水生所蛋白质翻译后修饰组学研究获进展
蛋白质的翻译后修饰，如磷酸化、乙酰化等，是调节蛋白质生物学功能的关键步骤，是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础，也是细胞信号网络调控的重要靶点。由于翻译后修饰蛋白质在样本中含量低且动态范围广，其研究极具挑战性。近期，中国科学院水生生物研究所葛峰研究员学科组在蛋白质翻译后修饰组学及其功能方面展开了深入的研究并取得了系列进展。 在蛋白质磷酸化修饰方面，该学科组与研究所相关团队合作，综合应用最新的蛋白和肽段分离技术、TiO2磷酸肽富集技术和高分辨质谱分析技术，先后研究了磷酸化在蓝藻光合作用中的重要作用(Journal of Proteome Research 2013, 12 (4):1909–1923)，构建了嗜热四膜虫的磷酸化调控网络(Molecular & Cellular Proteomics 2014, 13 (2): 503 -519)，并发现磷酸化修饰在三角褐指藻胁迫响应中起重要作用（Journal......阅读全文
蛋白质乙酰化修饰的精细调控
近期，国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》在线发表了中国科学技术大学生命科学学院施蕴渝教授与姚雪彪教授研究组的合作成果，文章标题为EB1 acetylation by P300/CBP-associated factor (PCAF) ensures accurate kinetochore -m
蛋白质N磷酸化修饰富集方法进展
蛋白质N-磷酸化修饰富集方法进展 江波1, 高博2, 魏淑娴2, 梁振1, 张丽华1,*, 张玉奎1 1.中国科学院大连化学物理研究所,医学蛋白质组全国重点实验室,国家色谱研究中心, 中国科学院分离分析化学重点实验室,辽宁 大连 116023 2.中国石油大学(华东)化学化工学院,山东 青
磷酸化多肽及其修饰方法
蛋白质磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰，20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中，大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关，如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质
磷酸化多肽及其修饰方法
蛋白质磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰，20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中，大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关，如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质
磷酸化多肽及其修饰方法
蛋白质磷酸化是生物界最普遍，也是最重要的一种蛋白质翻译后修饰，20世纪50年代以来一直被生物学家看作是一种动态的生物调节过程。在细胞中，大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关，如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质及多
科学家重组真核生物tRNA乙酰化修饰活力并实现RNA定点高效乙酰化修饰
4月13日，中国科学院分子细胞科学卓越创新中心研究员周小龙团队，在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上以Activity reconstitution of Kre33 and Tan1 reveals a molecular ruler mechanism in euka
水生所蛋白质翻译后修饰组学研究获进展
蛋白质的翻译后修饰，如磷酸化、乙酰化等，是调节蛋白质生物学功能的关键步骤，是蛋白质动态反应和相互作用的一个重要分子基础，也是细胞信号网络调控的重要靶点。由于翻译后修饰蛋白质在样本中含量低且动态范围广，其研究极具挑战性。近期，中国科学院水生生物研究所葛峰研究员学科组在蛋白质翻译后修饰组学及其功能方
表观遗传学修饰
组蛋白修饰 表观遗传学是指表观遗传学改变 (DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA 如 miRNA) 对 表观基因组基因表达的调节，这种调节不依赖基因序列的改变且可遗传表观。因素如 DNA 甲基化、组蛋白修饰和 miRNA 是对环境刺激因素变化的反映，这些表观遗传学因素相互作用以调节基因
