Science:宏基因组研究挑战DNA编码规则
人们一直认为DNA编码的指令是所有生命通用的,例外情况极少。但本期Science杂志上的一项新研究显示,自然界中的生物又一次打破了既定的规则。 美国能源部联合基因组研究所的Edward Rubin领导研究团队,获得来自1776种环境(包括17个人体区域)的微生物宏基因组数据,以便在其中寻找重编码事件(对遗传编码的解读不同于绝大多数生物)。 研究团队专门就终止密码子(命令蛋白合成停止的遗传序列)的重编码进行了分析,寻找那些将终止密码子当成“前进”信号,还继续往蛋白上添加氨基酸的事件。他们发现,这样的事件在环境样本中大量存在。 这一发现对于合成生物学有着重要的启示:人们可以利用重编码让合成生物抵抗病毒感染,或者阻止合成生物感染计划以外的宿主。“这项研究向人们展示了遗传密码的可变性,”耶鲁大学的生物工程师Farren Isaacs说。 从“停”到“行” 研究人员先用传统的编码规则预测1kb以上的DNA序列编码什么样的蛋白......阅读全文
基因组重编码生物体“赭石”诞生
美国耶鲁大学合成生物学家创建了一种新型基因组重新编码生物体(GRO),并命名为“赭石”(Ochre),实现了对生物体遗传密码的重写。这一成果发表在最新一期《自然》杂志上,不仅促进了人类对遗传密码可塑性的理解,也为未来合成生物学的应用提供了更多可能。在这项研究中,科学家成功将DNA或RNA中的冗余密码
关于生物分子中心法则的基因编码的介绍
哺乳动物细胞里的基因编码产生一种糖蛋白PrP。人的PrP基因位于20号染色体短臂,PrP由253个氨基酸残基组成,在氨基端有22个氨基酸组成的信号 肽。在正常脑组织中的PrP称为PrPc,相对分子质量为33 000~35 000,对蛋白酶敏感。在病变脑组织中的PrP称为PrPsc,相对分子质量为
调整基因编码蛋白的检测
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EGFR负相关基因编码功能描述
EGFR编码的蛋白是一种跨膜糖蛋白,也是表皮生长因子受体家族中的一员,该家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(erbB3)及HER4(erbB4),也属于受体酪氨酸激酶家族。EGFR作为细胞表面蛋白可与配体如表皮生长因子(EGF)结合,EGFR可被激活,
PTEN负相关基因编码功能描述
PTEN基因编码的蛋白具有蛋白磷酸酶和脂质磷酸酶活性,是第一个具有磷酸酶活性的抑癌基因,也是是继p53和Rb基因之后,与肿瘤发生密切相关的一种抑癌基因,其主要机制因为PTEN是PI3K/Akt通路的主要负调控因子。PTEN的功能缺陷在人类多种肿瘤中广泛存在。
常见癌基因编码蛋白的检测
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ITPA基因编码功能及结构描述
该基因编码一种肌苷三磷酸焦磷酸水解酶。编码蛋白水解肌苷三磷酸和脱氧肌苷三磷酸,得到一磷酸核苷酸和二磷酸。这种蛋白质是ham1 ntpase蛋白家族的一员,存在于细胞质中,起着同二聚体的作用。编码蛋白的缺陷可导致肌苷三磷酸焦磷酸化酶缺乏,从而导致红细胞中itp的积聚。交替剪接导致多个转录变体。[由Re
GOPC基因编码功能及结构描述
该基因编码一个具有PDZ结构域的高尔基蛋白PDZ结构域是球状的,含有它们的蛋白质通过C末端附近的短基序与其他蛋白质结合缺乏原代蛋白的小鼠有球形精子症,并且不育。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2011年12月]This gene encodes a Golgi prot
MGMT基因编码功能及结构描述
