武汉植物园等长链非编码RNA调控基因转录研究获进展
长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)一般指长度大于200个核苷酸的非编码RNA,目前已在多种生物中发现了大量lncRNA,然而只有少数lncRNA的精细作用机理被阐明。 中国科学院武汉植物园汪志伟博士在植物种群遗传学科组王艇研究员支持和中国科学院留学基金资助下,与英国John Innes Centre 的Caroline Dean教授合作,通过突变体的筛选,发现CDKC;2虽为正向转录延伸因子P-TEFb复合体的激酶亚基,却对拟南芥开花时间重要调控基因FLC的转录表现为抑制作用。前期研究在FLC位点发现了一组名为COOLAIR的反义转录本。受此启发,本研究阐明CDKC;2直接促进COOLAIR的转录。进一步解析表明不含COOLAIR启动子的FLC转录不受CDKC;2的影响。从而揭示出cdkc;2突变下调了COOLAIR的转录,进而扰乱了COOLAIR介导的抑制机制,最终导......阅读全文
关于启动子的转录单元和转录起点的介绍
一、转录单元 转录单元(transcription unit) 是一段从启动子开始至终止子(terminator)结束的DNA序列,RNA聚合酶从转录起点开始沿着模板前进,直到终止子为止,转录出一条RNA链。在细胞中,一个转录单元可以是一个基因,也可以是几个基因。 二、转录起点 转录起点是
RNA干扰相关知识Small-interfering-RNA(siRNA)
Small interfering RNA(siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。
关于小干扰RNA的RNA激活介绍
已经发现dsRNA还可以激活基因表达,这种机制被称为“小RNA诱导的基因激活”或RNAa。已经显示靶向基因启动子的dsRNA诱导相关基因的有效转录激活。使用合成的dsRNA在人细胞中证明RNAa,称为“小活化RNA”(saRNA)。尚不清楚RNAa是否在其他生物体中是保守的。
连缀转录分析实验
核连缀分析用于确定某个克隆的基因是否受转录调控。理论上,核连缀分析应该在检测稳定状态 mRNA 水平变化的杂交实验之后,而在启动子分析之前进行。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实验方法原理离心机和转头,沸腾的水浴锅, Dounce 匀浆器,
转录后水平的调控
真核生物基因转录在细胞核内进行,而翻译则在细胞质中进行。在转录过程中真核基因有插入序列,结构基因被分割成不同的片段,因此转录后的基因调控是真核生物基因表达调控的一个重要方面,首要的是RNA的加工、成熟。各种基因转录产物RNA,无论rRNA、tRNA还是mRNA,必须经过转录后的加工才能成为有活性的分
转录定位法方法介绍
许多 RNA病毒的整个基因组往往作为一个单位转录。随着转录的进行,由基因组上各个基因所编码的蛋白质也依序在寄主细胞中出现。当寄主细胞被紫外线照射使本身的蛋白质合成受到抑制时,病毒蛋白的出现更为明显。紫外线照射也起着抑制病毒基因组的转录的作用。紫外线在 RNA分子的某一部位造成损伤后,损伤的部位和它后
概述转录因子的组成
真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分: 1、亚基 RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。 2、复合物 某些转录因子能
基因转录调控的途径
可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。
基因转录后调控方式
真核生物的RNA被翻译之前需要通过核孔输出,因此核输出对基因表达有着显著影响。所有进出细胞核的mRNA的运输都是通过核孔进行的,受到各种输入蛋白和输出蛋白的控制。携带遗传密码的mRNA需要存活足够长的时间才能被翻译,因为mRNA在翻译之前必须经过很长距离的运输。在典型的细胞中,RNA分子仅在特异性保
转录组高通量测序
(第二代高通量测序技术-454) 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu
依赖ρ因子的转录终止
ρ因子是一种分子量为46kDa的蛋白质,以六聚体为活性形式。
人类首次“转录”太阳声波
英国科研人员对太阳日冕层产生的声波实施“转录”,首次推出太阳“交响乐”。这项研究不但有助于了解太阳大气层活动,还有助于预测太阳耀斑爆发。首次“转录” 谢菲尔德大学太阳物理和空间等离子体研究中心首次把日冕环状磁场振荡转变为人耳可以听到的声音。 3年前,这一研究中心宣布,观察到太阳日冕
共转录的技术特点
中文名称共转录英文名称cotranscription定 义(1)原核生物的基因以多顺反子或操纵子形式存在,被转录为一个共同的信使核糖核酸(mRNA)。(2)通过基因操作使不同的基因同时在细胞或组织中一起转录。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
