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Nature:构造酵母染色体

合成生物学的目标之一就是构建那些复杂的人工合成有机体。目前,在酵母细胞中已经取得了阶段性的进展——采用分段式方法,研究者已经可以将整个酵母染色体转化成为合成序列了。 生物细胞其实很像是一台计算机——基因组可以比作软件,它负责对细胞的构成进行编码,细胞器则犹如计算机的硬件,负责读取并运行软件的命令。DNA技术的进展使得这个领域的科学家能够以生物学“软件工程师”的角色来进行工作,把新的生物“运行系统”装载到细胞中去。的确,就在2010年,蕈状支原体(Mycoplasma mycoides)的整个基因组被人工合成的基因组所取代,从而产生了第一个合成细胞。如今,Annaluru等人在《科学》(Science)杂志上发表了文章,描述他们的小组是如何开始重写更加复杂的有机体——酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的基因组的。研究者们在文章中叙述了他们怎样在这个酵母中设计并构建出具有功能的合成染色体,这是他们将......阅读全文

生物芯片技术在药物R&D中的应用(二)

4 建立病原作基因的表达模型  由于病原体的基因组规模相对较小,可用包含其全部基因的DNA 芯片鉴定那些对人产生毒害作用的基因。异烟肼(isoniazid,INH)是治疗肺结核的常用药物,其治疗结核病的机制是它阻断了分枝茵酸的生物合成途径。Wilson等根据已测序的肺结核杆菌基因组序列,用PCR

3种常用基因功能验正方法简述

  科研人员在分析项目的过程中,碰到这样的问题:通过各种手段(选择清除分析、比较基因组学分析、转录组分析)获得的行驶某种功能的某基因,如果进行实验的验正呢?一般分为:基因上调(基因转染法)、基因下调(基因干扰法)后看蛋白表达水平、细胞功能改变、在体动物模型中相关功能的变化等。   相信大家也有

3种常用基因功能验正方法简述

  科研人员在分析项目的过程中,碰到这样的问题:通过各种手段(选择清除分析、比较基因组学分析、转录组分析)获得的行驶某种功能的某基因,如果进行实验的验正呢?一般分为:基因上调(基因转染法)、基因下调(基因干扰法)后看蛋白表达水平、细胞功能改变、在体动物模型中相关功能的变化等。   相信大家也有

两项中国科学家肿瘤药物输送成果获国际认可

附:“长江学者”教授风采:郭子建  南京大学化学化工学院长江学者特聘教授。聘任岗位:无机化学。博士生导师。     个人简介  男,1961年10月出生。教育部长江学者奖励计划“特聘教授”,国家杰出青年基金获得者。现任配位化学国家重点实验室主任, 配位化学研究所

酵母双杂交原理(蛋白相互作用)

 概述酵母双杂交系统由Fields和Song等首先在研究真核基因转录调控中建立。典型的真核生长转录因子, 如GAL4、GCN4、等都含有二个不同的结构域: DNA结合结构域(DNA-binding domain)和转录激活结构域(transcription-activating domai

现有技术水平蛋白质水平上研究基因功能的技术有哪些

  随着分子生物学技术的开展,对生物基因组中包含的全部基因及其所翻译的蛋白质的功用加以解读和描绘,特别是大量未知基因的功用及其相应蛋白质产物的功用停止研讨成了基因工程研讨的热点方向。而在蛋白质程度上定量、动态、整体性研讨生物体的蛋白质组学,将在后基因组时期大大促进我们对基因功用的了解。酵母双杂交实验

基因突变新模式?这项研究正在挑战达尔文

  1944年,哥伦比亚大学的遗传学博士生伊夫琳•威特金做实验时出现了一个偶然的失误。她在纽约冷泉港实验室做的第一个实验中,不小心用致死量的紫外线照射了数百万个大肠杆菌(E. coli)。当她第二天回去检查样品的时候,那些大肠杆菌都死了——除了其中一个样品中的四个细胞,它们存活了下来,并且能够继续生

中国学者参与发表Science里程碑式研究成果

  当遗传学家Ronald Davis十年前建议他的同事尝试构建一个人工酵母染色体,并将其整合进活细胞中的时候,Jef Boeke其实并没有特别在意,然而时隔多年,Boeke终于完成了这一构想,合成了第一个酵母功能性染色体,这是合成生物学领域的一项里程碑式成果。   研究人员在3月27日Sci