烷基化剂是一种有效的致癌物,可导致细胞死亡、突变和癌症。该基因编码的蛋白质是一种DNA修复蛋白,参与细胞抵御烷基化剂的诱变和毒性。这种蛋白催化甲基从O(6)-烷基鸟嘌呤和DNA的其他甲基化部分转移到它自己的分子,从而修复毒性损伤。基因启动子甲基化与多种癌症类型有关,包括结直肠癌、肺癌、淋巴瘤和胶质母
GAST基因编码功能及结构描述
胃泌素是一种激素,其主要功能是刺激胃粘膜分泌盐酸,从而抑制胃泌素的形成这种激素也是胃肠道上皮细胞有丝分裂因子胃泌素有两种生物活性肽形式,G34和G17[由RefSeq提供,2008年7月]Gastrin is a hormone whose main function is to stimulate
HGF基因编码功能及结构描述
该基因编码转录因子缺氧诱导因子-1(hif-1)的α亚单位,是由α亚单位和β亚单位组成的异二聚体。HIF-1通过激活许多基因的转录,包括那些参与能量代谢、血管生成、细胞凋亡和其他蛋白质产物增加氧气输送或促进对缺氧的代谢适应的基因,作为细胞和全身对缺氧的稳态反应的主要调节器。因此,HIF-1在胚胎血管
MAGOh基因编码功能及结构描述
果蝇的mago-nashi(无孙)基因突变产生的后代在种质组合和种系发育方面存在缺陷这个基因编码哺乳动物的mago-nashi同源基因在哺乳动物中,mRNA的表达并不局限于原生质,而是在成体组织中广泛表达,可通过血清刺激静止成纤维细胞诱导表达[由RefSeq提供,2008年7月]\Drosophil
CYLD基因编码功能及结构描述
该基因编码一种细胞质蛋白,具有三个细胞骨架相关蛋白-甘氨酸保守(cap-gly)结构域,作为一种去氢酶。该基因突变与圆筒状瘤、多发性家族性毛发上皮瘤和brooke-spiegler综合征有关。交替转录剪接变体,编码不同的亚型,已经被描述出来。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene
GUSB基因编码功能及结构描述
该基因编码一种降解糖胺聚糖的水解酶,包括硫酸乙酰肝素、硫酸皮肤素和硫酸软骨素。这种酶形成一个定位于溶酶体的四聚体该基因突变导致粘多糖病第七型。选择性剪接导致多个转录变体人类基因组中有许多这个位点的假基因。[由RefSeq提供,2014年5月]This gene encodes a hydrolase
FANCL基因编码功能及结构描述
这个基因编码泛素连接酶,它是范科尼贫血互补组(FANC)的成员。这一组的成员通过组装成一个共同的核蛋白复合物而不是通过序列相似性来联系。该基因编码互补群L的蛋白,该蛋白介导FANCD2和FANCI的单泛素化。范科尼贫血是一种遗传异质性隐性疾病,其特征是细胞遗传不稳定、对dna交联剂过敏、染色体断裂增
GGH基因编码功能及结构描述
该基因通过去除γ链多聚谷氨酸盐和谷氨酸盐来催化叶酸聚γ-谷氨酸盐和抗多聚γ-谷氨酸盐的水解。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene catalyzes the hydrolysis of folylpoly-gamma-glutamates and antifolylpoly-ga
ARFRP基因编码功能及结构描述
该基因编码的蛋白是一种膜相关gtp酶,定位于质膜,与adp核糖基化因子(arf)和arf样蛋白(arl)有关。这个基因在跨高尔基体网络和内切体之间的膜运输中起作用。另外,还发现了编码不同亚型的剪接转录变体。[由RefSeq提供,2012年5月]The protein encoded by this
DAXX基因编码功能及结构描述
该基因编码一种多功能蛋白质,位于细胞核和细胞质的多个位置。它与多种蛋白质相互作用,如凋亡抗原fas、着丝粒蛋白c和转录因子红细胞增多症病毒e26癌基因同源物1。在细胞核中,编码的蛋白质作为一种与sumoylated转录因子结合的有效转录抑制因子发挥作用。它的抑制作用可以通过将这种蛋白质固定在早幼粒细
NKAP基因编码功能及结构描述
