天津工生所等基因组数据整合研究获系列进展
随着人类基因组计划(Human genome project, HGP)和高通量生物芯片技术的成功研发,人们广泛利用高通量全基因组生物芯片的技术手段,采用全基因组关联研究(Genome-Wide Association Studies, GWAS)的方法筛选复杂疾病易感多态(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),取得了前所未有的成就。这些易感多态最初在欧美人群中首先被报道与疾病显著相关,但是在后期其它群体候选研究中却出现了不一致的结果。 中国科学院天津工业生物技术研究所陈祖耕研究组(基因组分析实验室)研究人员认为,造成这种结果的不一致性可能是由于以下两个原因:第一,和初始欧美人群的大量的样本量相比,其它群体的小样本量没有足够的统计效能去识别显著的疾病关联。第二,不同群体之间存在着遗传的异质性,在一个群体中关联的多态未必在另外一个群体中显著相关。 为了验证这一观点,天津工生所基因组分析......阅读全文
酶多态性介绍
中文名称酶多态性英文名称enzyme polymorphism;multiple forms of an enzyme定 义在单一物种中天然存在的、具有相同酶活性的多种蛋白质形式。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)
酶的多态性
酶的遗传多态性表现为许多酶都在存在同工酶的现象。同工酶(isozyme或isoenzyme)是指分子结构不同的酶,可催化相同化学反应,这类酶称为同工酶。同工酶不仅可存在于不同个体。也可存在于不同的组织中,甚至在同一细胞的不同细胞器中有同工酶。
纳米磁珠唾液DNA检测可用于脑卒中相关基因多态性分析
应用纳米磁珠法从唾液提取的DNA(1-5)和传统试剂盒法从血液样本中提取的DNA(7-11)的亚甲四氢叶酸还原酶C677T基因扩增结果 亚甲四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T基因多态性表达在中国人群中远远高于欧洲人群,是脑卒中的危险因子之一。目前的检测程序耗时且需有创采集血样,难以在大
PCRRFLPSSCP及测序用于霍乱弧菌ctxAB基因多态
建立PCR-RFLP-SSCP及测序方法,用于分析霍乱弧菌肠毒素AB(ctx-AB)基因多态性。针对ctx-AB基因设计引物,扩增片段为528bp,包括ctx-B编码基因375bp,引物序列为5′-GGT GTA AAA TTC CTT GAC G-3′和5′-GGT TCG ATG ATG A
单核苷酸多态性在基因组内的形式介绍
一是遍布于基因组的大量单碱基变异; 二是分布在基因编码区(coding region) , 称其为cSNP,属功能性突变。 SNP在单个基因或整个基因组的分布是不均匀的: (1)非转录序列要多于转录序列 (2)在转录区非同义突变的频率, 比其他方式突变的频率低得多。
生物多态性的概念
生物多态性是指地球上所有生物,从食物链系统、物种水平、群体水平、个体水平、组织和细胞水平、分子水平、基因水平等层次上体现出的形态(morphism)和状态(state)的多样性。
遗传多态性的产生
用分子生物学的术语来定义,遗传多态性就是一种孟德尔单基因性状,在同一正常群体中的同一基因位点上具有多种等位基因引起,并在环境影响下,由此导致生物机体遗传结构所产生的多种物理表现和可见性状。自然选择是造成遗传多态性的主要原因。多态现象的遗传机制的研究有助于对生物进化过程的了解。影响遗传多态性的因素很多
遗传多态现象介绍(二)
根据酶的多态性产生原因不同,大致可以分为三类: (1)多座位同工酶(multiple loci determining isozyme):是指由不同基因座位决定的同工酶。例如乳酸氢酶(lactic dehydrogenase,LDH)有A、B两种亚基,分别由LDHA基因(定位于11p
DNA多态性的概念
DNA多态性是指群体内某个基因座存在2个或多个等位基因形成而造成的同种DNA分子的多样性,是单一基因座等位基因变异性在群体水平的体现。凡在群体中出现频率大于1%的变异体,不论其是正常还是致病性,称多态性;频率低于1%的变异体,则考虑为突变。
什么是DNA多态性?