酵母双杂交检测的原理及应用

检测原理:酵母双杂交系统(Yeast two-hybrid assay)是用于体内研究蛋白相互作用的一种非常便利的工具,常用的如GAL4为基础的系统,使用酵母转录因子GAL4来检测转录激活后的蛋白相互作用。某些转录因子(如GAL4)由两个可以分开,功能上相互独立的结构域组成,N端有一个147个氨

微流控芯片与基因诊断关系的研究进展

微流控芯片已经广泛于医学、生物、电子、流体、化学等领域,且微流控芯片可把样品制备、反应、分离、检测、扩增、分析等集成到一块几微米至几百微米尺度的芯片上并自动完成所有基本过程。目前,微流控芯片已经广泛地应用到医学基因诊断方面,例如基因多态性检测、基因高效性测序、基因快速性扩增等,为此,本文主要对微流控

真核细胞表达系统-1

自上世纪70年代基因工程技术诞生以来,基因表达技术已渗透到生命科学研究的各个领域。并随着人类基因组计划实施的进行,在技术方法上得到了很大发展,时至今日已取得令人瞩目的成就 。随着人类基因组计划的完成,越来越多的基因被发现,其中多数基因功能不明。利用表达系统在哺乳动物细胞内表达目的基因是研究基

真核细胞表达系统的类型与常用真核细胞表达载体

原核表达系统是常被用来研究基因功能的成熟系统,由于原核表达系统具有包涵体蛋白不易纯化、蛋白修饰不完整等缺陷,人们也开始利用真核细胞表达系统来研究基因。自上世纪70年代基因工程 技术诞生以来,基因表达技术已渗透到生命科学研究的各个领域。并随着人类基因组计划实施的进行,在技术方法上得到了很大发展,时至今

Science发表CRISPR基因组编辑重要成果

  利用两种互补的分析方法,Whitehead研究所和麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所的科学家们,第一次在人类基因组中鉴别出了人类细胞系或培养人类细胞生存及增殖必需的基因宇宙。  他们的研究结果和在该研究中开发出的材料,不仅为全球科研团体提供了宝贵的资源,还可应用于发现各种人类癌症药物可靶向的

惊人发现:食物会影响我们的基因?

  科学家们最近发现,我们的大多数基因都会受到食物的影响。这项引人注目的研究发表在Nature旗下新期刊Nature Microbiology上。  细胞行为是由基因活性决定的,而基因活性受到表观遗传学开关的调控。此前有研究表明,基因调控还存在另一个层面,那就是代谢网络。代谢是维持细胞的生化反应,主

Nature子刊:华人团队带来CRISPR新突破 1个月完成多年工作

  日前,《自然》子刊《Nature Biotechnology》上刊发了一项来自华人学者的重要研究。来自伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校(UIUC)的华人学者赵惠民教授团队开发出了一项全新的CRISPR技术,它有望极大加速基础研究的进程。  “过去,研究人员需要花上好几年,才能敲除掉酵母里的每一个基因

是敌是友?基因突变的“互抖”或成癌症病人救命稻草

  我敌人的敌人是我的朋友--这个古老的概念解释了许多奇怪的甚至令人讨厌的联盟。这个概念不仅适用于国家事务,还包括基因组,即一个潜在的有害突变能够被二次突变有效地中和,称之为突变抑制基因。直到最近,突变抑制基因都是未解之谜。利用这些基因去对抗致病突变几乎是不可能的。然而,全基因组调查结果显示许多携带

生物芯片技术在药物R&D中的应用(一)

1946年世界上第一台电子数字计算机ENIAC在美国Pennsylvania大学问。在随后的50年里,以美国的硅谷为摇篮,计算机技术不断飞速发展,给我们的生活带来了巨大的变革。无独有偶,1991年又是在美国硅谷,Affymax公司开始了生物芯片的研制,他们将芯片光刻技术与光化学合成技术相结合制作了寡

武汉植物园在抗癌三萜化合物生物合成研究上取得进展

药用化合物白桦酯酸、熊果酸与齐墩果酸的生物合成途径   药用化合物白桦酯酸、熊果酸以及齐墩果酸具有抗肿瘤、HIV病毒以及抵抗多种微生物病菌的功效,尤其是白桦酯酸,被认为是继紫杉醇之后又一最具潜力的抗癌药。   中国科学院武汉植物园天然药物生物合成学科组的博士研究生黄莉莉在章焰生研究员的指