多肽磷酸化修饰及检测方法
磷酸化影响着细胞生命的方方面面。在细胞中，大概有1/3的的蛋白质被认为是通过磷酸化修饰的。蛋白质的磷酸化修饰与多种生物学过程密切相关，如DNA损伤修复、转录调节、信号传导、细胞凋亡的调节等。磷酸化蛋白质及多肽的研究可以帮助人们阐述上述过程的机理，进一步认识生命活动的本质。肽谷生物依据自身原料优势和技
磷酸化修饰蛋白质组学共性关键技术研究获突破
近日，广东省农业科学院农业生物基因研究中心晏石娟团队联合加拿大约克大学、德国马普分子植物生理研究所等研究人员在磷酸化修饰蛋白质组学共性关键技术研发方面取得重大突破，首次搭建全自动在线磷酸化蛋白质组学分析技术平台，解决了磷酸化蛋白质组学研究的一大瓶颈。相关研究以农业生物基因研究中心为第一完成单位在线发
表观遗传之组蛋白修饰—组蛋白乙酰化
大家好，我又来啦~~今天给大家放送的是表观遗传之组蛋白修饰相关的内容噢，组蛋白修饰也是一个比较复杂的过程，今天呢，我们就给大家讲讲组蛋白乙酰化及相关的产品。 一 组蛋白修饰 真核生物染色质的基本结构单位是核小体，它由约 146 bp DNA 缠绕组蛋白八聚体组成，其中组蛋白八聚体包含 2 (H2
sumo化与磷酸化修饰联合分析
随着质谱技术的不断进步，大规模修饰组学的方法也越来越成熟，PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定，找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年10月发
国自然冲刺蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点
每年三月初，都是科研界的“高考”倒计时，因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况，蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明，磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目，总研究资助金额超过2亿。 继上周的肠道微生物研究方案
国自然冲刺蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点
每年三月初，都是科研界的“高考”倒计时，因为距离国自然基金申请的截止日期已不到半月。纵观历年国自然申请情况，蛋白的翻译后修饰都是申请中重大研究方向之一。2018年国自然统计表明，磷酸化、泛素化、乙酰化等修饰的相关基金项目，总研究资助金额超过2亿。 继上周的肠道微生物研究方案解析后（国自然冲
蛋白质磷酸化
Tyrosine Kinase Assay Using Synthetic Peptides (T. Miller)Small synthetic peptide substrates are especially well suited for applications such as assay
水生所四膜虫蛋白质磷酸化修饰特征等研究获进展
11月7日，国际蛋白质组学领域刊物Molecular & Cellular Proteomics在线发表了题为Phosphoproteomic analysis of protein phosphorylation networks in Tetrahymena thermophila, a
蛋白质磷酸化修饰的进化与功能相关性研究取得新成果
10月18日，Molecular Biology and Evolution杂志在线发表了中科院系统生物学重点实验室李亦学研究组与曾嵘研究组、日本国立遗传研究所Yoshio Tateno教授以及德国国家环境生物学研究中心流行病研究所在中科院系统生物学重点实验室的进修生Ludwig
张丽华发文：N磷酸化修饰蛋白质的富集和鉴定方法
摘要 蛋白质磷酸化修饰在细胞的信号转导、代谢、发育等生命过程中发挥着重要作用。除了研究较为透彻的发生在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸侧链羟基的O-磷酸化修饰之外，近年来，发生在组氨酸、精氨酸和赖氨酸侧链氨基的N-磷酸化修饰受到了越来越广泛的关注。然而，由于N-磷酸化修饰具有独特的P-N键结构，导致其化
化学性调节具有哪些特点
凡通过化学基因的引入或除去，而使蛋白质或核酸共价结构发生改变的现象。化学修饰（chemical modification）调节方式有别于别构调节。它以引起酶分子共价键的变化、化学结构的改变而影响酶活性。酶的化学修饰是在另一种酶的催化下完成的，是体内快速调节的另一种重要方式。化学修饰的方式包括磷酸化与