DNA多态性是指群体内某个基因座存在2个或多个等位基因形成而造成的同种DNA分子的多样性,是单一基因座等位基因变异性在群体水平的体现。凡在群体中出现频率大于1%的变异体,不论其是正常还是致病性,称多态性;频率低于1%的变异体,则考虑为突变。
生物多态性的类型
遗传和变异这一对既对立又统一的内在矛盾,在外在环境的影响下相互作用,促生了生物群体遗传多态性的存在,进而提供了物种进化的动力。根据一个群体中各种变异类型的比例,可以把遗传多态性分为两种类型:平衡型:一个群体中各种变异类型的比数可以长期保持不变,呈现所谓平衡型(或稳定)多态现象;过渡型:一个群体中各种
遗传多态性现象度量
遗传多态性现象是指同一生物群体中,两种或两种以上变异类型或基因型并存的现象。一般认为每种变异型的频率超过1%即可定为多态现象,不足1%的称为罕见变异型。由于生物的遗传多态性是通过多方面表现的,对遗传多态性应该进行多角度的综合评价,避免应用单一方法进行研究。形态学研究具有检测直观、相关文献资料丰富、研
DNA多态性的概念
DNA多态性是指群体内某个基因座存在2个或多个等位基因形成而造成的同种DNA分子的多样性,是单一基因座等位基因变异性在群体水平的体现。凡在群体中出现频率大于1%的变异体,不论其是正常还是致病性,称多态性;频率低于1%的变异体,则考虑为突变。
遗传多态现象介绍(一)
遗传多态现象(genetic polymorphism)是指在一个群体中,同时和经常存在的两种或两种以上的变异型或基因型,每种类型的频率比较高,一般认为每种变异型超过1%即可定为多态现象,不足1%的称为罕见变异型。 人类存在多种遗传多态现象(多态性),主要有染色体多态性、酶和蛋白质多态性、抗
DNA多态性的概念
DNA多态性在人群中不同个体之间的基因产物大多数是一致的,但每个个体在遗传上还是有所不同的,这种个体之间的差异从本质上讲是DNA碱基顺序存在的差异,它是通过用内切酶切割不同个体的基因组DNA出现不同长度的片段而被发现的,并通过孟德尔方式遗传,称为DNA多态性。
单链构象多态性
单链构象多态性(signle strand conformation polymorphism,SSCP)是指单链DNA由于碱基序列的不同可引起构象差异,这种差异将造成相同或相近长度的单链DNA电泳迁移率不同,从而可用于DNA中单个碱基的替代、微小的缺失或手稿的检测。用SSCP法检查基因突变时,通常
质谱流式技术在T细胞功能多态性研究中的应用
质谱流式技术在T细胞功能多态性研究中的应用:
花色多态型对花温和开花行为的调节研究取得新进展
蓝白龙胆 植物花色多态型很早就引起了生态学家和进化生物学家的注意。对高等植物来说,尤其是依靠动物或者昆虫进行传粉而维持植物繁殖的物种,花色是一个非常重要的繁育调控因子。比如,白色花多以自花授粉为主,花瓣艳丽的植株异花授粉的机率往往很高。花色多样性还表现在对某些逆境的适应上,
昆明植物所异型花柱植物花表型多态性维持研究取得进展
被子植物花表型多态现象在种群内的维持与稳定受其自身遗传和生态选择等内外因素的相互作用影响。随机因素,如奠基者效应、瓶颈效应和遗传漂变等可能对物种分布区内特定种群,尤其是作用于分布区边缘种群时,对种群性别表型多态性的保持与丢失可能具有不可低估的影响。然而,到目前为止仍缺乏确凿有效的证据支持这类假说
全线性的电流诱导多态自旋轨道耦合磁性存储器件研究
近期,中国科学院微电子研究所集成电路先导工艺研发中心研究员罗军课题组与中科院半导体研究所研究员王开友课题组合作,研制出全线性的电流诱导多态自旋轨道耦合(SOT)磁性存储器件,并实现了低能耗、可编辑的突触功能,为基于SOT-MRAM的低功耗存算一体逻辑和神经形态计算提供了一种新方法。 存算一体及
微卫星多态性的概念
