上海药物所阐明代谢性疾病生化机理并发现潜在药物靶标
蛋白翻译后修饰是细胞生命活动的基本形式之一，也是细胞精细调控其诸多生理过程关键生物学通路之一，并与很多疾病的发生发展休戚相关。因此，负责蛋白翻译后修饰的调控酶成为当今新药研究领域的前沿和热点靶标。以其中蛋白激酶为例，近十年来在美国年销售额超过十亿美元的抗肿瘤药超过一半是靶向此类蛋白翻译后修饰调控酶。 中国科学院上海药物研究所化学蛋白组学研究中心紧紧围绕研究所“一三五”规划，聚焦蛋白翻译后修饰及其调控酶药靶的发现和功能确证，与美国芝加哥大学、杜克大学等单位合作，首次报道了细胞内一种新型蛋白翻译后修饰通路—赖氨酸戊二酰化，发现其修饰调控Srituin家族的去酰化酶SIRT5，以及其修饰底物和遗传病的相关性。 该项研究工作通过综合运用修饰抗体、生物质谱和生物化学等方法，发现了赖氨酸戊二酰化这种细胞中新的蛋白翻译后修饰方式。通过运用化学和生物化学等多种方法，证实了此修饰存在于生物体内，且从原核生物到高等哺乳动物......阅读全文
相分离调控蛋白翻译与生物节律的分子机制
清华大学生命科学学院吝易团队与杨雪瑞团队合作揭示了细胞利用相分离对蛋白质翻译进行精细的时空调控，从而维持昼夜节律周期的分子机制。相关成果以“区室化周期性蛋白质翻译精确调控生物节律（Circadian clocks are modulated by compartmentalized oscill
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验 实验步骤 一、引言 蛋 白 质 翻 译 后 修 饰 (P T
清华教授发文：首次揭示组蛋白巴豆酰化特异识别机制
生物通报道：组蛋白翻译后修饰是一类重要的表观遗传调控事件，被认为构成一类“组蛋白密码”，控制着染色质层面的遗传信息解读，在基因表达以及细胞命运决定等生命过程中发挥着关键作用。 来自清华大学医学院李海涛研究团队近期在组蛋白翻译后修饰研究领域取得了重要突破：他们通过对表观调控因子AF9和YEATS
组蛋白去乙酰化酶抑制剂的简介
组蛋白去乙酰化酶抑制剂（histone deacetylase inhibitor，HDACI），简称HDACIs，是一类化合物，有干扰与组蛋白去乙酰化酶的功能。 组蛋白去乙酰化酶抑制剂通常可分为两大类：NAD + -依赖性酶和Zn2 +依赖性酶。Zn2+依赖性蛋白酶包括HDACsI、II、IV
关于体外翻译翻译系统的选择介绍
虽然不是必须，但一般说，选用真核系统来翻译真核序列，选用原核系统来翻译原核序列。 如果一个系统存在功能上或抗原的交叉反应，就得选择另一个系统。使用微粒体膜进行翻译后修饰或加工一般只与兔网织红细胞系统兼容。仅在某些特定条件下麦胚芽翻译系统才与微粒体膜兼容。
上海药物所发现赖氨酸丙二酰化的新蛋白修饰及其调控酶
蛋白翻译后修饰是调控诸多生物学过程和疾病的主要生物学通路之一，因而，蛋白翻译后修饰通路研究正成为目前新药研发的重要热点之一。近日，中科院上海药物研究所联合美国芝加哥大学Ben May癌症研究所赵英明教授实验室建立的中科院上海药物所化学蛋白质组学研究中心发现了细胞中赖氨酸丙二酰化的新蛋白修饰及
水生所蛋白质翻译后修饰组学研究获进展
蛋白质的翻译后修饰，如磷酸化、乙酰化等，是调节蛋白质生物学功能的关键步骤，是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础，也是细胞信号网络调控的重要靶点。由于翻译后修饰蛋白质在样本中含量低且动态范围广，其研究极具挑战性。近期，中国科学院水生生物研究所葛峰研究员学科组在蛋白质翻译后修饰组学及其功能方
什么是乙酰化？常见的乙酰化剂
乙酰化就是将有机化合物分子中的氮、氧、碳原子上引入乙酰基CH3CO-的反应，最常见的是组蛋白乙酰化。常用氯乙酰和醋酸酐等作为乙酰化剂。
Cell－Metabolism：代谢性疾病生化机理并发现新的潜在药物靶标
蛋白翻译后修饰是细胞生命活动的基本形式之一，也是细胞精细调控其诸多生理过程关键生物学通路之一，并与很多疾病的发生发展休戚相关。因此，负责蛋白翻译后修饰的调控酶成为当今新药研究领域的前沿和热点靶标。以其中蛋白激酶为例，近十年来在美国年销售额超过十亿美元的抗肿瘤药超过一半是靶向此类蛋白翻译后修饰调控
翻译后修饰
中文名翻译后修饰外文名Post-translational modification定义翻译后修饰是指蛋白质在翻译后的化学修饰。对于大部分的蛋白质来说，这是蛋白质生物合成的较后步骤。
