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Nature:构造酵母染色体

合成生物学的目标之一就是构建那些复杂的人工合成有机体。目前,在酵母细胞中已经取得了阶段性的进展——采用分段式方法,研究者已经可以将整个酵母染色体转化成为合成序列了。 生物细胞其实很像是一台计算机——基因组可以比作软件,它负责对细胞的构成进行编码,细胞器则犹如计算机的硬件,负责读取并运行软件的命令。DNA技术的进展使得这个领域的科学家能够以生物学“软件工程师”的角色来进行工作,把新的生物“运行系统”装载到细胞中去。的确,就在2010年,蕈状支原体(Mycoplasma mycoides)的整个基因组被人工合成的基因组所取代,从而产生了第一个合成细胞。如今,Annaluru等人在《科学》(Science)杂志上发表了文章,描述他们的小组是如何开始重写更加复杂的有机体——酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的基因组的。研究者们在文章中叙述了他们怎样在这个酵母中设计并构建出具有功能的合成染色体,这是他们将......阅读全文

Nature子刊:阻击ALS毒性蛋白

  肌萎缩侧索硬化ALS到目前为止还是一种不治之症。日前,Gladstone研究所和斯坦福大学医学院发现,操纵一个基因能够中止神经细胞中毒性蛋白的累积,为包括ALS在内的多种神经退行性疾病提供了新的治疗策略。该研究发表在十月二十八日Nature Genetics杂志上。   ALS 患者通

癌细胞线粒体DNA漂移的分子机理

  通过对57例结肠癌患者的基因组进行基因分析,研究人员发现患者体细胞核内的平均线粒体DNA数量比健康人高4.42倍。“这表明,迁移到核基因组中的线粒体DNA可能对癌症的发展起重要作用,”本文的共同作者,来自UAB公共卫生学院的生物统计学教授Hemant K. Tiwari博士和UAB医学院遗传学教

β-胡萝卜素的生物合成研究取得新进展

  β-胡萝卜素是一种天然色素,属于四萜类化合物,有很高的药理学及营养学价值,现在已广泛应用于医药、保健品、食品添加剂及化妆品等行业。构建高效合成β-胡萝卜素的微生物菌株具有良好的应用前景。   中国科学院武汉植物园天然产物合成生物学学科组硕士研究生李倩在章焰生研究员的指导下,于酿酒酵母中重构了β

武汉植物园β-胡萝卜素的生物合成研究取得新进展

  β-胡萝卜素是一种天然色素,属于四萜类化合物,有很高的药理学及营养学价值,现在已广泛应用于医药、保健品、食品添加剂及化妆品等行业。构建高效合成β-胡萝卜素的微生物菌株具有良好的应用前景。   中国科学院武汉植物园天然产物合成生物学学科组硕士研究生李倩在章焰生研究员的指导下,于酿酒酵母中重构了β

潘多拉病毒,基因世界的“匹诺曹”

《木偶奇遇记》中和蔼可亲的老木匠皮帕诺和匹诺曹的故事,很多人都非常熟悉。可你知道吗?在携带生命密码遗传信息的基因世界里,竟然也有皮帕诺和匹诺曹一样的“神存在”。日前,法国科学家在研究中新发现的三种潘多拉病毒,可能擅长创造全新的基因,并在病毒庞大的基因组中发现了许多“孤儿基因”。潘多拉病毒的“魔

Cell挑战传统观点,提出基因表达新模式

  与普遍的科学观点相反,来自荷兰乌特勒支大学医学中心(UMC)的Frank Holstege教授发现,许多的基因被默认开启。   个体之间的遗传差异可影响疾病的起因和治疗,这推动了科学家们去展开更大规模的遗传研究。然而,我们有时候却似乎缺乏最基本的遗传学认知。   Holstege研究小组证实

靶向突变细胞的新方法或为开发个体化癌症疗法提供思路

  明尼苏达大学、梅奥诊所以及多伦多大学的研究者开发了一种新型的靶向作用突变细胞的方法,这或许为进一步开发个体化疗法来治疗癌症提供思路。(Credit: University of Minnesota)   2013年10月16日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,刊登在国际杂志Cancer

DNA修复出错何以致癌?