何谓化学修饰调节
凡通过化学基因的引入或除去，而使蛋白质或核酸共价结构发生改变的现象。化学修饰（chemical modification）调节方式有别于别构调节。它以引起酶分子共价键的变化、化学结构的改变而影响酶活性。酶的化学修饰是在另一种酶的催化下完成的，是体内快速调节的另一种重要方式。化学修饰的方式包括磷酸化与
重要次生代谢产物合成调控与植物抗逆研究取得系列进展
近日，中国科学院东北地理与农业生态研究所，在蛋白翻译后修饰调控植物次生代谢产物合成，以及植物逆境胁迫适应方面取得系列进展。研究团队在药用植物丹参次生代谢调控研究中取得成果。科研人员通过整合代谢组、蛋白质组与磷酸化蛋白质组学分析，解析了丹参不同器官中丹参酮类成分积累与蛋白质表达谱的关联，鉴定出丝裂原活
乙酰化修饰调控植物向光性分子机制获揭示
近日，中国科学院华南植物园研究员刘勋成团队在国家自然科学基金和广东省科技计划等项目的资助下，研究揭示了乙酰化修饰调控植物向光性分子机制。相关成果发表于《植物通讯》（Plant Communications）。分子模式：HDA9介导phot1乙酰化-磷酸化动态平衡调控植物向光性。研究团队供图植物的向光
结核杆菌研究新进展：乙酰化修饰图谱公布
近日，发表于杂志Int J Biochem Cell Biol.上的一篇文章中，来自西南大学和杭州景杰生物科技有限公司的研究者公布了结核分歧杆菌的乙酰化修饰谱图。近年来科学家都非常有兴趣致力于病原微生物的蛋白质翻译后修饰研究，本文中作者首次全面鉴定了结核分歧杆菌的乙酰化修饰。这也是继公布首张结合
研究发现全新组蛋白修饰类型——赖氨酸乙酰乙酰化
细胞代谢为生命过程提供能量。同时，代谢物可共价修饰蛋白质来发挥信号传导功能。虽然许多代谢物在代谢通路中的作用广为人知，但它们介导细胞信号调控的功能有待探索。酮体（包括丙酮、乙酰乙酸和β-羟基丁酸）为脂质代谢产物。在葡萄糖缺乏的状态下，肝脏产生的酮体可用作多种组织的替代能源，且与多种病理生理状态密
研究揭示乙酰化修饰调控植物向光性分子机制
植物的向光性是一种关键的环境适应性机制，使其能通过调整生长方向来优化对光能的捕获，提升光合效率并促进生长发育。向光素phototropin 1（phot1）作为核心的光受体，介导了植物对蓝光的感知和向光性反应。尽管已有的研究鉴定了phot1下游信号通路组成和功能，但连接光信号与phot1激酶活性的关
蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点（二）
由此可见，泛素化相关基金无论是申请项目数还是金额数均在向磷酸化逼近，甚至从重点项目数看，18年泛素化的项目数已然超过了磷酸化。进一步统计表明，泛素化研究资助项目在医学部中一共98项，总资助金额高达4700万元。由此可见，泛素化的相关研究正是科研界的“当红小生”，基金申请的一大热点。图2.国自然基金项
Protein－Cell：病毒感染时翻译后修饰乙酰化的动态调控
天然免疫应答是机体应对病原微生物入侵的第一道防线，在杀伤病原微生物、清除感染细胞和维持体内稳态等方面发挥关键作用。蛋白质翻译后修饰（protein post-translational modifications，PTMs）广泛参与调控各种通路中信号分子的激活。非组蛋白乙酰化修饰（non-hi
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的－DIA－解析3
结果显示，从 DIA 数据中提取、定量到 6401 条可信的磷酸化肽，占谱图库磷酸化肽总数（6505 条）的 98.4%（图 5）。磷酸化肽的丰度和离子化效率普遍较低，本实验如此高的解析成功率表明，基于 Orbitrap 的 DIA 数据具有极高的谱图质量和出色的灵敏度。 图5. DIA可
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的－DIA－解析1
引言 数据非依赖采集（Data-Independent Acquisition, DIA）是当前最热门的质谱采集技术之一，它以非目标的方式将质量范围分为若干窗口，依次并循环采集窗口内所有母离子的二级碎片[1,2]。DIA 与 SRM 类似，也是基于子离子（transition）定量，相比
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的－DIA－解析2
2. 磷酸化样本的 DDA 鉴定、可信度筛选和谱图库建立磷酸化样本信息和色谱质谱参数见实验条件部分。3 针 DDA 数据按磷酸化检索流程使用 Proteome Discoverer 2.0 软件搜库鉴定（S/T/Y+79.966 Da），并使用 ptmRS 模块对位点打分（图 2-1）。搜库完成