中国科大攻克复杂肿瘤全基因组异常的检测难题
中国科学技术大学信息科学与技术学院副教授李骜研究组以原创性论文(Original paper)的形式,在Bioinformatics上在线发表了最新研究成果。论文的第一作者是博士生余振华。 基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征,在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。传统的肿瘤基因组异常检测技术存在着通量低、分辨率差等问题,随着近年来大规模平行测序实验技术的快速兴起,新一代测序凭借其在通量和分辨率方面的独特优势,目前已经成为癌症基因组学研究中最流行的实验手段。但由于肿瘤本身的复杂性,从新一代测序数据中准确检测基因组异常仍面临着正常细胞掺杂和污染、肿瘤基因组非整倍体性等棘手问题。 该研究组提出一种基于全局参数化隐Markov模型的新算法,通过期望最大化方法对模型进行训练和参数估计,从而有效解决了利用新一代测序技术检测复杂肿瘤全基因组异常的国际性难题。 审稿人认为,该算法具有令人关注的特性并为解决......阅读全文
提高流式细胞术检测细胞结果解读准确性的方法
提高流式细胞术检测细胞结果解读准确性的方法:严格的质量控制:确保样本制备的标准化,包括细胞的收集、处理和保存方法。定期校准仪器,监测仪器的性能和稳定性。合理设置对照:包括未染色细胞对照、同型对照和阳性对照。未染色细胞对照用于确定细胞的自发荧光水平;同型对照用于排除非特异性染色;阳性对照用于验证实验体
建立高线数字化自动外径检测的几大关键点
线材测径仪应用于高线的生产线中,进行外径尺寸的在线测量,提供测量的实时值,提供更准确,更详细的尺寸信息,测径仪可以做到可持续的长时间连续的外径尺寸检测与分析。线材测径仪作为自动化的测量设备,采用工业级器件及各种防护措施,使其能应用于恶劣的工业现场,同时对1000℃的高温轧材也能做到高质量的测量,以全
【设备更新】岛津特色质谱分析技术赋能中药研究
中药品质研究岛津成像质谱显微镜解决方案 岛津将光学显微镜和质谱仪整合成一体,既可观察到高分辨率的形态图像,又可以对中药材、饮片等有效成分或指标成分进行鉴定和可视化分布分析。 典型案例: 成像质谱可视化分析巴戟天不同炮制方式质量评价研究 引自:乔菲,戴胜云,连超杰,刘杰,董静,郑健,马双成.基质辅
烟台海岸带所检测生物活性物质分子荧光探针研究取得进展
生物体内存在着各种内源性活性物质 (蛋白质,小分子和离子),它们在生命体内的种类和浓度不尽相同,所起的生理活性的功能各异。生态环境一旦改变(例如:受到环境污染或者其它刺激)就会直接改变内源性物质的分布,从而导致疾病的发生。因此,详尽了解这些活性物质的产生、分布和生理功能对生态平衡、生理和病理
xCELLigence系统实时监测低毒性XtremeGENE-DNA转染实验(一)
前言 X-tremeGENE DNA Transfection Reagent是一种非脂质体、多组分转染试剂,已被证明可有效转染多种细胞。X-tremeGENE 9和X-tremeGENE HP在有无血清条件下均可进行转染,且细胞毒性低,转染后无需更换培养基。 降低转染试剂本身的脱靶效应是非常重要的
红肠香肠双室真空包装机-豆干真空包装机-牛肉真空包装机
红肠香肠双室真空包装机 豆干真空包装机 牛肉真空包装机双室真空包装机由上工作室、下工作平台、机架、电器系统、真空系统五部分组成.工作原理:首先将包装物放置在工作平台上,将包装袋袋口平铺在硅橡胶条上,并用包装袋压条压住袋口。打开电源,选择加热温度,以及调整好抽气时间和加热时间,合盖后,包装机即可自动完
TM5食品安全分析仪
TM5食品安全分析仪,是普析公司最新推出的一款用于酶联免疫检测的专用仪器(酶标仪)。仪器测量准确、重复性好,96孔可视化布板,具有多样化的测试方法和计算模式,可满足食品安全测量分析多个领域的检测需求。 TM5食品安全分析仪可广泛应用于工商、卫生监督、质检、出入境检验检疫、农业等部门对各种食
助力预制菜产业高质量发展,海能提供仪器与方法支持
大会概况 由中国食品科学技术学会主办,中国食品科学技术学会预制菜专业委员会、仲恺农业工程学院等承办的“第二届预制菜产业科技创新大会”12月3日-5日在广州举办。 预制菜领域权威专家与产业代表齐聚,集中展示当前预制菜领域发展的最新动态,破解掣肘行业发展的科学问题和产业瓶颈,助力预制菜产业高质量
