Science:宏基因组研究挑战DNA编码规则

人们一直认为DNA编码的指令是所有生命通用的,例外情况极少。但本期Science杂志上的一项新研究显示,自然界中的生物又一次打破了既定的规则。 美国能源部联合基因组研究所的Edward Rubin领导研究团队,获得来自1776种环境(包括17个人体区域)的微生物宏基因组数据,以便在其中寻找重编码事件(对遗传编码的解读不同于绝大多数生物)。 研究团队专门就终止密码子(命令蛋白合成停止的遗传序列)的重编码进行了分析,寻找那些将终止密码子当成“前进”信号,还继续往蛋白上添加氨基酸的事件。他们发现,这样的事件在环境样本中大量存在。 这一发现对于合成生物学有着重要的启示:人们可以利用重编码让合成生物抵抗病毒感染,或者阻止合成生物感染计划以外的宿主。“这项研究向人们展示了遗传密码的可变性,”耶鲁大学的生物工程师Farren Isaacs说。 从“停”到“行” 研究人员先用传统的编码规则预测1kb以上的DNA序列编码什么样的蛋白......阅读全文

DLAT基因编码功能及结构描述

该基因编码多酶丙酮酸脱氢酶复合物(PDC)的组分E2PDC位于线粒体内膜,催化丙酮酸转化为乙酰辅酶A。该基因的蛋白质产物,二氢脂酰胺乙酰转移酶接受丙酮酸氧化脱羧基形成的乙酰基并将其转移到辅酶A。二氢硫酰胺乙酰转移酶是抗线粒体抗体的抗原。这些自身抗体存在于近95%的自身免疫性肝病原发性胆汁性肝硬化(P

EZR基因编码功能及结构描述

该基因编码的细胞质外周膜蛋白在微绒毛中起蛋白酪氨酸激酶底物的作用。作为erm蛋白家族的一员,该蛋白作为质膜和肌动蛋白细胞骨架之间的中间产物。这种蛋白在细胞表面结构的粘附、迁移和组织中起着关键作用,并与多种人类癌症有关。一个位于3号染色体上的假基因已经被鉴定为该基因。另外,这个基因的剪接变体也被描述过

ALK负相关基因编码功能描述

ALK基因编码一种受体酪氨酸激酶(eceptor tyrosine kinase ,RTK),为跨膜蛋白,属于胰岛素受体超家族,在大脑发育与及特定的神经元中起重要作用。最初在间变性大细胞淋巴瘤(anaplastic large cell lymphoma, ALCL)发现ALK-NPM1融合蛋白,目

KRAS基因编码功能及结构描述

KRAS (Kirsten Rat Sarcoma Viral Oncogene Homolog)基因是GDP/GTP结合蛋白,比较重要的同家族基因还包括HRAS和NRAS。KRAS与GTP结合呈激活状态,与GDP结合呈关闭状态,KRAS可被生长因子或酪氨酸激酶(如EGFR)短暂活化,活化后的KRA

APOE基因编码功能及结构描述

这个基因编码的蛋白质是乳糜微粒的一个主要的凋亡蛋白。它与特定的肝脏和外周细胞受体结合,对富含甘油三酯的脂蛋白成分的正常分解代谢至关重要。该基因与载脂蛋白C1和C2基因簇中的19号染色体定位该基因突变导致家族性β-脂蛋白血症或Ⅲ型高脂蛋白血症(HLP-Ⅲ),其中血浆胆固醇和甘油三酯升高是乳糜微粒和极低

ARNT基因编码功能及结构描述

该基因编码一个含有一个基本螺旋环螺旋结构域和两个特征性PAS结构域以及一个PAC结构域的蛋白质编码的蛋白质与配体结合的芳香烃受体结合,并有助于该复合物向细胞核移动,在细胞核中促进参与外源代谢的基因的表达该蛋白也是缺氧诱导因子1转录调控的共因子。该位点与12号染色体上的etv6(ets变异体6)基因的

CHFR基因编码功能及结构描述

该基因编码一种E3泛素蛋白连接酶,维持调控细胞周期进入有丝分裂的前相检查点,因此可能在细胞周期进展和肿瘤发生中起关键作用编码的蛋白质具有一个N末端叉头相关结构域、一个中央无名指结构域和一个富含半胱氨酸的C末端区域。已经描述了编码不同蛋白质亚型的选择性剪接转录变体[由RefSeq提供,2014年3月]

