中国科大攻克复杂肿瘤全基因组异常的检测难题

中国科学技术大学信息科学与技术学院副教授李骜研究组以原创性论文(Original paper)的形式,在Bioinformatics上在线发表了最新研究成果。论文的第一作者是博士生余振华。 基因组异常是多种恶性肿瘤的标志性特征,在肿瘤发病机理、临床诊断和治疗等研究中具有极为重要的作用。传统的肿瘤基因组异常检测技术存在着通量低、分辨率差等问题,随着近年来大规模平行测序实验技术的快速兴起,新一代测序凭借其在通量和分辨率方面的独特优势,目前已经成为癌症基因组学研究中最流行的实验手段。但由于肿瘤本身的复杂性,从新一代测序数据中准确检测基因组异常仍面临着正常细胞掺杂和污染、肿瘤基因组非整倍体性等棘手问题。 该研究组提出一种基于全局参数化隐Markov模型的新算法,通过期望最大化方法对模型进行训练和参数估计,从而有效解决了利用新一代测序技术检测复杂肿瘤全基因组异常的国际性难题。 审稿人认为,该算法具有令人关注的特性并为解决......阅读全文

基因检测能检测那些疾病

  1.恶性肿瘤疾病31种 :肺癌、胃癌、急性淋巴细胞白血病、慢性淋巴细胞白血病、直肠癌、喉癌、食管癌、鼻咽癌、膀胱癌、前列腺癌、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、子宫肌瘤、原发性肝癌、胰腺癌、甲状腺癌、脑膜瘤、口腔癌、皮肤黑色素瘤、神经母细胞瘤、神经胶质瘤、多发性骨髓瘤、皮肤鳞状细胞癌、脑动脉瘤、肾癌、睾丸

XTT检测法检测细菌生长

用XTT代替MTT可省去溶解还原产物结晶的步骤,XTT可以被活细胞中的代谢酶还原成黄色水溶性的代谢产物(formazan)。代谢产物在OD450处有吸收峰。

核酸检测用什么仪器检测

数字式PCR仪。能将每个样品的反应体系分为12000个—20000个纳升级的微滴。微滴生成速度:8个样品:3分钟。微滴分析仪可一次检测96个样品,全自动检测,无需人工干预。具有温度梯度功能,可进行96个样本扩增,升降温速度可达5度每秒。

焊缝检测仪检测功能

  波峰记忆:实时检索缺陷最高波,记录缺陷最大值  Φ值计算:直探头锻件探伤找准缺陷最高波后自动计算、显示缺陷当量尺寸  缺陷定位:实时显示缺陷水平、深度(垂直)、声程位置  缺陷定量:缺陷当量dB 值实时显示  缺陷定性:通过回波包络波形,方便人工经验判断  曲面修正:用于曲面工件探伤,可实时显示

酒驾检测方式血液检测

血液中酒精(乙醇)含量专用气相色谱分析仪(GC-7980F型),是郑州泽铭科技公司研发、*推出的血液中乙醇专用顶空气相色谱分析系统(血液中乙醇的测定),本系统方法利用乙醇的易挥发性,以叔丁醇为内标,用顶空气相色谱---火焰离子化检测器进行检测,整套设备符合2016年司法部颁布实施的SF/Z  JD行

VOC检测仪检测范围

  光离子化检测器可以测量0.1到2000 ppm的VOC和其它有毒气体。PID是一个高度灵敏的宽范围检测器,可以看成一个“低浓度LEL检测器”。如果将有毒气体和蒸气看成是一条大江的话,即使你游入大江,LEL检测器可能还没有反应,而PID则在你刚刚湿脚的时候就告知你。   从某种意义上讲,VOC是保

MTT检测法检测细菌生长

1、取96孔细胞培养板,每孔中加0.1ml含2×104~10×104靶细胞的培养液(含10%小牛血清的RPMI-1640培养液),在37℃ 5% CO2的饱和水汽二氧化碳培养箱中培养2~3小时让细胞帖壁(如果是悬浮细胞可直接进行下一步) 2、用RPMI-1640培养液2~10倍递次稀释细胞因子标

核酸检测是怎么检测的

新型冠状病毒的核酸检测根据采样方式,大致分为上呼吸道标本和下呼吸道标本,上呼吸道标本主要为鼻咽拭子、鼻咽抽取物,下呼吸道标本主要是支气管肺泡灌洗液、深部痰液。1.用于检测不同病毒,需取相应的标本,具体包括呼吸道分泌物、粪便、尿液、血液。以检测呼吸道病毒用咽拭子为例,需用一次性无菌植绒拭子+螺旋盖管或

核酸检测是怎样检测的

众所周知,新型冠状病毒肺炎(COVID-19)是一种烈性呼吸道传染病,其病原体为新型冠状病毒。若想证实已出现的感染症状是由本病毒所引起,最准确的方法是从患者体内分离出活病毒,并进行病毒培养。然而,此方法并不适合大面积应用,在此次疑似病例的确诊工作中,也并不适用。这是因为病毒培养所需时间较长,需要的场

