述

ATM基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,这种蛋白是一种重要的细胞周期检查点激酶,通过磷酸化调控下游一系列重要蛋白,包括抑癌蛋白p53和BRCA1、检查点激酶CHK2、检查点蛋白RAD17和RAD9以及DNA修复蛋白NBS1。ATM和与其密切相关的蛋白ATR被认为是在细胞周期调控以及DNA损伤

KALRN基因编码功能及结构描述

亨廷顿病(hd)是一种以纹状体神经元丧失为特征的神经退行性疾病,是由hd蛋白亨廷顿蛋白中的多聚谷氨酸束扩张引起的。该基因编码一种与huntingtin相关蛋白1相互作用的蛋白质,huntingtin相关蛋白1是一种huntingtin结合蛋白,可能在囊泡运输中发挥作用。[由RefSeq提供,2016

ITK基因编码功能及结构描述

该基因编码在t细胞中表达的细胞内酪氨酸激酶。该蛋白包含sh2和sh3两个结构域,它们通常存在于细胞内激酶中。它被认为在t细胞增殖和分化中起作用。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene encodes an intracellular tyrosine kinase expresse