CSK基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白参与多种途径,包括src家族激酶的调控。它通过与蛋白酪氨酸磷酸酶(ptpn22)基因编码的蛋白结合,在t细胞活化中发挥重要作用。该蛋白也在多种底物上磷酸化C末端酪氨酸残基,包括SRC原癌基因、非受体酪氨酸激酶基因编码的蛋白质磷酸化抑制src家族酪氨酸激酶的激酶活性。该基因的内含子多态

GOPC基因编码功能及结构描述

该基因编码一个具有PDZ结构域的高尔基蛋白PDZ结构域是球状的,含有它们的蛋白质通过C末端附近的短基序与其他蛋白质结合缺乏原代蛋白的小鼠有球形精子症,并且不育。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2011年12月]This gene encodes a Golgi prot

BCR基因编码功能及结构描述

断裂簇区域蛋白(BCR)也称为肾癌抗原NY-REN-26,是人类中由BCR基因编码的蛋白质。 BCR是BCR-ABL复合物中的两个基因之一,其与费城染色体相关。 已经发现了编码该基因的不同同种型的两种转录物变体。 虽然BCR-ABL融合蛋白已被广泛研究,但正常BCR基因产物的功能尚不清楚。 该蛋白质

ATIC基因编码功能及结构描述

该基因编码一种双功能蛋白,对从头嘌呤生物合成途径的最后两个步骤进行催化。N-末端结构域具有磷酸核糖氨基咪唑甲酰胺甲酰转移酶活性,C-末端结构域具有IMP环水解酶活性。该基因突变导致AICA核糖尿症。[由RefSeq提供,2009年9月]This gene encodes a bifunctional

KLLN基因编码功能及结构描述

这种无内含子基因编码的蛋白质存在于细胞核中,在那里它可以抑制DNA合成,促进S相停滞,并与凋亡相结合。这种DNA结合蛋白的表达被转录因子p53上调。The protein encoded by this intronless gene is found in the nucleus, where i

INHA基因编码功能及结构描述

这个基因编码tgfβ(转化生长因子β)超家族的一个成员。编码的前蛋白经蛋白质水解处理产生多肽产物,包括抑制素a和b蛋白复合物的α亚单位。这些复合物对垂体分泌的促卵泡激素负性调节。抑制素还参与调控许多细胞过程,包括细胞增殖、凋亡、免疫反应和激素分泌。该基因突变可能与男性不育和女性卵巢早衰有关。[由Re

FYN基因编码功能及结构描述

原癌基因酪氨酸蛋白激酶Fyn(p59-FYN,Slk,Syn,MGC45350,Gene ID 2534)是人类中由FYN基因编码的酶。 Fyn是Src激酶家族的59kDa成员,其通常与发育和正常细胞生理学中的T细胞和神经元信号传导相关。这些信号传导途径的破坏通常会影响多种癌症的形成。根据定义为原癌

ATR基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白属于PI3/PI4激酶家族,与ATM(一种在共济失调性毛细血管扩张症中突变的基因编码的蛋白激酶)关系最为密切。这种蛋白和atm与pombe-rad3裂殖酵母菌(schizosaccharomyces pombe rad3)具有相似性,后者是细胞周期停滞和DNA损伤修复反应中所需的细胞

MTAP基因编码功能及结构描述

该基因编码一种在多胺代谢中起主要作用的酶,对腺嘌呤和蛋氨酸的修复都很重要。编码酶在许多癌症中缺乏,因为这个基因和抑癌基因p16被共同删除。已经描述了该基因的多个选择性剪接转录变体,但它们的全长性质仍然未知。This gene encodes an enzyme that plays a major

EPOR基因编码功能及结构描述

该基因编码红细胞生成素受体,红细胞生成素受体是细胞因子受体家族的一员。在促红细胞生成素结合后,该受体激活JAK2酪氨酸激酶,激活不同的细胞内途径,包括:ras/map激酶、磷脂酰肌醇3激酶和stat转录因子。受刺激的促红细胞生成素受体似乎在红细胞存活中起作用。红细胞生成素受体缺陷可导致红白血病和家族

ITK基因编码功能及结构描述

该基因编码在t细胞中表达的细胞内酪氨酸激酶。该蛋白包含sh2和sh3两个结构域,它们通常存在于细胞内激酶中。它被认为在t细胞增殖和分化中起作用。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene encodes an intracellular tyrosine kinase expresse

MPL基因编码功能及结构描述

MPL基因编码的蛋白为促血小板生成素受体,与NF-κB以及JAK/STAT信号通路相关。

FANCM基因编码功能及结构描述

fanconi贫血互补组(fanc)目前包括fanca、fancb、fancc、fancd1(也称为brca2)、fancd2、fance、fancf、fancg、fanci、fancj(也称为brip1)、fancl、fancm和fancn(也称为palb2)。先前定义的组fanch与fanca相