无损检测涡流检测的原理

  原理:将通有交流电的线圈置于待测的金属板上或套在待测的金属管外。这时线圈内及其附近将产生交变磁场,使试件中产生呈旋涡状的感应交变电流,称为涡流。涡流的分布和大小,除与线圈的形状和尺寸、交流电流的大小和频率等有关外,还取决于试件的电导率、磁导率、形状和尺寸、与线圈的距离以及表面有无裂纹缺陷等。因而

磁粉检测的检测原理

磁粉探伤(检测)原理磁粉检测,是通过对被检工件施加磁场使其磁化(整体磁化或局部磁化),在工件的表面和近表面缺陷处将有磁力线逸出工件表面而形成漏磁场,有磁极的存在就能吸附施加在工件表面上的磁粉形成聚集磁痕,从而显示出缺陷的存在。磁粉检测方法应用比较广泛,主要用以探测磁性材料表面或近表面的缺陷。多用于检

NAG检测法检测细菌生长

1、按MTT检测法培养细胞和用不同稀释度的细胞因子处理细胞。 2、吸去培养液,用PBS洗涤两次(如为悬浮细胞,应在吸去上清液前先离心)。 3、每孔加60μl NAG染液,在37℃ 5% CO2的饱和水汽二氧化碳培养箱中培养4小时。 4、每孔加90μl终止液,混匀后置酶联检测仪上测定光密度

土壤检测是如何检测的

自然界的土壤由有机质、矿物质、土壤空气和土壤水分三相物质所组成,所以土壤检测前需要的准备工作有检测仪器、土壤取样器、样品制备、土壤检测等基本方法。如果要检测一块苗圃的土地,需要选择一块具有代表性的土壤进行检测,以便保证检测结果的准确性,土壤检测一般按六个流程进行。(1)前期采样:根据背景资料与现场考

无损检测法如何检测珍珠

  众所周知,人们欣赏珍珠主要是从外观上看珍珠的外在美,如看珍珠的颜色、光泽、圆度、规格大小以及光洁度。如果想深入了解珍珠的内部结构,通常则要通过打孔或解剖的方式才能看到。随着全球高新技术的迅猛发展,使得X射线技术和光学相干层析成像技术的新成果得以延伸进入珍珠检测领域。笔者经过反复的研究和验证

BGFR基因检测是检测什么

表皮生长因子受体(EGFR)是原癌基因C-erbB-1的表达产物,是一种跨膜蛋白,是表皮生长因子受体家族第1个成员。表皮生长因子受体EGFR基因位于第7号染色体短臂上,有28个外显子。其中EGFR酪氨酸激酶区域的突变主要发生在18~21外显子,其中19和21号外显子突变更为重要,尤其是19外显子突变

食品检测兽药残留检测

兽药残留检测兽药残留是指兽药在动物源食品中的残留,根据联合国粮农组织和世界卫生组织食品中兽药残留联合立法委员会的定义,兽药残留是指肉类和鱼类及蛋、奶制品、蜂制品等等动物源产品的任何可食部分所含兽药的母体化合物及(或)其代谢物,以及与兽药有关的杂质。因此兽药残留既包括原药,也包括动物体内代谢产物和兽药

橡胶检测需要哪些检测设备

橡胶拉力试验机:测试橡胶材料的拉伸性能,撕裂强度,剥离力等力学性能.橡胶无转子硫化仪:用于检测橡胶硫化过程的焦烧时间、正硫化时间、硫化速率、模量以及硫化平坦期等性能指标.橡胶门尼粘度仪:用于测定生胶或混炼胶的粘度、焦烧及硫化指数等.硫化橡胶低温脆化温度测定仪:是测定硫化橡胶在规定条件下试样受冲击出现

NAG检测法检测细胞生长

1.按MTT检测法培养细胞和用不同稀释度的 细胞因子 处理细胞。 2.吸去培养液,用PBS洗涤两次(如为悬浮细胞,应在吸去上清液前先离心)。 3.每孔加60μl NAG染液,在37℃ 5% CO 2 的饱和水汽二氧化碳培养箱中培养4小时。

甲醛检测仪检测原理

甲醛检测仪检测原理:  用光电光度法测定室内空气中甲醛的浓度,甲醛气体通过检测单元时,检测单元中浸有发色剂的纸因化学反应其颜色由白色变成黄色。变色的程度所引起反射光强度的变化与甲醛浓度呈函数关系。根据反射光量强度变化率测定甲醛的浓度。待仪器达到试纸反应时间读取数值。  国标要求的甲醛测量步骤  1、