  最近,日本大阪大学的一组研究人员发现,如果在DNA受到辐射损伤的时候DNA损伤应答(DDR)不起作用,那么,那些应该被去除的蛋白质反而会保留下来,遗传信息的丢失可能被刺激,当被错误修复的时候,这会导致肿瘤的形成。相关研究结果发表在《PLOS Genetics》杂志。  人们认为,细胞癌变的原因之

如何寻找对有益的基因突变?Science有新招

  人们通常认为基因突变给机体带来了疾病,但并不是所有的突变都是罪魁祸首,有些甚至可以抵消或抑制某些突变带来的恶性结果,该过程被称为基因抑制,且鲜为人知。11月4日,多伦多大学的研究人员揭露了该过程的基本原理,这为人们了解基因抑制过程奠定了基础。  有些突变能抵消有害突变带来的恶性结果  该研究由D

Cell挑战传统观点,提出基因表达新模式

  与普遍的科学观点相反,来自荷兰乌特勒支大学医学中心(UMC)的Frank Holstege教授发现,许多的基因被默认开启。   个体之间的遗传差异可影响疾病的起因和治疗,这推动了科学家们去展开更大规模的遗传研究。然而,我们有时候却似乎缺乏最基本的遗传学认知。   Holstege研究小组证实

“人造生命” 我国科学家“创造”世界首例单染色体真核细胞

  日前,中科院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所合成生物学重点实验室覃重军研究团队与合作者,在国际上首次人工创建了单条染色体的真核细胞:把酿酒酵母细胞里原本天然的16条染色体,人工融合成单条染色体,且仍具有正常的细胞功能。既改变了染色体的结构,又仍保有生命的“活性”,人工蜕变出一个全新细

你的遗传背景如何塑造了你的“与众不同”

  几乎每个家族都有一个嗜酒如命、喜欢吃肉、不爱运动的亲戚,但他们仍过着幸福的晚年生活,而另一些很关心自己健康的人却英年早逝。命运为何如此不公?如今,只需看看你的基因组,我们就有可能判断谁是那个幸运儿。  在遗传背景下,任何两个人的基因组都有无数的细微差异,这些差异以科学家尚不完全清楚的方式影响着基

Nature重磅新星-eccDNA的物种发现史(二)

3.非洲爪蟾染色体外环状DNA的形成与端粒DNA相关发表期刊:EMBO reports影响因子:8.383发表时间:2002.10.15文章链接:Formation of extrachromosomal circles from telomeric DNA in Xenopus laevis端粒D

遗传疾病研究新方法介绍

  近日来自Texas University Austen的研究人员做了一个有趣的实验,他们向酵母细胞内插入我们人类的某片段基因,发现这些携带我们遗传物质的酵母菌株并没有死亡,而这可能预示着一种新的遗传病研究方法的诞生。   酵母细胞和我们人类在遗传信息上存在着一定的联系。这种以单细胞形式存在的真

我们都活到100岁的世界什么样?

   美国《大西洋月刊》网站在近日的报道中指出,随着社会不断进步,人类的寿命也不断增加,如果这种增加持续下去,那么,在可见的未来,百岁老人的数量将大幅增加,从而对整个社会产生巨大而又深远的影响。  数千年来,人们一直坚信一个真理,那就是:生命何其短暂,少数活得久一点的人,也因为其超乎常人的年龄,而被

遗传疾病研究新方法

近日来自Texas University Austen的研究人员做了一个有趣的实验,他们向酵母细胞内插入我们人类的某片段基因,发现这些携带我们遗传物质的酵母菌株并没有死亡,而这可能预示着一种新的遗传病研究方法的诞生。酵母细胞和我们人类在遗传信息上存在着一定的联系。这种以单细胞形式存在的真菌存在着许多

酵母菌载体与克隆基因表达产物的检测

构建LacZ融合载体研究酵母菌基因调控。由于这种检测方法简便而且灵敏度高,因此,酵母菌基因经常以LacZ基因的功能 部分作标签,来指示待研究酵母菌基因的表达调节功能。融合蛋白被这样构建:酵母基因的启动子加上这个基因编码蛋白的N端的几个氨基酸残基融合在LacZ基因的羧基 端,由此编码的蛋白质片段仍保持

基因编辑进展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技术应用篇(三)

上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。一、大规模基因功能的筛选尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基因型-表型关系仍然是数量遗传学的一个

Natureasia聚焦:CRISPR/Cas研究进展Top20

  CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种后天免疫系统,其以消灭外来的质体或者噬菌体并在自身基因组中留下外来基因片段作为“记忆”。  CRISPR/Cas系统全名为常间回文重复序列丛集/常间回文重复序列丛集关联蛋白系统(clustered regularly inte