翻译的起始
（一）原核细胞原核细胞的翻译起始过程大概可以分为以下几个过程：（1）翻译起始因子IF3结合到小亚基的E位点，同时也横跨至P位点；（这一过程在起始之初就已经完成）起始因子IF1结合至A位点；（2）起始因子IF2·GTP被IF3和IF1招募至P位点；（3）起始fMet·tRNA一方面被mRNA起始密码子
上海药物所阐明代谢性疾病生化机理并发现潜在药物靶标
蛋白翻译后修饰是细胞生命活动的基本形式之一，也是细胞精细调控其诸多生理过程关键生物学通路之一，并与很多疾病的发生发展休戚相关。因此，负责蛋白翻译后修饰的调控酶成为当今新药研究领域的前沿和热点靶标。以其中蛋白激酶为例，近十年来在美国年销售额超过十亿美元的抗肿瘤药超过一半是靶向此类蛋白翻译
中外学者合作Cell子刊解析蛋白翻译后修饰
来自密西根大学，中科院上海药物研究所，芝加哥大学等处的研究人员发表了题为“SIRT5-Mediated Lysine Desuccinylation Impacts Diverse Metabolic Pathways”的文章，首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底
上海药物所合作在赖氨酸琥珀酰修饰通路研究中取得进展
蛋白翻译后修饰对蛋白质的结构和功能起着关键作用，是细胞精细调节生理活动的关键之一。因而，蛋白翻译后修饰通路研究是目前新药研发的重要热点之一。 中科院上海药物研究所化学蛋白质组学研究中心与美国芝加哥大学、密西根大学合作研究，首次在哺乳动物细胞中对去乙酰化调控酶Sirt5调控的琥珀酰底物进行了
科研人员创造出含有定点共翻译修饰核小体的酵母菌
随着蛋白质谱技术的发展，许多组蛋白赖氨酸残基的酰化修饰被鉴定出来，其中巴豆酰化修饰是一类在酵母、哺乳动物等真核生物中保守存在的组蛋白酰化修饰。自2011年被发现以来，巴豆酰化修饰俨然成为了领域内的研究热点。这是因为该修饰是一种重要的表观遗传机制调节基因转录的翻译后修饰。尽管巴豆酰化和乙酰化基团的
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验4
五、质 谱 分 析质谱仪器的多种设计和配置都支持蛋白质组的动态性质及其相关 P T M 的研究工作 。对 鉴 定 PTM 而言，质谱仪的最重要的两个特征（feature) 就是其质量准确度和分辨率 。与蛋白质鉴定不同 (其通常是基于鉴定同一蛋白质中的多个独立肽段)P T M 必须通过单独的 MS/M
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（三）
2.2 糖基化糖 基 化 是 一 种 常 见 的 P T M , 并 且 已 经 证 明 能 够 影 响 酶 的 活 性 、蛋 白 质 定 位 、稳 定 性 、信 号 转 导 、细 胞 黏 附 和 蛋 白 质 相 互 作 用 (Spiro, 2002k 目 前 已 经 发 现 在 肿 瘤 恶
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验6
七、P T M 的定量分析 当研究 P T M 的生物学意义时，如能了解一个特定修饰或一组P T M 的相对或绝对丰度通常会有帮助。这样可以将不同的生物样品间的目的修饰进行直接比较。例如, 将正常与疾病状态下细胞或组织内某一 P T M 的丰度进行比较。定量分析这些变化能够帮助
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（一）
一、引言蛋 白 质 翻 译 后 修 饰 (P T M ) 在 细 胞 生 物 调 节 中 发 挥 着 基 本 作 用 。 P T M 是 m R N A 翻译 后 蛋 白 质 的 酶 促 共 价 化 学 修 饰 。蛋 白 质 化 学 修 饰 非 常 重 要 ，因 为 它 们 会 潜 在 地
Molecular－Cell：蛋白质翻译后修饰调控植物胁迫反应
甲基化修饰与一氧化氮(nitric oxide； NO)依赖的亚硝基化修饰是高度保守的蛋白质翻译后修饰，这两类修饰参与调控众多生物学过程，包括调控非生物胁迫反应。但二者调控非生物胁迫的分子机制不甚清楚。 中国科学院遗传与发育生物学研究所左建儒研究组在亚硝基化蛋白质组学研究中发现拟南芥蛋白质
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验3