该基因编码一种参与普遍存在的转录因子nf-kappab激活的蛋白质。该蛋白和组蛋白去乙酰化酶HDAC3和Notch共加压因子复合物相关,从而充当Notch靶基因的转录抑制因子它也是αβT细胞发育所必需的在x染色体上发现了一个相关的假基因,而在6号染色体上发现了一个相关的无内含子的逆转录酶,该逆转录酶
MCC基因编码功能及结构描述
该基因是一个候选的大肠肿瘤抑制基因,被认为是负调控细胞周期进程小鼠的同源基因表达一种与质膜和膜细胞器相关的磷蛋白,而小鼠蛋白的过度表达抑制了进入s期。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2008年7月]This gene is a candidate colorectal
GNAS基因编码功能及结构描述
GNAS作为一个重要的信号转导蛋白,主要功能是在G蛋白偶联受体信号转导途径中,激活腺苷酸环化酶,导致cAMP水平的升高,参与调控细胞生长和细胞分裂。
EDNRA基因编码功能及结构描述
这个基因编码内皮素-1的受体,内皮素-1是一种在有效和持久的血管收缩中起作用的肽这种受体与鸟嘌呤核苷酸结合(G)蛋白相结合,这种结合激活了磷脂酰肌醇钙第二信使系统该基因的多态性与偏头痛抵抗有关。选择性剪接导致多个转录变体[由RefSeq提供,2009年10月]This gene encodes th
BMX-基因编码功能及结构描述
该基因编码一个属于Tec激酶家族的非受体酪氨酸激酶该蛋白包含一个PH样结构域,通过结合磷脂酰肌醇3,4,5-三磷酸(PIP3)介导膜靶向性,以及一个结合酪氨酸磷酸化蛋白和信号转导功能的SH2结构域该蛋白参与多种信号转导途径,包括stat途径,并调节多种癌细胞的分化和致瘤性。另外,已经发现该基因的剪接
CFLAR基因编码功能及结构描述
该基因编码的蛋白是一种细胞凋亡调节因子,其结构与caspase-8相似。然而,编码蛋白缺乏半胱天冬酶活性,似乎自己被半胱天冬酶8分裂成两个肽。该基因有几种编码不同亚型的转录变体,并且存在更多变体的部分证据。The protein encoded by this gene is a regulator
CAST基因编码功能及结构描述
该基因编码的蛋白质是一种内源性钙蛋白酶(钙依赖半胱氨酸蛋白酶)抑制剂它由一个N-末端结构域L和四个重复的钙蛋白酶抑制结构域(结构域1-4)组成,参与淀粉样前体蛋白的蛋白水解。calpain/calpastatin系统参与许多膜融合事件,如神经囊泡胞吐、血小板和红细胞聚集编码的蛋白质也被认为会影响编码
MET基因编码功能及结构描述
MET基因编码的蛋白为肝细胞生长因子受体HGFR,具有酪氨酸激酶活性,与多种癌基因产物和调节蛋白相关,参与细胞信息传导、细胞骨架重排的调控,是细胞增殖、分化和运动的重要因素。目前认为,c-met与多种癌的发生和转移密切相关,研究表明,许多肿瘤病人在其肿瘤的发生和转移过程中均有c-met过度表达和基因
LTK基因编码功能及结构描述
该基因编码的蛋白质是酪氨酸激酶ros/胰岛素受体家族的成员。蛋白质酪氨酸特异性磷酸化是控制细胞生长和分化的多种途径的关键。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。[由RefSeq提供,2008年10月]The protein encoded by this gene is a member of t
MAFB基因编码功能及结构描述
该基因编码的蛋白质是一种碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子,在血缘特异性造血调控中起重要作用编码的核蛋白抑制ets1介导的髓系细胞中红系特异基因的转录。这个基因不含内含子[由RefSeq提供,2008年7月]The protein encoded by this gene is a basic le