双向转录的技术特点
E.coli外膜蛋白OmpC和OmpF的合成调控:OmpC和OmpF的合成受到培养基渗透压的控制,当培养基渗透压增加时,由 envZ基因编码的一种外膜受体蛋白能感受渗透压的变化,将信息传递给细胞质内的OmpR蛋白。激活的OmpR是一种正调节蛋白,能促进双向转录,除转录OmpC基因外,还以相反方向在O
转录抑制剂分类
转录抑制剂分为两大类。第一类抑制剂特异性地与DNA链结合,抑制模板的活性,使转录不能进行。这类抑制剂同时抑制DNA复制,例如:放线菌素D、纺锤菌素、远霉素、溴乙锭和黄曲霉素等。第二类抑制剂作用于RNA聚合酶,使RNA聚合酶的活性改变或丧失,从而抑制转录的进行。这类抑制剂只抑制转录,不影响复制,是研究
通用转录因子的定义
通用转录因子(general transcription factors, GTFs) 。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子。
转录终止因子的定义
中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定 义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
转录组高通量测序
(第二代高通量测序技术-454) 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titanium第二代
转录的调节控制方式
转录的调节控制是基因表达调节控制中的一个重要环节。促进基因转录叫正调节,抑制基因转录叫负调节。在原核生物方面1961年F.雅各布和J.莫诺提出的操纵子学说,得到许多人的验证和充实。操纵子通常的调控方式为:①诱导和阻遏作用;②环腺苷酸(CAMP)和降解物活化蛋白(CAP)的调节作用;③弱化作用。对真核
转录物组的定义
转录组也称“转录物组”。是一个基因组转录的所有RNA。
连缀转录分析实验
实验方法原理 离心机和转头,沸腾的水浴锅, Dounce 匀浆器,晶型塑料或超明亮型吊桶式离心管,聚丙烯管,刀片,预设到 30°C 的振荡水浴,预设到 4°C 和 65°C 的水浴实验材料 非重组质粒载体含感兴趣 cDNA 或基因的重组质粒培养细胞或新鲜组织试剂、试剂盒 氯仿DNA变性溶液乙醇甘油贮
关于转录单位的简介
RNA的合成是由RNA聚合酶(RNA polymerase)催化的。当RNA聚合酶结合到基因起始处时,即为启动子(promoter)的特殊序列上时,转录开始进行。最先转录成RNA的一个碱基对是转录起点(startpoint),启动子序列围绕在它周围。从起点开始,RNA聚合酶不断沿着模板链不断合成
关于转录的特点介绍
转录时,细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA,通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比,转录有很多相同或相似之处,亦有其自己的特点。 转录中,一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说,以特定的DNA片段作为模板,以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂,
连缀转录分析实验
实验方法原理 离心机和转头,沸腾的水浴锅, Dounce 匀浆器,晶型塑料或超明亮型吊桶式离心管,聚丙烯管,刀片,预设到 30°C 的振荡水浴,预设到 4°C 和 65°C 的水浴 实验材
通用转录因子的定义
通用转录因子(general transcription factors, GTFs) 。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子
转录辅阻遏物
中文名称转录辅阻遏物英文名称transcriptional corepressor定 义对阻止转录起辅助作用的蛋白质。其中许多为组蛋白脱乙酰酶。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)
转录组高通量测序
(第二代高通量测序技术-454) 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu
转录物组的定义
转录组也称“转录物组”。是一个基因组转录的所有RNA。
转录模板的操作步骤
1. 提取cDNA质粒;2. 线性化质粒:(利用单一的酶切位点线性化有利于转录)3. 纯化质粒:(尽量避免RNase污染) ① 加等体积的Tris-苯酚:氯仿(1:1)到100μL限制内切酶消化体系,涡旋振荡20s, 13000g离心5min; ②上清转移,加入2倍体积无水乙醇和1/10体积的3M的
转录组高通量测序
(第二代高通量测序技术-454) 转录组即特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。罗氏GS-FLX-Titaniu