球形核酸探针让肿瘤细胞“发光”
本报合肥5月3日电 记者从中科院合肥物质科学研究院获悉:近期该院智能所智能微纳器件研究室张忠平特聘研究员团队在肿瘤细胞检测及精准手术导航方面取得突破。相关研究成果日前发表在国际著名化学期刊上,并已申请国家发明ZL。 肿瘤细胞.jpg 癌症是一种高发病率和高致死率疾病,其共性是细胞不受
新型无辐射磁粉成像扫描仪面世
在一项最新研究中,德国物理学家和医生团队成功开发出一种便携式扫描仪,可借助新的无辐射成像技术——磁粉成像,可视化人体内的动态过程,例如血流情况。科学家们表示,这是迈向无辐射干预的重要一步。相关研究刊发于最新一期《科学报告》杂志。 磁粉成像是一种基于对磁性纳米颗粒直接可视化的技术。这种纳米颗粒不
温湿度监测仪上位机设计系统的应用
上位机系统是温湿度监测仪中的一个重要组成部分,在软件开发平台它的使用是一个功能强大的应用程序开发工具,它具有快速、容易学习,利用和开发效率高等特点,是一个可视化应用程序编程开发环境,可重用的面向对象的编程语言,快速编译器和数据库的完美结合。 温湿度监测仪所设计的上位机软件是在已完成的以单片机为下位机
球形核酸探针让肿瘤细胞“发光”
记者从中科院合肥物质科学研究院获悉:近期该院智能所智能微纳器件研究室张忠平特聘研究员团队在肿瘤细胞检测及精准手术导航方面取得突破。相关研究成果日前发表在国际著名化学期刊上,并已申请国家发明ZL。 肿瘤细胞.jpg 癌症是一种高发病率和高致死率疾病,其共性是细胞不受控制生长和永生化。由
中药基础物质、代谢及代谢组学研究方案
中药组成成分复杂、作用环节多样,中药药效物质基础以及临床疗效机理的阐明,已成为中医药现代化研究的重要内容。如何快速地从海量的质谱数据中获取有价值的信息,减轻繁重的数据处理工作量,成为广大中医药研究工作者的心声。 赛默飞的Compound Discoverer软件针对中药成分鉴定、体内代谢转化和
球形核酸探针让肿瘤细胞“发光”
本报合肥5月3日电 记者从中科院合肥物质科学研究院获悉:近期该院智能所智能微纳器件研究室张忠平特聘研究员团队在肿瘤细胞检测及精准手术导航方面取得突破。相关研究成果日前发表在国际著名化学期刊上,并已申请国家发明ZL。 癌症是一种高发病率和高致死率疾病,其共性是细胞不受控制生长和永生化。由于肿
单细胞测序数据分析软件的性能评估报告模板
以下是一个单细胞测序数据分析软件性能评估报告的模板,可以根据具体的评估内容和需求进行修改和补充:单细胞测序数据分析软件性能评估报告软件名称:[软件名称]评估日期:[具体日期]评估人员:[评估人员姓名]一、引言简要介绍评估该单细胞测序数据分析软件的目的和背景。二、评估方法数据来源和数据集描述说明用于评
长春应化所研制出震动光谱电化学联用设备
近日,受中国科学院条件保障与财务局委托,东北先进制造与材料大型仪器区域中心组织专家,对中科院长春应用化学研究所承担的“晶体生长系统关键单元部件功能开发实现稀土晶体专用、高能效比、可视化功能”和“与振动光谱集成联用的电化学检测模块设计及技术方法开发”两个项目进行了验收。 验收专家组听取了项目负责
爱可索农药残留检测仪的检测原理你知道吗?
爱可索农药残留快速检测仪针对我国使用量最大的有机磷和氨基甲酸酯农药(例如敌敌畏、敌百虫、灭多威)进行研发。数据显示,有机磷类农药和氨基甲酸酯类农药在我国农药使用量中占比超过90%。 也就是说,只要拥有一台爱可索手持式农残检测仪,超过90%的残留农药都能测出来。 爱可索农残检测仪采用的检测原理
科学家团队研制出一种新型有机室温磷光探针
华东理工大学化学与分子工程学院、费林加诺贝尔奖科学家联合研究中心教授田禾、马骧团队,研制了一种可激活的红/近红外水溶性有机纯有机室温磷光(RTP)探针,有助于多功能高分辨率磷光成像,可用于体内可视化特定的生物标志物和病理过程。10月29日,相关研究发表于《国家科学评论》。 RTP探针可长时间持
生物体自发性活性氧簇检测获进展
日前,合肥物质研究院智能所研究员张忠平团队在细胞及生物体内自发性活性氧簇(ROS)检测方面取得进展,首次观测到了新鲜伤口处释放的羟基自由基,相关研究已发表于《美国化学会志》。 生命体内的ROS在信号传导和维持生物体内的动态平衡方面具有重要的作用,但是,过量的ROS也会导致细胞的衰老以及蛋白质和
单细胞测序数据的分析流程是怎样的?