Nature:合成生物学里程碑 大规模量产半合成青蒿素

非洲肯尼亚的种植青蒿的人员正在清理田地。  在获得一项突破性研究发现的12年之后,来自加州大学伯克利分校(UC Berkeley)化学工程学系的Jay Keasling看到他的梦想成为了现实。  在4月11日,赛诺菲(Sanofi)将基于Keasling研究发现,启动大规模地生产一种半合成青蒿素(a

基因修补技术令酵母寿命延长十倍 有望用于人类

北京时间1月16日消息,据美国生活科学网报道,利用基因修补技术,科学家成功地将酵母的寿命延长了10倍!从之前的1个星期延长到现在的10个星期。  在制作面包和啤酒的过程中,微生物酵母扮演着重要角色。与以前在一种生物体中创造的寿命延长纪录相比,它是前者的两倍。科学界为之振奋,因为这一突

三种常用基因功能验正方法

科研人员在分析项目的过程中,碰到这样的问题:通过各种手段(选择清除分析、比较基因组学分析、转录组分析)获得的行驶某种功能的某基因,如果进行实验的验正呢?一般分为:基因上调(基因转染法)、基因下调(基因干扰法)后看蛋白表达水平、细胞功能改变、在体动物模型中相关功能的变化等。1、 RNA 干扰

天津工生所揭示与工业酵母高温发酵性能相关的遗传变异

  酿酒酵母作为一种重要的工业生物,不仅被广泛用于传统食品发酵工业,也是合成生物学和现代发酵工业最常用的底盘细胞之一,用于生物燃料、大宗化学品、天然化合物、医药原料等多元化产品的研发,具有巨大的市场潜力和社会经济效益。酿酒酵母细胞生长需要合适的温度,温度的变化将导致细胞生长和繁殖速度的改变以及细胞酶

张宏Cell子刊发文 解析自噬降解

  12月17日,中国科学院生物物理研究所张宏课题组和日本微生物化学所Nobuo N. Noda课题组合作,在国际刊物《分子细胞》(Molecular Cell)上,在线发表了题为Structural basis of the differential function of the two C.

基因编辑进展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技术应用篇(下)

  上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。   一、大规模基因功能的筛选   尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基

基因编辑进展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技术应用篇(下)

  上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。   一、大规模基因功能的筛选   尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基因型-表型关系仍

成都生物所酵母耐热基因研究获进展

  第二代燃料乙醇具有清洁、原料来源广泛、可再生等诸多优点,有望替代传统化石能源的使用,缓解当前人类社会面临的日趋严重的能源危机及环境污染等问题,成为目前各国研究的热点。木质纤维素原料的高效、低成本酶解是纤维素乙醇能否实现产业化的关键之一。目前广泛使用的同步糖化发酵方式(SSF),能使糖化和发酵在时

Cell子刊揭示一大波衰老基因

  从古至今,人类从未停止过对长生不老的追求。现在科学家们正在逐步揭开衰老的秘密,在分子水平上寻找延缓衰老和治疗衰老相关疾病的线索。  Buck衰老研究所和华盛顿大学的科学家们经过十年努力,最终鉴定了238个与衰老有关基因。研究表明,去除这些基因可以延长酿酒酵母的复制寿命。相关论文发表在十月八日的C

最新研究:你吃进去什么,能影响基因

  基因是具有遗传效应的DNA片段,作为决定生命健康的内在因素,基因支持着生命的基本构造和性能。它储存着生命的种族、血型、孕育、生长、凋亡过程的全部信息。演绎着生命的繁衍、细胞分裂和蛋白质合成等重要生理过程。生物体的生、长、衰、病、老、死等一切生命现象都与基因有关,是决定生命健康的内在因素。  众所

甲醇酵母基因表达系统

 1 甲醇酵母表达系统的特点  1.1 宿主  七十年代巴斯德毕赤酵母曾被用于生产单细胞蛋白(SCP),有很好的发酵基础,菌体密度可达100g/L干重。其生长培养液的组分包括无机盐、微量元素、生物素、氮源和碳源,廉价而无毒。它能在以甲醇为唯一碳源的培养基中快速生长,其中醇氧化酶AOX——甲醇代谢途径

Nature子刊:阻击ALS毒性蛋白

  肌萎缩侧索硬化ALS到目前为止还是一种不治之症。日前,Gladstone研究所和斯坦福大学医学院发现,操纵一个基因能够中止神经细胞中毒性蛋白的累积,为包括ALS在内的多种神经退行性疾病提供了新的治疗策略。该研究发表在十月二十八日Nature Genetics杂志上。   ALS 患者通