三、蛋白质的硝化修饰酪氨酸、色氨酸、甲硫氨酸、半胱氨酸侧链的硝化与亚硝化作用构成了蛋白质硝化PT M 的主要部分。这些加成反应由发育、氧化应激及衰老过程中产生的活性氮介导。活性氮的增加是由一氧化氮和活性氧的过度反应或调控紊乱造成的（Yeo et al.，2008)。活性氮和活性氧能够靶向于DNA、脂
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（二）
二、用 于 鉴 定 P T M 的富 集 技 术2.1 磷酸化丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸残基的可逆磷酸化也许是研究最为深人的 PT M 。蛋白质磷酸化信号网络介导细胞对与不同的应激因子、生长因子、细胞因子以及细胞间相互作用作出响应。憐酸化还影响多种细胞进程，如增殖、凋亡 、迁移 、转录和蛋白
RNA翻译与蛋白质折叠之间的微妙舞蹈
在蛋白质的合成过程中，RNA翻译会影响蛋白质的折叠，而蛋白质折叠也会影响RNA的翻译。 在过去的十年里，我们对细胞内蛋白质合成方式的认知取得了快速的增长，其中包括蛋白质合成的各个基本步骤：转运RNA（transfer RNA， tRNA）是如何高保真、高速率地对信使RNA（messenger
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验6
七、P T M 的定量分析当研究 P T M 的生物学意义时，如能了解一个特定修饰或一组P T M 的相对或绝对丰度通常会有帮助。这样可以将不同的生物样品间的目的修饰进行直接比较。例如, 将正常与疾病状态下细胞或组织内某一 P T M 的丰度进行比较。定量分析这些变化能够帮助深人了解 P T M 在
翻译全局控制改善外源蛋白质的折叠效率
近日，华南理工大学林影教授和暨南大学张弓教授的团队在Biotechnology for Biofuels杂志（生物工程类一区）上发表文章，使用翻译全局控制方法，改善外源蛋白质在毕赤酵母中表达的折叠效率，有效提高活性蛋白质产量。据悉，这是翻译组调控在真核生物细胞工厂底盘细胞中的首次成功应用，极大地
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（五）
六、CID、ECD和 ETD的对比基于质谱的蛋白质组学分析依赖于气相中肽段在低碰撞能量下断裂, 在质量谱图中形成峰。进而通过峰图确定肽段序列，再推断出相关蛋白质。完成肽段断裂最主要的方法就是碰撞诱导解离（collision induced dissociation，C I D ) ( S w
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验（五）
六、CID、ECD和 ETD的对比 基于质谱的蛋白质组学分析依赖于气相中肽段在低碰撞能量下断裂, 在质量谱图中形成峰。进而通过峰图确定肽段序列，再推断出相关蛋白质。完成肽段断裂最主要的方法就是碰撞诱导解离（collision induced dissociation，C I
关于蛋白质合成真核生物翻译起始的特点
一、真核生物翻译起始的特点： 1.真核起始甲硫氨酸不需甲酰化。 2.真核mRNA没有S-D序列，但5'端帽子结构与其在核蛋白体就位相关。帽结合蛋白（CBP）可与mRNA帽子结合，促进mRNA与小亚基结合。 3.肽链的延长 ：延长阶段为不断循环进行的过程，也称核蛋白体循环。分为进位、
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验5
六、CID、ECD和 ETD的对比基于质谱的蛋白质组学分析依赖于气相中肽段在低碰撞能量下断裂, 在质量谱图中形成峰。进而通过峰图确定肽段序列，再推断出相关蛋白质。完成肽段断裂最主要的方法就是碰撞诱导解离（collision induced dissociation，C I D ) ( S w a n
翻译后修饰蛋白质的定性和定量实验2
二、用 于 鉴 定 P T M 的富 集 技 术2.1 磷酸化丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸残基的可逆磷酸化也许是研究最为深人的 PT M 。蛋白质磷酸化信号网络介导细胞对与不同的应激因子、生长因子、细胞因子以及细胞间相互作用作出响应。憐酸化还影响多种细胞进程，如增殖、凋亡 、迁移 、转录和蛋白质翻译（W