中国科大攻克复杂肿瘤全基因组异常的检测难题
中国科学技术大学信息科学与技术学院副教授李骜研究组以原创性论文（Original paper）的形式，在Bioinformatics上在线发表了最新研究成果。论文的第一作者是博士生余振华。 基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征，在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。传统的肿瘤基因组异常检测技术存在着通量低、分辨率差等问题，随着近年来大规模平行测序实验技术的快速兴起，新一代测序凭借其在通量和分辨率方面的独特优势，目前已经成为癌症基因组学研究中最流行的实验手段。但由于肿瘤本身的复杂性，从新一代测序数据中准确检测基因组异常仍面临着正常细胞掺杂和污染、肿瘤基因组非整倍体性等棘手问题。 该研究组提出一种基于全局参数化隐Markov模型的新算法，通过期望最大化方法对模型进行训练和参数估计，从而有效解决了利用新一代测序技术检测复杂肿瘤全基因组异常的国际性难题。 审稿人认为，该算法具有令人关注的特性并为解决......阅读全文
空间转录组技术用于免疫治疗的研究与展望
肿瘤免疫治疗现状近年来，免疫疗法，这种通过激活患者的免疫系统来杀死癌细胞的策略，已成为对抗癌症的新希望。目前的免疫疗法主要基于癌症疫苗，细胞因子（例如白介素2），继细胞转移（ACT）和免疫检查点抑制。基于他们的特点，特别针对程序性细胞死亡-1 /程序性细胞死亡配体1（PD-1 / PD-L1）途
点亮基因组——基于CRISPR/Cas9的新方法
自从2012年CRISPR/Cas9（通常被称为基因组编辑工具）问世以来，该系统在科学界一直受到关注，许多科学家发现了它的不同应用。来自Leibniz研究所植物遗传学和作物植物研究的科学家们最近发现了一种新型RNA引导核酸内切酶原位标记（RNA-guided endonuclease -in
POCT方法学发展（一）
导语：POCT不仅仅是试纸条加上配套仪器，更是患者身边或所在地使用的基于物理量、化学量和生物量技术体内外检测试剂、仪器和设备，是生物、纳米、计算机等多技术融合的产物。作为技术驱动型产物，目前，POCT产品正向着第五代自动化、信息化、智能化技术平台发展。那么POCT方法具体有哪些呢，本文就将带大家来具
超灵敏MRI技术：照亮人体肺部
人口健康直接影响到一个国家的经济发展和社会进步。据我国2013年发布的肿瘤发病率统计年报表明，肺癌是我国目前首位恶性肿瘤，是癌症死亡的头号杀手，目前城市中每4名死亡的癌症患者中，约有1名是肺癌。如何开发仪器进行肺部疾病的早期诊断成为当前国际医学界和科学界研究的热点。 近期，中国科学院武汉物理
基于计算机视觉检测的大米外观品质检测系统
以往，我们在超市购买大米的时候，会通过外观来判断大米的品质，这也是我们一般消费者最常用的一种检测大米品质的一种方式。但是针对于更加专业的大米品质检测来说，这种方式缺乏客观性和重复性。而为了保证流入市场的大米品质，质监部门会使用大米外观品质检测系统这种更先进的检测技术，来保证我国大米的安全。
蓝盾股份率先推基因检测技术下一代深度态势感知
为了应对网络空间日益复杂、隐蔽的网络威胁，各种检测技术相继出现，如脆弱性检测技术、恶意代码检测技术、入侵检测技术等，这些技术试图从不同角度发现网络中可能存在的安全问题，但都无法全面地将网络中存在的真实威胁进行全面的展现和预警。近年来，网络安全态势感知技术已经开始从理论走向实践，众多研究机构与安全
荧光寿命衰老时钟可动态检测个体衰老进程