中文名称微卫星多态性英文名称microsatellite polymorphism定 义头尾衔接的短串联重复序列由于重复单元的重复数目不同而造成的DNA多态现象。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
细胞化学词汇DNA多态性
中文名称:DNA多态性外文名称:polymorphism定 义:DNA多态性是指群体内某个基因座存在2个或多个等位基因形成而造成的同种DNA分子的多样性,是单一基因座等位基因变异性在群体水平的体现。凡在群体中出现频率大于1%的变异体,不论其是正常还是致病性,称多态性;频率低于1%的变异体,
单链构象多态性简介
单链构象多态性,在一定条件下, 单链DNA可形成特有的二级结构。不同 DNA链上单个碱基的改变可引起其二级结 构的改变,从而改变DNA链在非变性胶中 的电泳迁移率形成的多态性称作单链构象多 态性。单链DNA片段呈复杂的空间折叠构 象。这种立体结构主要是由其内部碱基配对 等分子内相互作用力来维持的
DNA序列多态性的定义
中文名称DNA序列多态性英文名称DNA sequence polymorphism定 义同一物种的不同基因组DNA等位序列之间的差异。包括长度多态、限制性酶切位点多态及单核苷酸多态等。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
补体遗传多态性的检测
补体遗传多态性的检测大多分二步进行,第一步是用琼脂糖高压电泳或聚丙烯酰胺等电聚焦电泳将EDTA抗凝血浆通过凝胶电泳,根据分子量的大小、所带电荷的多少及等电点(pI)将血浆蛋白分开。第二步是免疫固定或溶血鉴定,琼脂糖高压电泳或聚丙烯酰胺等电聚焦后,在凝胶板上铺上抗补体某一成分的抗血清,使其与凝胶板上的
什么是随机扩增多态-DNA?
随机扩增多态 DNA (randomly amplified polymorphic DNA, RAPD),是美国学者Williams和Welsh于1990年首先提出的该技术是通过分析DNA的PCR产物的多态性来推测生物体内基因排布与外在性状表现的规律的技术。RAPD技术是以8-lObp的随机寡核苷
影响遗传多态性的因素
影响遗传多态性的因素分为两个:自然因素和人为因素。自然选择自然因素为环境因子和生物竞争,这方面的影响须经过漫长的选择进化加以体现。自然选择是自然界中难以计数的偶然事件累积出现的的必然结果,Ernst Mayr 提出“自然选择只是一个统计学现象,它意味着较好的基因型有较好的延续的机会”,进化的改变不能
简单序列长度多态图的定义
中文名称简单序列长度多态图英文名称simple sequence length polymorphism map;SSLP map定 义不同基因组内,由2~4个核苷酸为一个单元的串联重复序列中,单元重复拷贝数不同,造成串联重复序列的长度不同,以此为标记绘制出的物理图。应用学科遗传学(一级学科),基
上海药物所等发现对环孢菌素敏感的基因多态性位点
甲酰肽受体1(Formyl peptide receptor 1, FPR1)属于A族G蛋白偶联受体,可被菌源性甲酰化肽及部分病毒来源的蛋白所激活,引起嗜中性粒细胞趋化、脱颗粒和超氧离子释放。活化FPR1有助于清除病原菌和损伤组织,在先天性免疫反应中发挥重要的作用。 中国科学院上海药物
Southern-blot对动物细胞基因组DNA中小卫星多态性的检测
实验概要本实验介绍了动物细胞基因组DNA中小卫星多态性Southern blot检测的原理和操作步骤。掌握核酸杂交检测技术(Southern blotting技术)、核酸探针的标记技术、小卫星DNA多态性检测分析技术(DNA 指纹图谱技术)和化学发光检测技术。实验原理Southern印迹杂交技术包括