研究比较芯片和测序在分析无细胞胎儿RNA转录组上的能力

来自GenomeWeb的消息——美国塔夫茨医学中心(Tufts Medical Center)的一组研究人员最近评估了芯片和新一代测序在分析无细胞胎儿RNA中基因表达的能力,这些胎儿RNA来自羊水上清。 他们发现,表达芯片带来了基因表达的更广泛视图,特别是对低浓度或降解的样品,而在这一方面,RNA-seq面临“技术上的挑战”。与此同时,他们也指出,RNA-seq的数据让人更好地专注选择性剪接以及与胎儿发育相关的特异生物学通路。 这些结果发表在上周的《Prenatal Diagnosis》杂志上。 “我们最终了解到的是,使用芯片并没有那么糟,因为你能得到更多鉴定出的序列,”塔夫茨母婴研究所的执行主管Diana Bianchi谈道,她也是这篇文章的通讯作者。“若你希望通过RNA-seq检测到额外的序列,那么你似乎需要更高质量的RNA,”她告诉BioArray News。 Bianchi表示,她和她的同事主动去比较表达芯片......阅读全文

生物芯片与与电子芯片的比较

生物芯片和电子芯片有什么区别呢?其实电子芯片和生物芯片有着既远又近的关系。“它们相同的地方在于,都用很小的元件,储藏很大的信息量,输入输出也很大。”杨洪波说。所谓的生物芯片输出,就是在平方厘米大的芯片上,用特制的扫描仪扫出1百万个化学分子的反应信号,“一行一行地扫,小到0.5微米的地方也全部会被扫到

比较基因组杂交芯片介绍

  比较基因组杂交芯片(Comparative Genomic Hybridization Array)、基于芯片的比较基因组杂交(Microarray-based comparative genomic hybridization)或者阵列比较基因组杂交技术(array comparative g

比较基因组杂交芯片介绍

比较基因组杂交芯片(Comparative Genomic Hybridization Array)、基于芯片的比较基因组杂交(Microarray-based comparative genomic hybridization)或者阵列比较基因组杂交技术(array comparative gen

主流生物芯片扫描仪比较

生物芯片技术是20世纪末发展起来的一项新技术。生物芯片是在微小面积上,利用微加工技术,并结合有关的化学合成技术制造而成的一种具有一定分子生物学检验功能的微型器件。分析和解释生物芯片上得到的信息,将在DNA结构与功能之间架起一道桥梁,进而推进生命科学的迅速发展。目前,荧光标记是生物芯片信息采集中使用最

主流生物芯片扫描仪比较

  生物芯片技术是20世纪末发展起来的一项新技术。生物芯片是在微小面积上,利用微加工技术,并结合有关的化学合成技术制造而成的一种具有一定分子生物学检验功能的微型器件。分析和解释生物芯片上得到的信息,将在DNA结构与功能之间架起一道桥梁,进而推进生命科学的迅速发展。  目前,荧光标记是生物芯片信息采集

基因芯片与RNAseq的比较分析

  最近几年二代测序(又叫NGS)很火,而且价格越来越便宜,原来都用芯片检测mRNA、miRNA、LncRNA表达量的,好像不少都换用RNA-seq了。那么,到底选择哪种更好呢?今天就来回答下这个问题。一句话—— 看研究目的。  常见误区一:  测序的准确性高,获得的信息更丰富  对,但又不对。  

基因芯片与RNAseq的比较分析

基因芯片 vs RNA-seq哪个好 ?最近几年二代测序(又叫NGS)很火,而且价格越来越便宜,原来都用芯片检测mRNA、miRNA、LncRNA表达量的,好像不少都换用RNA-seq了。那么,到底选择哪种更好呢?今天就来回答下这个问题。一句话—— 看研究目的。常见误区一:测序的准确性高,获得的信息

研究比较芯片和测序在分析无细胞胎儿RNA转录组上的能力

  来自GenomeWeb的消息——美国塔夫茨医学中心(Tufts Medical Center)的一组研究人员最近评估了芯片和新一代测序在分析无细胞胎儿RNA中基因表达的能力,这些胎儿RNA来自羊水上清。  他们发现,表达芯片带来了基因表达的更广泛视图,特别是对低浓度或降解的样品,而在这一方面,R