中国科学院院士、华东理工大学教授朱为宏与该校教授郭志前团队，提出“自上而下”的衰老量化研究策略，并建立了基于荧光寿命成像的衰老检测（S-FLIM）新策略，成功构建超敏分子探针“荧光寿命衰老时钟”，实现从细胞到生物个体衰老进程的动态检测与长寿个体鉴定，为衰老生物学研究和抗衰老干预研究提供可视化的新型技
中科院实现神经元脑网络活体成像
中国科学院精密测量科学与技术创新研究院研究员徐富强、王杰研究团队基于新型基因编码生物磁共振成像技术，首次实现特异类型神经元网络的在体检测。相关研究成果在影像学期刊《神经影像》（Neuroimage）上发表。 目前，基于病毒的脑网络示踪技术主要依赖于光学成像，广泛应用于脑组织切片免疫荧光染色成像检
金纳米颗粒传感器可用于检测早期肝腹水细菌
由肝腹水引起的细菌性腹膜炎是造成肝硬化病人死亡的重要原因。目前临床上所面临的挑战是如何早期快速发现腹水中的细菌。常规的细菌检测的方法主要是微生物培养或基因分析，然而这些方法需要复杂的设备和专业技术人员的操作。检测过程 肽聚糖(Peptidoglycan, PG)是细菌细胞壁的主要成分。研究证
单细胞测序基准数据集的使用方法有哪些？
以下是一些常见的单细胞测序基准数据集的使用方法： 1. 方法验证和比较 - 将新开发的分析方法应用于基准数据集，并与已有的成熟方法进行比较，以评估新方法的性能优势和局限性。 2. 算法优化和调参 - 通过在数据集上的多次试验，调整和优化分析算法的参数，以获得最佳的分析结果。
深中通道开通，上海交大助力大国工程勇攀新高度
6月30日，深中通道正式开通，并于下午3时通车试运营。上海交通大学海洋水下工程科学研究院有限公司所属子公司，上海海科工程咨询有限公司负责了深中通道的沉管隧道工程。这是全线难度最大的控制性工程，海科院咨询公司深中通道监理团队创新采用多波束、潜水探摸摄像、可视化实时监控等多种先进检测手段，克服了海上作业
集成微泵式微流控芯片关键技术的研究
本课题以平面型结构的微型无阀泵和集成微型无阀泵式微流控芯片为研究对象，研究了高刻蚀速率与高表面质量兼具的玻璃湿法刻蚀工艺，创新性的建立了非超净环境下玻璃高效键合的工艺路线，同时，系统地研究了Micro—DPIV微流场可视化检测技术中的显微拍摄、激光照明方式、纳米级示踪粒子布朗运动误差消除、跨帧技术以
将拉曼光谱与计量学结合－实现毒品快速检测
记者23日从中科院合肥研究院获悉，该院智能所课题组研究发现，在3分钟之内可快速实现毒品的检测，能直接检出是否含毒以及含有哪种毒品，实现检测结果可视化。 据介绍，智能所研究员杨良保等人在利用表面增强拉曼光谱(SERS)技术结合化学计量学的方法，实现对吸毒人员尿液中毒品的快速检测和直接读出。研究表
使用酶标仪的细胞成像系统检测标签蛋白的表达
优势： 带细胞成像系统的功能模块扩展了微孔读板机的检测应用2. 方便检测每个细胞或每孔的标签蛋白的表达水平3. 按照一般微孔读板机的简单流程4. 细胞可视化数据输出，增加了数据可信性某些细胞蛋白存在或不存在，可代表着细胞对某些刺激的反应、某种分化的状态或特定细胞类型的独特特征或者基因
全自动水分测定仪和半自动水分测定仪哪种更好？
全自动水分测定仪是指仪器全自动检测分析，检测过程和结果都是可视化操作，这类水分测定仪检测方便，省时省力，同时价格也要相对高很多。国内代表：SFY-20A卤素水分测定仪 半自动水分测定仪是相对全自动水分测定仪而言，这类水分测定仪需要人工控制实验过程，属于半智能化操作，半自动水分测定价格相对便
机器视觉检测技术组件及应用
一个现代典型机器视觉检测系统，由下图所示基本单元组成，不同的机器视觉检测系统的基本原理大同小异。典型机器视觉测控系统原理框图机器视觉检测技术组成及应用可归纳为以下几点：1. 机器视觉测控系统硬件：光源、镜头、CCD；2. 机器视觉检测软件：组态、可视化；3.