单细胞测序数据的一般分析流程包括以下主要步骤:数据质量控制评估测序数据的质量指标,如测序深度、细胞捕获效率、基因检测数量等。去除低质量的细胞和基因。数据预处理对原始数据进行标准化和归一化处理,以消除技术偏差。基因表达定量确定每个细胞中基因的表达水平。细胞过滤基于基因表达数量、线粒体基因比例等指标进一
带你认识超高分辨激光共聚焦显微镜
激光器:紫外激光器:405nm,功率>30 mW;Ar离子激光器:458/476/488/496/514nm,功率>50mW;白激光器:脉冲式激光,470-670nm,功率≥1mW,步进1nm,可同时使用8个激光谱线,脉冲频率80MHz-10MHz可调。物镜:顶级平场复消色差共聚焦专用荧光物镜。检测
便携式土壤重金属分析仪获ZL权
由市农科院农产品质量检测与农田环境监测中心、信息中心联合设计研制的“便携式土壤重金属分析仪”,日前获得国家发明ZL授权。 该发明集成了重金属X射线荧光检测、GPS定位和上位机软件空间分析功能,不仅可以在田间原位快速同步检测20多种重金属,而且使重金属定量信息与取样点的位置信息在米级精
43项获奖!中国分析测试协会分析测试科学奖2025年度获奖名单
11月25日,中国分析测试协会公布了中国分析测试协会分析测试科学奖2025年度获奖名单,共评出获奖项目43项。其中,代谢组学和暴露组学精准测量关键技术及在重大慢病研究中的应用、痕量爆炸物、毒品、毒剂多模可视化检测方法研究及实战应用、痕量气态有机危害物的荧光传感材料开发与实际应用等14个项目荣获一等奖
基因检测生化检测
生化检测是通过化学手段,检测血液、尿液、羊水或羊膜细胞样本,检查相关蛋白质或物质是否存在,确定是否存在基因缺陷。用于诊断某种基因缺陷,这种缺陷是因某种维持身体正常功能的蛋白质不均衡导致的,通常是检测测试蛋白质含量。还可用于诊断苯丙酮尿症等。
革命性工具:更快捷-更准确的单细胞RNA测序处理方法
2018年12月,《Science》杂志称,如果没有基于scRNA-seq的可视化技术,一个细胞一个细胞地跟踪胚胎发育就不可能实现,因此这是今年最大的突破这一。2019年,研究人员写道,毫无疑问,FIt-SNE将加速发育生物学、神经科学以及癌症研究等领域的进一步工作。 就像从针孔相机到偏光片一
简介多功能氮吹仪的特点
★样品可视化 ★多功能氮吹仪模块可选,有5ml/12孔、5ml/24孔、20ml/12孔、20ml/24孔 ★每条吹扫针可独立控制 ★气腔高度可调节, ★自动故障检测及报警功能 ★超温保护装置 ★整机可置于通风橱内使用 ★可选配流量计减压阀 ★多功能氮吹仪吹针任意调整、吹针高度可
便携式甲醛检测仪测试时的优缺点
便携式甲醛检测仪核心部件甲醛传感器,甲醛传感器又有甲醛氧化物气体传感器、甲醛气体筛传感器、甲醛表面声波气体传感器、可视化荧光甲醛传感器、甲醛气体电子鼻等。在自动化、传感器高速发展的这么多年,甲醛传感器的发展进度并不理想,检测精度低、抗干扰能力差,这两项是研发的难点中的难点,全世界都无法突破的科技
合肥研究院生物体内自发性活性氧簇的检测研究获进展
近期,中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所研究员张忠平领导的研究团队在细胞及生物体内自发性活性氧簇(Reactive Oxygen Species,以下简称ROS)的检测方面取得新进展,并首次观测到了新鲜伤口处释放的羟基自由基。相关研究成果近日发表在国际化学期刊《美国化学会志》(
台式核磁共振波谱仪的应用领域简介
石油领域: 汽油调合 柴油燃料混合 燃料油混合 石油裂解 催化裂化装置饲料 催化裂化装置馏分 硫酸烷基化 食品领域 脂肪酸的含量测定: 脂肪酸作为油类的重要指标,一直以来没有一种低成本,快速的检测方法来确定含量,我公司推出的台式核磁共振谱仪可以在几秒内检测此项指标。 饮料的
如何读懂空间转录组测序数据结果
空间转录组学研究是很多老师非常感兴趣的一种最新组学研究技术。做完空间转录组测序后,能拿到哪些结果,是不是存在买家秀和卖家秀的差距?本期,生物芯片生物信息团队利用已发表数据的实操分析,为大家展示空间转录组测序数据结果。我们分析了来自10x Genomics 的Visium技术生成的某肿瘤生物学数据集,