HCG:尿液检测与血液检测

人绒毛膜促性腺激素是由胎盘的滋养层细胞分泌的一种糖蛋白,它是由α和β二聚体的糖蛋白组成。人绒毛膜促性腺激素(HCG)αβ,由合体滋养细胞合成。分子量为36700的糖蛋白激素,α亚基与垂体分泌的FSH(卵泡刺激素)、LH(黄体生成素)和TSH(促甲状腺激素)等基本相似,故相互间能发生交叉反应,而β亚基

金含量检测方法(金矿检测)

方法、步骤:1、取20克样品,放入马弗炉之中,以600~700度烧2小时(如测量铅,则加热温度不能越过550度,否则会挥发)      2、取出后放入烧杯中,用已经配制好的王水40ML(盐酸3:硝酸1)溶解,放于加热板上烧沸温度加加热30分钟左右.      3、取下后位温度降低,然后加入纯水50M

微流图像法粒度仪

上海梓梦科技新产品微流图像法粒度仪产品型号:M3000产品简介:微流图像法粒度仪是采用动态流式成像原理,对流经微流通道的样品颗粒进行拍照,分析图片中的颗粒大小、形貌。给出每个颗粒的形貌特征,是目前国内外先进的图像处理系统。使得对复杂液体制剂、混悬液、微球等颗粒分析可视化,所见即所得。产品功能:粒度分

料位计的测量工艺

  1.物料自然堆积会产生堆积倾斜,所以固体物料的料面是不平整的,很难明确料位的准确高度;物料进出时,存在滞留区,影响料位最低位置点的测量。实现介质可视化(介可视),过程自动化。  2.料斗或储仓中,固体物料内部易存在大的孔隙,形成拱桥。粉料内部易存在小的间隙。前者影响对物料储量的计算,而后者则在振

料位计的测量工艺

  1.物料自然堆积会产生堆积倾斜,所以固体物料的料面是不平整的,很难明确料位的准确高度;物料进出时,存在滞留区,影响料位最低位置点的测量。实现介质可视化(介可视),过程自动化。  2.料斗或储仓中,固体物料内部易存在大的孔隙,形成拱桥。粉料内部易存在小的间隙。前者影响对物料储量的计算,而后者则在振

基因检测中活细胞检测和血液检测的区别

基因检测中活细胞检测和血液检测的区别基因检测就是通过血液、其他体液或细胞对DNA进行检测的技术,是取被检测者脱落的口腔黏膜细胞或其他组织细胞,扩增其基因信息后,通过特定设备对被检测者细胞中的DNA分子信息作检测,预知身体患疾病的风险,分析它所含有的各种基因情况,从而使人们能了解自己的基因信息,从而通

基因检测除了检测胎儿健康,还可以检测什么呢

   每个妈咪都希望提供一个安全健康的生长环境给宝宝,而产检就是其中最必不可少的功课了。做过功课的朋友都知道,近年来无创产前基因检测是越来越受欢迎。但,对于无创产前基因检测,你又了解多少呢?  什么是无创产前基因检测?  无创产前基因检测是一项安全且准确的胎儿染色体异常检测技术,准确率高达99.8%

兽药残留检测仪介绍

可定性或定量检测抗生素类、磺胺类、呋喃类和、激素类等兽药残留。 仪器特点: 1、超大7英寸全彩触摸屏,全中文显示,图标化触摸式操作,简单方便; 2、96孔可视化布板,借助PC软件可实现单板多种项目测试; 3、8通道光纤测量系统,微孔中心自动定位,可快速准确检测96孔数据;

关于检测仪器—血细胞形态分析仪的简介

  血细胞形态分析仪是临床上用于测试血液中红细胞和血小板的数目以及体积分布、血红蛋白的浓度、白细胞的总数并进行分类的检测仪器。  一、检测仪器—血细胞形态分析仪的定义:  血细胞形态分析仪主要用于血细胞形态学筛查,包括血细胞图像摄取、可视化观察及描述、白细胞分类计数、红细胞形态学特性描述、血小板测定

酶标仪的主要技术是什么

一、组成本仪器由主机和内置打印机组成。二、技术指标1、检测通道:8通道光纤检测;2、显示方式:5.7英寸液晶显示屏;3、布板功能:96孔可视化布板,触摸式操作;*4、模板保存:具有布板模型保存和调用功能;*5、项目测试:同一酶标板可进行12项以上不同项目测试;*6、线性误差:±1.0%(0.000-

彩屏泵吸二合一气体检测仪概述

概述:彩屏泵吸二合一气体检测仪是一款专注于检测空气中氨气、可燃气气体浓度的便携式报警设备。它可安装四种气体传感器,内置微型采样泵的便携式高精度气体检测仪;仪器标配3000条历史数据存储功能,可通过数据列表或曲线图查看历史数据;选配大容量SD卡数据存储功能,可通过电脑从SD卡中读取历史记录,进行打印、