2秒检测出“农药残留”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481657.shtm 近日，中国科学院合肥物质科学研究院固体物理研究所研究员蒋长龙团队开发了一种新型且无酶的便携式传感平台（以下简称传感平台），2秒内检测出环境和食品中的草甘膦残留，最终浓度结果直接显
磁共振可视纳米基因载体研究获进展
最新发布的2013年1月SCI学术期刊《纳米尺度》(Nanoscale)中报道了由中国科学院深圳先进技术研究院医工所劳特伯生物医学成像研究中心磁共振(MRI)分子影像研究组与医药所肝脏基因与细胞治疗中心合作完成的最新科研成果：自组装高灵敏度MRI探针在微环DNA(Minicircle DNA
单细胞测序数据分析常用软件的功能有哪些？
以下是单细胞测序数据分析常用软件的一些常见功能：Seurat：数据预处理：包括数据标准化、归一化、过滤低质量细胞和基因。降维：如主成分分析（PCA）、t-SNE、UMAP 等。聚类：识别不同的细胞群体。差异表达分析：比较不同细胞簇之间的基因表达差异。细胞类型注释：基于已知标记基因或数据库进行细胞类型
深圳先进院穿戴式心电房颤检测研究获进展
近日，中国科学院深圳先进技术研究院数字所生物医学信息技术研究中心研究员李烨课题组在穿戴式心电房颤检测领域取得新进展，其研究成果Multi-Scaled Fusion of Deep Convolutional Neural Networks for Screening Atrial Fibril
科研人员研制出新型金属有机框架复合纳米纤维传感器
近期，中国科学院合肥物质科学研究院在新型金属有机框架（MOF）复合纳米纤维传感器的设计、制备，及痕量水高灵敏实时检测方面取得进展。精准测量痕量水是环境监测的关键环节。发展高灵敏、快速响应的水分传感器，对提升技术水平、保障质量安全、节约能源资源具有重要作用。但是，在ppb级极低浓度下，水分子信号微弱，
太赫兹安检神器为进博会筑牢“安心屏障”
11月5日～10日，首届中国国际进口博览会将在国家会展中心（上海）举行，届时130多个国家、2800余家企业将携主打商品亮相，展馆的安防安检工作将迎来建馆以来最大考验和压力。据了解，由中国电科38所自主研发的太赫兹人体安检系统将为公众及安检员带来安检新体验，目前已陆续在国家会展中心多个入口部
全基因组测序助力临床基因诊断发现更多阳性诊断
随着测序技术的快速发展和成本下降，二代测序在临床遗传病的诊断上已经变得越来越成熟，全外显子测序已成为遗传病诊断一线检测方案，然而仍然有一半以上的疑似病例得不到确诊，高深度全基因组测序（WGS）除了检测常规的点突变和微小插入缺失（Indel）外，可以同时检测结构变异（包括拷贝数变异、倒位、易位）、动态
检测机构也需检测检测
从蔬菜的农残检测，到汽车尾气检测都离不开检验检测机构。 那么，广西的检验检测机构出具的检验检测报告是否都公正、准确呢？记者获悉，自治区质监局通报了2017年度全区检验检测机构资质认定飞行检查情况。结果显示，有7家检验检测机构涉嫌违法违规检验，被依法查处。（1月10日《南国早报》） 检验检测机
生物传感及光谱成像(下)：光谱质谱联合与原位实时
2023年7月16日，第22届全国分子光谱学术会议暨2023年光谱年会召开的第二天，在生物传感及光谱成像专场的下午半场，专家们继续带来荧光纳米探针，光声成像，分子诊断，纳米酶，多功能流式，设计和表征MOFs材料，微流控，原位光谱，光谱和质谱联合分析等领域的精彩报告。报告人：山西大学 阴彩霞教
球形核酸探针让肿瘤细胞“发光”
记者从中科院合肥物质科学研究院获悉：近期该院智能所智能微纳器件研究室张忠平特聘研究员团队在肿瘤细胞检测及精准手术导航方面取得突破。相关研究成果日前发表在国际著名化学期刊上，并已申请国家发明ZL。 癌症是一种高发病率和高致死率疾病，其共性是细胞不受控制生长和永生化。由于肿瘤细胞不受控制生长和
“金针”让肿瘤细胞无处遁形
记者从中科院合肥物质科学研究院获悉，该院智能所智能微纳器件研究室张忠平特聘研究员团队，在肿瘤细胞检测及精准手术导航方面取得最新突破。相关研究成果日前发表在国际化学期刊《ACS纳米》上，并已申请了国家发明ZL。 肿瘤细胞不受控制生长和永生化需要高活性端粒酶的催化，研究人员以金纳米颗粒为载体，
如何提高流式细胞术检测细胞结果解读的准确性？
提高流式细胞术检测细胞结果解读准确性的方法：严格的质量控制：确保样本制备的标准化，包括细胞的收集、处理和保存方法。定期校准仪器，监测仪器的性能和稳定性。合理设置对照：包括未染色细胞对照、同型对照和阳性对照。未染色细胞对照用于确定细胞的自发荧光水平；同型对照用于排除非特异性染色；阳性对照用于验证实验体
“金针”让肿瘤细胞无处遁形
科技日报合肥4月11日电 记者从中科院合肥物质科学研究院获悉，该院智能所智能微纳器件研究室张忠平特聘研究员团队，在肿瘤细胞检测及精准手术导航方面取得最新突破。相关研究成果日前发表在国际化学期刊《ACS纳米》上，并已申请了国家发明ZL。 肿瘤细胞不受控制生长和永生化需要高活性端粒酶的催化，研
球形核酸探针让肿瘤细胞“发光”
记者从中科院合肥物质科学研究院获悉：近期该院智能所智能微纳器件研究室张忠平特聘研究员团队在肿瘤细胞检测及精准手术导航方面取得突破。相关研究成果日前发表在国际著名化学期刊上，并已申请国家发明ZL。 癌症是一种高发病率和高致死率疾病，其共性是细胞不受控制生长和永生化。由于肿瘤细胞不受控制生长和永生