数控加工微流控芯片材质的选择比较和说明

数控CNC设备能够加工高精度的聚合物材质芯片产品(PMMA,PC,ABS,TEFLON等工程塑料)和金属材质(铝、镍和不锈钢等),汶颢芯片数控加工通道宽度最小极限为150μm,深度极限视加工特征定性,最大加工范围为400*400*260cm,配合高精度检测设备,控制产品尺寸精准,表面粗糙度微小,能够

国外质检体制机制的比较研究

  三、日本  20世纪50年代是日本的质检体制机制发展完善的关键时期。一方面,由于1955年日本加入关税及贸易总协定(GATT)后,日本承受着国际竞争压力;另一方面,日本战后经济转型,从农业、轻工业向重化工业的转化中推行了“产业合理化运动”,将质量提升到与产业结构调整并重高度。由此日本形成了政府主

国外质检体制机制的比较研究

  欧盟是一个政治和经济共同体,一直在推进建立欧盟内自由贸易的“单一市场”,在政治制度上也逐渐建立起超国家层面有力的统一管理。在质检体制机制的完善发展过程中,也呈现了与美国不同的统一、宏观特征。  (一)欧盟质检机构与职能  1.欧盟委员会企业和工业总司。负责欧盟计量协调工作,促进开发和使用创新的欧

法医-DNA检测平台的研究进展与比较研究

法医 DNA检测平台的研究进展与比较研究摘要:现代科学技术带动了 DNA检测技术在法医领域的不断发展.以目前世界上比较先进的三个 DNA检测平台为例,探讨法医 DNA检测平台的研究与应用.每项技术有其优缺点,在实际的法医 DNA检 测中,要灵活地选用检测平台,以促进工作的顺利开展.近几年来,中国

用于药物研究的心脏组织芯片

  最近有生物工程研究者,尝试将人类的心脏细胞组织嵌入微流控制芯片(microfluidic chip),用于研究心脏在药物刺激下的反应。  临床上尝试用动物模型代替人类进行药物测试的早期阶段测试,但是动物往往无法反应出药物在人体的相关反应,因为不同药物在不同种类的生物体内的反应相差很大。不同种类的

生物芯片技术的研究背景

原定于2005年竣工的人类30亿碱基序列的测定工作(Human Genome Project,基因组计划)由于高效测序仪的引入和商业机构的介入已经完成。怎样利用该计划所揭示的大量遗传信息去探明人类众多疾病的起因和发病机理,并为其诊断、治疗及易感性研究提供有力的工具,则是继人类基因组计划完成后生命科学

生物芯片技术研究背景

原定于2005年竣工的人类30亿碱基序列的测定工作(Human Genome Project,基因组计划)由于高效测序仪的引入和商业机构的介入已经完成。怎样利用该计划所揭示的大量遗传信息去探明人类众多疾病的起因和发病机理,并为其诊断、治疗及易感性研究提供有力的工具,则是继人类基因组计划完成后生命科学

确定生物芯片实验研究目标

目前生物芯片尤其是基因芯片已广泛用于医学研究之中,已有很多商业化生产的生物芯片产品销售,研究者直接可以选择成型的产品使用,不需要自己制备芯片,因此如何正确使用芯片解决研究中的生物学问题是研究者更关注的。     基因芯片设计是最重要的部分,它关系到最终结果能否达到预期目标。实验设计首先要明确以下几个

生物芯片技术的研究背景

  原定于2005年竣工的人类30亿碱基序列的测定工作(Human Genome Project,基因组计划)由于高效测序仪的引入和商业机构的介入已经完成。怎样利用该计划所揭示的大量遗传信息去探明人类众多疾病的起因和发病机理,并为其诊断、治疗及易感性研究提供有力的工具,则是继人类基因组计划完成后生命

基因芯片的应用研究领域

研究领域包括基因表达检测、寻找新基因、杂交测序、基因突变和多态性分析以及基因文库作图以及等方面。1、基因表达检测。人类基因组编码大约10万个不同的基因,仅掌握基因序列信息资料,要理解其基因功能是远远不够的,因此,具有监测大量mRNA(信使RNA,可简单理解为基因表达的中介物)的实验工具很重要。有关对