IFNG基因编码功能及结构描述

这个基因编码一种可溶性细胞因子,它是Ⅱ型干扰素的一个成员。编码的蛋白质由先天免疫系统和适应性免疫系统的细胞分泌。活性蛋白是一种与干扰素γ受体结合的同二聚体,它触发细胞对病毒和微生物感染的反应。这种基因突变与病毒、细菌和寄生虫感染以及一些自身免疫疾病的易感性增加有关。[由RefSeq提供,2015年1

DPYD基因编码功能及结构描述

该基因编码的蛋白是嘧啶分解代谢酶,是尿嘧啶和胸腺嘧啶分解代谢途径的起始和限速因子。该基因突变导致二氢嘧啶脱氢酶缺乏,嘧啶代谢错误与胸腺嘧啶尿嘧啶尿有关,癌症患者接受5-氟尿嘧啶化疗后毒性增加。两个编码不同亚型的转录变体已经被发现。The protein encoded by this gene is

FRK基因编码功能及结构描述

Fyn相关激酶(FRK,以前称为酪氨酸蛋白激酶5)是一种人类中由FRK基因编码的酶。 由该基因编码的蛋白质属于TYR蛋白激酶家族。 这种酪氨酸激酶是一种核蛋白,可能在细胞周期的G1期和S期发挥作用,抑制生长。

ITPA基因编码功能及结构描述

该基因编码一种肌苷三磷酸焦磷酸水解酶。编码蛋白水解肌苷三磷酸和脱氧肌苷三磷酸,得到一磷酸核苷酸和二磷酸。这种蛋白质是ham1 ntpase蛋白家族的一员,存在于细胞质中,起着同二聚体的作用。编码蛋白的缺陷可导致肌苷三磷酸焦磷酸化酶缺乏,从而导致红细胞中itp的积聚。交替剪接导致多个转录变体。[由Re

MAF基因编码功能及结构描述

这个基因编码的蛋白质是一个DNA结合,亮氨酸拉链包含转录因子,作为同二聚体或异二聚体。根据结合位点和结合伙伴,编码的蛋白质可以是转录激活物或阻遏物。这种蛋白在一些细胞过程中起调节作用,包括胚胎晶状体纤维细胞的发育,增加t细胞对凋亡的敏感性,以及软骨细胞的终末分化。该基因缺陷是幼年性粉状白内障和先天性

IKBKB基因编码功能及结构描述

由该基因编码的蛋白质使抑制剂/nf-kappa-b复合物磷酸化,导致抑制剂离解和nf-kappa-b活化。编码的蛋白质本身存在于蛋白质复合物中。已经发现了一些转录变体,有些是蛋白质编码的,有些不是。[由RefSeq提供,2011年9月]The protein encoded by this gene

MAGOh基因编码功能及结构描述

果蝇的mago-nashi(无孙)基因突变产生的后代在种质组合和种系发育方面存在缺陷这个基因编码哺乳动物的mago-nashi同源基因在哺乳动物中,mRNA的表达并不局限于原生质,而是在成体组织中广泛表达,可通过血清刺激静止成纤维细胞诱导表达[由RefSeq提供,2008年7月]\Drosophil

KRAS基因编码功能及结构描述

KRAS (Kirsten Rat Sarcoma Viral Oncogene Homolog)基因是GDP/GTP结合蛋白,比较重要的同家族基因还包括HRAS和NRAS。KRAS与GTP结合呈激活状态,与GDP结合呈关闭状态,KRAS可被生长因子或酪氨酸激酶(如EGFR)短暂活化,活化后的KRA

BTK基因编码功能及结构描述

Bruton的酪氨酸激酶(缩写为Btk或BTK)也称为酪氨酸 - 蛋白激酶BTK,是人类中由BTK基因编码的酶。 BTK是一种在B细胞发育中起关键作用的激酶。 BTK通过高亲和力IgE受体在B细胞成熟以及肥大细胞活化中起关键作用。 Btk含有结合磷脂酰肌醇(3,4,5) - 三磷酸(PIP3)的PH

EED基因编码功能及结构描述

该基因编码一个多囊组(pcg)家族成员。pcg家族成员形成多聚蛋白复合物,参与维持基因在连续细胞世代中的转录抑制状态。该蛋白与zeste 2的增强子、整合素beta7的细胞质尾、免疫缺陷病毒1型(hiv-1)ma蛋白和组蛋白脱乙酰酶蛋白相互作用。该蛋白通过组蛋白去乙酰化介导基因活性的抑制,并可能作为