酵母双杂交系统的实验步骤

酵母双杂交系统的实验步骤 1. 将报告基因p8op-LacZ转化酵母EGY48菌株,用培养基SD/-Ura筛选。2. 同时构建DNA文库,并纯化足够的质粒以转化酵母细胞。3. 构建DNA-BD/靶蛋白质粒pLexA-X,作为钓饵(bait)。4. 将

英国科学家揭开细胞繁殖秘密

  近日,英国皇家学会期刊“开放生物学”(Open Biology)刊登的一项研究成果表明,英国科学家首次识别出生物体内细胞繁殖所需要的几乎全部基因。   英国癌症研究中心(Cancer Research UK)的科学家们研究了一组单一基因被敲除的酵母突变株。科学家对每一株进行鉴定以确定突

人造酵母:捅破生命界限的“窗户纸”

  覃重军说自己是个“懒人”,最近5年来,他平均每年的论文还不到1篇;他也不怎么去积极申请经费,每天要么在单位院子里散步,要么就是关在办公室里,琢磨事儿。   他开玩笑说,像他这样的人在别的地方,估计早就被开除了。   但是,他所工作的中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所非但没

人造酵母:捅破生命界限的“窗户纸”

  覃重军说自己是个“懒人”,最近5年来,他平均每年的论文还不到1篇;他也不怎么去积极申请经费,每天要么在单位院子里散步,要么就是关在办公室里,琢磨事儿。   他开玩笑说,像他这样的人在别的地方,估计早就被开除了。   但是,他所工作的中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所非但没

微流控芯片与基因的关系

  基因测序主要是指采用先进的方法对高等动物、低等动物核酸序列进行系统化、规范化、快速化分析,此过程需要的工程量尤为巨大。目前,对微流控芯片实验室主要采用96根阵列毛细管电泳对基因序列进行系统化测定,虽在一定程度上加快了人类基因组项目,但是还不能实现高效、灵敏、快速、价廉、自动、准确等基本

LexA酵母双杂交系统的设计原理

 LexA酵母双杂交系统的设计原理 报告质粒p8op-LacZ的GAL4 UAS编码序列被完全去除,因此在缺乏LexA融合激活剂的情况下,报告基因LacZ的转录活性为零,该基因的筛选标志为URA3,可以作为有自主复制能力的质粒存在于酵母EGY48菌株中,也可以被整合到EGY48基

内含子的重要功能:帮助酵母应对压力下的生存

  内含子(intron)的存在,是真核细胞蛋白质编码基因与原核细胞最大的区别。在真核细胞基因表达的过程中,需要经过RNA剪接反应将其去除。一般来说,内含子的长度远比编码蛋白的外显子序列长,并且执行剪接反应的酶——剪接体高度复杂,由170多个相关蛋白组成。剪接反应需要高度精准,移码错位一个碱基都会导

异养菌转化自养菌获突破,这种菌将以CO2作为唯一碳源

  巴斯德毕赤酵母广泛用于工业酶和药物的生产。像大多数生物技术生产宿主一样,巴斯德毕赤酵母是异养的,生长在有机原料上,这些原料在食品和动物饲料的生产中具有竞争性用途。如果将二氧化碳用作碳原料,生物技术制造业将变得更具可持续性,因为它不会消耗有机原料,并且会消耗大气中的二氧化碳。  2019年12月1

基因分离克隆的方法

1 基因芯片技术分离目的基因生物芯片是高密度固定在固相支持介质上的生物信息分子的微列阵。列阵中每个分子的序列及位置都是已知的,并按预先设定好的顺序点阵。基因芯片是生物芯片的一种,其上固定的是核算类物质,主要用于DNA、RNA分析。分为DNA芯片和微点阵两种。分离目的基因是是指从基因组中发现或找出某个

Science重要成果揭示遗传学基本规则

  生物通报道:人们往往将突变视为引发疾病的基因错误。其实并非所有突变都有害,有些突变甚至能抵消或抑制致病突变的危害。不过,科学家们对这种基因抑制(genetic suppression)机制还知之甚少。多伦多大学的研究人员首次对细胞中的抑制突变进行了全面分析,揭示了基因抑制的基本规则。相关论文于十

抗体筛选技术汇总

  近年来,生物药的市场需求逐年扩容,其中抗体药物因其靶向性好,治疗效果显著,在生物药中占据着举足轻重的地位,目前已经进入了抗体药物发展的黄金时代。随着抗体药的需求越来越大,抗体筛选技术的发展也是日新月异,目前应用较普遍的有杂交瘤技术、抗体文库筛选技术、纳米抗体技术和转基因小鼠抗体筛选技术。其中抗体