LncRNA芯片应用于胃癌研究

上海交通大学附属仁济医院房静远教授主要从事消化系统肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗等相关研究。近期,该课题组应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌组织的lncRNAs表达情况,筛选到可预测胃癌发生的分子标志物GClnc1,并且阐明了GClnc1在胃癌的发生和发展中是如何发挥

LncRNA芯片应用于胃癌研究

     研究背景      在全世界分范围内,每年因肝癌死亡的病例超过50万人,是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中,随着影像学的进步以及健康体检的普及,越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺,外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确

微流控芯片抗衰老研究

白藜芦醇苷是一种存在于天然植物中的功效成分,一种具有保护肝脏、抑制血小板聚集、抗菌、抗病毒、降血脂及抗脂质过氧化等,多种药理作用的成分的物质存在于天然的植物中,它就是白藜芦醇苷。不过目前科学家对其抗衰老的功效和分子机制等尚待研究。 为此,以微流控药物评价平台为基础,科研人员用经典的模式生物—秀丽隐杆

生物芯片技术的研究发展

生物芯片技术的发展最初得益于埃德温·迈勒·萨瑟恩(Edwin Mellor Southern)提出的核酸杂交理论,即标记的核酸分子能够与被固化的与之互补配对的核酸分子杂交。从这一角度而言,Southern杂交可以被看作是生物芯片的雏形。弗雷德里克·桑格(Fred Sanger)和吉尔伯特(Walte

生物医学研究类器官芯片的研究进展

现有的生物医学研究模型主要是细胞系模型和动物模型。细胞系模型是简单、经济、最常见的,但单细胞的细胞生长模式的生长模式缺乏细胞-细胞、细胞-细胞基质间的相互作用,体外培养过程中会丢失细胞的异质性及其在体内的特性,使其无法模拟复杂的三维环境和组织细胞在体内的功能及相关的信号通路。动物模型可以近似于人类生

蓝藻和叶绿体基因组的比较研究

原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。蓝藻基因组的作图和测

对于焦炉煤气脱硫方法的比较研究

 煤化行业作为能源消耗比较大、污染排放物比较多的一个行业,在生产运作中势必产生大量的焦炉煤气,因此要对其进行脱硫处理.一方面可以减少其对设备的腐蚀危害及维护成本,同时可以提高脱硫产品的回收质量,以便在循环使用中达到预期的目标.焦炉煤气不同脱硫方法的使用条件和范围上各有差异,这就需要明晰具体脱硫方法的

最新DNA甲基化测序技术比较研究

  在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具体模式通常与诸如疾病亚型、疾病预后以及药物反应等临床信息具有一一对应的联系。在多种癌症的治疗过程中,DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。  对于拥有成千上万个样本的大量病人来说,全基因组映射与DNA甲基化分析是非常合

植物多组学比较和进化研究平台发布

近日,西北农林科技大学生命科学学院马闯教授团队发布了植物多组学数据跨物种比较和进化研究的在线分析平台,相关成果发表在Molecular Biology and Evolution上。进化是植物性状遗传多样性和适应生存环境的基础,而基因变异是物种进化的源动力。随着后基因组时代高通量技术的发展和应用,在

蓝藻和叶绿体基因组的比较研究

  原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模式生物。  蓝藻基因组的

蓝藻和叶绿体基因组的比较研究

蓝藻和叶绿体基因组的比较研究原核的蓝藻和真核植物(包括其他藻类)中的叶绿体,都同样进行放氧的光合作用,这为人类和整个生物界提供了赖以生存的食物、氧气、能源和原料。对叶绿体和蓝藻的细胞结构和分子生物学特性作分析,证明真核生物的叶绿体可能起源于蓝藻祖先的内共生。这使蓝藻在20多年来已成为光合作用研究的模

大规模基因比较助力系谱图研究

Emily和Alan Lemmon希望生物学家可以利用他们的技术绘制系谱图。   Emily Moriarty Lemmon永远不会忘记她在读研究生时,为建立青蛙系谱图而付出的努力。为了了解不同种类青蛙之间如何彼此相关,她需要评估尽可能多的DNA差异,但是时间和资金大大限制了她可以确定和测试的